FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 3.4t11 Apr 17, 2002
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 ../query/mKIAA1084.ptfa, 1013 aa
 vs ./tmplib.26680 library

1768004 residues in  2168 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1961+/-0.00592; mu= 12.3883+/- 0.396
 mean_var=164.1733+/-38.041, 0's: 0 Z-trim: 44  B-trim: 9 in 1/35
 Lambda= 0.1001

FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                       opt bits E(2168)
mKIAA1396  ( 481 res)   mfj16154                   ( 481)  326   59 1.3e-09
mKIAA4205  ( 653 res)   mfj21207                   ( 653)  326   60 1.6e-09
mKIAA0441  ( 699 res)   mbp07087                   ( 699)  323   59 2.2e-09
mKIAA1588  ( 617 res)   mbp00262                   ( 617)  320   59 2.8e-09
mKIAA4236  ( 919 res)   mfj05191                   ( 919)  320   59 3.6e-09
mKIAA1431  ( 833 res)   mfj27243                   ( 833)  313   58 6.7e-09
mKIAA1852  ( 736 res)   mej02019                   ( 736)  312   58 6.9e-09
mKIAA0236  ( 1852 res)   mbg02771                  (1852)  314   58   1e-08
mKIAA1874  ( 435 res)   mbg02924                   ( 435)  302   56 1.4e-08
mKIAA4218  ( 601 res)   mpm12334                   ( 601)  303   56 1.5e-08
mKIAA1710  ( 461 res)   mbg19468                   ( 461)  301   56 1.6e-08
mKIAA0924  ( 617 res)   mbp20088                   ( 617)  294   55 3.7e-08
mKIAA1948  ( 463 res)   mph00578                   ( 463)  291   54 4.2e-08
mKIAA3006  ( 617 res)   mbg05721                   ( 617)  282   53 1.2e-07
mKIAA1954  ( 643 res)   mpj01436                   ( 643)  278   53 1.9e-07
mKIAA1015  ( 831 res)   mbh00453                   ( 831)  276   53 2.7e-07
mKIAA0326  ( 885 res)   mib10041                   ( 885)  273   52 3.8e-07
mKIAA1611  ( 558 res)   mph00982                   ( 558)  269   51 4.3e-07
mKIAA1703  ( 891 res)   mfj09089                   ( 891)  263   51   1e-06
mKIAA1559  ( 504 res)   mbp01052                   ( 504)  249   48   3e-06
mKIAA0628  ( 508 res)   msj08164                   ( 508)  228   45 2.5e-05
mKIAA1141  ( 886 res)   mef00011                   ( 886)  220   45 7.7e-05
mKIAA0198  ( 506 res)   mpm05258                   ( 506)  215   43   9e-05
mKIAA4196  ( 437 res)   mfj00049                   ( 437)  214   43 9.1e-05
mKIAA4237  ( 519 res)   mfj17080                   ( 519)  204   42 0.00028
mKIAA0426  ( 508 res)   mpm11025                   ( 508)  203   42  0.0003
mKIAA1572  ( 463 res)   mfj40003                   ( 463)  201   41 0.00035
mKIAA1803  ( 705 res)   mfj24209                   ( 705)  199   41 0.00055
mKIAA0478  ( 1234 res)   mib07095                  (1234)  202   42 0.00058
mKIAA3011  ( 496 res)   mph01327                   ( 496)  196   41  0.0006
mKIAA4222  ( 543 res)   mkg04188                   ( 543)  196   41 0.00063
mKIAA1020  ( 642 res)   mpm09294                   ( 642)  181   39  0.0031
mKIAA0961  ( 486 res)   mph04182                   ( 486)  178   38  0.0036
mFLJ00416  ( 522 res)   msj08249                   ( 522)  178   38  0.0037
mKIAA1388  ( 523 res)   mbg09616                   ( 523)  174   38  0.0056
mFLJ00107  ( 1371 res)   mfj24090                  (1371)  176   38  0.0083


>>mKIAA1396  ( 481 res)   mfj16154                        (481 aa)
 initn: 715 init1: 183 opt: 326  Z-score: 264.9  bits: 59.5 E(): 1.3e-09
Smith-Waterman score: 326;  26.606% identity (28.293% ungapped) in 218 aa overlap (677-890:234-442)

        650       660       670       680        690       700     
mKIAA1 SLLTVIEKLRERTDQNASDDDILKELQDNAQCQPN-SDGSLLGSNVVEYIPDAERPYRCR
                                     .:.   :..: :  .: . :  .:.::.:.
mKIAA1 CTVCGKAFKQSHHLAQHHTTHTHEKLFQCEECKKAFSQNSYL--TVHRRIHTGEKPYKCK
           210       220       230       240         250       260 

