FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0620.ptfa, 1746 aa vs ./tmplib.26680 library 1767271 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2731+/-0.00451; mu= 17.5107+/- 0.302 mean_var=110.4227+/-25.588, 0's: 0 Z-trim: 12 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1221 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4053 ( 1400 res) mbg07434 (1400) 1544 284 1.6e-76 mKIAA1206 ( 1374 res) mbg00219 (1374) 1373 254 1.8e-67 mKIAA0407 ( 1207 res) mpm02292 (1207) 1106 207 2.4e-53 mKIAA0463 ( 1529 res) mbg07539 (1529) 1015 191 1.8e-48 mKIAA4078 ( 609 res) mic26093 ( 609) 934 176 2e-44 mKIAA0315 ( 1299 res) mbg03309 (1299) 911 173 5.4e-43 mKIAA1550 ( 199 res) mfj03098 ( 199) 737 141 2.7e-34 mKIAA1745 ( 871 res) mid29072 ( 871) 227 52 7.5e-07 mKIAA1739 ( 755 res) mtj00724 ( 755) 170 42 0.00072 mKIAA4225 ( 868 res) mfj58259 ( 868) 160 40 0.0027 >>mKIAA4053 ( 1400 res) mbg07434 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:..:..::: ..:::. ::.:..:: :...:.:: :::. . .:: mKIAA4 KHFLLTFIRTLEAQRSFSMRDRGNVASLIMTALQGEMEYATGVLKQLLSDLIEKNLESKN 870 880 890 900 910 920 1300 1310 1320 1330 1340 1350 mKIAA0 -PKLMLRRTESVVEKMLTNWMSICMYGCLRETVGEPFFLLLCAIKQQINKGSIDAITGKA :::.:::::::.:::::::... .: :.: .:::.:.: ::::::..:: ::::::.: mKIAA4 HPKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFLLYKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITGEA 930 940 950 960 970 980 1360 1370 1380 1390 1400 1410 mKIAA0 RYTLNEEWLLRENIEAKPRNLN-VSFQGCGMDSLSVRAMDTDTLTQVKEKILEAFCKNVP ::.:.:. :.:..:. : .:: :. . . . :.... ::.::::::.:.: :.:: mKIAA4 RYSLSEDKLIRQQIDYKTLTLNCVNPEHENAPEVPVKGLNCDTVTQVKEKLLDAVYKGVP 990 1000 1010 1020 1030 1040 1420 1430 1440 1450 1460 1470 mKIAA0 YSQWPRAEDVDLEWFASSTQSYVLRDLDDTSVVEDGRKKLNTLAHYKIPEGASLAM---- ::: :.: :.:::: . .:.: : :. ... :.:::::::.. .:.:.:. mKIAA4 YSQRPKAGDMDLEWRQGRMARIILQDEDVTTKIDNDWKRLNTLAHYQVTDGSSVALVPKQ 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1480 1490 1500 mKIAA0 --------------SLT---------DKKDSTLGRVK----DLDT-EKYFHLVLPTDELV ::. .. :: .:. ::.. : .::: :.: 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.:. . . .: .: ::. . . :..:.:::: ::::.: . mKIAA1 GLIHCQAQQFYPSMSQWELPVPIYVTRGEIQR-LDNAGDLHVTLYDCAMGHPDCSHCQAA 400 410 420 430 440 690 700 710 720 730 mKIAA0 EDLGHL-CVW-NDG---CRLRGPLQPLPGT----CPAPEIRAIEPLSGPLDGGTLLTIRG . : : :.: .:: :: ::: : ::. :: : : .::::.:: .:: .:: : mKIAA1 N--GSLSCLWCGDGQPACRY-GPLCP-PGAVEQLCPIPSIDVIEPLTGPPEGGLAITILG 450 460 470 480 490 500 740 750 760 770 780 790 mKIAA0 RNLGRRLSDVAHGVWIGSVACEPLADRYTVSEEIVCATGPAAGAFSDVVTVNVSKE--GR :::. ..:: ..: ... :.: . : .: .:::.:.:: .. . : : .... : mKIAA1 SNLGQAFNDVRNAVTVAGQPCNPDPSLYRISARIVCVTSPAPNGTAGPVQVAIKSRPPGI 510 520 530 540 550 560 800 810 820 830 840 850 mKIAA0 SREQFSYVLPTVHSLEPSMGPKAGGTRITIHGSDLNVGSMLQVLVNDTDPCTDLTRTATS : ..:.: :.. ::.:. ::.::::..::::. :..:. ..:.:.: .:: : mKIAA1 STQNFTYQDPVLLSLNPQWGPQAGGTQLTIHGQYLQTGGNISVFVGD-QPCP------MS 570 580 590 600 610 860 870 880 890 900 910 mKIAA0 ITCTVPGGTLPSPVPVCVRFESRGCVHGNLTFWYMQNPVITAISPGRSPVSGGRTITVAG . : . .: :: . : . . : : :: .. :. : .:::.: : : mKIAA1 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. :. . .:..::::.::::::.:. . :..:.:: : ....:. . . :: mKIAA1 