# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mpf00724.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0296.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0296, 1541 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7897517 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9915+/-0.000196; mu= 16.7124+/- 0.011 mean_var=93.8545+/-17.935, 0's: 23 Z-trim: 164 B-trim: 381 in 2/66 Lambda= 0.132387 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|46249439|gb|AAH68300.1| Zinc finger protein 646 (1788) 10818 2078.1 0 gi|109459461|ref|XP_219364.4| PREDICTED: similar t (1786) 9609 1847.2 0 gi|26347345|dbj|BAC37321.1| unnamed protein produc (1104) 6075 1172.0 0 gi|194678615|ref|XP_001252298.2| PREDICTED: simila (1815) 3875 752.0 9.3e-214 gi|14548316|sp|O15015.1|ZN646_HUMAN RecName: Full= (1829) 3745 727.2 2.8e-206 gi|215820619|ref|NP_055514.3| zinc finger protein (1832) 3745 727.2 2.8e-206 gi|119572556|gb|EAW52171.1| zinc 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|462 GKAFRLRKQLANHQRVHAERRRSRGTQKLTREDRPFRCGQCGRTYRHAGSLMNHQCNPEA 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1060 1070 1080 1090 1100 1110 mKIAA0 SRYSCPFCFKTYSNRTALKDHQRVHSDSQQRRQSGCPQRAAAVRCTLCGCGFSGQGSLEQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|462 SRYSCPFCFKTYSNRTALKDHQRVHSDSQQRRQSGCPQRAAAVRCTLCGCGFSGQGSLEQ 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1120 1130 1140 1150 1160 1170 mKIAA0 HLQEHEDTKLEVASGQGGQHATEGSEENLDDWGLEGRSDGTEVLQVEHETKRPGGHSQSP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|462 HLQEHEDTKLEVASGQGGQHATEGSEENLDDWGLEGRSDGTEVLQVEHETKRPGGHSQSP 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1180 1190 1200 1210 1220 1230 mKIAA0 SSPACSGGTESTQQVGKVDGSQGDRGQMNHNGAWVLQDQLTKPEGKLEDTVSRNPCHLSE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|462 SSPACSGGTESTQQVGKVDGSQGDRGQMNHNGAWVLQDQLTKPEGKLEDTVSRNPCHLSE 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1240 1250 1260 1270 1280 1290 mKIAA0 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