         710       720       730       740       750       760     
mKIAA1 LCNYSSGNRGYIKQHLRVHRQRQPYQCPICEHIAENSKDLESHMINHCKTRIHQCKQCKE
        :  :  . ... :: :.:  ..::.: :: .  ..: .: .:.  :   . ..::.: .
mKIAA1 ECAKSFRQPAHLAQHHRIHTGEKPYKCEICGKAFNHSMSLTGHQRVHSGEKPYKCKDCGK
             270       280       290       300       310       320 

         770        780       790       800       810       820    
mKIAA1 SFHYKSQLRNHER-EQHCLPNTLSVASNEPRISRDAADGKCAQEGNKPSTQKQYRCDVCD
       .:. . .:  : : .    :   .  ..  : : . .  .  . :.::     ..:  : 
mKIAA1 AFRQSIHLVVHSRIHTGEEPYECNECGKTFRESSQLTIHQRNHTGEKP-----FECKQCG
             330       340       350       360            370      

            830       840       850       860       870       880  
mKIAA1 --YTSTTYVGVRNHRRVHNSDKPYRCSLCGYVCSHPPSLKSHMWKHASDQNYNYEQVNKA
         .. ..:..   :...:...:::.:. :: . .:   :  :   :.... :.  . .::
mKIAA1 KFFNRSAYLA--RHQKIHTGEKPYECNECGKTFTHAAYLIRHKRVHTGEKPYKCAECGKA
        380         390       400       410       420       430    

            890       900       910       920       930       940  
mKIAA1 INDAISQSARVLGKSRGKPLLTSSEERTGPTTGSPENLVSSSELTSQLPGEVMDASELEK
       ..:. :..                                                    
mKIAA1 FGDGSSRAQHQRLHTGQRPYVCEKCGRAFRRKSSLNCHQRYHTGKKL             
          440       450       460       470       480              

>>mKIAA4205  ( 653 res)   mfj21207                        (653 aa)
 initn: 490 init1: 204 opt: 326  Z-score: 263.4  bits: 59.7 E(): 1.6e-09
Smith-Waterman score: 339;  27.660% identity (28.261% ungapped) in 188 aa overlap (695-882:427-610)

          670       680       690       700       710       720    
mKIAA1 DDDILKELQDNAQCQPNSDGSLLGSNVVEYIPDAERPYRCRLCNYSSGNRGYIKQHLRVH
                                     :  .:.::.:.::. :  . . .:.: :.:
mKIAA4 RKIQHSKKSYKCNECGKAFKYCSSYRKHSIIHTGEKPYKCKLCGKSFTQCASLKKHQRIH
        400       410       420       430       440       450      

          730       740       750       760       770       780    
mKIAA1 RQRQPYQCPICEHIAENSKDLESHMINHCKTRIHQCKQCKESFHYKSQLRNHEREQHCLP
         ..::.:  : .  .. . : .:.  :   . ..:::: .::   :.:..:.   :   
mKIAA4 TGEKPYRCEECGRSFNHYSILGQHQRIHTGEKPYKCKQCGKSFTQCSSLQKHQV-IHTGE
        460       470       480       490       500       510      

          790       800       810       820       830       840    
mKIAA1 NTLSVASNEPRISRDAADGKCAQEGNKPSTQKQYRCDVCDYTSTTYVGVRNHRRVHNSDK
       .    :     ......    .:.    . .: :.:. :  . :   ..:.:.:.:...:
mKIAA4 KPYRCAECGKSFTQNST---LSQHQRIHTGEKPYKCEECGKAFTQCSSLRKHQRIHTGEK
         520       530          540       550       560       570  

          850       860       870       880       890       900    
mKIAA1 PYRCSLCGYVCSHPPSLKSHMWKHASDQNYNYEQVNKAINDAISQSARVLGKSRGKPLLT
       ::.: .:: . .   :. .:   :.... :. .. .::.                     
mKIAA4 PYKCEVCGRAFNCRSSFTKHKRIHTGEKPYKCKDCDKAFIHCTNLIQHQRIHTGEKPYKC
            580       590       600       610       620       630  

          910       920       930       940       950       960    
mKIAA1 SSEERTGPTTGSPENLVSSSELTSQLPGEVMDASELEKLNPTGCSSDVSGRSCSLAAPGT
                                                                   
mKIAA4 NECGKSFSQCSNLRKHERIHT                                       
            640       650                                          

>>mKIAA0441  ( 699 res)   mbp07087                        (699 aa)
 initn: 329 init1: 197 opt: 323  Z-score: 260.7  bits: 59.3 E(): 2.2e-09
Smith-Waterman score: 323;  27.374% identity (28.655% ungapped) in 179 aa overlap (699-875:327-499)

