Comparison of KIAA cDNA sequences between mouse and human (KIAA1541)

<<Original sequence data>>

mouse  mKIAA1541 (mnh10009)     length:   2078 bp, CDS:    97 -  1512
human   KIAA1541  (hg04104)     length:   6206 bp, CDS:   909 -  2342

In this page, the longest coding region predicted by GeneMark
was assigned as CDS for each of mouse and human KIAA cDNAs.
They were colored in green.  When the CDS positions were not identical
on the aligned sequences between mouse and human cDNAs, mouse cDNA
sequence was translated based on the human CDS information.
The amino acid sequence produced here may not be identical to the
protein sequence deduced (see Description).


<<Aligned sequence information>>

----------------------------------------------------------
            region      #match  #mismatch  %diff
----------------------------------------------------------
DNA

5'UTR:    127 -   956      90       92      50.5
  CDS:    957 -  2342    1167      169      12.6
3'UTR:   2343 -  2945     403      157      28.0

amino acid

  CDS:    957 -  2342     414       48      10.4
----------------------------------------------------------


<<Alignment>>

             1 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 50
mnh10009     1 .................................................. 1
                                                                 
hg04104      1 ACTTCGCAGGTCAAGGGGGCCATCGACGAGGACGTGGCCGAAGGGCGTGG 50

            51 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 100
mnh10009     1 .................................................. 1
                                                                 
hg04104     51 AGAGGAGAGCTCGGGGCTGCTGCCACAGATCATGCTGAGCCGCCAGCAGC 100

           101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 150
mnh10009     1 ..........................CGGGCATTGGGCGCCATTTTGAAA 24
                                         || | |   | |  ||   |||||
hg04104    101 TCCACCTGCCCTTGGCTTTGCTCATCCGTGGAAATGACAACAGCGTGAAA 150

           151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 200
mnh10009    25 AGGGGAAAAAAT...................................... 36
               | || | |  ||                                      
hg04104    151 ACGGCAGATGATGTACAAGGATTATGATGAAAATAGTCTTGACCTCACGG 200

           201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 250
mnh10009    37 TCCCTCCCCGGCGGCGGCGACGGTGG........................ 62
                |||||   |  |     ||| || |                        
hg04104    201 ACCCTCTGAGAGGTTCTTGACCGTTGCACCCTCAAGGGCCCACAGACCGC 250

           251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 300
mnh10009    63 .................................................. 63
                                                                 
hg04104    251 ACTTTGAGAACTGCTGCTTGAATGCAAGCTATTAGCAGTAGGAGTGTCAA 300

           301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 350
mnh10009    63 .................................................. 63
                                                                 
hg04104    301 GGACAGGGCAGACTTCAGGATTAACTGTTCCTTCTCATCTTTACCAGATT 350

           351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 400
mnh10009    63 .................................................. 63
                                                                 
hg04104    351 GTACTGGTTTTGTCTCAAAATACAAAAATAGAGTGTTTATTATGTAAAGA 400

           401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 450
mnh10009    63 .................................................. 63
                                                                 
hg04104    401 AAATCAAATGATAGAACAGCTGAGAACAGCTGGATCAAGAGCACAGAGCG 450

           451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 500
mnh10009    63 .................................................. 63
                                                                 
hg04104    451 GAAGTTCCTCTTCATCCCACTGCTGTCCTGGAGTCTTCCTCAGGACCCAC 500

           501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 550
mnh10009    63 .................................................. 63
                                                                 
hg04104    501 TGCTCCTAACTGTATCTTTGTAGATCATTTTCTATGTGTTTATTTATTTA 550

           551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 600
mnh10009    63 .................................................. 63
                                                                 
hg04104    551 TATTTTAAAACCTAGTTTGTGTATAAGCAATCTTTTTTAATCCACAAATG 600

           601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 650
mnh10009    63 .................................................. 63
                                                                 
hg04104    601 TGGAATCTTATTCTAGACTTTGAATAAGATTTTCTGTATTAGTCAGTATT 650

           651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 700
mnh10009    63 .................................................. 63
                                                                 
hg04104    651 GTTTTTTGCTACTTCTTTTCCTTTCCTTTCCTTTTTTGGAAATAGGGTCT 700

           701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 750
mnh10009    63 .......CGGCAGCGGCGGCGGCGGTGGCGGCCGGGGCTGAGCGCTCGGA 105
                      | |   |   ||| |  |||  |    | | | || ||||   
hg04104    701 TACTCCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCAGAGCTCACT 750

