# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mpf00884.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0013.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0013, 1049 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7917066 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5161+/-0.000186; mu= 12.5918+/- 0.010 mean_var=83.1046+/-16.105, 0's: 40 Z-trim: 59 B-trim: 61 in 1/66 Lambda= 0.140689 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|148695911|gb|EDL27858.1| Rho GTPase activating (1083) 6821 1395.0 0 gi|81895387|sp|Q80Y19.1|RHGBA_MOUSE RecName: Full= ( 987) 6499 1329.7 0 gi|123858298|emb|CAM16570.1| Rho GTPase activating ( 987) 6477 1325.2 0 gi|109468553|ref|XP_230459.4| PREDICTED: similar t ( 994) 5724 1172.4 0 gi|26328453|dbj|BAC27965.1| unnamed protein produc ( 648) 4249 872.8 0 gi|114656186|ref|XP_510272.2| PREDICTED: Rho GTPas (1091) 3337 687.9 7.6e-195 gi|109080507|ref|XP_001084475.1| PREDICTED: simila (1289) 3252 670.7 1.4e-189 gi|148695912|gb|EDL27859.1| Rho GTPase activating ( 553) 3226 665.1 2.7e-188 gi|123858300|emb|CAM16572.1| Rho GTPase activating ( 498) 3206 661.0 4.2e-187 gi|119361641|sp|Q6P4F7.2|RHGBA_HUMAN RecName: Full (1023) 3189 657.8 8e-186 gi|123858299|emb|CAM16571.1| Rho GTPase activating ( 457) 2898 598.5 2.6e-168 gi|54673768|gb|AAH85123.1| Arhgap11a protein [Ratt ( 522) 2813 581.3 4.5e-163 gi|194206831|ref|XP_001503706.2| PREDICTED: Rho GT ( 499) 2774 573.4 1e-160 gi|194670632|ref|XP_875227.3| PREDICTED: similar t ( 497) 2699 558.1 4e-156 gi|39793952|gb|AAH63444.1| Rho GTPase activating p ( 501) 2671 552.5 2.1e-154 gi|194381166|dbj|BAG64151.1| unnamed protein produ ( 834) 2090 434.7 9.6e-119 gi|34604128|gb|AAQ79777.1| Rho GTPase activating p ( 992) 1683 352.1 8.1e-94 gi|224051350|ref|XP_002200530.1| PREDICTED: Rho GT ( 997) 1581 331.4 1.4e-87 gi|46362541|gb|AAH66588.1| Zgc:77004 [Danio rerio] ( 461) 1528 320.4 1.3e-84 gi|197725382|pdb|3EAP|A Chain A, Crystal Structure ( 271) 1485 311.5 3.7e-82 gi|194034947|ref|XP_001924614.1| PREDICTED: simila ( 969) 1358 286.2 5.8e-74 gi|119612666|gb|EAW92260.1| Rho GTPase activating ( 694) 1311 276.5 3.3e-71 gi|121942629|sp|Q3KRB8.1|RHGBB_HUMAN RecName: Full ( 267) 1282 270.3 9.3e-70 gi|149574070|ref|XP_001519030.1| PREDICTED: simila ( 265) 1221 257.9 4.9e-66 gi|73999801|ref|XP_544601.2| PREDICTED: similar to ( 943) 1131 240.1 4.2e-60 gi|183986461|gb|AAI66229.1| LOC100158559 protein [ ( 946) 1068 227.3 3e-56 gi|28279443|gb|AAH46258.1| MGC53357 protein [Xenop ( 950) 1038 221.2 2e-54 gi|47230264|emb|CAG10678.1| unnamed protein produc ( 847) 945 202.3 8.9e-49 gi|57920936|gb|AAH89149.1| MGC85067 protein [Xenop ( 801) 788 170.4 3.3e-39 gi|169208760|ref|XP_001716962.1| PREDICTED: simila ( 144) 763 164.8 3e-38 gi|47123176|gb|AAH70822.1| MGC83907 protein [Xenop ( 803) 734 159.5 6.7e-36 gi|47224553|emb|CAG03537.1| unnamed protein produc ( 221) 611 134.1 8e-29 gi|149022926|gb|EDL79820.1| rCG27309 [Rattus norve ( 90) 541 119.6 7.6e-25 gi|156221379|gb|EDO42235.1| predicted protein [Nem ( 558) 522 116.3 4.5e-23 gi|156542381|ref|XP_001600720.1| PREDICTED: hypoth (1080) 515 115.1 2e-22 gi|108871373|gb|EAT35598.1| hypothetical protein A (1045) 486 109.2 1.2e-20 gi|194166312|gb|EDW81213.1| GK11942 [Drosophila wi ( 816) 479 107.7 2.6e-20 gi|210080579|gb|EEA29855.1| hypothetical protein B ( 279) 472 105.9 3e-20 gi|190588514|gb|EDV28536.1| hypothetical protein T ( 474) 471 105.9 5.2e-20 gi|221116972|ref|XP_002164915.1| PREDICTED: simila ( 586) 452 102.1 8.9e-19 gi|116487943|gb|AAI25865.1| Zgc:153345 [Danio reri ( 922) 448 101.4 2.2e-18 gi|110756779|ref|XP_396895.3| PREDICTED: similar t ( 868) 435 98.8 1.3e-17 gi|210121431|gb|EEA69143.1| hypothetical protein B ( 181) 410 93.2 1.3e-16 gi|212512407|gb|EEB15185.1| Rho-GTPase-activating ( 816) 403 92.3 1.1e-15 gi|91087031|ref|XP_974382.1| PREDICTED: similar to ( 766) 389 89.4 7.7e-15 gi|163779102|gb|EDQ92716.1| predicted protein [Mon ( 356) 370 85.3 6.2e-14 gi|149497871|ref|XP_001517623.1| PREDICTED: simila ( 564) 363 84.0 2.4e-13 gi|126632134|gb|AAI34069.1| Zgc:153345 protein [Da ( 272) 355 82.2 4.1e-13 gi|109471218|ref|XP_001068716.1| PREDICTED: simila ( 533) 330 77.3 2.3e-11 gi|149043063|gb|EDL96637.1| rCG32104 [Rattus norve ( 564) 330 77.3 2.5e-11 >>gi|148695911|gb|EDL27858.1| Rho GTPase activating prot (1083 aa) initn: 6803 init1: 6803 opt: 6821 Z-score: 7476.2 bits: 1395.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 6821; 98.856% identity (99.237% similar) in 1049 aa overlap (1-1049:36-1083) 10 20 30 mKIAA0 REAREKKVCVSGSRESGGRVPEVAGRQRSR : :::. .: : .:::::::::::::: gi|148 ESEGKGKFVEVTDRAERPGKKAGGSETRVKRGAREEGLCKWIER-NGGRVPEVAGRQRSR 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 ASLRAFGKWKSWLVAKKVRTRSRPRRVGDVFGMWDQRLVRLALLQQLRAVYGIKVKGGRG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 ASLRAFGKWKSWLVAKKVRTRSRPRRVGDVFGMWDQRLVRLALLQQLRAVYGIKVKGGRG 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 QCDRRRHETAATEIKGKVFGVPFNSLPHSVVPEFGHIPSFLVDACASLKEHIHTEGLFRK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::: gi|148 QCDRRRHETAATEIKGKVFGVPFNSLPHSVVPEFGHIPSFLVDACTSLKEHIHTEGLFRK 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 SGSVVRLKALKSKLDQGEACLSSALPCDVAGLLKQFFRELPEPVLPADLHEALFKAQQLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 SGSVVRLKALKSKLDQGEACLSSALPCDVAGLLKQFFRELPEPVLPADLHEALFKAQQLG 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 AEERNKATLLLSCLMANPTVDILRYFFNFLKSVSLRASENKMDSSNLAVIFAPNLLQTSE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 