FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1481.ptfa, 1726 aa vs ./tmplib.26680 library 1767291 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.6348+/-0.0092; mu= -16.8750+/- 0.607 mean_var=471.0542+/-114.291, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0591 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1202 ( 1395 res) mia20043 (1395) 762 81 2.8e-15 >>mKIAA1202 ( 1395 res) mia20043 (1395 aa) initn: 916 init1: 350 opt: 762 Z-score: 366.7 bits: 80.6 E(): 2.8e-15 Smith-Waterman score: 769; 26.090% identity (31.523% ungapped) in 1468 aa overlap (339-1690:65-1395) 310 320 330 340 350 360 mKIAA1 ENEDSSLKRHITPPHGHSPYPSERKNIHGGSRACSNHHSLSSPQAQALHVGDDRRPSRLS :: ::...: : . ..:. .:. mKIAA1 TTMHFPSEAFSLSWHSGCNTSDVSVQWCPLSRHCSTEKSSSIGSMESLE-----QPG--- 40 50 60 70 80 370 380 390 400 410 420 mKIAA1 QP-WEGDFQE-DHNANLRQKVEREGQGQGLSGNSGRTRSAFSSLQNIPESLRRQSNVELG :: .:: . 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