FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1395.ptfa, 1930 aa vs ./tmplib.26680 library 1767087 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2743+/-0.00487; mu= 19.5901+/- 0.326 mean_var=117.7836+/-26.965, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1182 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1771 ( 727 res) mbg08859a ( 727) 3521 612 1.5e-175 mFLJ00346 ( 1128 res) mph03762 (1128) 3156 550 1e-156 mKIAA0694 ( 1816 res) mbg08921 (1816) 1319 237 2.7e-62 mKIAA1058 ( 2072 res) mbf00778 (2072) 1136 206 7.2e-53 mKIAA0209 ( 1567 res) mth00856 (1567) 231 52 1.7e-06 >>mKIAA1771 ( 727 res) mbg08859a (727 aa) initn: 3596 init1: 3463 opt: 3521 Z-score: 3244.2 bits: 612.3 E(): 1.5e-175 Smith-Waterman score: 3521; 78.306% identity (79.607% ungapped) in 673 aa overlap (1269-1930:1-673) 1240 1250 1260 1270 1280 1290 mKIAA1 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.::.:. ::::.. :: . .: .:.. . .:: : . . . mKIAA0 TFVVSTVNTQDPHVNAFFRQCQK----------REKDMSQSPTSSFVRACKNLLNVDKIH 500 510 520 530 540 770 780 790 800 810 820 mKIAA1 PLVAFSHLVLDKLVRLVVRPPIICGQMVNLGRGAFEAMAHVASLVHRNLEAVQDSRGHCP ...: ..:..: ...:. .. .. . ...: ... :. : .. : mKIAA0 SIMSFLPIILNQLFKILVQ-----NEEDEITATVTRVLADIVAKCHE--EQLDHS----- 550 560 570 580 590 830 840 850 860 870 880 mKIAA1 LLASYVHYAFRLPGGDLSLPGEAPPATVQAATLARGSGRPASLYLARSKSISSSNPDLAV . ::....:. .:: . mKIAA0 -VQSYIKFVFK------------------------------------TKSYKER------ 600 610 890 900 910 920 930 940 mKIAA1 VPGSVDDEVSRILASKGVDRSHSWVNSAYAPGGSKAVLRRVPPYCGADPRQLLHEELALQ .. .:... :.. ::. mKIAA0 ---TIHEELAKNLSD------------------------------------LLKS----- 620 630 950 960 970 980 990 1000 mKIAA1 WVVSGSAVRELVLQHAWFFFQLMVKSMELHLLLGQRLDTPRKLRFPGRFLDDIAALVASV . :.. . ::.:.:::: ...::: ::. .... :: ::: . ... :: .. mKIAA0 ---NDSTIVKHVLEHSWFFFAIILKSMAQHLIDTNKIQLPRAQRFPESYQSELDNLVMGL 640 650 660 670 680 1010 1020 1030 1040 1050 1060 mKIAA1 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