      670       680       690       700       710       720        
mKIAA1 LKELQDNAQCQPNSDGSLLGSNVVEYIPDAERPYRCRLCNYSSGNRGYIKQHLRVHRQRQ
                                     :::..:  :. . ...  .. : :.:  ..
mKIAA0 SSGPEARCKDCDRVFKYSHFLAIHQRRHTGERPFKCNECGKGFAQKHSLQVHTRMHTGER
        300       310       320       330       340       350      

      730       740       750       760       770       780        
mKIAA1 PYQCPICEHIAENSKDLESHMINHCKTRIHQCKQCKESFHYKSQLRNHEREQ--HCLPNT
       :: : .: .   ....:  ::  :   .   : :: . :  : ::..: : .  : ::. 
mKIAA0 PYTCTVCGKALTTKHSLLEHMSLHSGQKSFTCDQCGKYFSQKRQLKSHYRVHTGHSLPEC
        360       370       380       390       400       410      

        790       800       810       820       830       840      
mKIAA1 LSVASNEPRISRDAADGKCAQEGNKPSTQKQYRCDVCDYTSTTYVGVRNHRRVHNSDKPY
           :.  :   :... :  ..    . .: . :..:  . :.  ....: :.: ..:::
mKIAA0 ----SHCHRKFMDVSQLK--KHLRTHTGEKPFTCEICGKSFTAKSSLQTHIRIHRGEKPY
            420       430         440       450       460       470

        850       860       870       880       890       900      
mKIAA1 RCSLCGYVCSHPPSLKSHMWKHASDQNYNYEQVNKAINDAISQSARVLGKSRGKPLLTSS
        ::.::   :   . . :   :.. . ..                               
mKIAA0 SCSICGKCFSDSSAKRRHCILHTGKKPFSCPECGLQFARLDNLKAHLKIHSKEKHTADSS
              480       490       500       510       520       530

>>mKIAA1588  ( 617 res)   mbp00262                        (617 aa)
 initn: 493 init1: 196 opt: 320  Z-score: 259.0  bits: 58.8 E(): 2.8e-09
Smith-Waterman score: 338;  23.476% identity (24.919% ungapped) in 328 aa overlap (669-995:284-593)

      640       650       660       670        680       690       
mKIAA1 QVKTGISMSLLTVIEKLRERTDQNASDDDILKELQ-DNAQCQPNSDGSLLGSNVVEYIPD
                                     :::   : .::. :.  .: . ..   .  
mKIAA1 IHTGEKPYECSSCGKAFNDPSALRSHTRTHLKEKPFDCSQCS-NAFRTLSALKIHMRVHT
           260       270       280       290        300       310  

       700       710       720       730       740       750       
mKIAA1 AERPYRCRLCNYSSGNRGYIKQHLRVHRQRQPYQCPICEHIAENSKDLESHMINHCKTRI
       .::::.:  :. . :   ..  : :.:  ..::.:  : .  .. . :. :. ::   . 
mKIAA1 GERPYKCDECGKAYGRSCHLIAHKRTHTGERPYECQDCGKAFQHPSHLKEHVRNHTGEKP
            320       330       340       350       360       370  

       760       770       780       790       800       810       
mKIAA1 HQCKQCKESFHYKSQLRNHEREQHCLPNTLSVASNEPRISRDAADGKCAQEGNKPSTQKQ
       ..: :: ..:..::..  :... : . .:         .: :  . .  ..     ..: 
mKIAA1 YECTQCGKAFRWKSNFNLHKKN-HMVEKTYECKECGKSFS-DLLSRR--KHMRIHIVKKP
            380       390        400       410          420        

       820       830       840       850       860       870       
mKIAA1 YRCDVCDYTSTTYVGVRNHRRVHNSDKPYRCSLCGYVCSHPPSLKSHMWKHASDQNYNYE
        .:  :  :  .   ...:   :....:: :.::: . :   .: .:   :.....:.  
mKIAA1 VECHQCGKTFRNQSILKTHMNSHTGERPYGCDLCGKAFSASSNLTAHRKIHTQERHYECT
      430       440       450       460       470       480        

       880       890       900       910       920       930       
mKIAA1 QVNKAINDAISQSARVLGKSRGKPLLTSSEERTGPTTGSPENLVSSSELTSQLPGEVMDA
       . .:...: .:.  : ..    :  .   .   : .  .  .:  .... :.   . .. 
mKIAA1 SCGKVFGDYLSRR-RHMSIHLVKKRVDCRQ--CGKAFRNQSTL--KTHMRSHTGEKPYEC
      490       500        510         520         530       540   

