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FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 mKIAA0754, 939 aa
 vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library

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gi|149 QDFKNLSGDCQDFRFQQHSANPPHEFQPVESEAVATSGNTDVMQESRFSSATWPRATKSL
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      90       100       110       120       130       140         
mKIAA0 SKGGFSEKQYPLGDTACAVELPPLSPCLSEELLDPELHMLITPSLREKTESELKFEEDER
       .::::::::.:::::::.::.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
gi|149 AKGGFSEKQHPLGDTACTVEMPPLSPCLSEELLDPELHVLITPSLREKTESELKFEEDER
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       ::::::: ::::::::...:. :...:..:::: .:: .:::.. .:::::: .: :  :
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         ::.: :.::  : ::..::::.::.  : :: :: .:. ...:: ::  ::::::.: 
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         : :   .:::::::::::::::::::::::::::  .:: .: :::::: .::::. :
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       .:::: :::::.:::.:.: :: :: :: ::  : :.:::::::.:::: :. :  ::.:
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       :.::: ::::::::. . :::    :::.   .:: ::::::. :.: ::.:  ::::::
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       ::.::.::: :::::::: :: .::. .:::::.:  ::::::::::.  .:::::::::
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       ::::. . ..::...:.:.:::  ::::.:::::.:::.::   :. :: . :::.:   
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        :     :.::.: :::.::::::. :::::  :.::..: .:.:..: :. ::.: :: 
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       :: ::::::.:..::.:: : :::::   :::  .:.:: :..::::. : : :    .:
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       . : ::          ::... .::.:.:::  ::.: : : :: .::.::::.:.  : 
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       . .::           : ::                           .:::: .:: : :
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        : ::: ..:.   ::::.: . ...   ::  ..::.:::. :   : .:     :  .
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        .  .  .:. :. .::. ..                                       
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>>gi|34534555|dbj|BAC87042.1| unnamed protein product [H  (980 aa)
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                                     :::::.::::::::::::::.:::. ::::
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       .::::::::.:::::::.::.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
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         : :   .:::::::::::::::::::::::::::  .:: .: :::::: .::::. :
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       .:::: :::::.:::.: : :: :: :: ::  : :.:::::::.:::: :. :  ::.:
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       :: ::::::.:..::.:: : :::::   :::  .:.:: :..::::. : : :    .:
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       . : ::          ::... .::.:.:::  ::.: : : :: .::.::::.:.  : 
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       . .::           : ::                           .:::: .:: : :
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mKIAA0 -------------EPDTQAAEMFLPEEPAIPTPAGPTAEEPDTPTVPVSTAEEPSMPPPA
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        : ::: ..:.   ::::.: . ...   ::  ..::.:::. :   : .:     :  .
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        .  .  .:. :.:  :                                           
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>>gi|224056975|ref|XP_002190837.1| PREDICTED: similar to  (1388 aa)
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        ..   :..     ..  ::...    ..: : ::.    :.:   :..: ::: : . :
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>>gi|49648049|emb|CAG82502.1| YALI0C23452p [Yarrowia lip  (830 aa)
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       . .:.::.:.:        . :   ::   :: :  :. :   ::. :    : . .  .
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>>gi|114194814|gb|EAU36514.1| predicted protein [Aspergi  (1181 aa)
 initn: 196 init1: 113 opt: 294  Z-score: 256.8  bits: 59.2 E(): 1.3e-05
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         :  : .::.: .    :  : .    :.   . : .:..     :: .    :: ::.
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        .:  :. .:.. :.:  :.. :   :  .: . ::.: . . :   : ::  :.  :..
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mKIAA0 PTAEEPDTPTVPVSTAEEPSMPPPAGPTP-EESAA-P--TLKEPTPEKPDTQVVSSSIPE
       : :::: .:      ::::  :    ::: :: :: :  ::.::::.         .: .
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         :.::  .:  :  : . :. ::..  . .:   : :. :  :...  ..:        
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>>gi|210121023|gb|EEA68738.1| hypothetical protein BRAFL  (1009 aa)
 initn: 740 init1: 155 opt: 289  Z-score: 253.4  bits: 58.3 E(): 2.1e-05
Smith-Waterman score: 309;  29.859% identity (50.141% similar) in 355 aa overlap (595-930:216-540)

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gi|210 APEVPEPAAAELPAPEKTEAIEPEESEQPAPELPTPEEQEETRLEVPVLEEPVSEVPEKS
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mKIAA0 ISKASNTVPGLEEWISSQQRPVPAAVVPMVENALDAVTPMPG-EDI--PAV---ALTASE
           :.. :. ::     . :.:. ..:  :..   .. .:. ::.  ::.   :: . :
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        :    :: :  . ::  :  :::. : :. .   :.  .::     .::::. :.. . 
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        : .:    : ..:  : . :::.  : .   ::.::   :  :. :::. :. :    :
gi|210 SPAAEEPEDPALEEPEDPAPEEPEDPAPDSEEPEDPAPEEPEDPAPEEPEDPA-P-EEPE
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       .:.   :  :.:::   :.     :: :  .   .  ::    ::   :  :  .:. : 
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              : .:   : :. :.  .:.   .:  :     :.:   .:.::     . :  
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        :.:..: :  :   ....: :. :                                   
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>>gi|221504305|gb|EEE29980.1| conserved hypothetical pro  (749 aa)
 initn:  51 init1:  51 opt: 281  Z-score: 248.2  bits: 56.9 E(): 4e-05
Smith-Waterman score: 285;  26.513% identity (51.873% similar) in 347 aa overlap (553-880:285-609)

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                                     ::..     .  : :.:. ..     ::  
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         ::.. : .. :    . . :.:  ..   .: .  :::. . :  : :      ..  
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       ::.:  .::   ::.  .. .:. ::.      : . .:  .:.... :. :. . :.::
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       .  :. .:        ::   :.  ..::: :..   .::. ..  :.      .:  .:
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         ::  .  : :  : :.:  :    :  .:.. :    : . :  .  ::: : ::.  
gi|221 PEAEAPVEGEKATET-ASPEEEATTFELTSPAAGVRPMPEQAPPAETVETPE-SEAPVEG
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mKIAA0 EPTPE--KPDTQVVSSSIPEWSA----TPATAVPAKEIFSPDG--PFLEGTTHTDSVPIS
       : : :  .:. ..... .   .:     :  ::::. . .:..  : .::   :...   
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       ::. . :  .::. :..                                           
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>>gi|115681537|ref|XP_001201559.1| PREDICTED: similar to  (727 aa)
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Smith-Waterman score: 294;  29.104% identity (49.254% similar) in 268 aa overlap (620-881:78-321)

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        : :  :..    .:   :     ::.   :: :: .   ... :::.   :.  :  : 
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                  ..  .  :. : : .   ::  :. . :   :.: ::  .: .: . . 
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         : . .:: :.   :.::..  .: ::::.: :  : :: .::    ::::: :  . .
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           :: .  : :  :   .  : .:  : . .    :  : ::     ..: : ..:  
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>>gi|119697372|gb|ABL94445.1| conserved hypothetical pro  (291 aa)
 initn: 187 init1: 135 opt: 273  Z-score: 246.8  bits: 55.3 E(): 4.8e-05
Smith-Waterman score: 285;  25.564% identity (50.376% similar) in 266 aa overlap (622-880:18-273)

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        .:....:.      .:: .    :..  . ..::: .  : :. : .: .: .:    :
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        ..:  :   : ..  :::  . :..   :::   ..:.    : .  : .: ::   : 
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           : :  : .: :  :  :: .   :..  :  : : :.: :  .: .:  :    :.
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