AEERNKATLLLSCLMANPTVDILRYFFNFLKSVSLRASENKMDSSNLAVIFAPNLLQTSE 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 GHEKMSANTEKKLRLQAAVVQTFIDCASDIGRVPDFILEKIPAMLGIDGLCTTPSLEGFE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 GHEKMSANTEKKLRLQAAVVQTFIDCASDIGRVPDFILEKIPAMLGIDGLCTTPSLEGFE 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 GDFETPGECKRKRRQSVGDFVNGALNKLKSSRTPSITPQQDRTAQASASPLILTPSVKRK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 GDFETPGECKRKRRQSVGDFVNGALNKLKSSRTPSITPQQDRTAQASASPLILTPSVKRK 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 LPGESSHAFSSKKRKSIKHNLNFELLPSHFFSSNSTPVSVHLDTSPDGSSQTSLSPIAMS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 LPGESSHAFSSKKRKSIKHNLNFELLPSHFFSSNSTPVSVHLDTSPDGSSQTSLSPIAMS 430 440 450 460 470 480 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 GNHLVSTELRRSKRIASKKVYRVESGKAGCFSPKVSRKEKTRRSLRLKFSLGKNRDSDGC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 GNHLVSTELRRSKRIASKKVYRVESGKAGCFSPKVSRKEKTRRSLRLKFSLGKNRDSDGC 490 500 510 520 530 540 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 SVINRYENVGRRLANQQNLKSRIDSVKTGLLFSPDIDERLLKKGSEKISKSEEHLLTPDQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 SVINRYENVGRRLANQQNLKSRIDSVKTGLLFSPDIDERLLKKGSEKISKSEEHLLTPDQ 550 560 570 580 590 600 580 590 600 610 620 630 mKIAA0 LDGTGYRMSWTEPSNSSFQDMSANGTSPIMQNLEVKSFSLEPDITVEKSPVVSCELRPST :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 LDGTGYRMSWTEPSNSSFQDMSANGTSPIMQNLEVKSFSLEPDITVEKSPVVSCELRPST 610 620 630 640 650 660 640 650 660 670 680 690 mKIAA0 FHSQPDSSVLSLSGDEGNLASETLQKIQKAFSESGSDLHMVINHEQSSVTNTGEEVEFRD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 FHSQPDSSVLSLSGDEGNLASETLQKIQKAFSESGSDLHMVINHEQSSVTNTGEEVEFRD 670 680 690 700 710 720 700 710 720 730 740 750 mKIAA0 VTVTESKGHDGSCAGEEENCPSERNFSPDQSPEFAREADEECYSTQMKVECEGLHSETPK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 VTVTESKGHDGSCAGEEENCPSERNFSPDQSPEFAREADEECYSTQMKVECEGLHSETPK 730 740 750 760 770 780 760 770 780 790 800 810 mKIAA0 ADPLILQAFPGEEPAEEPQSPRNQLSTPSRGNENVGESAGASGAPGEDESTCSVAVLSKP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::: gi|148 ADPLILQAFPGEEPAEEPQSPRNQLSTPSRGNENVGESAGASGAPGEDESTCRVAVLSKP 790 800 810 820 830 840 820 830 840 850 860 870 mKIAA0 RPQRLSRQQSLVEKCDSVAPGALQVTEHGKVSDHIQWFNKLSLNEPNRGKVKSPLKFQRT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 RPQRLSRQQSLVEKCDSVAPGALQVTEHGKVSDHIQWFNKLSLNEPNRGKVKSPLKFQRT 850 860 870 880 890 900 880 890 900 910 920 930 mKIAA0 PVRQSVRRINSLLEYGRQPVRQKLAIFGDAASPLVKSVSCDSALPSCVQNTSKGPTAPHI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 PVRQSVRRINSLLEYGRQPVRQKLAIFGDAASPLVKSVSCDSALPSCVQNTSKGPTAPHI 910 920 930 940 950 960 940 950 960 970 980 990 mKIAA0 TSGLEAQKSTSCNKSSVELTSKSFTKMKRHPDPLSASLGTPRLCKQENKSNGHIKFPLDD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 TSGLEAQKSTSCNKSSVELTSKSFTKMKRHPDPLSASLGTPRLCKQENKSNGHIKFPLDD 970 980 990 1000 1010 1020 1000 1010 1020 1030 1040 mKIAA0 LTNHERLKFVVNNNVAFSPGMKNRVVRKPSEKERVWYKGSPKNPIGKTQLLPTSKPVDL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 LTNHERLKFVVNNNVAFSPGMKNRVVRKPSEKERVWYKGSPKNPIGKTQLLPTSKPVDL 1030 1040 1050 1060 1070 1080 >>gi|81895387|sp|Q80Y19.1|RHGBA_MOUSE RecName: Full=Rho (987 aa) initn: 6499 init1: 6499 opt: 6499 Z-score: 7123.6 bits: 1329.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 6499; 100.000% identity (100.000% similar) in 987 aa overlap (63-1049:1-987) 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 LRAFGKWKSWLVAKKVRTRSRPRRVGDVFGMWDQRLVRLALLQQLRAVYGIKVKGGRGQC :::::::::::::::::::::::::::::: gi|818 MWDQRLVRLALLQQLRAVYGIKVKGGRGQC 10 20 30 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 DRRRHETAATEIKGKVFGVPFNSLPHSVVPEFGHIPSFLVDACASLKEHIHTEGLFRKSG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|818 DRRRHETAATEIKGKVFGVPFNSLPHSVVPEFGHIPSFLVDACASLKEHIHTEGLFRKSG 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 SVVRLKALKSKLDQGEACLSSALPCDVAGLLKQFFRELPEPVLPADLHEALFKAQQLGAE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|818 SVVRLKALKSKLDQGEACLSSALPCDVAGLLKQFFRELPEPVLPADLHEALFKAQQLGAE 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 ERNKATLLLSCLMANPTVDILRYFFNFLKSVSLRASENKMDSSNLAVIFAPNLLQTSEGH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|818 ERNKATLLLSCLMANPTVDILRYFFNFLKSVSLRASENKMDSSNLAVIFAPNLLQTSEGH 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 EKMSANTEKKLRLQAAVVQTFIDCASDIGRVPDFILEKIPAMLGIDGLCTTPSLEGFEGD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|818 EKMSANTEKKLRLQAAVVQTFIDCASDIGRVPDFILEKIPAMLGIDGLCTTPSLEGFEGD 220 230 240 250 260 270 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 FETPGECKRKRRQSVGDFVNGALNKLKSSRTPSITPQQDRTAQASASPLILTPSVKRKLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|818 FETPGECKRKRRQSVGDFVNGALNKLKSSRTPSITPQQDRTAQASASPLILTPSVKRKLP 280 290 300 310 320 330 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 GESSHAFSSKKRKSIKHNLNFELLPSHFFSSNSTPVSVHLDTSPDGSSQTSLSPIAMSGN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|818 GESSHAFSSKKRKSIKHNLNFELLPSHFFSSNSTPVSVHLDTSPDGSSQTSLSPIAMSGN 340 350 360 370 380 390 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 HLVSTELRRSKRIASKKVYRVESGKAGCFSPKVSRKEKTRRSLRLKFSLGKNRDSDGCSV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|818 HLVSTELRRSKRIASKKVYRVESGKAGCFSPKVSRKEKTRRSLRLKFSLGKNRDSDGCSV 400 410 420 430 440 450 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 