       940       950       960       970       980       990       
mKIAA1 SELEKLNPTGCSSDVSGRSCSLAAPGTEYCVLLFCCCICGFESTSKESLLDHMKEHEGEI
       ..  :    : . .:  :  .   :        . : :::   ... :: .:.: :.:. 
mKIAA1 DHCGKAFSIGSNLNVHRRIHTGEKP--------YECLICGKAFSDHSSLRSHVKTHRGRS
           550       560               570       580       590     

      1000      1010         
mKIAA1 VSIILNKDHSTALNAN      
                             
mKIAA1 SLRRLCGKGFSEYSNAEEAWQT
         600       610       

>>mKIAA4236  ( 919 res)   mfj05191                        (919 aa)
 initn: 222 init1: 153 opt: 320  Z-score: 257.1  bits: 59.0 E(): 3.6e-09
Smith-Waterman score: 362;  24.895% identity (27.442% ungapped) in 237 aa overlap (654-884:685-905)

           630       640       650       660       670       680   
mKIAA1 TVVALPEGRQELSDGQVKTGISMSLLTVIEKLRERTDQNASDDDILKELQDNAQCQPNSD
                                     .:.:.   .....    :.  :. : :.  
mKIAA4 HSYLTQHKVVHSGEKPYKCEECGKKFYYPSRLKEHQRIHSQENPYKCEICGNVFCTPK--
          660       670       680       690       700       710    

           690       700       710       720       730       740   
mKIAA1 GSLLGSNVVEYIPDAERPYRCRLCNYSSGNRGYIKQHLRVHRQRQPYQCPICEHIAENSK
           : .  . .  .:.::.:. :.      . .:.: :.: :..::.: :: .   . .
mKIAA4 ----GLSKHQRFHTGEKPYKCEECGKMFYYPSRLKEHQRIHSQENPYKCEICGKAFYTHS
                720       730       740       750       760        

           750       760       770       780       790        800  
mKIAA1 DLESHMINHCKTRIHQCKQCKESFHYKSQLRNHEREQHCLPNTLSVASNE-PRISRDAAD
        : .: ..:   . ..:..: ..:.: : :..:          :.. :.. :   .. . 
mKIAA4 YLTQHKLGHTGEKPYKCEECGKTFYYPSILKEH----------LAIHSGKKPYRCEECGK
      770       780       790       800                 810        

            810            820       830       840       850       
mKIAA1 GKCAQEGNK-----PSTQKQYRCDVCDYTSTTYVGVRNHRRVHNSDKPYRCSLCGYVCSH
         :.. : .      . .: :.:. :  . .:.  . .:. ::...:::.:  :: .  .
mKIAA4 DFCTRSGRSRHQRIHTGEKPYKCEQCGKAFSTHSYLSQHKVVHSGEKPYKCEECGKMFYY
      820       830       840       850       860       870        

       860       870       880       890       900       910       
mKIAA1 PPSLKSHMWKHASDQNYNYEQVNKAINDAISQSARVLGKSRGKPLLTSSEERTGPTTGSP
       :  :: :.  :.... :. :  .:...                                 
mKIAA4 PSRLKEHQRIHSQENPYKCEVCGKVFSAHLELATHLSIHSG                   
      880       890       900       910                            

>>mKIAA1431  ( 833 res)   mfj27243                        (833 aa)
 initn: 309 init1: 192 opt: 313  Z-score: 252.1  bits: 57.9 E(): 6.7e-09
Smith-Waterman score: 336;  27.053% identity (29.630% ungapped) in 207 aa overlap (695-893:575-771)

          670       680       690       700       710       720    
mKIAA1 DDDILKELQDNAQCQPNSDGSLLGSNVVEYIPDAERPYRCRLCNYSSGNRGYIKQHLRVH
                                     :  .:.:..:  :. : .  . .  : :.:
mKIAA1 QRVHSGEKPFKCKECGKAFRQNIHLASHWRIHTGEKPFECGECGKSFSISSQLATHQRIH
          550       560       570       580       590       600    

          730       740       750       760       770       780    
mKIAA1 RQRQPYQCPICEHIAENSKDLESHMINHCKTRIHQCKQCKESFHYKSQLRNHEREQ----
         ..::.: .:..   ..  : .:. .:   . ..::.: ..:   ..: .:.: .    
mKIAA1 TGEKPYECKVCRKAFTQKAHLAQHQKTHTGEKPYECKECGKAFSQTTHLIQHQRVHTGEK
          610       620       630       640       650       660    

                790       800       810       820       830        
mKIAA1 --HCLPNTLSVASNEPRISRDAADGKCAQEGNKPSTQKQYRCDVCDYTSTTYVGVRNHRR
         .::    . ..:          ..:.:.    . :. :.:  :  :  :  ..  :::
mKIAA1 PYKCLECGKAFGDN----------SSCTQHRRLHTGQRPYECVECGKTFKTKSSLICHRR
          670                 680       690       700       710    

