Comparison of KIAA cDNA sequences between mouse and human (KIAA1541)
<< Original sequence data >>
mouse mKIAA1541 (mnh10009) length: 2078 bp
human KIAA1541 (hg04104) length: 6206 bp
<< Aligned sequence information (excl. stop, if exists.) >>
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length #match #mismatch %diff
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DNA
CDS1 : 1263 1132 131 10.37
Total: 1263 1132 131 10.37
3'UTR: 561 403 158 28.16
amino acid
CDS1 : 421 408 13 3.09
Total: 421 408 13 3.09
----------------------------------------------------------
<< Alignment region (incl. stop, if exists.) >>
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cDNA cDNA original amino acid
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CDS1 : mouse 247 - 1512 97 - 1512 51 - 472
human 1077 - 2342 909 - 2342 57 - 478
3'UTR: mouse 1513 - 2078
human 2343 - 6206
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<< Alignment >>
*--[ CDS1 ]--*
1 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 50
51 E A D I I S T V E F N Y S G D L L 67
mnh10009 247 GAAGCCGACATCATCTCCACCGTTGAGTTTAACTACTCTGGAGACCTTCT 296
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hg04104 1077 AAATCGGACATCATTTCCACCGTTGAGTTTAATTACTCTGGAGATCTTCT 1126
57 K S D I I S T V E F N Y S G D L L 73
51 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 100
68 A T G D K G G R V V I F Q R E Q E 84
mnh10009 297 TGCAACAGGAGACAAAGGTGGCAGAGTTGTTATTTTCCAGCGGGAACAAG 346
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hg04104 1127 TGCAACAGGAGACAAGGGCGGCAGAGTTGTTATTTTTCAGCGTGAACAAG 1176
74 A T G D K G G R V V I F Q R E Q E 90
101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 150
85 N K G R A H S R G E Y N V Y S T 100
mnh10009 347 AGAATAAAGGCCGCGCTCACTCTAGGGGAGAGTACAATGTTTACAGTACC 396
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hg04104 1177 AGAATAAAAGCCGCCCTCATTCTAGGGGAGAATATAATGTTTACAGCACC 1226
91 N K S R P H S R G E Y N V Y S T 106
151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 200
101 F Q S H E P E F D Y L K S L E I E 117
mnh10009 397 TTTCAGAGTCATGAGCCAGAGTTTGACTATTTGAAAAGTCTAGAAATTGA 446
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hg04104 1227 TTTCAAAGTCATGAACCGGAGTTTGACTATTTGAAAAGTCTAGAAATTGA 1276
107 F Q S H E P E F D Y L K S L E I E 123
201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 250
118 E K I N K I R W L P Q Q N A A H F 134
mnh10009 447 AGAAAAAATTAATAAAATCAGGTGGTTACCGCAACAGAATGCTGCTCATT 496
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hg04104 1277 GGAAAAAATTAATAAAATTAGGTGGTTACCACAACAGAATGCTGCTCATT 1326
124 E K I N K I R W L P Q Q N A A H F 140
251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 300
135 L L S T N D K T I K L W K I S E 150
mnh10009 497 TTCTACTCTCTACAAATGATAAAACTATTAAATTATGGAAAATAAGTGAA 546
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hg04104 1327 TTCTACTGTCTACAAATGATAAAACTATAAAATTATGGAAAATAAGTGAA 1376
141 L L S T N D K T I K L W K I S E 156
301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 350
151 R D K R A E G Y N L K D E D G R L 167
mnh10009 547 CGGGATAAAAGAGCAGAAGGTTATAACTTGAAAGATGAAGATGGACGACT 596
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hg04104 1377 CGGGATAAAAGAGCAGAAGGTTATAACCTGAAAGACGAAGATGGAAGACT 1426
157 R D K R A E G Y N L K D E D G R L 173
351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 400
168 R D P F R I T A L R V P I L K P M 184
mnh10009 597 TCGAGACCCATTTAGAATTACGGCACTACGGGTTCCAATATTGAAGCCCA 646
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hg04104 1427 TCGAGACCCATTTAGGATCACGGCGCTACGGGTCCCAATATTGAAGCCCA 1476
