FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1055.ptfa, 979 aa vs ./tmplib.26680 library 1768038 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6423+/-0.00608; mu= 10.7029+/- 0.404 mean_var=194.9868+/-46.671, 0's: 0 Z-trim: 15 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0918 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mFLJ00006 ( 766 res) mbj00080 ( 766) 656 100 1.3e-21 mKIAA0882 ( 1229 res) mfj03243 (1229) 522 83 3.8e-16 mKIAA0676 ( 1268 res) mfj02220 (1268) 481 77 1.7e-14 mKIAA1108 ( 1266 res) mbg02140 (1266) 392 65 5.9e-11 mKIAA4104 ( 1065 res) mbg15134 (1065) 385 64 1e-10 mFLJ00288 ( 329 res) mic33003 ( 329) 363 61 3.7e-10 mKIAA0603 ( 956 res) mfj60230 ( 956) 358 61 1.1e-09 mKIAA0019 ( 841 res) mpm12253 ( 841) 346 59 3.1e-09 mFLJ00332 ( 439 res) msk03045 ( 439) 271 49 2.1e-06 mKIAA1322 ( 645 res) mbh00387 ( 645) 265 48 4.5e-06 mKIAA0608 ( 738 res) mfj39041 ( 738) 262 48 6.5e-06 mKIAA1171 ( 586 res) mph01652 ( 586) 207 40 0.00088 >>mFLJ00006 ( 766 res) mbj00080 (766 aa) initn: 662 init1: 591 opt: 656 Z-score: 480.5 bits: 100.0 E(): 1.3e-21 Smith-Waterman score: 669; 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