INRYENVGRRLANQQNLKSRIDSVKTGLLFSPDIDERLLKKGSEKISKSEEHLLTPDQLD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|818 INRYENVGRRLANQQNLKSRIDSVKTGLLFSPDIDERLLKKGSEKISKSEEHLLTPDQLD 460 470 480 490 500 510 580 590 600 610 620 630 mKIAA0 GTGYRMSWTEPSNSSFQDMSANGTSPIMQNLEVKSFSLEPDITVEKSPVVSCELRPSTFH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|818 GTGYRMSWTEPSNSSFQDMSANGTSPIMQNLEVKSFSLEPDITVEKSPVVSCELRPSTFH 520 530 540 550 560 570 640 650 660 670 680 690 mKIAA0 SQPDSSVLSLSGDEGNLASETLQKIQKAFSESGSDLHMVINHEQSSVTNTGEEVEFRDVT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|818 SQPDSSVLSLSGDEGNLASETLQKIQKAFSESGSDLHMVINHEQSSVTNTGEEVEFRDVT 580 590 600 610 620 630 700 710 720 730 740 750 mKIAA0 VTESKGHDGSCAGEEENCPSERNFSPDQSPEFAREADEECYSTQMKVECEGLHSETPKAD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|818 VTESKGHDGSCAGEEENCPSERNFSPDQSPEFAREADEECYSTQMKVECEGLHSETPKAD 640 650 660 670 680 690 760 770 780 790 800 810 mKIAA0 PLILQAFPGEEPAEEPQSPRNQLSTPSRGNENVGESAGASGAPGEDESTCSVAVLSKPRP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|818 PLILQAFPGEEPAEEPQSPRNQLSTPSRGNENVGESAGASGAPGEDESTCSVAVLSKPRP 700 710 720 730 740 750 820 830 840 850 860 870 mKIAA0 QRLSRQQSLVEKCDSVAPGALQVTEHGKVSDHIQWFNKLSLNEPNRGKVKSPLKFQRTPV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|818 QRLSRQQSLVEKCDSVAPGALQVTEHGKVSDHIQWFNKLSLNEPNRGKVKSPLKFQRTPV 760 770 780 790 800 810 880 890 900 910 920 930 mKIAA0 RQSVRRINSLLEYGRQPVRQKLAIFGDAASPLVKSVSCDSALPSCVQNTSKGPTAPHITS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|818 RQSVRRINSLLEYGRQPVRQKLAIFGDAASPLVKSVSCDSALPSCVQNTSKGPTAPHITS 820 830 840 850 860 870 940 950 960 970 980 990 mKIAA0 GLEAQKSTSCNKSSVELTSKSFTKMKRHPDPLSASLGTPRLCKQENKSNGHIKFPLDDLT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|818 GLEAQKSTSCNKSSVELTSKSFTKMKRHPDPLSASLGTPRLCKQENKSNGHIKFPLDDLT 880 890 900 910 920 930 1000 1010 1020 1030 1040 mKIAA0 NHERLKFVVNNNVAFSPGMKNRVVRKPSEKERVWYKGSPKNPIGKTQLLPTSKPVDL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|818 NHERLKFVVNNNVAFSPGMKNRVVRKPSEKERVWYKGSPKNPIGKTQLLPTSKPVDL 940 950 960 970 980 >>gi|123858298|emb|CAM16570.1| Rho GTPase activating pro (987 aa) initn: 6477 init1: 6477 opt: 6477 Z-score: 7099.4 bits: 1325.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 6477; 99.797% identity (99.797% similar) in 987 aa overlap (63-1049:1-987) 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 LRAFGKWKSWLVAKKVRTRSRPRRVGDVFGMWDQRLVRLALLQQLRAVYGIKVKGGRGQC :::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 MWDQRLVRLALLQQLRAVYGIKVKGGRGQC 10 20 30 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 DRRRHETAATEIKGKVFGVPFNSLPHSVVPEFGHIPSFLVDACASLKEHIHTEGLFRKSG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 DRRRHETAATEIKGKVFGVPFNSLPHSVVPEFGHIPSFLVDACASLKEHIHTEGLFRKSG 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 SVVRLKALKSKLDQGEACLSSALPCDVAGLLKQFFRELPEPVLPADLHEALFKAQQLGAE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 SVVRLKALKSKLDQGEACLSSALPCDVAGLLKQFFRELPEPVLPADLHEALFKAQQLGAE 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 ERNKATLLLSCLMANPTVDILRYFFNFLKSVSLRASENKMDSSNLAVIFAPNLLQTSEGH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 ERNKATLLLSCLMANPTVDILRYFFNFLKSVSLRASENKMDSSNLAVIFAPNLLQTSEGH 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 EKMSANTEKKLRLQAAVVQTFIDCASDIGRVPDFILEKIPAMLGIDGLCTTPSLEGFEGD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 EKMSANTEKKLRLQAAVVQTFIDCASDIGRVPDFILEKIPAMLGIDGLCTTPSLEGFEGD 220 230 240 250 260 270 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 FETPGECKRKRRQSVGDFVNGALNKLKSSRTPSITPQQDRTAQASASPLILTPSVKRKLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 FETPGECKRKRRQSVGDFVNGALNKLKSSRTPSITPQQDRTAQASASPLILTPSVKRKLP 280 290 300 310 320 330 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 GESSHAFSSKKRKSIKHNLNFELLPSHFFSSNSTPVSVHLDTSPDGSSQTSLSPIAMSGN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 GESSHAFSSKKRKSIKHNLNFELLPSHFFSSNSTPVSVHLDTSPDGSSQTSLSPIAMSGN 340 350 360 370 380 390 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 HLVSTELRRSKRIASKKVYRVESGKAGCFSPKVSRKEKTRRSLRLKFSLGKNRDSDGCSV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 HLVSTELRRSKRIASKKVYRVESGKAGCFSPKVSRKEKTRRSLRLKFSLGKNRDSDGCSV 400 410 420 430 440 450 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 INRYENVGRRLANQQNLKSRIDSVKTGLLFSPDIDERLLKKGSEKISKSEEHLLTPDQLD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 INRYENVGRRLANQQNLKSRIDSVKTGLLFSPDIDERLLKKGSEKISKSEEHLLTPDQLD 460 470 480 490 500 510 580 590 600 610 620 630 mKIAA0 GTGYRMSWTEPSNSSFQDMSANGTSPIMQNLEVKSFSLEPDITVEKSPVVSCELRPSTFH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 GTGYRMSWTEPSNSSFQDMSANGTSPIMQNLEVKSFSLEPDITVEKSPVVSCELRPSTFH 520 530 540 550 560 570 640 650 660 670 680 690 mKIAA0 SQPDSSVLSLSGDEGNLASETLQKIQKAFSESGSDLHMVINHEQSSVTNTGEEVEFRDVT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 SQPDSSVLSLSGDEGNLASETLQKIQKAFSESGSDLHMVINHEQSSVTNTGEEVEFRDVT 580 590 600 610 620 630 700 710 720 730 740 750 mKIAA0 VTESKGHDGSCAGEEENCPSERNFSPDQSPEFAREADEECYSTQMKVECEGLHSETPKAD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 VTESKGHDGSCAGEEENCPSERNFSPDQSPEFAREADEECYSTQMKVECEGLHSETPKAD 640 650 660 670 680 690 760 770 780 790 800 810 mKIAA0 PLILQAFPGEEPAEEPQSPRNQLSTPSRGNENVGESAGASGAPGEDESTCSVAVLSKPRP :::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::: gi|123 PLILQAFPGEEPAEEPQSPRNQLSTPSRGNENGGESAGASGAPGEDESTCSVAVLSKPRP 700 710 720 730 740 750 820 830 840 850 860 870 mKIAA0 