174 R D P F R I T A L R V P I L K P M 190
401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 450
185 D L M V E A S P R R I F A N A H 200
mnh10009 647 TGGACCTTATGGTAGAAGCAAGTCCACGACGAATTTTTGCAAATGCTCAT 696
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hg04104 1477 TGGATCTTATGGTAGAAGCGAGTCCACGGCGAATTTTTGCAAATGCTCAC 1526
191 D L M V E A S P R R I F A N A H 206
451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 500
201 T Y H I N S I S V N S D H E T Y L 217
mnh10009 697 ACATATCACATAAATTCCATTTCAGTAAATAGTGATCATGAAACATATCT 746
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hg04104 1527 ACATATCATATAAATTCCATTTCAGTAAATAGTGATCATGAAACATATCT 1576
207 T Y H I N S I S V N S D H E T Y L 223
501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 550
218 S A D D L R I N L W H L E I T D R 234
mnh10009 747 CTCTGCAGATGATCTGAGAATTAACCTATGGCATTTAGAAATCACAGATA 796
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hg04104 1577 TTCTGCAGATGACCTGAGAATTAATTTATGGCACTTAGAAATCACAGATA 1626
224 S A D D L R I N L W H L E I T D R 240
551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 600
235 S F N I V D I K P A N M E E L T 250
mnh10009 797 GAAGCTTCAACATTGTGGACATTAAGCCAGCTAATATGGAGGAGCTGACA 846
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hg04104 1627 GAAGCTTTAACATCGTGGACATCAAGCCTGCTAACATGGAGGAGCTGACC 1676
241 S F N I V D I K P A N M E E L T 256
601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 650
251 E V I T A A E F H P H Q C N V F V 267
mnh10009 847 GAAGTCATCACTGCCGCAGAGTTCCACCCACATCAGTGCAATGTATTTGT 896
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hg04104 1677 GAAGTCATCACTGCAGCCGAGTTCCACCCGCACCAGTGCAACGTGTTCGT 1726
257 E V I T A A E F H P H Q C N V F V 273
651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 700
268 Y S S S K G T I R L C D M R S S A 284
mnh10009 897 TTACAGCAGCAGCAAGGGCACCATCAGGCTGTGTGACATGCGTTCCTCTG 946
|||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||||| ||||| |
hg04104 1727 CTACAGCAGTAGCAAAGGGACCATCCGCCTGTGTGACATGCGCTCCTCGG 1776
274 Y S S S K G T I R L C D M R S S A 290
701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 750
285 L C D R H A K F F E E P E D P S 300
mnh10009 947 CCCTATGTGACAGGCATGCCAAGTTTTTTGAAGAGCCAGAAGATCCCAGC 996
|||| || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||
hg04104 1777 CCCTGTGCGACAGACACTCCAAGTTTTTTGAAGAGCCTGAAGATCCCAGC 1826
291 L C D R H S K F F E E P E D P S 306
751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 800
301 S R S F F S E I I S S I S D V K F 317
mnh10009 997 AGTAGATCCTTCTTCTCAGAAATAATCTCATCTATATCTGATGTCAAGTT 1046
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hg04104 1827 AGTAGGTCCTTCTTCTCAGAAATAATTTCATCCATATCCGATGTAAAATT 1876
307 S R S F F S E I I S S I S D V K F 323
801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 850
318 S H S G R Y M M T R D Y L S V K V 334
mnh10009 1047 CAGCCACAGTGGTCGATACATGATGACCAGAGACTATCTGTCGGTGAAGG 1096
||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||
hg04104 1877 CAGTCATAGTGGGCGGTACATGATGACCAGAGACTACCTGTCGGTGAAGG 1926
324 S H S G R Y M M T R D Y L S V K V 340
851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 900
335 W D L N M E G R P V E T H Q V H 350
mnh10009 1097 TCTGGGACCTCAACATGGAGGGCAGGCCTGTGGAGACCCACCAGGTACAT 1146
| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||
hg04104 1927 TGTGGGACCTCAACATGGAGAGCAGGCCGGTGGAGACCCACCAGGTCCAC 1976
341 W D L N M E S R P V E T H Q V H 356
901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 950
351 E Y L R S K L C S L Y E N D C I F 367
mnh10009 1147 GAGTACCTGCGAAGCAAGCTCTGCTCCTTGTATGAGAACGACTGCATCTT 1196