           751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 800
mnh10009   106 GCGCCTCGGTCGGCCGC..GCTCGGCTGGGCGCGTCCCGCCCGCGCCATG 153
               ||  |  | || | | |  ||    ||   |  |  | |||  |    | 
hg04104    751 GCAGCCTGATCAGGCTCAAGCAATCCTCTCCCTGCTCAGCCTCCTGAGTA 800

           801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 850
mnh10009   154 GCAGGAGCTGGAGGCGGCGGCTGCC......................... 178
               || ||| ||  ||||     |||||                         
hg04104    801 GCTGGAACTATAGGCTTGCACTGCCATGCCCAGCTTTTTTCTATTTTTTG 850

           851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 900
mnh10009   179 .................................................. 179
                                                                 
hg04104    851 TAGAGACAGGGTTTTGCTGTGTTGCCCAGGATGGTCTTGAACTCCTGGAC 900

           901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 950
mnh10009   179 .................................................. 179
                                                                 
hg04104    901 TCAAGTGATCCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAATGCTGGGAATACAAGCAT 950
                       S  S  H  L  G  L  P  K  C  W  E  Y  K  H  

           951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1000
                     R  R  A  A  T  T  S  S  G  -     L  A  G  E 
mnh10009   179 ......CGGCGGGCGGCAACGACTTCCAGTGGTGC..TTCTCGCAGGTGA 220
                      |||  | |||  | |||| |  |  | |  |    |    | |
hg04104    951 GAGCCATGGCATGTGGCCGCCACTTGCCTTTTTTCATTAAGAGTCTATAA 1000
               E  P  W  H  V  A  A  T  C  L  F  S  L  R  V  Y  N 

          1001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1050
                G  R  C  R  R  G  R  G                           
mnh10009   221 AGGGCGCTGTCGACGAGGACGTGGC......................... 245
                 || | | |    | | ||  |||                         
hg04104   1001 TTGGAGATCTTACAGGGAACTGGGCTTTCTGCTCAGCCATACTCGAGCTC 1050
                W  R  S  Y  R  E  L  G  F  L  L  S  H  T  R  A  H

          1051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1100
                                         E  A  D  I  I  S  T  V  
mnh10009   246 .........................GGAAGCCGACATCATCTCCACCGTT 270
                                        | || | |||||||| |||||||||
hg04104   1051 ATTTGACCCCCGGCCACTGCCCCTTGAAATCGGACATCATTTCCACCGTT 1100
                 L  T  P  G  H  C  P  L  K  S  D  I  I  S  T  V  

          1101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1150
               E  F  N  Y  S  G  D  L  L  A  T  G  D  K  G  G  R 
mnh10009   271 GAGTTTAACTACTCTGGAGACCTTCTTGCAACAGGAGACAAAGGTGGCAG 320
               |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||
hg04104   1101 GAGTTTAATTACTCTGGAGATCTTCTTGCAACAGGAGACAAGGGCGGCAG 1150
               E  F  N  Y  S  G  D  L  L  A  T  G  D  K  G  G  R 

          1151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1200
                V  V  I  F  Q  R  E  Q  E  N  K  G  R  A  H  S  R
mnh10009   321 AGTTGTTATTTTCCAGCGGGAACAAGAGAATAAAGGCCGCGCTCACTCTA 370
               |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||
hg04104   1151 AGTTGTTATTTTTCAGCGTGAACAAGAGAATAAAAGCCGCCCTCATTCTA 1200
                V  V  I  F  Q  R  E  Q  E  N  K  S  R  P  H  S  R