QRLSRQQSLVEKCDSVAPGALQVTEHGKVSDHIQWFNKLSLNEPNRGKVKSPLKFQRTPV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 QRLSRQQSLVEKCDSVAPGALQVTEHGKVSDHIQWFNKLSLNEPNRGKVKSPLKFQRTPV 760 770 780 790 800 810 880 890 900 910 920 930 mKIAA0 RQSVRRINSLLEYGRQPVRQKLAIFGDAASPLVKSVSCDSALPSCVQNTSKGPTAPHITS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: gi|123 RQSVRRINSLLEYGRQPVRQKLAIFGDAASPLVKSVSCDSALPSCVQNTSKGPTAPLITS 820 830 840 850 860 870 940 950 960 970 980 990 mKIAA0 GLEAQKSTSCNKSSVELTSKSFTKMKRHPDPLSASLGTPRLCKQENKSNGHIKFPLDDLT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 GLEAQKSTSCNKSSVELTSKSFTKMKRHPDPLSASLGTPRLCKQENKSNGHIKFPLDDLT 880 890 900 910 920 930 1000 1010 1020 1030 1040 mKIAA0 NHERLKFVVNNNVAFSPGMKNRVVRKPSEKERVWYKGSPKNPIGKTQLLPTSKPVDL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 NHERLKFVVNNNVAFSPGMKNRVVRKPSEKERVWYKGSPKNPIGKTQLLPTSKPVDL 940 950 960 970 980 >>gi|109468553|ref|XP_230459.4| PREDICTED: similar to Rh (994 aa) initn: 3876 init1: 3876 opt: 5724 Z-score: 6273.4 bits: 1172.4 E(): 0 Smith-Waterman score: 5724; 87.964% identity (95.587% similar) in 997 aa overlap (63-1049:1-994) 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 LRAFGKWKSWLVAKKVRTRSRPRRVGDVFGMWDQRLVRLALLQQLRAVYGIKVKGGRGQC :::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 MWDQRLVRLALLQQLRAVYGIKVKGGRGQC 10 20 30 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 DRRRHETAATEIKGKVFGVPFNSLPHSVVPEFGHIPSFLVDACASLKEHIHTEGLFRKSG ::::.:::::::.::.:::::::::::::::.:::::::::::.:::::::::::::::: gi|109 DRRRQETAATEIRGKIFGVPFNSLPHSVVPEYGHIPSFLVDACTSLKEHIHTEGLFRKSG 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 SVVRLKALKSKLDQGEACLSSALPCDVAGLLKQFFRELPEPVLPADLHEALFKAQQLGAE ::.::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 SVIRLKALKSKLDHGEACLSSALPCDVAGLLKQFFRELPEPVLPADLHEALFKAQQLGAE 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 ERNKATLLLSCLMANPTVDILRYFFNFLKSVSLRASENKMDSSNLAVIFAPNLLQTSEGH ::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 ERNKATLLLSCLMADPTVDVLRYFFNFLKSVSLRASENKMDSSNLAVIFAPNLLQTSEGH 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 EKMSANTEKKLRLQAAVVQTFIDCASDIGRVPDFILEKIPAMLGIDGLCTTPSLEGFEGD ::::::::::::::::::::.:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 EKMSANTEKKLRLQAAVVQTLIDYASDIGRVPDFILEKIPAMLGIDGLCTTPSLEGFEGD 220 230 240 250 260 270 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 FETPGECKRKRRQSVGDFVNGALNKLKSSRTPSITPQQDRTAQASASPLILTPSVKRKLP .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::::::: gi|109 YETPGECKRKRRQSVGDFVNGALNKLKSSRTPSITPQQDRTAQAPVSPLILTPSVKRKLP 280 290 300 310 320 330 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 GESSHAFSSKKRKSIKHNLNFELLPSHFFSSNSTPVSVHLDTSPDGSSQTSLSPIAMSGN ::.::..:::::::::.::::::::::.:::::::::::.::::.::::.:::::::::: gi|109 GETSHTLSSKKRKSIKNNLNFELLPSHLFSSNSTPVSVHFDTSPEGSSQSSLSPIAMSGN 340 350 360 370 380 390 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 HLVSTELRRSKRIASKKVYRVESGKAGCFSPKVSRKEKTRRSLRLKFSLGKNRDSDGCSV ::.::.:::::::::::::::::::::::::::.::::.:::::::::: :::::.:::: gi|109 HLTSTDLRRSKRIASKKVYRVESGKAGCFSPKVTRKEKVRRSLRLKFSLRKNRDSNGCSV 400 410 420 430 440 450 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 INRYENVGRRLANQQNLKSRIDSVKTGLLFSPDIDERLLKKGSEKISKSEEHLLTPDQLD :::.::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 INRHENVGRRLANQQNLKNRIESVKTGLLFSPDIDERLLKKGSEKISKSEEHLLTPDQLD 460 470 480 490 500 510 580 590 600 610 620 630 mKIAA0 GTGYRMSWTEPSNSSFQDMSANGTSPIMQNLEVKSFSLEPDITVEKSPVVSCELRPSTFH ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .::::::::::::::::::: gi|109 GTGYRMSWTEPSNSSFQDMSANGTSPIMQNLEVKSFSLESNITVEKSPVVSCELRPSTFH 520 530 540 550 560 570 640 650 660 670 680 690 mKIAA0 SQPDSSVL--SLSGDEGNLASETLQKIQKAFSESGSDLHMVINHEQSSVTNTGEEVEFRD :::.:::: :::::::::: :::::::::::::::::: ..:::::::::.::: : :: gi|109 SQPNSSVLGRSLSGDEGNLAFETLQKIQKAFSESGSDLHTAVNHEQSSVTNVGEEGESRD 580 590 600 610 620 630 700 710 720 730 740 750 mKIAA0 VTVTESKGHDGSCAGEEENCPSERNFSPDQSPEFAREADEECYSTQMKVECEGLHSETPK : .:::::::: .:..:: ::::.::.::::.::::.:::.:::::: ::.::::::. gi|109 V--SESKGHDGSYTGQDENYASERNLSPSQSPELAREASEECHSTQMKVGCESLHSETPR 640 650 660 670 680 760 770 780 790 800 mKIAA0 ADPLILQAFPGEEPAEEPQSPRNQL-STPSRGNENV-GESAGASGAPGEDE------STC :: :. ::::.:::..: ::: .:: .:::.:.::: :..:: :: :.. ::: gi|109 AD-LLQQAFPSEEPTKETQSPGSQLDTTPSQGDENVVEENSGACEAPEENDAQSLKQSTC 690 700 710 720 730 740 810 820 830 840 850 860 mKIAA0 SVAVLSKPRPQRLSRQQSLVEKCDSVAPGALQVTEHGKVSDHIQWFNKLSLNEPNRGKVK ::.:.:::: :::.::.::::::::..::. :.::::::::::::::::::::::::::: gi|109 SVTVISKPRAQRLARQRSLVEKCDSAVPGGPQMTEHGKVSDHIQWFNKLSLNEPNRGKVK 750 760 770 780 790 800 870 880 890 900 910 920 mKIAA0 SPLKFQRTPVRQSVRRINSLLEYGRQPVRQKLAIFGDAASPLVKSVSCDSALPSCVQNTS :::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:: gi|109 SPLKFQRTPVRQSVRRINSLLEYGRQPVRQKLAVFGDAASPLVKSVSCDSALPSCVQSTS 810 820 830 840 850 860 930 940 950 960 970 980 mKIAA0 KGPTAPHITSGLEAQKSTSCNKSSVELTSKSFTKMKRHPDPLSASLGTPRLCKQENKSNG ::: .:: :::::: :::.:::::::::::::::::::::.:::.: :::::::::. gi|109 KGPCVPHTKPGLEAQKCTSCDKSSVELTSKSFTKMKRHPDPLNASLATTRLCKQENKSDV 870 880 890 900 910 920 990 1000 1010 1020 1030 1040 mKIAA0 HIKFPLDDLTNHERLKFVVNNNVAFSPGMKNRVVRKPSEKERVWYKGSPKNPIGKTQLLP .:::::::::::.:::::::::: : ::.::::..:: :::::::::::::::::::::: gi|109 QIKFPLDDLTNHDRLKFVVNNNVDFPPGIKNRVLKKPLEKERVWYKGSPKNPIGKTQLLP 930 940 950 960 970 980 mKIAA0 TSKPVDL ::::::: gi|109 TSKPVDL 990 >>gi|26328453|dbj|BAC27965.1| unnamed protein product [M (648 aa) initn: 4249 init1: 4249 opt: 4249 Z-score: 4658.0 bits: 872.