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hg04104 1977 GAGTACCTGCGCAGCAAGCTCTGCTCTCTCTATGAGAACGACTGCATCTT 2026
357 E Y L R S K L C S L Y E N D C I F 373
951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1000
368 D K F E C C W N G S D S A I M T G 384
mnh10009 1197 TGACAAGTTCGAGTGCTGCTGGAACGGTTCAGACAGTGCCATTATGACGG 1246
||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| |
hg04104 2027 TGACAAGTTTGAGTGTTGCTGGAACGGTTCGGATAGCGCCATCATGACCG 2076
374 D K F E C C W N G S D S A I M T G 390
1001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1050
385 S Y N N F F R M F D R N T R R D 400
mnh10009 1247 GGTCCTACAACAACTTCTTTAGAATGTTTGATAGAAACACTCGGAGGGAT 1296
||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||
hg04104 2077 GGTCCTATAACAACTTCTTCAGGATGTTTGATAGAGACACGCGGAGGGAT 2126
391 S Y N N F F R M F D R D T R R D 406
1051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1100
401 V T L E A S R E N S K P R A S L K 417
mnh10009 1297 GTTACACTGGAAGCCTCAAGAGAGAACAGCAAACCCCGAGCCAGCCTGAA 1346
|| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| ||
hg04104 2127 GTGACCCTGGAGGCCTCGAGAGAGAGCAGCAAACCGCGCGCCAGCCTCAA 2176
407 V T L E A S R E S S K P R A S L K 423
1101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1150
418 P R K V C T G G K R K K D E I S V 434
mnh10009 1347 GCCCCGGAAAGTATGTACAGGGGGTAAGAGAAAGAAAGACGAGATTAGCG 1396
|||||||| || ||||| ||||||||| | | |||||||||||| || |
hg04104 2177 ACCCCGGAAGGTGTGTACGGGGGGTAAGCGGAGGAAAGACGAGATCAGTG 2226
424 P R K V C T G G K R R K D E I S V 440
1151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1200
435 D S L D F N K K I L H T A W H P 450
mnh10009 1397 TGGACAGTTTGGACTTCAATAAGAAGATCCTCCACACAGCCTGGCACCCC 1446
|||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
hg04104 2227 TGGACAGTCTGGACTTCAACAAGAAGATCCTGCACACAGCCTGGCACCCC 2276
441 D S L D F N K K I L H T A W H P 456
1201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1250
451 M E S I I A V A A T N N L Y I F Q 467
mnh10009 1447 ATGGAGAGCATTATTGCTGTAGCTGCCACCAATAACTTGTATATATTCCA 1496
|||| | | ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||
hg04104 2277 GTGGACAATGTCATTGCCGTGGCTGCCACCAATAACTTGTACATATTCCA 2326
457 V D N V I A V A A T N N L Y I F Q 473
1251 ----+----*----+- 1266
468 D K I N * 472
mnh10009 1497 GGACAAAATTAATTAA 1512
||||||||| || ||
hg04104 2327 GGACAAAATCAACTAG 2342
474 D K I N * 478
*--[ 3'UTR ]--*
1 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 50
mnh10009 1513 GAAAACTGACTGGAGGACCAAGTGTTGTCTTGCATATGTACGCCGGTCAA 1562
| | || ||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||
hg04104 2343 AGACGCGAACGTGAGGACCAAGTCTTGTCTTGCATAGTTAAGCCGGACAT 2392
51 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 100
mnh10009 1563 TTAGTTTTCCTGTCAAAAAAGGCATTGTCCTCTCCATTGAGAATAGTGGC 1612
|| | || ||| |||||||| ||||||| |||| |||| |
hg04104 2393 TTTTCTGTCAGAGAAAAGGCATCATTGTCCGCTCCATTAAGAACAGTGAC 2442
101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 150
mnh10009 1613 GCA.CTTCTACTTCCC.TAATAGATACAGGAGAAGAAGGGCTCTCAGCTG 1660
||| || ||||||||| | | ||| |||||||| ||| ||| ||||
hg04104 2443 GCACCTGCTACTTCCCTTCACAGACACAGGAGA..AAGCCGCCTCCGCTG 2490
151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 200
mnh10009 1661 GAGTC........................GGAAGAGATGAGTGCCGCTGC 1686
||| | | |||| | || |||||
hg04104 2491 GAGGCCCGGTGTGGTTCCGCCTCGGCGAGGCGCGAGACAGGCGCTGCTGC 2540
201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 250
mnh10009 1687 TGAAGGGAAAACCTGCTCGAAGCTGAATTGGTGGACTCTGCTCAATAAAG 1736
| | | | | || |||||||| || ||| |||| |||||| ||||
hg04104 2541 TCACGTGGAGACGCTCTCGAAGCAGAGTTGACGGACACTGCTCCCAAAAG 2590
251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 300