          1201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1250
                 G  E  Y  N  V  Y  S  T  F  Q  S  H  E  P  E  F  
mnh10009   371 GGGGAGAGTACAATGTTTACAGTACCTTTCAGAGTCATGAGCCAGAGTTT 420
               ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||
hg04104   1201 GGGGAGAATATAATGTTTACAGCACCTTTCAAAGTCATGAACCGGAGTTT 1250
                 G  E  Y  N  V  Y  S  T  F  Q  S  H  E  P  E  F  

          1251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1300
               D  Y  L  K  S  L  E  I  E  E  K  I  N  K  I  R  W 
mnh10009   421 GACTATTTGAAAAGTCTAGAAATTGAAGAAAAAATTAATAAAATCAGGTG 470
               |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
hg04104   1251 GACTATTTGAAAAGTCTAGAAATTGAGGAAAAAATTAATAAAATTAGGTG 1300
               D  Y  L  K  S  L  E  I  E  E  K  I  N  K  I  R  W 

          1301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1350
                L  P  Q  Q  N  A  A  H  F  L  L  S  T  N  D  K  T
mnh10009   471 GTTACCGCAACAGAATGCTGCTCATTTTCTACTCTCTACAAATGATAAAA 520
               |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
hg04104   1301 GTTACCACAACAGAATGCTGCTCATTTTCTACTGTCTACAAATGATAAAA 1350
                L  P  Q  Q  N  A  A  H  F  L  L  S  T  N  D  K  T

          1351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1400
                 I  K  L  W  K  I  S  E  R  D  K  R  A  E  G  Y  
mnh10009   521 CTATTAAATTATGGAAAATAAGTGAACGGGATAAAAGAGCAGAAGGTTAT 570
               |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
hg04104   1351 CTATAAAATTATGGAAAATAAGTGAACGGGATAAAAGAGCAGAAGGTTAT 1400
                 I  K  L  W  K  I  S  E  R  D  K  R  A  E  G  Y  

          1401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1450
               N  L  K  D  E  D  G  R  L  R  D  P  F  R  I  T  A 
mnh10009   571 AACTTGAAAGATGAAGATGGACGACTTCGAGACCCATTTAGAATTACGGC 620
               ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||
hg04104   1401 AACCTGAAAGACGAAGATGGAAGACTTCGAGACCCATTTAGGATCACGGC 1450
               N  L  K  D  E  D  G  R  L  R  D  P  F  R  I  T  A 

          1451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1500
                L  R  V  P  I  L  K  P  M  D  L  M  V  E  A  S  P
mnh10009   621 ACTACGGGTTCCAATATTGAAGCCCATGGACCTTATGGTAGAAGCAAGTC 670
                |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
hg04104   1451 GCTACGGGTCCCAATATTGAAGCCCATGGATCTTATGGTAGAAGCGAGTC 1500
                L  R  V  P  I  L  K  P  M  D  L  M  V  E  A  S  P

          1501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1550
                 R  R  I  F  A  N  A  H  T  Y  H  I  N  S  I  S  
mnh10009   671 CACGACGAATTTTTGCAAATGCTCATACATATCACATAAATTCCATTTCA 720
               |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
hg04104   1501 CACGGCGAATTTTTGCAAATGCTCACACATATCATATAAATTCCATTTCA 1550
                 R  R  I  F  A  N  A  H  T  Y  H  I  N  S  I  S  

          1551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1600
               V  N  S  D  H  E  T  Y  L  S  A  D  D  L  R  I  N 
mnh10009   721 GTAAATAGTGATCATGAAACATATCTCTCTGCAGATGATCTGAGAATTAA 770
               |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
hg04104   1551 GTAAATAGTGATCATGAAACATATCTTTCTGCAGATGACCTGAGAATTAA 1600
               V  N  S  D  H  E  T  Y  L  S  A  D  D  L  R  I  N 

          1601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1650
                L  W  H  L  E  I  T  D  R  S  F  N  I  V  D  I  K
mnh10009   771 CCTATGGCATTTAGAAATCACAGATAGAAGCTTCAACATTGTGGACATTA 820
                 ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
hg04104   1601 TTTATGGCACTTAGAAATCACAGATAGAAGCTTTAACATCGTGGACATCA 1650
                L  W  H  L  E  I  T  D  R  S  F  N  I  V  D  I  K