      840       850       860       870       880         890      
mKIAA1 VHNSDKPYRCSLCGYVCSHPPSLKSHMWKHASDQNYNYEQVNKAINDA--ISQSARVLGK
        :...:::.:: :: . ::  ::. :.  :.. . :. ..  :.. .   ..:  ::   
mKIAA1 CHTGEKPYECSACGKAFSHRQSLSVHQRIHSGKKPYECKECRKTFIQIGHLNQHKRVHTG
          720       730       740       750       760       770    

        900       910       920       930       940       950      
mKIAA1 SRGKPLLTSSEERTGPTTGSPENLVSSSELTSQLPGEVMDASELEKLNPTGCSSDVSGRS
                                                                   
mKIAA1 ERTYNYKKGRRAFRQTAHFAHHQQIHSGKSPAHHSLPSTSNPVDLFSKFVWNPSSLPSS 
          780       790       800       810       820       830    

>>mKIAA1852  ( 736 res)   mej02019                        (736 aa)
 initn: 376 init1: 177 opt: 312  Z-score: 251.9  bits: 57.7 E(): 6.9e-09
Smith-Waterman score: 330;  24.290% identity (26.552% ungapped) in 317 aa overlap (699-996:370-678)

      670       680       690       700       710       720        
mKIAA1 LKELQDNAQCQPNSDGSLLGSNVVEYIPDAERPYRCRLCNYSSGNRGYIKQHLRVHRQRQ
                                     :.::.:  :.    ::. . .: :.:   .
mKIAA1 TAEKPYEFNKCGTSFIWSSYLIQHKKTHPGEKPYECDKCGKVFRNRSALTKHERTHTGVK
     340       350       360       370       380       390         

      730       740       750       760       770       780        
mKIAA1 PYQCPICEHIAENSKDLESHMINHCKTRIHQCKQCKESFHYKSQLRNHEREQHCL-PNTL
       ::.:  : .    .. :  :   :   . . :..: .::...:.: .:.: .    :   
mKIAA1 PYECNKCGKAFSWNSHLIVHTRIHTGEKPYVCNECGKSFNWNSHLIGHQRTHTGEKPFEC
     400       410       420       430       440       450         

       790       800       810       820       830       840       
mKIAA1 SVASNEPRISRDAADGKCAQEGNKPSTQKQYRCDVCDYTSTTYVGVRNHRRVHNSDKPYR
       .  ..    :         . :.::     ..:: :. .   : .. .:.:.:.. :::.
mKIAA1 TECGKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKP-----FKCDECEKAFRDYSALSKHERTHSGAKPYK
     460       470       480            490       500       510    

       850       860       870       880       890       900       
mKIAA1 CSLCGYVCSHPPSLKSHMWKHASDQNYNYEQVNKAINDAISQSARVLGKSRGKPLLTSSE
       :. ::   :    : .:.  :.... :: .. .::. .  . . . . .:  ::   .  
mKIAA1 CTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQECGKAFRERSALTKHEIIHSGIKPYECN--
          520       530       540       550       560       570    

       910       920        930           940                 950  
mKIAA1 ERTGPTTGSPENLVSSSEL-TSQLPGEVMDA----SELEKL----------NPTGCSSDV
        . : . ..  .::  ..  :.. : :        :.  .:          .:  :..  
mKIAA1 -KCGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKSFSQSCHLVAHRRIHTGEKPYKCNQCE
             580       590       600       610       620       630 

               960       970       980       990      1000         
mKIAA1 SGRSCS---LAAPGTEYCVLLFCCCICGFESTSKESLLDHMKEHEGEIVSIILNKDHSTA
        . .::   .:   :.     . :  ::   . . ::. :...: ::             
mKIAA1 RSFNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNESSSLIVHLRNHTGEKPYKCNHCEKAFC
             640       650       660       670       680       690 

    1010                                            
mKIAA1 LNAN                                         
                                                    
mKIAA1 KNSSLIIHQRMHSGEKRFICNQCGRAFSGHSALLQHQKNHSEEKL
             700       710       720       730      

>>mKIAA0236  ( 1852 res)   mbg02771                       (1852 aa)
 initn: 273 init1: 224 opt: 314  Z-score: 249.0  bits: 58.5 E(): 1e-08
Smith-Waterman score: 327;  20.972% identity (25.468% ungapped) in 844 aa overlap (133-918:1099-1851)

            110       120       130        140       150        160
mKIAA1 SEVDQQRKAKADPLVHVIQKLSKIVGHEKSQKC-LLIGKKRPRPSETANSLE-KLENCEI
                                     .:: .:. :..  :. .. .:. .: . . 
mKIAA0 SGCQGRREPLLCPECGASFKQQRGLSTHMMKKCPVLLKKNKALPKPVSPTLHPQLPDNQA
     1070      1080      1090      1100      1110      1120        