mnh10009 1737 GCCATTACTC.....AAATGTATTTATTTAAGTCTGAGCCTTCCTTTCCA 1781
| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||
hg04104 2591 GTCATTACTCAGAATAAATGTATTTATTTCAGTCCGAGCCTTCCTTTCCA 2640
301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 350
mnh10009 1782 GTTTATAGACCAAAAAACTAACATCTGAGAGGAAAAAAAAAAGCTCAT.C 1830
|||||||||||||||| ||||||| |||| ||| | | || |
hg04104 2641 ATTTATAGACCAAAAAATTAACATCCAAGAGAAAAGTTATTGTCAGATAC 2690
351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 400
mnh10009 1831 AAATCTCTCTCCAGCTCTTCCCTCTGTCTCTGCCATCCATCCCTGGGCCT 1880
||| |||||| || |||||||| |||||||||| || | |||||||
hg04104 2691 CGCTCTTTCTCCAACT.TTCCCTCTTTCTCTGCCAT.CACACTTGGGCCT 2738
401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 450
mnh10009 1881 TATCCTGGACATGGTGTGGCCACCACCCACGTTCCTCTCTG...GCCCTG 1927
| | | ||||||||||||| || | ||||||| | ||
hg04104 2739 TCACTGCAGCGTGGTGTGGCCACCGTCCGTG.TCCTCTCGGCCTTCCTCC 2787
451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 500
mnh10009 1928 GAGCCCCAGTGGGCTGCATCACCCTCCGCTGGTGCATGGTGCGTGGGTGC 1977
||| || |||| || ||| ||| | | ||
hg04104 2788 GAGTCCAGGTGGACT..............CTGTGGATGTGTGGATGTGGC 2823
501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 550
mnh10009 1978 CCGAGCAGGCTCAGGCAGCTCTACTCACCCACTGCA.CTGCCGTCACATC 2026
|||||||||||||||| || | |||||||||| ||| | |||| ||| |
hg04104 2824 CCGAGCAGGCTCAGGCGGCCCCACTCACCCACAGCATCCGCCGCCACCCC 2873
551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 600
mnh10009 2027 TTC.TGTGGAGCTACTTAATAAACACAACACACTGTGAAGTGTTTTTAAA 2075
||| ||| || |||||| |||||||||| | |||||||||||||
hg04104 2874 TTCGGGTGTGAGCGCTCAATAAAAACAACACACTATAAAGTGTTTTTAAA 2923
601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 650
mnh10009 2076 CCC............................................... 2078
||
hg04104 2924 TCCAAACAGAAGTATTGTCTTTTTATTTAATTTTATTGCATAGAATGAAG 2973
651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 700
mnh10009 2078 .................................................. 2078
hg04104 2974 TTATGCAGGGTTCTTCTTTGGAACTAACTGTTTGAGAAATGTGTGTCCTT 3023
701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 750
mnh10009 2078 .................................................. 2078
hg04104 3024 CTTTGGCAGCGTGGGGGTATGTGTGCAGCATTTCTGTCCCCAAGCTGCTG 3073
751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 800
mnh10009 2078 .................................................. 2078
hg04104 3074 CCCGCTGTGTTTCTGTAGAAGTAGCCCATCAGATACACCAGGTAAGGTCT 3123
801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 850
mnh10009 2078 .................................................. 2078
hg04104 3124 GGGAAAAGCCAGAACCGAGGCCACCTCTGAGAAAGAAAATTGCAAGGAAG 3173
851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 900
mnh10009 2078 .................................................. 2078
hg04104 3174 AACCAAAATTGCTGCCATCCAGTAAGCCTGGTTTAAAGTAGCTTCAAATT 3223
901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 950
mnh10009 2078 .................................................. 2078
hg04104 3224 CACTACAGTTGAAGAAATACGTGCTTGCTTTCTAAGGCTTTTGAAAAAGC 3273
951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1000
mnh10009 2078 .................................................. 2078
hg04104 3274 ACTTTGGGGAAAGTATACTTTTTAAACATTGCTAAAATTACATGCATGCT 3323
1001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1050
mnh10009 2078 .................................................. 2078
hg04104 3324 AAATTTCATCCTGCATTTCAAGCCAGCAAAATTAAGCAATTTTAATTACA 3373
1051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1100
mnh10009 2078 .................................................. 2078
