FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0239.ptfa, 842 aa vs ./tmplib.26680 library 1768175 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8000+/-0.00761; mu= 1.2195+/- 0.505 mean_var=333.9458+/-80.298, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 20 in 1/35 Lambda= 0.0702 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0215 ( 822 res) mpm10302 ( 822) 1755 192 2.7e-49 mKIAA1807 ( 850 res) mpm10336 ( 850) 1487 165 4.1e-41 mKIAA0876 ( 1027 res) mpg00855 (1027) 388 54 1.4e-07 mKIAA0677 ( 1080 res) mpm07016 (1080) 370 52 5.2e-07 mKIAA0780 ( 1129 res) mic14040 (1129) 369 52 5.8e-07 mKIAA4191 ( 931 res) msh25333 ( 931) 358 50 1.1e-06 mKIAA4140 ( 998 res) mfj05126 ( 998) 299 45 7.3e-05 >>mKIAA0215 ( 822 res) mpm10302 (822 aa) initn: 2101 init1: 1282 opt: 1755 Z-score: 977.4 bits: 191.8 E(): 2.7e-49 Smith-Waterman score: 2016; 42.963% identity (47.476% ungapped) in 810 aa overlap (55-833:33-796) 30 40 50 60 70 80 mKIAA0 SDNSDTTDGHVTSTSASRCSKLPSSTKSGWPRQNEKKPSEVFRTDLITAMKIPDSYQLSP :.. .:: .:::: :::.:::::::....: mKIAA0 IDLSAAVRVQMSVLPLPLLLAQCIGRSQKNPKE-QKKSAEVFRKDLISAMKIPDSHHVNP 10 20 30 40 50 60 90 100 110 120 130 mKIAA0 DDYYILADPWRQEWEKGVQVPAGAEAIPEPVVRLLPP-----LKGPPTQM----SPDSPT :.::...: :..::::::::::. ...: : .:.. : : .. ::.: mKIAA0 DSYYLFTDTWKEEWEKGVQVPANPDSVPTPSLRIISEKVKEMLFVRPRKYIRCSSPESAE 70 80 90 100 110 120 140 150 160 170 180 190 mKIAA0 LGEGAHPDWPGGS-RYDLDEIDAYWLELLNSELKEMEKPELDELTLERVLEELETLCHQN : . ... :::::..: .::. :: .: :: .:: .:...: :: ::.: mKIAA0 PGYINTLEQAASTCRYDLDDMDIFWLQELNEDLGEMGYGPIDETLMEKTIEVLERHCHEN 130 140 150 160 170 180 200 210 220 230 240 250 mKIAA0 MAQAIETQEGLGIEYDEDVVCDVCRSPEGEDGNEMVFCDKCNVCVHQACYGILKVPTGSW : .:::: :::::::::::.:::::::..:.::.::::::::::::::::::::.: ::: mKIAA0 MNHAIETVEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCVHQACYGILKIPEGSW 190 200 210 220 230 240 260 270 280 290 300 310 mKIAA0 LCRTCALGVQPKCLLCPKRGGALKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIGCPEKMEPITKISH :::.:.::. :.:.::::.:::.: ::.::::.:::::::::::::.:::.:::.::::: mKIAA0 LCRSCVLGIYPQCVLCPKKGGAMKTTRTGTKWAHVSCALWIPEVSIACPERMEPVTKISH 250 260 270 280 290 300 320 330 340 350 360 370 mKIAA0 IPASRWALSCSLCKECTGTCIQCSMPSCITAFHVTCAFDRGLEMRTILADNDEVKFKSLC :: ::::: :.::: ::.:::::. ::::::::::::..::::.::: ..:::::::.: mKIAA0 IPPSRWALVCNLCKLKTGACIQCSVKSCITAFHVTCAFEHGLEMKTILDEGDEVKFKSFC 310 320 330 340 350 360 380 390 400 410 420 430 mKIAA0 QEHSDGGPR---SEPTSEPV-EPSQAVEDLEKVTLRKQRLQQLEENFYELVEPAEVAERL .::.. :. .: . : : ::: ::..:: :.:..:::.:: ::. .::... mKIAA0 LKHSQNKPKLGDAEYHHHRVAEQSQAKS--EKTSLRAQKLRELEEEFYTLVQVEDVAKEM 370 380 390 400 410 440 450 460 470 480 490 mKIAA0 DLAEALVDFIYQYWKLKRRANANQPLLTPKTDEVDNLAQQEQDVLYRRLKLFTHLRQDLE .:. :::::.::::::..: :.::. :: .: ..:.: ... .. :...: ::::::: mKIAA0 ELSAFTVDFIYNYWKLKRKSNFNKPLIPPKEEEENGLVQPKEESIHTRMRMFMHLRQDLE 420 430 440 450 460 470 500 510 520 530 540 550 mKIAA0 RVRNLCYMVTRRERTKHTICKLQEQIFHLQMKLIEQDLCREPSGRRSKGKKNDSKRKGRE ::::::::..:::. : . :.::::: ::..::.... : mKIAA0 RVRNLCYMISRREKLKLSHTKVQEQIFGLQVQLINEEIT--------------------E 480 490 500 510 560 570 580 590 600 610 mKIAA0 GPKGSSPEKKEKVKAGPESVLGQLGLSTSFPIDGTFFNSWLAQSVQITAEDMAMSEWSLN : . .. .. :. .: .: . : : .. . .: . : : . mKIAA0 GLSLTNALENSLFYPPPRITL-KLKMPKSTSED--------CKDSSTETEHQLSSPGSSS 520 530 540 550 560 570 620 630 640 650 660 670 mKIAA0 SGHREDPAPGLLSEELLQDEETLLSFMRDPSLRPGDPARKARGRTRLPAKKKPSPLQDGP :: . .: . : : .. . . : : .. . .:...: .:.. :: .: mKIAA0 PGHSKR-SPQMPEEPLDMNVKI---YPRYPLESKSNCLQTSRSHSRCETKSS-SPTPRAP 580 590 600 610 620 680 690 700 710 720 mKIAA0 SARTTPDKQPKKAWAQD----GKGTQGPPMRKPPRRTSSHLPSSPAAGDCPVPATLESPP ::. .. : : . :. . : .: :.:: :. :. : . mKIAA0 SAEFYHGQSLGKPLALQAALHGQVSIGNGKNQPNSRVSS---SNGLEGNWSGNITQKVN- 630 640 650 660 670 680 730 740 750 760 770 mKIAA0 PLASEI-LDKTAPMASDLNVQVPGPT--VSPKPLGR---------LRPPREMKVSRKSPG .::. :. . ..: : :: : . ..: ..: .... : mKIAA0 --SSEVCYDQESMLSSHL--PSPGNIRKSSMEHFSRSFKEATNTWVKPTEDLQYCVKPTK 690 700 710 720 730 780 790 800 810 820 830 mKIAA0 ARSDAGTGLPSAVAERPKVSLHFDTEADGYFSDEEMSDSEVEAEDSG-VQRASREAGAEE :. . .:: .. :.::: : : ::::.:.: : . :..::.. .: mKIAA0 NVSSKEQLWGRQLLRRPTGRASYQ-ETDGYCPDLEPSDSEAEGEGSKETPRVKRESSDRE 740 750 760 770 780 790 840 mKIAA0 VVRMGVLAS mKIAA0 NPSHDSARECHGKTKTHPHSHSSMQR 800 810 820 >>mKIAA1807 ( 850 res) mpm10336 (850 aa) initn: 2355 init1: 1370 opt: 1487 Z-score: 830.6 bits: 164.7 E(): 4.1e-41 Smith-Waterman score: 2427; 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