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 4249; 99.537% identity (99.537% similar) in 648 aa overlap (402-1049:1-648) 380 390 400 410 420 430 mKIAA0 RTAQASASPLILTPSVKRKLPGESSHAFSSKKRKSIKHNLNFELLPSHFFSSNSTPVSVH :::::::::::::::::::::::::::::: gi|263 KKRKSIKHNLNFELLPSHFFSSNSTPVSVH 10 20 30 440 450 460 470 480 490 mKIAA0 LDTSPDGSSQTSLSPIAMSGNHLVSTELRRSKRIASKKVYRVESGKAGCFSPKVSRKEKT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|263 LDTSPDGSSQTSLSPIAMSGNHLVSTELRRSKRIASKKVYRVESGKAGCFSPKVSRKEKT 40 50 60 70 80 90 500 510 520 530 540 550 mKIAA0 RRSLRLKFSLGKNRDSDGCSVINRYENVGRRLANQQNLKSRIDSVKTGLLFSPDIDERLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|263 RRSLRLKFSLGKNRDSDGCSVINRYENVGRRLANQQNLKSRIDSVKTGLLFSPDIDERLL 100 110 120 130 140 150 560 570 580 590 600 610 mKIAA0 KKGSEKISKSEEHLLTPDQLDGTGYRMSWTEPSNSSFQDMSANGTSPIMQNLEVKSFSLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|263 KKGSEKISKSEEHLLTPDQLDGTGYRMSWTEPSNSSFQDMSANGTSPIMQNLEVKSFSLE 160 170 180 190 200 210 620 630 640 650 660 670 mKIAA0 PDITVEKSPVVSCELRPSTFHSQPDSSVLSLSGDEGNLASETLQKIQKAFSESGSDLHMV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|263 PDITVEKSPVVSCELRPSTFHSQPDSSVLSLSGDEGNLASETLQKIQKAFSESGSDLHMV 220 230 240 250 260 270 680 690 700 710 720 730 mKIAA0 INHEQSSVTNTGEEVEFRDVTVTESKGHDGSCAGEEENCPSERNFSPDQSPEFAREADEE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|263 INHEQSSVTNTGEEVEFRDVTVTESKGHDGSCAGEEENCPSERNFSPDQSPEFAREADEE 280 290 300 310 320 330 740 750 760 770 780 790 mKIAA0 CYSTQMKVECEGLHSETPKADPLILQAFPGEEPAEEPQSPRNQLSTPSRGNENVGESAGA ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::: gi|263 CYSTQMKVECEGLHSETPKADPLILQAFPGEEPAEEPQSPRNQLSTPSRGNENGGESAGA 340 350 360 370 380 390 800 810 820 830 840 850 mKIAA0 SGAPGEDESTCSVAVLSKPRPQRLSRQQSLVEKCDSVAPGALQVTEHGKVSDHIQWFNKL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|263 RGAPGEDESTCSVAVLSKPRPQRLSRQQSLVEKCDSVAPGALQVTEHGKVSDHIQWFNKL 400 410 420 430 440 450 860 870 880 890 900 910 mKIAA0 SLNEPNRGKVKSPLKFQRTPVRQSVRRINSLLEYGRQPVRQKLAIFGDAASPLVKSVSCD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|263 SLNEPNRGKVKSPLKFQRTPVRQSVRRINSLLEYGRQPVRQKLAIFGDAASPLVKSVSCD 460 470 480 490 500 510 920 930 940 950 960 970 mKIAA0 SALPSCVQNTSKGPTAPHITSGLEAQKSTSCNKSSVELTSKSFTKMKRHPDPLSASLGTP ::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|263 SALPSCVQNTSKGPTAPLITSGLEAQKSTSCNKSSVELTSKSFTKMKRHPDPLSASLGTP 520 530 540 550 560 570 980 990 1000 1010 1020 1030 mKIAA0 RLCKQENKSNGHIKFPLDDLTNHERLKFVVNNNVAFSPGMKNRVVRKPSEKERVWYKGSP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|263 RLCKQENKSNGHIKFPLDDLTNHERLKFVVNNNVAFSPGMKNRVVRKPSEKERVWYKGSP 580 590 600 610 620 630 1040 mKIAA0 KNPIGKTQLLPTSKPVDL :::::::::::::::::: gi|263 KNPIGKTQLLPTSKPVDL 640 >>gi|114656186|ref|XP_510272.2| PREDICTED: Rho GTPase ac (1091 aa) initn: 3091 init1: 1624 opt: 3337 Z-score: 3654.4 bits: 687.9 E(): 7.6e-195 Smith-Waterman score: 4605; 67.493% identity (84.757% similar) in 1089 aa overlap (2-1049:10-1091) 10 20 30 40 50 mKIAA0 REAREKKVCVSGSRESGGRVPEVAGRQRSRAS--LRAFGKWKSWLVAKKVRT : . : : :.:.: :: ::. .. : :::::.::.: .. ::: gi|114 MCRPGVDVSEDQGKAVEVAGGR---GRRSARRGRKAAERSSNLRAFGNWKTWWRTR-VRT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 mKIAA0 RSRPRRVGDVFGMWDQRLVRLALLQQLRAVYGIKVKGGRGQCDRRRHETAATEIKGKVFG :.:: :: ::::::::::::::.::: ::::::: :::::::::::::::: ::.:: gi|114 CILPQRVIDVSGMWDQRLVRLALLQHLRAFYGIKVKGVRGQCDRRRHETAATEIGGKIFG 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 mKIAA0 VPFNSLPHSVVPEFGHIPSFLVDACASLKEHIHTEGLFRKSGSVVRLKALKSKLDQGEAC ::::.::::.:::.:::::::::::.::.:::::::::::::::.::::::.:.:.::.: gi|114 VPFNALPHSAVPEYGHIPSFLVDACTSLEEHIHTEGLFRKSGSVIRLKALKNKVDHGEGC 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 mKIAA0 LSSALPCDVAGLLKQFFRELPEPVLPADLHEALFKAQQLGAEERNKATLLLSCLMANPTV :::: :::.::::::::::::::.:::::::::.::::::.::.::::::::::.:. :: gi|114 LSSAPPCDIAGLLKQFFRELPEPILPADLHEALLKAQQLGTEEKNKATLLLSCLLADHTV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 mKIAA0 DILRYFFNFLKSVSLRASENKMDSSNLAVIFAPNLLQTSEGHEKMSANTEKKLRLQAAVV .::::::::..::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::: gi|114 HVLRYFFNFLRNVSLRSSENKMDSSNLAVIFAPNLLQTSEGHEKMSSNTEKKLRLQAAVV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 mKIAA0 QTFIDCASDIGRVPDFILEKIPAMLGIDGLCTTPSLEGFE-GDFETPGECKRKRRQSVGD ::.:: :::::::::::.:::::::::::::.:::::::: :..::::: :::::::::: gi|114 QTLIDYASDIGRVPDFIVEKIPAMLGIDGLCATPSLEGFEEGEYETPGEYKRKRRQSVGD 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 mKIAA0 FVNGALNKLKSSRTPSITPQQDRTAQASASPLILTPSVKRKLPGESSHAFSSKKRKSIKH ::.:::::.: .:::::::::.: :: : ::.::::..::::: .:::.::::::::::: gi|114 FVSGALNKFKPNRTPSITPQQERIAQLSESPVILTPNAKRKLPVDSSHGFSSKKRKSIKH 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 mKIAA0 NLNFELLPSHFFSSNSTPVSVHLDTSPDGSSQTSLSPIAMSGNHLVSTEL-RRSKRIASK :.:::::::..:.:.:::::::.::: .::::.::::. ..::::... . :::::::.: gi|114 NFNFELLPSNLFNSSSTPVSVHIDTSSEGSSQSSLSPVLIGGNHLITAGVPRRSKRIAGK 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 mKIAA0 KVYRVESGKAGCFSPKVSRKEKTRRSLRLKFSLGKN-RDSDGCSVINRYENVGRRLANQQ :: :::::::::::::.:::::.::::::::.:::: :: .::: .::::.:: :::::: gi|114 KVCRVESGKAGCFSPKISRKEKVRRSLRLKFNLGKNGRDVNGCSGVNRYESVGWRLANQQ 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 mKIAA0 NLKSRIDSVKTGLLFSPDIDERLLKKGSEKISKSEEHLLTPDQLDGTGYRMSWTEPSNSS .::.::.:::::::::::.::.: :::::::::::: ::::..: ::.:::::: :.::: gi|114 SLKNRIESVKTGLLFSPDVDEKLPKKGSEKISKSEETLLTPERLVGTNYRMSWTGPNNSS 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 