               170          180             190       200       210
mKIAA1 PAKA-TESPAAGVRKTEM---SQASSTLASNDG------KAMSYQCSLCKFLSPSFSVLK
          : ...:     :.:.   ..: : : .. :         ..  :  .   :. .  :
mKIAA0 SQDAESRKPPPLPSKVELLLPKDAPSDLPGGPGVEEPLPTPSDFPTSPPENSLPTGTSEK
     1130      1140      1150      1160      1170      1180        

              220       230       240       250       260       270
mKIAA1 EHVKQHGQQHDVMLMCSECHATSRSQQELEAHVVSEHENSASSQARYSPSGQGATERKSE
        : .: :. :     :: :       . . .:: .:   .. .: :     .:   : . 
mKIAA0 FHFEQ-GKFH-----CSSCTFLCSRLSSITSHV-TEGCRGGRGQKRK----RG---RPQT
     1190            1200      1210       1220          1230       

              280       290       300        310       320         
mKIAA1 TMVDIPVNMGSPQTHAVQSAAMAESGRRKWYAYEQYG-MYRCLFCSYTCGQQRMLKTHAW
         : .:.: :.     . :.  . :      . .: : .. :  : ..: :.: :.::  
mKIAA0 HAVVLPLNNGDSTLLNTGSTESSPSDGDTAVVQKQKGALFSCPTCPFSCQQERTLRTHQT
         1240      1250      1260      1270      1280      1290    

     330           340       350       360       370       380     
mKIAA1 K----HAGEVNCSYPIFENENEPLGLLASSMSAAPGGVDAVVIAIGDSELSIHNGPSVQV
       .    ..:...:            ::   .  ::             . : .:.     .
mKIAA0 QGCPLKSGDLHC------------GLCPFTAPAA-------------AALRLHQKRRHPT
         1300                  1310                   1320         

         390       400       410       420       430       440     
mKIAA1 QICSSDPPSSSPLEQSTEEGVHLNQAVTLDANEEEMLEVMSDSEENLFADSLLSSAQKII
          .: :    :: :  . :   .:.  :. ...   : ..  .   : :   .   .. 
mKIAA0 ASPASGP---RPLLQCGDCGFTCKQSRCLQQHRRLKHEGVKPHQCP-FCDFSTTRRYRLE
    1330         1340      1350      1360      1370       1380     

         450       460       470       480           490       500 
mKIAA1 SSSPNKKGHVNVIVERLPSAEETLPPKHFLINAEMEEGK----SPSPSEAQTGCVGAGNM
       . .  . :     : :.: .     :. :  :....  .    . .:..    :  .: .
mKIAA0 AHQSRHTG-----VGRIPCSSC---PQTFGTNSKLRLHQLRVHDKTPTHFCPLCDYSGYL
        1390           1400         1410      1420      1430       

             510       520       530       540        550       560
mKIAA1 YHADKCTVDIGGLIIGWSSAEKKDSELSKGLAPDENAPPGRRRTNSES-LRLHSLAAEAL
        :      ::           .. .   .: .:. .    . . .::. :. :.:  .  
mKIAA0 RH------DI----------TRHVNSCHQG-TPSFSCTQCEAQFSSETALKQHALRRHPE
            1440                1450       1460      1470      1480

                570       580       590       600       610        
mKIAA1 VTMPIRA--AELTRASLGHYGDINLLDPDTGQRQVSGPLATYSKKIMSPLKNSTDGVTSF
        : :  .  .:.:.. : : .  .:: :. ..      :  ...:    :.    :. . 
mKIAA0 PTPPSSGCPVEVTEGPL-HCSHCGLLCPSPAS------LRGHTRKQHPRLEC---GACQE
             1490       1500      1510            1520         1530

      620       630          640       650       660          670  
mKIAA1 NQSNSTVVALPEGRQE--LSDG-QVKTGISMSLLTVIEKLRERTDQNA---SDDDILKEL
       .  :    :: : :..  .:   :. .  .   . ....  :. ....   :: :  .  
mKIAA0 SFPNRP--ALDEHRRQHHFSHRCQLCSFAARERVGLVKHYLEQHEESSTAPSDGDAGQP-
               1540      1550      1560      1570      1580        

            680       690          700       710       720         
mKIAA1 QDNAQCQPNSDGSLLGSNVVEY---IPDAERPYRCRLCNYSSGNRGYIKQHLRVHRQRQP
          . : :  : .   . :...      . : :.:  : ::. ::  :  : :.:  ..:
mKIAA0 ---SLCCPFCDFACRHQLVLDHHVKGHGGTRLYKCTDCAYSTKNRQKITWHSRIHTGEKP
         1590      1600      1610      1620      1630      1640    

