FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0805.ptfa, 1659 aa vs ./tmplib.26680 library 1767358 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9973+/-0.00555; mu= 14.3635+/- 0.371 mean_var=151.3248+/-35.979, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 159 in 1/35 Lambda= 0.1043 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0435 ( 1388 res) mbg09138 (1388) 4794 734 4.3e-212 mKIAA4073 ( 797 res) mbh01340 ( 797) 3451 532 1.9e-151 >>mKIAA0435 ( 1388 res) mbg09138 (1388 aa) initn: 3654 init1: 2200 opt: 4794 Z-score: 3900.2 bits: 734.4 E(): 4.3e-212 Smith-Waterman score: 4794; 54.511% identity (56.115% ungapped) in 1330 aa overlap (245-1553:5-1317) 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 PPTLLIGSPLSLQDGQQGQQSTAQVKVQSRPPSQAAVLSASASLLVDLLEQQDIDLSP-- : : ..:: . :. .. .. . .: mKIAA0 GSPDPSSGDPAVSALQQQLLLMVARRTQSETPRH 10 20 30 280 290 300 310 320 mKIAA0 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