FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1668.ptfa, 883 aa vs ./tmplib.26680 library 1768134 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.4259+/-0.00816; mu= -30.5380+/- 0.529 mean_var=763.3017+/-188.243, 0's: 0 Z-trim: 16 B-trim: 2 in 1/35 Lambda= 0.0464 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00139 ( 992 res) mbp09110 ( 992) 596 55 4e-08 mKIAA1364 ( 776 res) mbg16438 ( 776) 409 43 0.0002 mKIAA0903 ( 1242 res) mfj01081 (1242) 382 41 0.00096 mKIAA0819 ( 468 res) mfj12040 ( 468) 351 39 0.002 mKIAA4049 ( 1290 res) mbg01111 (1290) 357 40 0.0032 mKIAA0750 ( 1106 res) mbp09208 (1106) 339 38 0.0065 >>mFLJ00139 ( 992 res) mbp09110 (992 aa) initn: 1293 init1: 501 opt: 596 Z-score: 238.3 bits: 55.4 E(): 4e-08 Smith-Waterman score: 1244; 32.427% identity (40.402% ungapped) in 993 aa overlap (32-848:1-973) 10 20 30 40 50 60 mKIAA1 IPSPGRLRAGPAMAGPRGALLAWCRRQCEGYRGVDIRDLSSSFRDGLAFCAILHRHRPDL :: :.: ....::::::::::::::::::: mFLJ00 YRDVSITNMTTSFRDGLAFCAILHRHRPDL 10 20 30 70 80 90 100 110 120 mKIAA1 LDFQSLSKENVFENNRLAFEVAEKELGIPALLDPNDMVSMSVPDCLSIMTYVSQYYNHFT ..:..: :::..:::.:::.:::..:::::::: .:::...::: :::.::::::::.: mFLJ00 INFSALRKENIYENNKLAFQVAEEQLGIPALLDAEDMVALKVPDRLSILTYVSQYYNYFH 40 50 60 70 80 90 130 140 150 mKIAA1 S----SGQAAASPP---------------KPGKDPAP------P-SPTSTSPAVQPGEEA . .:.:. . : .:.: :.: : ::. :.:.:: .: mFLJ00 GRSPIGGMAGIKRPSSDSTEELSGKKGLSQPAKLPSPAQTQRSPLSPARTNPVVQRNE-- 100 110 120 130 140 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 QGDDLSPDSLSEQGKQQPP-SSACAACGQRVHLVQRYLAEGRLYHRHCFRCRQCSSTLVP : . :. . : :: :..::..::::::.::.:::::: ::::.:::::: mFLJ00 -GGSQRPSPKAAPGTAGSSVSSICGVCGKHVHLVQRHLADGRLYHRSCFRCKQCSSTLHS 150 160 170 180 190 200 220 230 240 250 260 mKIAA1 GSYSSGPEEGTFVCAER---CTRLGP-----GSRSGTRLLSQQRQQPAAAEAKDAEDNDP :.: . : :.:::... : ..: .::. . .. :. .. ...:. . mFLJ00 GAYRATGEPGVFVCTHHSSEVTSVSPKSSNLASRKPGGVTADTRSVGVSWTVQEANGEGT 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 mKIAA1 SLSV--AAVAEAD-----------RLQASSEVQFHTPTK--PPLPSKP--------QELA : : :: .: .:. : : :. .. : ::.. . :. mFLJ00 PLRVRTAAWEHAGGNTTAKGFVQTELKPPSTSQVHVGSSAGPKLPTSTVTTTSVTSKALT 270 280 290 300 310 320 310 320 330 340 350 mKIAA1 ----SPPGGRPTPAPRKASESSALTPPTPRPRSSLQQDGTVEQSVSSGL-----VNGRLQ : : : .:: . .. .. .: :.. . :. :..:.:. .:.. . mFLJ00 HVTNSSPTGWSSPAQSSPANFNSRPVVSPSARNT-HLPGSQGQTASKGVKTQLNLNSESS 330 340 350 360 370 380 360 370 380 390 400 410 mKIAA1 EPPVPKPRGTPKLSERMAAPRK---DPPWITLVQTEPKKKPAPQPPSSGPGPLSQAYRQV . : : : . :. . : .: :: : . ::: : :. : .. .: mFLJ00 NTAVT-PAWTSSASKTQQAREKFFQTPP----SAPAPASAPAPAPTSKVPTVVTVPTSKV 390 400 410 420 430 440 420 430 440 450 460 mKIAA1 EDGGLEEQTQKSSGTEPEPKPYNPFEEEEEEEGEPAPPVPSPSLAPPVPSP----SPAPP . . :.: . : : . :. ::. :: : : mFLJ00 PNV-VTAPTSKVPTVVTVPTSKVP-----TVVSAPTSKVPTVVSAPTSKVPTVVNSTNSR 450 460 470 480 490 470 480 490 500 510 mKIAA1 VPSPAPAPSEATPKSLHPWYGITPTS-SPKTKKRPAPRAPSAS---PL----AIHASR-- : . . ::. .: . : .:: . .: . :: ::: :. : ..:: mFLJ00 VTTVVNAPTSKVPTVVSATNGRVPTVVTAHTGRVPAVMNTSASKVSPVVDAPAQESSREQ 500 510 520 530 540 550 520 530 540 550 560 mKIAA1 ----LSHSEPP---SATPSPALSVESLSSESSSHTANAEPLEPPAVPKS---SSDPAVHV : .. : :.: .: : . :: . : : . :. : .. : . mFLJ00 ALSVLRKALPALTGSGTQAPNRSFPATSSVLVTLPKNEVPQKVPSDKLSALTTQTPNFTI 560 570 580 590 600 610 570 580 590 600 610 mKIAA1 ---PGTPGTSGNSVT--PSANSSLSSSGELGQPSGEQMPQVRTKGSAGTHST-------- :..: . ::... ....: : : ..:. : . ::... : : mFLJ00 KLEPSAPVNVGNTAVFLQAGKKSPSISPRVGKTSVGSRPQAEVAGVKGPGPISQEGQEEG 620 630 640 650 660 670 620 630 640 650 mKIAA1 --------KPFSGATPTPFLLAGDRNPA---PPVGSASPQ-------------LQIKSSC :: . ::. : ...:. : .:..: . .:. . mFLJ00 PEGWRARLKPVDKKTPAGRSLE-QKEPVLAEPRIGDTSRKASSSSDSSVHITLTSIQHKR 680 690 700 710 720 730 660 670 mKIAA1 KENPFNRKPSPSA---SPTVRK------------------------ATKGAK----PVR- : : . :::.: ::. :: .:.. : :.: mFLJ00 KPCPAGSGPSPAALSPSPSHRKKLAVPPSLDVSADWLQPEPKKQEDGTRSCKEEKSPTRW 740 750 760 770 780 790 680 690 700 710 720 mKIAA1 -------------PPAPGHGFPLIKRKVQADQYIPEEDIYGEMDNIERQLDALEHSGVLL ::. . :. ... : :::.:.. ....:: :::::: :: : mFLJ00 SRERSAVLDSGLAPPGEAVTSPV---RLHPD-YIPQEELQRQLQDIESQLDALELRGVEL 800 810 820 830 840 850 730 740 750 760 770 780 mKIAA1 EEKLRGGANEGSEDDMLVDWFKLIHEKHLLVRRESELIYVFKQQNLEQRQADVEFELRCL :..::.. ...:::...::::.:::::.::.: ::::.: :.: ::..: :.. ::: : mFLJ00 EKRLRAAEGDASEDSLMVDWFRLIHEKQLLLRLESELMYKSKDQRLEEQQLDLQGELRRL 860 870 880 890 900 910 790 800 810 820 830 840 mKIAA1 LNKPEKDWTDEDRAREKVLMQELMTLIEQRDAIVNCLDEDRQREEEEDKMLETMIKKKDF ..::: . .:: ::. :... .. ...:. ::. ::::: ::.:::.:::.::.. . mFLJ00 MDKPEGLKSPQDRQREQELLSQYVNTVNDRSDIVDFLDEDRLREQEEDQMLENMIQNLGL 920 930 940 950 960 970 850 860 870 880 mKIAA1 QREAESDSKKKGKFKTIKVLKFLGNKREAKSKAPGDKS ::. mFLJ00 QRKKSKSFLSKIWSSKSKSGQA 980 990 >>mKIAA1364 ( 776 res) mbg16438 (776 aa) initn: 436 init1: 409 opt: 409 Z-score: 171.9 bits: 42.8 E(): 0.0002 Smith-Waterman score: 409; 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