     730       740       750       760       770                   
mKIAA1 YQCPICEHIAENSKDLESHMINHCKTRIHQCKQCKESFHYKSQLRNHERE----------
       :.: .: .   . . :. ::  : . : . : .:  . .. .::. :  .          
mKIAA0 YHCHLCAYACADPSRLKYHMRIHKEERKYLCPECGYKCKWVNQLKYHMTKHTGLKPYQCP
         1650      1660      1670      1680      1690      1700    

       780       790       800       810                    820    
mKIAA1 --QHCLPNTLSVASNEPRISRDAADGKCAQEGN-------------KPSTQKQYRCDVCD
         ..:   . ..  ..    :.:    : : :.             : :  : : :.:: 
mKIAA0 ECEYCTNRADALRVHRETRHREARAFMCEQCGKAFKTRFLLRTHLRKHSEAKPYVCNVCH
         1710      1720      1730      1740      1750      1760    

          830       840       850       860       870       880    
mKIAA1 YTSTTYVGVRNHRRVHNSDKPYRCSLCGYVCSHPPSLKSHMWKHASDQNYNYEQVNKAIN
        .    .:.:.:  .:.. .:. : ::.:  ..  .. .:. .:  ::    . :.:   
mKIAA0 RAFRWAAGLRHHALTHTDRHPFFCRLCSYKAKQKFQVVKHVRRHHPDQADPNQGVGK---
         1770      1780      1790      1800      1810      1820    

          890       900       910       920       930       940    
mKIAA1 DAISQSARVLGKSRGKPLLTSSEERTGPTTGSPENLVSSSELTSQLPGEVMDASELEKLN
       :  . ....   .   :   :     .:.:: ::.                         
mKIAA0 DPTTPTVHLHDVKLEDP---SPPAPPAPSTG-PEG                         
            1830         1840       1850                           

          950       960       970       980       990      1000    
mKIAA1 PTGCSSDVSGRSCSLAAPGTEYCVLLFCCCICGFESTSKESLLDHMKEHEGEIVSIILNK

>>mKIAA1874  ( 435 res)   mbg02924                        (435 aa)
 initn: 214 init1: 161 opt: 302  Z-score: 246.7  bits: 56.0 E(): 1.4e-08
Smith-Waterman score: 310;  24.252% identity (26.354% ungapped) in 301 aa overlap (699-996:154-433)

      670       680       690       700       710       720        
mKIAA1 LKELQDNAQCQPNSDGSLLGSNVVEYIPDAERPYRCRLCNYSSGNRGYIKQHLRVHRQRQ
                                     ..:..:  :.     :. . .: :::  ..
mKIAA1 DPKGSWDVHTLGKRLKQKSKLMTKQRPYKEKKPHKCDECGELFTYRSVLIRHQRVHTGEK
           130       140       150       160       170       180   

      730       740       750       760       770       780        
mKIAA1 PYQCPICEHIAENSKDLESHMINHCKTRIHQCKQCKESFHYKSQLRNHEREQHCLPNTLS
       :: :  : .   .  .: .:. .: .  . .: .::..:  .:.:. :.:  :       
mKIAA1 PYTCSECGKSFSHRANLTKHQRTHTRI-LFECGECKKTFIESSSLEVHQR-IHIGERPYE
           190       200       210        220       230        240 

      790       800         810       820       830       840      
mKIAA1 VASNEPRISRDA--ADGKCAQEGNKPSTQKQYRCDVCDYTSTTYVGVRNHRRVHNSDKPY
        :     ..:..  :. .  . : ::     :.:. :: .     .. .:.:.:...:::
mKIAA1 CAECGKGFNRSTHLAQHQLIHTGVKP-----YECNECDKAFIHSSALIKHQRTHTGEKPY
             250       260            270       280       290      

        850       860       870       880       890       900      
mKIAA1 RCSLCGYVCSHPPSLKSHMWKHASDQNYNYEQVNKAINDAISQSARVLGKSRGKPLLTSS
       .:. :: . ::  :: .:.  :.... :.  . .:..    :::.... ..: .      
mKIAA1 KCQDCGKAFSHCSSLTKHQRVHTGERPYECSECGKTF----SQSTHLVQHQRIHTGEKPY
        300       310       320       330           340       350  

         910       920       930       940       950       960     
mKIAA1 E-ERTGPTTGSPENLVSSSELTSQLPGEVMDASELEKLNPTGCSSDVSGRSCSLAAPGTE
       : .. : : .   :... ...  ..  . .  .:        :..     :  .    :.
mKIAA1 ECNECGKTFSRSSNFAKHQRI--HMGKKPYKCGE--------CGKAFVHSSALIQHQRTH
            360       370         380               390       400  