mKIAA0 FQDMSANGTSPIMQNLEVKSFSLEPDITVEKSPVVSCELRPSTFHSQPDSSVLS--LSGD ::...:: .: ...::::.. :::::: :::::..:::: ::..... .:.. : :::: gi|114 FQEVDANEASSMVENLEVEN-SLEPDIMVEKSPATSCELTPSNLNNKHNSNITSSPLSGD 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 mKIAA0 EGNLASETLQKIQKAFSESGSDLHMVINHEQSSVTNTG--------------EEVEFR-- :.:...::: :.:::::::::.:: ..:..::::::.: :: :. gi|114 ENNVTKETLVKVQKAFSESGSNLHALMNQRQSSVTNVGKVKLTEPSYLEDSPEENLFETN 660 670 680 690 700 710 690 700 710 720 730 740 mKIAA0 DVTVTESKGHDGSCAGEEENCPSERNFSPDQSPEFAREADEECYSTQMKVECE-GLHSET :.:..::: . .:. :.: :::.::: :. : ::. .:::::::.: : .::. gi|114 DLTIVESKEKYEHHTGKGEKCFSERDFSPLQTQTFNRETTIKCYSTQMKMEHEKDIHSNM 720 730 740 750 760 770 750 760 770 780 790 mKIAA0 PKADPLILQAFPGEEPAEEPQSPRNQLSTPSRGNENVGESA-GASGAPGEDE-------- :: : : : : ..: .. :::...:.. . :::. :. .: ..:: gi|114 PK-DYLSKQEFSSDEEIKKQQSPKDKLNNKLKENENMMEGNLPKCAAHSKDEARSSFSQQ 780 790 800 810 820 830 800 810 820 830 840 850 mKIAA0 STCSVAVLSKPRPQRLSRQQSLVEKCDSVAPGALQVTEHGKVSDHIQWFNKLSLNEPNRG ::: :. ::::::.:...:::: : :.... . :.::: ::::::::::::::::::: gi|114 STCVVTNLSKPRPMRIAKQQSL-ETCEKTVSESSQMTEHRKVSDHIQWFNKLSLNEPNRI 840 850 860 870 880 890 860 870 880 890 900 910 mKIAA0 KVKSPLKFQRTPVRQSVRRINSLLEYGRQPVRQKLAIFGDAASPLVKSVSCDSALPSCVQ ::::::::::::::::::::::::::.:::. .::: .::.:::::::::::.:: ::.. gi|114 KVKSPLKFQRTPVRQSVRRINSLLEYSRQPTGHKLASLGDTASPLVKSVSCDGALSSCIE 900 910 920 930 940 950 920 930 940 950 960 970 mKIAA0 NTSKGPTAPHITSGLEAQKSTSC--------NKSSVELTSKSFTKMKRHPDPLSASLGTP ..:: .. : :: . ::: :: .:::.:: :::: ::..::: ..::: . gi|114 SASKDSSVSCIKSGPKEQKSMSCEESNIGAISKSSMELPSKSFLKMRKHPDSVNASLRST 960 970 980 990 1000 1010 980 990 1000 1010 1020 1030 mKIAA0 RLCKQENKSNGHIKFPLDDLTNHERLKFVVNNNVAFSPGMKNRVVRKPSEKERVWYKGSP . ::. :.:..: ::::::::. .: :::::...: :..:::.:.:::. :.:::::: gi|114 TVYKQKILSDGQVKVPLDDLTNHDIVKPVVNNNMGISSGINNRVLRRPSERGRAWYKGSP 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1040 mKIAA0 KNPIGKTQLLPTSKPVDL :.:::::::::::::::: gi|114 KHPIGKTQLLPTSKPVDL 1080 1090 >>gi|109080507|ref|XP_001084475.1| PREDICTED: similar to (1289 aa) initn: 2996 init1: 1587 opt: 3252 Z-score: 3560.1 bits: 670.7 E(): 1.4e-189 Smith-Waterman score: 4571; 66.942% identity (84.481% similar) in 1089 aa overlap (2-1049:208-1289) 10 20 30 mKIAA0 REAREKKVCVSGSRESGGRVPEVAGRQRSRA : . : : :.: : :: ::. .. gi|109 TKTGSCRPPSGVLILKRGVDQSDVERLDVSEDQGKAVEVAGVR---GRRSARRGRKAAER 180 190 200 210 220 230 40 50 60 70 80 mKIAA0 S--LRAFGKWKSWLVAKKVRTRSRPRRVGDVFGMWDQRLVRLALLQQLRAVYGIKVKGGR : :::::.::.: .. : : :.:. :: ::::::::::::::.::: ::::::: : gi|109 SSDLRAFGNWKTWWRTR-VGTCVLPQRAIDVSGMWDQRLVRLALLQHLRAFYGIKVKGVR 240 250 260 270 280 290 90 100 110 120 130 140 mKIAA0 GQCDRRRHETAATEIKGKVFGVPFNSLPHSVVPEFGHIPSFLVDACASLKEHIHTEGLFR ::::::::::::::: ::.::::::.::::.:::.:::::::::::.::.:::::::::: gi|109 GQCDRRRHETAATEIGGKIFGVPFNALPHSAVPEYGHIPSFLVDACTSLEEHIHTEGLFR 300 310 320 330 340 350 150 160 170 180 190 200 mKIAA0 KSGSVVRLKALKSKLDQGEACLSSALPCDVAGLLKQFFRELPEPVLPADLHEALFKAQQL :::::.::::::.:::.::.::::: ::::::::: ::::::::.:::::::::.::::: gi|109 KSGSVIRLKALKNKLDRGEGCLSSAPPCDVAGLLKLFFRELPEPILPADLHEALLKAQQL 360 370 380 390 400 410 210 220 230 240 250 260 mKIAA0 GAEERNKATLLLSCLMANPTVDILRYFFNFLKSVSLRASENKMDSSNLAVIFAPNLLQTS :.::.::::::::::.:. :: .::::::::..::::.:::::::::::::::::::::. gi|109 GTEEKNKATLLLSCLLADHTVHVLRYFFNFLRNVSLRSSENKMDSSNLAVIFAPNLLQTN 420 430 440 450 460 470 270 280 290 300 310 320 mKIAA0 EGHEKMSANTEKKLRLQAAVVQTFIDCASDIGRVPDFILEKIPAMLGIDGLCTTPSLEGF :::::: .:::::::::::::::.:: :::::::::::::::::::::::::.::::: : gi|109 EGHEKMFSNTEKKLRLQAAVVQTLIDDASDIGRVPDFILEKIPAMLGIDGLCATPSLEDF 480 490 500 510 520 530 330 340 350 360 370 380 mKIAA0 E-GDFETPGECKRKRRQSVGDFVNGALNKLKSSRTPSITPQQDRTAQASASPLILTPSVK : :..::::: ::::::::::::.:::::.::.:::::::::.: :: :.::.::::..: gi|109 EEGEYETPGEYKRKRRQSVGDFVSGALNKFKSNRTPSITPQQERIAQLSVSPVILTPNAK 540 550 560 570 580 590 390 400 410 420 430 440 mKIAA0 RKLPGESSHAFSSKKRKSIKHNLNFELLPSHFFSSNSTPVSVHLDTSPDGSSQTSLSPIA :::: .:::.:::::::.::::.:::::::..:.:.:::::::.::. .::::.::::. gi|109 RKLPVDSSHGFSSKKRKAIKHNFNFELLPSNLFNSSSTPVSVHIDTNSEGSSQSSLSPVP 600 610 620 630 640 650 450 460 470 480 490 500 mKIAA0 MSGNHLVSTEL-RRSKRIASKKVYRVESGKAGCFSPKVSRKEKTRRSLRLKFSLGKN-RD .::::... :::::::.::: :::::::::::::.:.:::.::::::::.:::: :: gi|109 SGGNHLITAGAPRRSKRIAGKKVCRVESGKAGCFSPKLSHKEKVRRSLRLKFNLGKNGRD 660 670 680 690 700 710 510 520 530 540 550 560 mKIAA0 SDGCSVINRYENVGRRLANQQNLKSRIDSVKTGLLFSPDIDERLLKKGSEKISKSEEHLL .::: ..:::.::.::::::.::.::.:::::::::::.::.: ::::.:::::::.:: gi|109 VNGCSGVSRYESVGQRLANQQSLKNRIESVKTGLLFSPDVDEKLPKKGSQKISKSEENLL 720 730 740 750 760 770 570 580 590 600 610 620 mKIAA0 TPDQLDGTGYRMSWTEPSNSSFQDMSANGTSPIMQNLEVKSFSLEPDITVEKSPVVSCEL : ..: ::.:::::: :.:::::....: .: ...::::.. :::::. :::::..:::: gi|109 TLERLVGTNYRMSWTGPNNSSFQEVDTNEASSMVENLEVEN-SLEPDVMVEKSPATSCEL 780 790 800 810 820 830 630 640 650 660 670 680 mKIAA0 RPSTFHSQPDSSVLS--LSGDEGNLASETLQKIQKAFSESGSDLHMVINHEQSSVTNTG- ::...:. .:.. : :::::.:...::: :.:::::::::.:: ..: .:::: :.: gi|109 IPSNLNSKHNSNITSSPLSGDENNVTKETLVKVQKAFSESGSNLHALLNDRQSSVPNVGK 840 850 860 870 880 890 690 700 710 720 mKIAA0 -------------EEVEFR--DVTVTESKGHDGSCAGEEENCPSERNFSPDQSPEFAREA :: :. :.::.::: . .:. :.: :::.::: .. : ::: gi|109 VKLTEPSYLEDSPEENLFETNDLTVVESKEKYEHHTGKGEKCFSERDFSPLKTQTFDREA 900 910 920 930 940 950 730 740 750 760 770 780 mKIAA0 DEECYSTQMKVECE-GLHSETPKADPLILQAFPGEEPAEEPQSPRNQLSTPSRGNENVGE .:::::::.: : .::. :: : : . ::..: .. :::. .:.. . :::. : gi|109 