# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mpf00214.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1968.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1968, 1100 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7917356 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2776+/-0.000201; mu= 10.2159+/- 0.011 mean_var=113.1654+/-22.170, 0's: 39 Z-trim: 46 B-trim: 1048 in 2/64 Lambda= 0.120564 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|81895194|sp|Q80VW7.1|AKNA_MOUSE RecName: Full=A (1404) 5750 1011.8 0 gi|74185738|dbj|BAE32751.1| unnamed protein produc (1230) 5725 1007.4 0 gi|149059587|gb|EDM10525.1| AT-hook transcription (1402) 4919 867.3 0 gi|23273653|gb|AAH36324.1| Akna protein [Mus muscu ( 489) 3191 566.4 1.4e-158 gi|19387951|gb|AAH25835.1| Akna protein [Mus muscu ( 628) 2997 532.7 2.4e-148 gi|10440371|dbj|BAB15721.1| FLJ00020 protein [Homo (1142) 1934 348.0 1.7e-92 gi|52222837|gb|AAU34186.1| AKNA 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