          1651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1700
                 P  A  N  M  E  E  L  T  E  V  I  T  A  A  E  F  
mnh10009   821 AGCCAGCTAATATGGAGGAGCTGACAGAAGTCATCACTGCCGCAGAGTTC 870
               |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||
hg04104   1651 AGCCTGCTAACATGGAGGAGCTGACCGAAGTCATCACTGCAGCCGAGTTC 1700
                 P  A  N  M  E  E  L  T  E  V  I  T  A  A  E  F  

          1701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1750
               H  P  H  Q  C  N  V  F  V  Y  S  S  S  K  G  T  I 
mnh10009   871 CACCCACATCAGTGCAATGTATTTGTTTACAGCAGCAGCAAGGGCACCAT 920
               ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| || |||||
hg04104   1701 CACCCGCACCAGTGCAACGTGTTCGTCTACAGCAGTAGCAAAGGGACCAT 1750
               H  P  H  Q  C  N  V  F  V  Y  S  S  S  K  G  T  I 

          1751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1800
                R  L  C  D  M  R  S  S  A  L  C  D  R  H  A  K  F
mnh10009   921 CAGGCTGTGTGACATGCGTTCCTCTGCCCTATGTGACAGGCATGCCAAGT 970
               | | |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||  ||||||
hg04104   1751 CCGCCTGTGTGACATGCGCTCCTCGGCCCTGTGCGACAGACACTCCAAGT 1800
                R  L  C  D  M  R  S  S  A  L  C  D  R  H  S  K  F

          1801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1850
                 F  E  E  P  E  D  P  S  S  R  S  F  F  S  E  I  
mnh10009   971 TTTTTGAAGAGCCAGAAGATCCCAGCAGTAGATCCTTCTTCTCAGAAATA 1020
               ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
hg04104   1801 TTTTTGAAGAGCCTGAAGATCCCAGCAGTAGGTCCTTCTTCTCAGAAATA 1850
                 F  E  E  P  E  D  P  S  S  R  S  F  F  S  E  I  

          1851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1900
               I  S  S  I  S  D  V  K  F  S  H  S  G  R  Y  M  M 
mnh10009  1021 ATCTCATCTATATCTGATGTCAAGTTCAGCCACAGTGGTCGATACATGAT 1070
               || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||||||
hg04104   1851 ATTTCATCCATATCCGATGTAAAATTCAGTCATAGTGGGCGGTACATGAT 1900
               I  S  S  I  S  D  V  K  F  S  H  S  G  R  Y  M  M 

          1901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1950
                T  R  D  Y  L  S  V  K  V  W  D  L  N  M  E  G  R
mnh10009  1071 GACCAGAGACTATCTGTCGGTGAAGGTCTGGGACCTCAACATGGAGGGCA 1120
               |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||
hg04104   1901 GACCAGAGACTACCTGTCGGTGAAGGTGTGGGACCTCAACATGGAGAGCA 1950
                T  R  D  Y  L  S  V  K  V  W  D  L  N  M  E  S  R

          1951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2000
                 P  V  E  T  H  Q  V  H  E  Y  L  R  S  K  L  C  
mnh10009  1121 GGCCTGTGGAGACCCACCAGGTACATGAGTACCTGCGAAGCAAGCTCTGC 1170
               |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||
hg04104   1951 GGCCGGTGGAGACCCACCAGGTCCACGAGTACCTGCGCAGCAAGCTCTGC 2000
                 P  V  E  T  H  Q  V  H  E  Y  L  R  S  K  L  C  

          2001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2050
               S  L  Y  E  N  D  C  I  F  D  K  F  E  C  C  W  N 
mnh10009  1171 TCCTTGTATGAGAACGACTGCATCTTTGACAAGTTCGAGTGCTGCTGGAA 1220
               ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
hg04104   2001 TCTCTCTATGAGAACGACTGCATCTTTGACAAGTTTGAGTGTTGCTGGAA 2050
               S  L  Y  E  N  D  C  I  F  D  K  F  E  C  C  W  N 