TIKCYSTQMKMEHEKDIHSNMPK-DYLSKEEFPSDEQIKKQQSPKVKLNNKLKENENMIE 960 970 980 990 1000 1010 790 800 810 820 830 mKIAA0 ---------SAGASGAPGEDESTCSVAVLSKPRPQRLSRQQSLVEKCDSVAPGALQVTEH : . : ..::: .. ::::::.:...:::: : :.... .::.::: gi|109 GNLPKYAAHSKDKTRASFSQQSTCVITNLSKPRPMRIAKQQSL-ETCEKTVSESLQMTEH 1020 1030 1040 1050 1060 1070 840 850 860 870 880 890 mKIAA0 GKVSDHIQWFNKLSLNEPNRGKVKSPLKFQRTPVRQSVRRINSLLEYGRQPVRQKLAIFG ::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::.:::. .::: .: gi|109 RKVSDHIQWFNKLSLNEPNRTKVKSPLKFQRTPVRQSVRRINSLLEYSRQPIGHKLASLG 1080 1090 1100 1110 1120 1130 900 910 920 930 940 950 mKIAA0 DAASPLVKSVSCDSALPSCVQNTSKGPTAPHITSGLEAQKSTSC--------NKSSVELT :.:::::::::::.:: ::...::. .. : :: . .:: :: .:::.:: gi|109 DTASPLVKSVSCDGALSSCMESTSNDSSVSCIESGPKERKSMSCEESNIDAISKSSMELP 1140 1150 1160 1170 1180 1190 960 970 980 990 1000 1010 mKIAA0 SKSFTKMKRHPDPLSASLGTPRLCKQENKSNGHIKFPLDDLTNHERLKFVVNNNVAFSPG :::: :::.::: ..::::. .:::. :.:..:.::::::::. :: :::::...: : gi|109 SKSFLKMKKHPDSVNASLGSTTVCKQKMLSDGQVKLPLDDLTNHDILKPVVNNNIGISSG 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1020 1030 1040 mKIAA0 MKNRVVRKPSEKERVWYKGSPKNPIGKTQLLPTSKPVDL ..:::.:.:::.::.:::::::.:::::::::::::::: gi|109 INNRVLRRPSERERAWYKGSPKHPIGKTQLLPTSKPVDL 1260 1270 1280 >>gi|148695912|gb|EDL27859.1| Rho GTPase activating prot (553 aa) initn: 3208 init1: 3208 opt: 3226 Z-score: 3536.7 bits: 665.1 E(): 2.7e-188 Smith-Waterman score: 3226; 97.830% identity (98.619% similar) in 507 aa overlap (1-507:36-541) 10 20 30 mKIAA0 REAREKKVCVSGSRESGGRVPEVAGRQRSR : :::. .: : .:::::::::::::: gi|148 ESEGKGKFVEVTDRAERPGKKAGGSETRVKRGAREEGLCKWIER-NGGRVPEVAGRQRSR 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 ASLRAFGKWKSWLVAKKVRTRSRPRRVGDVFGMWDQRLVRLALLQQLRAVYGIKVKGGRG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 ASLRAFGKWKSWLVAKKVRTRSRPRRVGDVFGMWDQRLVRLALLQQLRAVYGIKVKGGRG 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 QCDRRRHETAATEIKGKVFGVPFNSLPHSVVPEFGHIPSFLVDACASLKEHIHTEGLFRK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::: gi|148 QCDRRRHETAATEIKGKVFGVPFNSLPHSVVPEFGHIPSFLVDACTSLKEHIHTEGLFRK 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 SGSVVRLKALKSKLDQGEACLSSALPCDVAGLLKQFFRELPEPVLPADLHEALFKAQQLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 SGSVVRLKALKSKLDQGEACLSSALPCDVAGLLKQFFRELPEPVLPADLHEALFKAQQLG 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 AEERNKATLLLSCLMANPTVDILRYFFNFLKSVSLRASENKMDSSNLAVIFAPNLLQTSE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 AEERNKATLLLSCLMANPTVDILRYFFNFLKSVSLRASENKMDSSNLAVIFAPNLLQTSE 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 GHEKMSANTEKKLRLQAAVVQTFIDCASDIGRVPDFILEKIPAMLGIDGLCTTPSLEGFE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 GHEKMSANTEKKLRLQAAVVQTFIDCASDIGRVPDFILEKIPAMLGIDGLCTTPSLEGFE 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 GDFETPGECKRKRRQSVGDFVNGALNKLKSSRTPSITPQQDRTAQASASPLILTPSVKRK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 GDFETPGECKRKRRQSVGDFVNGALNKLKSSRTPSITPQQDRTAQASASPLILTPSVKRK 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 LPGESSHAFSSKKRKSIKHNLNFELLPSHFFSSNSTPVSVHLDTSPDGSSQTSLSPIAMS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 LPGESSHAFSSKKRKSIKHNLNFELLPSHFFSSNSTPVSVHLDTSPDGSSQTSLSPIAMS 430 440 450 460 470 480 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 GNHLVSTELRRSKRIASKKVYRVESGKAGCFSPKVSRKEKTRRSLRLKFSLGKNRDSDGC ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|148 GNHLVSTELRRSKRIASKKVYRVESGKAGCFSPKVSRKEKTRRSLRLKFSLGKNRDSAQK 490 500 510 520 530 540 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 SVINRYENVGRRLANQQNLKSRIDSVKTGLLFSPDIDERLLKKGSEKISKSEEHLLTPDQ gi|148 RSANLRNTC 550 >>gi|123858300|emb|CAM16572.1| Rho GTPase activating pro (498 aa) initn: 3206 init1: 3206 opt: 3206 Z-score: 3515.4 bits: 661.0 E(): 4.2e-187 Smith-Waterman score: 3206; 99.797% identity (100.000% similar) in 493 aa overlap (63-555:1-493) 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 LRAFGKWKSWLVAKKVRTRSRPRRVGDVFGMWDQRLVRLALLQQLRAVYGIKVKGGRGQC :::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 MWDQRLVRLALLQQLRAVYGIKVKGGRGQC 10 20 30 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 DRRRHETAATEIKGKVFGVPFNSLPHSVVPEFGHIPSFLVDACASLKEHIHTEGLFRKSG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 DRRRHETAATEIKGKVFGVPFNSLPHSVVPEFGHIPSFLVDACASLKEHIHTEGLFRKSG 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 SVVRLKALKSKLDQGEACLSSALPCDVAGLLKQFFRELPEPVLPADLHEALFKAQQLGAE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 SVVRLKALKSKLDQGEACLSSALPCDVAGLLKQFFRELPEPVLPADLHEALFKAQQLGAE 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 ERNKATLLLSCLMANPTVDILRYFFNFLKSVSLRASENKMDSSNLAVIFAPNLLQTSEGH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 ERNKATLLLSCLMANPTVDILRYFFNFLKSVSLRASENKMDSSNLAVIFAPNLLQTSEGH 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 EKMSANTEKKLRLQAAVVQTFIDCASDIGRVPDFILEKIPAMLGIDGLCTTPSLEGFEGD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 EKMSANTEKKLRLQAAVVQTFIDCASDIGRVPDFILEKIPAMLGIDGLCTTPSLEGFEGD 220 230 240 250 260 270 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 FETPGECKRKRRQSVGDFVNGALNKLKSSRTPSITPQQDRTAQASASPLILTPSVKRKLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 FETPGECKRKRRQSVGDFVNGALNKLKSSRTPSITPQQDRTAQASASPLILTPSVKRKLP 280 290 300 310 320 330 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 GESSHAFSSKKRKSIKHNLNFELLPSHFFSSNSTPVSVHLDTSPDGSSQTSLSPIAMSGN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 