         970       980       990      1000      1010   
mKIAA1 YCVLLFCCCICGFESTSKESLLDHMKEHEGEIVSIILNKDHSTALNAN
            : :  ::    :. ::. :.. :  :                 
mKIAA1 TGEKPFRCTECGKSFKSSPSLIRHQRTHTEEQP               
            410       420       430                    

>>mKIAA4218  ( 601 res)   mpm12334                        (601 aa)
 initn: 401 init1: 176 opt: 303  Z-score: 245.9  bits: 56.3 E(): 1.5e-08
Smith-Waterman score: 320;  22.302% identity (24.933% ungapped) in 417 aa overlap (590-996:182-564)

     560       570       580       590       600       610         
mKIAA1 LVTMPIRAAELTRASLGHYGDINLLDPDTGQRQVSGPLATYSKKIMSPLKNSTDGV-TSF
                                     ...: :: :   :.      .: ::. :.:
mKIAA4 IKNGSTKCVYWKISFGELVKTECRDIAQEQEKKVHGPGAESPKET-----TSEDGTPTGF
             160       170       180       190            200      

      620       630       640       650       660       670        
mKIAA1 NQSNSTVVALPEGRQELSDGQVKTGISMSLLTVIEKLRERTDQNASDDDILKELQDNAQC
       .  .   ..     ::   :.   ..  .  :  . : .  :   : .  .   :    :
mKIAA4 EPEKPLFISKALVSQE---GDPTESVPATYHTSEKDLPQDFDLMRSFQ--MYPGQKPHVC
        210       220          230       240       250         260 

      680       690         700       710       720       730      
mKIAA1 QPNSDGSLLGSNVVEY--IPDAERPYRCRLCNYSSGNRGYIKQHLRVHRQRQPYQCPICE
       .  . :   . ...:.  .  .:.::.:  :. : ..:. .  : :.:  ..::.:  ::
mKIAA4 SECGKGFTQSLHLLEHKRLHTGEKPYKCSECGKSFSHRSSLLAHQRTHTGEKPYKCSECE
             270       280       290       300       310       320 

        740       750       760       770       780       790      
mKIAA1 HIAENSKDLESHMINHCKTRIHQCKQCKESFHYKSQLRNHEREQHCLPNTLSVASNEPRI
       .   .:. : .:.  :   . ..:.:: ..:   : :  :.:  :   .  . :  .  .
mKIAA4 KAFGSSSTLIKHLRVHTGEKPYRCRQCGKAFSQCSTLTVHQR-IHTGEKLYKCAECDKAF
             330       340       350       360        370       380

        800       810       820       830       840       850      
mKIAA1 SRDAADGKCAQEGNKPSTQKQYRCDVCDYTSTTYVGVRNHRRVHNSDKPYRCSLCGYVCS
       .  :   :  ..    . .: :.:  :    . . .. .:.:.:....  .:  :: . .
mKIAA4 NCRA---KLHRHQRIHTGEKPYKCAECGKGYSQFPSLAEHQRLHTGEQLCQCLQCGRTFT
                 390       400       410       420       430       

        860       870       880         890       900       910    
mKIAA1 HPPSLKSHMWKHASDQNYNYEQVNKAIND--AISQSARVLGKSRGKPLLTSSEERTGPTT
       .  .:  :.  :.... :. .. .:..:.  ....  ..     :. : :   :. : . 
mKIAA4 RVSTLIEHQRIHTGQKPYQCNECGKTFNQYSSFNEHRKI---HTGEKLYTC--EECGKAF
       440       450       460       470          480         490  

          920       930       940       950       960              
mKIAA1 GSPENLVSSSELTSQLPGEVMDASELEKLNPTGCSSDVSGRSCSLAAPGTEYCVL-----
       :   ::   ... .   ::          .:  :..   :.. :  .  ::.  .     
mKIAA4 GCKSNLYRHQRIHT---GE----------KPYQCNQ--CGKAFSQYSFLTEHERIHTGEK
            500                    510         520       530       

     970       980       990      1000      1010                   
mKIAA1 LFCCCICGFESTSKESLLDHMKEHEGEIVSIILNKDHSTALNAN                
       :. :  ::   . . .:  : : :  :                                 
mKIAA4 LYKCMECGKAYSYRSNLCRHKKVHLKERLYKWKEYGTPFIYGSSLTPYQKFLKGDKPENF
       540       550       560       570       580       590       




1013 residues in 1 query   sequences
1768004 residues in 2168 library sequences
 Scomplib [34t11]
 start: Mon Mar 27 10:35:41 2006 done: Mon Mar 27 10:35:43 2006
 Scan time:  1.020 Display time:  0.370

Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]