hg04104 3374 CGATGCCACCAGTACGTTGGTTTATTTTCAAAGTAGGATCTTTGATACCA 3423
1101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1150
mnh10009 2078 .................................................. 2078
hg04104 3424 GAAATCAAGATTTTCCAAGACAAATAATACAGAGCTGTACCAATGCTGAG 3473
1151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1200
mnh10009 2078 .................................................. 2078
hg04104 3474 TGACCAGAGCTTGCTTCCGTGGGATTTAACACACGCCCACTACGTGTCCC 3523
1201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1250
mnh10009 2078 .................................................. 2078
hg04104 3524 CGAGGGGAGTGGGGAGTCGGGCTCCCGTGCCCCTGTGGAGATGGAGGTGT 3573
1251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1300
mnh10009 2078 .................................................. 2078
hg04104 3574 GTGCTGATCCCCCGTCCGCCTGTGGAGATGAAGGTGTGTGTTGATTCCTC 3623
1301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1350
mnh10009 2078 .................................................. 2078
hg04104 3624 CTGCTGCTGTGGAGATGGAGGTGTGTGCTGATCGCCCGTCACCCTGTCTA 3673
1351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1400
mnh10009 2078 .................................................. 2078
hg04104 3674 GATGAAGGTATGTGCTGATTGCCTGTGCCCCTGTGGAGAAGGAGGTGTGT 3723
1401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1450
mnh10009 2078 .................................................. 2078
hg04104 3724 GCTGATCCCCTGTGCCCTGTGGAGATGGAGGTGTGTGCTGCTCCCTCGTG 3773
1451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1500
mnh10009 2078 .................................................. 2078
hg04104 3774 CCCCTGTGGAGATGGAGGTGTGTGCTGATCCCCCATCCCATCCCCCTGTC 3823
1501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1550
mnh10009 2078 .................................................. 2078
hg04104 3824 TAGATGAAGGTGTGTGCTGATTCCTCATGCCCCTGTCTGGATGAAGGTGT 3873
1551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1600
mnh10009 2078 .................................................. 2078
hg04104 3874 GTGCTGATCCCCCGTCCCCCTGTGGAGATGAAGGTGTGTGCTGATCCCCC 3923
1601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1650
mnh10009 2078 .................................................. 2078
hg04104 3924 GTGCCCCTGTGGAGATGAAGGTGCGTGCTGATCCCCCATCTCCCTGTGGA 3973
1651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1700
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hg04104 3974 GATGAAGGTGTGTGCTGATCCCCATCCCCCTGTGGAGATGAAGGGATATG 4023
1701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1750
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hg04104 4024 CTGATCCCCTGTCCCACTGTGGAGATGAAGGGGTGTGCTGATCCCCCGTC 4073
1751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1800
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hg04104 4074 CCCCTGTGGAGATGAAGGTGTGTGCTGATCCCCCATCTCCCTGTGGAGAT 4123
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hg04104 4124 GAAGGGGTGTGCCAATCCCCCGCGCCCCTGTGGAGATGGAGGCGTGTGCT 4173
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hg04104 4174 GATCCCCATCCCCCTGTGGAGATGAAGGTGTGTGCTGATCCCCCATCCCC 4223
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1951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2000
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hg04104 4724 TGATCCCCCGTCTTCCTGTGGAGATGAAGGTGTGTGCTGATTCCTCATGC 4773
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hg04104 5024 CCCCCATCCCCCTGTGGAGATGAAGATGTGTGCTGATCCCCCGTCCTCCT 5073
2751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2800
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hg04104 6174 TTGACCAAAAAGTTCAATAAATTTTAAATGTTT 6206