GESSHAFSSKKRKSIKHNLNFELLPSHFFSSNSTPVSVHLDTSPDGSSQTSLSPIAMSGN 340 350 360 370 380 390 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 HLVSTELRRSKRIASKKVYRVESGKAGCFSPKVSRKEKTRRSLRLKFSLGKNRDSDGCSV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 HLVSTELRRSKRIASKKVYRVESGKAGCFSPKVSRKEKTRRSLRLKFSLGKNRDSDGCSV 400 410 420 430 440 450 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 INRYENVGRRLANQQNLKSRIDSVKTGLLFSPDIDERLLKKGSEKISKSEEHLLTPDQLD ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. gi|123 INRYENVGRRLANQQNLKSRIDSVKTGLLFSPDIDERLLKKGTFTQYC 460 470 480 490 580 590 600 610 620 630 mKIAA0 GTGYRMSWTEPSNSSFQDMSANGTSPIMQNLEVKSFSLEPDITVEKSPVVSCELRPSTFH >>gi|119361641|sp|Q6P4F7.2|RHGBA_HUMAN RecName: Full=Rho (1023 aa) initn: 3040 init1: 1577 opt: 3189 Z-score: 3492.4 bits: 657.8 E(): 8e-186 Smith-Waterman score: 4457; 68.519% identity (86.062% similar) in 1026 aa overlap (63-1049:1-1023) 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 LRAFGKWKSWLVAKKVRTRSRPRRVGDVFGMWDQRLVRLALLQQLRAVYGIKVKGGRGQC :::::::::::::.::: ::::::: :::: gi|119 MWDQRLVRLALLQHLRAFYGIKVKGVRGQC 10 20 30 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 DRRRHETAATEIKGKVFGVPFNSLPHSVVPEFGHIPSFLVDACASLKEHIHTEGLFRKSG :::::::::::: ::.::::::.::::.:::.:::::::::::.::..:::::::::::: gi|119 DRRRHETAATEIGGKIFGVPFNALPHSAVPEYGHIPSFLVDACTSLEDHIHTEGLFRKSG 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 SVVRLKALKSKLDQGEACLSSALPCDVAGLLKQFFRELPEPVLPADLHEALFKAQQLGAE ::.::::::.:.:.::.::::: :::.::::::::::::::.:::::::::.::::::.: gi|119 SVIRLKALKNKVDHGEGCLSSAPPCDIAGLLKQFFRELPEPILPADLHEALLKAQQLGTE 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 ERNKATLLLSCLMANPTVDILRYFFNFLKSVSLRASENKMDSSNLAVIFAPNLLQTSEGH :.::::::::::.:. :: .::::::::..::::.::::::::::::::::::::::::: gi|119 EKNKATLLLSCLLADHTVHVLRYFFNFLRNVSLRSSENKMDSSNLAVIFAPNLLQTSEGH 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 mKIAA0 EKMSANTEKKLRLQAAVVQTFIDCASDIGRVPDFILEKIPAMLGIDGLCTTPSLEGFE-G ::::.:::::::::::::::.:: :::::::::::::::::::::::::.:::::::: : gi|119 EKMSSNTEKKLRLQAAVVQTLIDYASDIGRVPDFILEKIPAMLGIDGLCATPSLEGFEEG 220 230 240 250 260 270 340 350 360 370 380 390 mKIAA0 DFETPGECKRKRRQSVGDFVNGALNKLKSSRTPSITPQQDRTAQASASPLILTPSVKRKL ..::::: ::::::::::::.:::::.: .::::::::..: :: : ::.::::..:: : gi|119 EYETPGEYKRKRRQSVGDFVSGALNKFKPNRTPSITPQEERIAQLSESPVILTPNAKRTL 280 290 300 310 320 330 400 410 420 430 440 450 mKIAA0 PGESSHAFSSKKRKSIKHNLNFELLPSHFFSSNSTPVSVHLDTSPDGSSQTSLSPIAMSG : .:::.::::::::::::.:::::::..:.:.:::::::.::: .::::.::::. ..: gi|119 PVDSSHGFSSKKRKSIKHNFNFELLPSNLFNSSSTPVSVHIDTSSEGSSQSSLSPVLIGG 340 350 360 370 380 390 460 470 480 490 500 mKIAA0 NHLVSTEL-RRSKRIASKKVYRVESGKAGCFSPKVSRKEKTRRSLRLKFSLGKN-RDSDG :::... . :::::::.::: :::::::::::::.:.:::.::::::::.:::: :. .: gi|119 NHLITAGVPRRSKRIAGKKVCRVESGKAGCFSPKISHKEKVRRSLRLKFNLGKNGREVNG 400 410 420 430 440 450 510 520 530 540 550 560 mKIAA0 CSVINRYENVGRRLANQQNLKSRIDSVKTGLLFSPDIDERLLKKGSEKISKSEEHLLTPD :: .::::.:: ::::::.::.::.:::::::::::.::.: :::::::::::: ::::. gi|119 CSGVNRYESVGWRLANQQSLKNRIESVKTGLLFSPDVDEKLPKKGSEKISKSEETLLTPE 460 470 480 490 500 510 570 580 590 600 610 620 mKIAA0 QLDGTGYRMSWTEPSNSSFQDMSANGTSPIMQNLEVKSFSLEPDITVEKSPVVSCELRPS .: ::.:::::: :.:::::...:: .: ...::::.. :::::: :::::..:::: :: gi|119 RLVGTNYRMSWTGPNNSSFQEVDANEASSMVENLEVEN-SLEPDIMVEKSPATSCELTPS 520 530 540 550 560 630 640 650 660 670 680 mKIAA0 TFHSQPDSSVLS--LSGDEGNLASETLQKIQKAFSESGSDLHMVINHEQSSVTNTG---- ..... .:.. : :::::.:...::: :.:::::::::.:: ..:..::::::.: gi|119 NLNNKHNSNITSSPLSGDENNMTKETLVKVQKAFSESGSNLHALMNQRQSSVTNVGKVKL 570 580 590 600 610 620 690 700 710 720 730 mKIAA0 ----------EEVEFR--DVTVTESKGHDGSCAGEEENCPSERNFSPDQSPEFAREADEE :: :. :.:..::: . .:. :.: :::.::: :. : ::. . gi|119 TEPSYLEDSPEENLFETNDLTIVESKEKYEHHTGKGEKCFSERDFSPLQTQTFNRETTIK 630 640 650 660 670 680 740 750 760 770 780 mKIAA0 CYSTQMKVECE-GLHSETPKADPLILQAFPGEEPAEEPQSPRNQLSTPSRGNENVGESA- :::::::.: : .::. :: : : : : ..: .. :::...:.. . :::. :. gi|119 CYSTQMKMEHEKDIHSNMPK-DYLSKQEFSSDEEIKKQQSPKDKLNNKLKENENMMEGNL 690 700 710 720 730 740 790 800 810 820 830 840 mKIAA0 GASGAPGEDE--------STCSVAVLSKPRPQRLSRQQSLVEKCDSVAPGALQVTEHGKV .: ..:: ::: :. ::::::.:...:::: : :.... . :.::: :: gi|119 PKCAAHSKDEARSSFSQQSTCVVTNLSKPRPMRIAKQQSL-ETCEKTVSESSQMTEHRKV 750 760 770 780 790 800 850 860 870 880 890 900 mKIAA0 SDHIQWFNKLSLNEPNRGKVKSPLKFQRTPVRQSVRRINSLLEYGRQPVRQKLAIFGDAA ::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::.:::. .::: .::.: gi|119 SDHIQWFNKLSLNEPNRIKVKSPLKFQRTPVRQSVRRINSLLEYSRQPTGHKLASLGDTA 810 820 830 840 850 860 910 920 930 940 950 mKIAA0 SPLVKSVSCDSALPSCVQNTSKGPTAPHITSGLEAQKSTSC--------NKSSVELTSKS ::::::::::.:: ::....:: .. : :: . ::: :: .:::.:: ::: gi|119 SPLVKSVSCDGALSSCIESASKDSSVSCIKSGPKEQKSMSCEESNIGAISKSSMELPSKS 870 880 890 900 910 920 960 970 980 990 1000 1010 mKIAA0 FTKMKRHPDPLSASLGTPRLCKQENKSNGHIKFPLDDLTNHERLKFVVNNNVAFSPGMKN : ::..::: ..::: . . ::. :.:..: ::::::::. .: :::::...: :..: gi|119 FLKMRKHPDSVNASLRSTTVYKQKILSDGQVKVPLDDLTNHDIVKPVVNNNMGISSGINN 930 940 950 960 970 980 1020 1030 1040 mKIAA0 RVVRKPSEKERVWYKGSPKNPIGKTQLLPTSKPVDL ::.:.:::. :.:::::::.:::::::::::::::: gi|119 RVLRRPSERGRAWYKGSPKHPIGKTQLLPTSKPVDL 990 1000 1010 1020 1049 residues in 1 query sequences 2727779818 residues in 7921681 library sequences Tcomplib [34.26] (2 proc) start: Thu Mar 12 11:46:32 2009 done: Thu Mar 12 11:55:43 2009 Total Scan time: 1198.450 Total Display time: 0.530 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]