          2051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2100
                G  S  D  S  A  I  M  T  G  S  Y  N  N  F  F  R  M
mnh10009  1221 CGGTTCAGACAGTGCCATTATGACGGGGTCCTACAACAACTTCTTTAGAA 1270
               |||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |
hg04104   2051 CGGTTCGGATAGCGCCATCATGACCGGGTCCTATAACAACTTCTTCAGGA 2100
                G  S  D  S  A  I  M  T  G  S  Y  N  N  F  F  R  M

          2101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2150
                 F  D  R  N  T  R  R  D  V  T  L  E  A  S  R  E  
mnh10009  1271 TGTTTGATAGAAACACTCGGAGGGATGTTACACTGGAAGCCTCAAGAGAG 1320
               ||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||
hg04104   2101 TGTTTGATAGAGACACGCGGAGGGATGTGACCCTGGAGGCCTCGAGAGAG 2150
                 F  D  R  D  T  R  R  D  V  T  L  E  A  S  R  E  

          2151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2200
               N  S  K  P  R  A  S  L  K  P  R  K  V  C  T  G  G 
mnh10009  1321 AACAGCAAACCCCGAGCCAGCCTGAAGCCCCGGAAAGTATGTACAGGGGG 1370
               | ||||||||| || |||||||| || |||||||| || ||||| |||||
hg04104   2151 AGCAGCAAACCGCGCGCCAGCCTCAAACCCCGGAAGGTGTGTACGGGGGG 2200
               S  S  K  P  R  A  S  L  K  P  R  K  V  C  T  G  G 

          2201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2250
                K  R  K  K  D  E  I  S  V  D  S  L  D  F  N  K  K
mnh10009  1371 TAAGAGAAAGAAAGACGAGATTAGCGTGGACAGTTTGGACTTCAATAAGA 1420
               |||| | | |||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||
hg04104   2201 TAAGCGGAGGAAAGACGAGATCAGTGTGGACAGTCTGGACTTCAACAAGA 2250
                K  R  R  K  D  E  I  S  V  D  S  L  D  F  N  K  K

          2251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2300
                 I  L  H  T  A  W  H  P  M  E  S  I  I  A  V  A  
mnh10009  1421 AGATCCTCCACACAGCCTGGCACCCCATGGAGAGCATTATTGCTGTAGCT 1470
               ||||||| |||||||||||||||||| |||| |   | ||||| || |||
hg04104   2251 AGATCCTGCACACAGCCTGGCACCCCGTGGACAATGTCATTGCCGTGGCT 2300
                 I  L  H  T  A  W  H  P  V  D  N  V  I  A  V  A  

          2301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2350
               A  T  N  N  L  Y  I  F  Q  D  K  I  N  *          
mnh10009  1471 GCCACCAATAACTTGTATATATTCCAGGACAAAATTAATTAAGAAAACTG 1520
               ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||   |  |  
hg04104   2301 GCCACCAATAACTTGTACATATTCCAGGACAAAATCAACTAGAGACGCGA 2350
               A  T  N  N  L  Y  I  F  Q  D  K  I  N  *          

          2351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2400
mnh10009  1521 ACTGGAGGACCAAGTGTTGTCTTGCATATGTACGCCGGTCAATTAGTTTT 1570
               ||  ||||||||||| ||||||||||||  || ||||| || ||   | |
hg04104   2351 ACGTGAGGACCAAGTCTTGTCTTGCATAGTTAAGCCGGACATTTTTCTGT 2400

          2401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2450
mnh10009  1571 CCTGTCAAAAAAGGCATTGTCCTCTCCATTGAGAATAGTGGCGCA.CTTC 1619
               |     |||     |||||||| ||||||| |||| |||| |||| || |
hg04104   2401 CAGAGAAAAGGCATCATTGTCCGCTCCATTAAGAACAGTGACGCACCTGC 2450

          2451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2500
mnh10009  1620 TACTTCCC.TAATAGATACAGGAGAAGAAGGGCTCTCAGCTGGAGTC... 1665
               |||||||| | | ||| ||||||||  |||    ||| ||||||| |   
hg04104   2451 TACTTCCCTTCACAGACACAGGAGA..AAGCCGCCTCCGCTGGAGGCCCG 2498

