FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4226.ptfa, 2225 aa vs ./tmplib.26680 library 1766792 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.2706+/-0.00498; mu= 23.0853+/- 0.332 mean_var=116.7144+/-28.057, 0's: 0 Z-trim: 17 B-trim: 52 in 1/35 Lambda= 0.1187 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 43, opt: 31, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00070 ( 1167 res) mbg01449 (1167) 1056 194 2.4e-49 mKIAA0815 ( 835 res) mpm01062 ( 835) 614 118 1.3e-26 mKIAA1781 ( 1140 res) mbg19640 (1140) 471 94 3.5e-19 mFLJ00344 ( 1032 res) msh20362 (1032) 385 79 9e-15 mKIAA0813 ( 1557 res) mbg05377 (1557) 377 78 2.9e-14 mKIAA0246 ( 1789 res) mpm11210 (1789) 333 70 5.7e-12 mKIAA4141 ( 1593 res) mbg03129 (1593) 259 58 3.5e-08 mKIAA1983 ( 426 res) mbp99003 ( 426) 244 54 1.1e-07 mKIAA0817 ( 1399 res) mbg09915 (1399) 231 53 9.1e-07 mKIAA0149 ( 827 res) msp04035 ( 827) 221 51 2.3e-06 mKIAA0021 ( 853 res) mbh01716 ( 853) 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..:.: .:..: .:: .: :::::. :: :. .: mFLJ00 CEDIDECDFPAACIGGDCINTNGSYRCLCPQGHRL--VGGRKCQDIDECSQDPGLCLPHG 740 750 760 770 780 790 860 870 880 890 900 910 mKIAA4 LCVNTPGRYECNCPPDFQLNPTGVGCVD----NRVGNCYLKFGPRGDGSLSCNTEVGVGV : : : : : : : :. :: . .. .:::.: : .. :.. ....: mFLJ00 ACENLQGSYVCVCDEGFTLTQDQHGCEEVEQPHHKKECYLNF----DDTVFCDSVLATNV 800 810 820 830 840 920 930 940 950 960 mKIAA4 SRSSCCCSLGKAWGNPCE--TCPPVNSTEYYTLCPGGEGFRPNPITIIL-----EDIDEC ... :::::: .::. :: :: .:.:...::: :.:. . . .::::: mFLJ00 TQQECCCSLGAGWGDHCEIYPCPVYSSAEFHSLCPDGKGYTQDNNIVNYGIPAHRDIDEC 850 860 870 880 890 900 970 980 990 1000 1010 1020 mKIAA4 QELPG-LCQGGNCINTFGSFQCECPQGYYLSEETRICEDIDECFAHPGVCGPGTCYNTLG . . .:. :.:.:: ...: : ::.: . . : :.:::. . . : :.: :: : mFLJ00 ILFGAEICKEGKCVNTQPGYECYCKQGFYYDGNLLECVDVDECLDESN-CRNGVCENTRG 910 920 930 940 950 960 1030 1040 1050 1060 1070 mKIAA4 NYTCICPPEYMQVNGGHNCM---DM-----RKSFCY--RSYNGTTCENEL--PFNVTKRM .: : : : . ..:. .: :. :. :. .: : . : : .: mFLJ00 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: :. mKIAA1 NGTCSPIDGS--CQCFPGWI---GKDCSQA--CPSGFWGSACFHTCSCHNGASCSAEDGA 720 730 740 750 760 770 1310 1320 1330 1340 1350 mKIAA4 FKCLCNEGY------ELTPD---GKNCIDTNECVALPGSCS--PGTCQNLEG-SFR-C-- : :. :. . :. ::.: .: .::. : : : : : : mKIAA1 --CHCTPGWTGLFCTQRCPSAFFGKDCGHICQCQN-GASCDHITGKCTCRTGFSGRHCEQ 780 790 800 810 820 1360 1370 1380 1390 1400 1410 mKIAA4 ICPPGYEVRSENCIDINECDEDPNICLFGSCTNTPGGFQCICPPGFVLSDNGRRCFDTRQ : :: . . .: .. :: .. ..: .. : : : ::: .: :: mKIAA1 RCAPG--TFGYGCQQLCECMNN------ATCDHVTG--TCYCSPGF----KGIRCDQAAL 830 840 850 860 870 1420 1430 1440 1450 1460 1470 mKIAA4 SFCFTNFENGKCSVPKAFNTTKAKCCCSKMPGEGWGDPCELCPKDDEVAFQDLCPYGHGT mKIAA1 MMDELNPYTKISPALGAERHSVGAVTGIVLLLFLVVVLLGLFAWRRRRQKEKGRDLAPRV 880 890 900 910 920 930 >>mFLJ00344 ( 1032 res) msh20362 (1032 aa) initn: 355 init1: 155 opt: 385 Z-score: 357.6 bits: 78.9 E(): 9e-15 Smith-Waterman score: 438; 26.271% identity (31.156% ungapped) in 472 aa overlap (428-868:298-726) 400 410 420 430 440 450 mKIAA4 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.: :.. : ::... :: .: mKIAA4 DND--CENNSTCVDGINNYTCLCPPEYTGE----LCEEKLDFCAQDLNPCQHDSKCILTP 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1190 1200 1210 1220 1230 mKIAA4 GSYRCECAAGFKLSPNGAC-VDRNECLEIPNVCSHGL-CVDLQGSYQCICNNGFKA---S ...:.:. :. .. . : .: ..: . : :..: :.: ..: :.: .:... mKIAA4 KGFKCDCTPGY-IGEH--CDIDFDDCQD--NKCKNGAHCTDAVNGYTCVCPEGYSGLFCE 1130 1140 1150 1160 1170 1240 1250 1260 1270 1280 1290 mKIAA4 QDQTMCMD-VDECERHPCGNGT-CKNTVGSYNCLCYPGFELTHNNDCLDIDECSSFFGQV . : . .. :. : ::. : .. : : ::. .:. mKIAA4 FSPPMVLPRTSPCDNFDCQNGAQCIIRINEPICQCLPGY-----------------LGEK 1180 1190 1200 1210 1300 1310 1320 1330 1340 1350 mKIAA4 CRNGRCFNEIGSFKCLCNEGYELTPDGKNCIDTNECVALPGSCSPGTCQNLEGSFRCICP :. .. : . . .:.: :..: .:: . . . . : .:. : mKIAA4 CE------KLVSVNFVNKESYLQIPSAKVRPQTNITLQIATDEDSGILL-YKGDKDHIAV 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1360 1370 1380 1390 1400 1410 mKIAA4 PGYEVRSENCIDINECDEDPNICLFGSCTNTPGGFQCI----CPPGFVLS-DNGRRCFDT :. : . : . : ... : . :.:. . .. :: :.: : mKIAA4 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