NSGVHRVPARVLDTDTITQVKEKVLDQIYKGTPFSQRPSVHSLDVP----DGATVVL--- 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1450 1460 1470 1480 1490 1500 mKIAA0 DDTSVVEDGRKKLNTLAHYKIPEGASLAMSLTDKKDSTLGRVKDLDTEKYFHLVLPTDEL :..: ..:.. : : . : : : .. : :. .::: :.: mKIAA1 --IPQVHNGGTVSQSLGQTGCPSGENTPM-LEDGEE---GGVR------LWHLVKATEEA 1090 1100 1110 1120 1130 1510 1520 1530 1540 1550 mKIAA0 --VEPKKS-----HRQSHRKKVLPEIYLTRLLSTKGTLQKFLDDLFKAILSIREDKP-PL .. ..: .:. : :..:::::::::: :::::::.:: :.::::. ..: :. mKIAA1 EGAKVRRSSLRDRERERSRAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDTFQAILSM--NRPVPI 1140 1150 1160 1170 1180 1560 1570 1580 1590 1600 1610 mKIAA0 AVKYFFDFLEEQAEKRGISDPDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIEKTDHIDACL ::::.::::.: :::.:: ::.:::::::::: ::::::.:::::..::.. .:. :: : mKIAA1 AVKYLFDFLDELAEKHGIEDPETLHIWKTNSLLLRFWVNVLKNPQLIFDVQVSDNEDAIL 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1620 1630 1640 1650 1660 1670 mKIAA0 SVIAQAFIDACSISDLQLGKDSPTNKLLYAKEIPEYRKTVQRYYKQIQDMTPLSEQEMNA .::::.:::.: .:. ..:.:::.::::::.:::.:.. :..:: .:.. .: : ::::. mKIAA1 AVIAQTFIDSCMVSEHKVGRDSPVNKLLYAREIPRYKQMVEKYYADIRQSSPASYQEMNS 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1680 1690 1700 1710 1720 1730 mKIAA0 HLAEESRKYQNEFNTNVAMAEIYKYAKRYRPQIMAALEANPTARRTQLQHKFEQVVALME ::: : .:.. . :. :.:.. .:: ::..::: .:.:.. :: ...::.::.: mKIAA1 ALAELSGNYSSAPHCLEALRELYNHIHRYYDQIISALEEDPVAQKMQLACRLQQVAALVE 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1740 mKIAA0 NNIYECYSEA .. mKIAA1 YKVTDL 1370 >>mKIAA0407 ( 1207 res) mpm02292 (1207 aa) initn: 2197 init1: 758 opt: 1106 Z-score: 1050.2 bits: 206.9 E(): 2.4e-53 Smith-Waterman score: 2619; 39.748% identity (44.123% ungapped) in 1190 aa overlap (622-1739:61-1204) 600 610 620 630 640 650 mKIAA0 QDILVPLTKATFFHGSSLECSFGLEESFEAVWANNSLVRCNQVVLHTTQKSQVFPLSLKL :: . ..:.: . . . ..: : mKIAA0 DGPRSSECVLELGSREVAVEAQVECAPPPDVWCH---IKCQQHQFSYEALKPELQVGLFL 40 50 60 70 80 660 670 680 690 700 mKIAA0 KGPPDRFLDSPNPMTVVVYNCAMGSPDCSQCLGREDLGHLCVWNDGCRLR-------GPL . .:: . . ::.:.:..: :::.: . ::: .: : : . mKIAA0 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... : .: ..: mKIAA0 NDTKVVFLSPAVPE--EPEAYNLTVLIRMDGHCAPLRTEAGVFEYVADPTFENFTGGVKK 610 620 630 640 650 660 1030 1040 1050 1060 mKIAA0 EQDSL----------GLESHEYHIKIGQVSCDIQIISDRVIHCSVNE---------SLGT . ..: .. .: . .: : .. ... ..: : . : mKIAA0 QVNKLIHARGTNLNKAMTLEEAEAFVGAERCIMKTLTETDLYCEPPEVQPPPKRRQKRDT 670 680 690 700 710 720 1070 1080 1090 1100 1110 1120 mKIAA0 AEGQLPITIQVGNFNQTIATLQLGGSETAIVVSIVICSVLL-LLSVVALFVFC--TKSRR :.. . .. :. . ... .. . . .:... :.. .. .... ..: ::.. mKIAA0 AHNLPEFIVKFGSREWVLGRVEYDTRASDVPLSLILPLVMVPMVFIIVVSIYCYWRKSQQ 730 740 750 760 770 780 1130 1140 1150 1160 1170 1180 mKIAA0 AERYWQKTLLQMEEMESQIREEIRKGFAELQTDMTDLTKELNRSQGIPFLEYKHFVTRTF ::: ..: :.: .: ..:.. .: :..:. .: : :...... ::: :.:: .. :.: mKIAA0 AEREYEKIKSQLEGLEESVRDRCKKEFTDLMIEMEDQTNDVHEA-GIPTLDYKTYTDRVF 790 800 810 820 830 840 1190 1200 1210 1220 1230 1240 mKIAA0 FPKCSSLYEERYVLPSKTLNSQGGSPPQETHPLLGEWNIPEHCRPSMEEGISLFSSLLNN : :::: .: . . : :. .::: :: .:... ::.:::. mKIAA0 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