# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mpf00636.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1924.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1924, 1782 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7911123 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4538+/-0.000189; mu= 14.6327+/- 0.011 mean_var=83.2655+/-16.376, 0's: 27 Z-trim: 78 B-trim: 339 in 3/64 Lambda= 0.140553 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|190431668|sp|Q6ZPG2.2|WDR90_MOUSE RecName: Full (1874) 12076 2459.9 0 gi|109487922|ref|XP_213271.4| PREDICTED: similar t (1873) 10965 2234.6 0 gi|194219432|ref|XP_001497125.2| PREDICTED: WD rep (1980) 6929 1416.3 0 gi|73959831|ref|XP_537020.2| PREDICTED: similar to (1822) 6724 1374.7 0 gi|148690521|gb|EDL22468.1| mCG17671, isoform CRA_ ( 978) 6517 1332.5 0 gi|148690520|gb|EDL22467.1| mCG17671, isoform CRA_ (1680) 5745 1176.1 0 gi|190431650|sp|A0JP70.1|WDR90_XENTR RecName: Full 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