          2501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2550
mnh10009  1666 .....................GGAAGAGATGAGTGCCGCTGCTGAAGGGA 1694
                                    |   ||||   | || |||||| | | | 
hg04104   2499 GTGTGGTTCCGCCTCGGCGAGGCGCGAGACAGGCGCTGCTGCTCACGTGG 2548

          2551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2600
mnh10009  1695 AAACCTGCTCGAAGCTGAATTGGTGGACTCTGCTCAATAAAGGCCATTAC 1744
               | ||   |||||||| || |||  |||| ||||||   ||||| ||||||
hg04104   2549 AGACGCTCTCGAAGCAGAGTTGACGGACACTGCTCCCAAAAGGTCATTAC 2598

          2601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2650
mnh10009  1745 TC.....AAATGTATTTATTTAAGTCTGAGCCTTCCTTTCCAGTTTATAG 1789
               ||     |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||
hg04104   2599 TCAGAATAAATGTATTTATTTCAGTCCGAGCCTTCCTTTCCAATTTATAG 2648

          2651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2700
mnh10009  1790 ACCAAAAAACTAACATCTGAGAGGAAAAAAAAAAGCTCAT.CAAATCTCT 1838
               ||||||||| |||||||  |||| |||   |    |  || |   ||| |
hg04104   2649 ACCAAAAAATTAACATCCAAGAGAAAAGTTATTGTCAGATACCGCTCTTT 2698

          2701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2750
mnh10009  1839 CTCCAGCTCTTCCCTCTGTCTCTGCCATCCATCCCTGGGCCTTATCCTGG 1888
               ||||| || |||||||| |||||||||| ||  | ||||||||  |    
hg04104   2699 CTCCAACT.TTCCCTCTTTCTCTGCCAT.CACACTTGGGCCTTCACTGCA 2746

          2751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2800
mnh10009  1889 ACATGGTGTGGCCACCACCCACGTTCCTCTCTG...GCCCTGGAGCCCCA 1935
                | |||||||||||||  ||  | ||||||| |    ||   ||| ||  
hg04104   2747 GCGTGGTGTGGCCACCGTCCGTG.TCCTCTCGGCCTTCCTCCGAGTCCAG 2795

          2801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2850
mnh10009  1936 GTGGGCTGCATCACCCTCCGCTGGTGCATGGTGCGTGGGTGCCCGAGCAG 1985
               |||| ||                ||| |||    |  |  ||||||||||
hg04104   2796 GTGGACT..............CTGTGGATGTGTGGATGTGGCCCGAGCAG 2831

          2851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2900
mnh10009  1986 GCTCAGGCAGCTCTACTCACCCACTGCA.CTGCCGTCACATCTTC.TGTG 2033
               |||||||| || | |||||||||| ||| | |||| |||  ||||  |||
hg04104   2832 GCTCAGGCGGCCCCACTCACCCACAGCATCCGCCGCCACCCCTTCGGGTG 2881

          2901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2950
mnh10009  2034 GAGCTACTTAATAAACACAACACACTGTGAAGTGTTTTTAAACCC..... 2078
                     || |||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||     
hg04104   2882 TGAGCGCTCAATAAAAACAACACACTATAAAGTGTTTTTAAATCCAAACA 2931

          2951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3000
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   2932 GAAGTATTGTCTTTTTATTTAATTTTATTGCATAGAATGAAGTTATGCAG 2981

          3001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3050
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   2982 GGTTCTTCTTTGGAACTAACTGTTTGAGAAATGTGTGTCCTTCTTTGGCA 3031

          3051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3100
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   3032 GCGTGGGGGTATGTGTGCAGCATTTCTGTCCCCAAGCTGCTGCCCGCTGT 3081

          3101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3150
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   3082 GTTTCTGTAGAAGTAGCCCATCAGATACACCAGGTAAGGTCTGGGAAAAG 3131

          3151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3200
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   3132 CCAGAACCGAGGCCACCTCTGAGAAAGAAAATTGCAAGGAAGAACCAAAA 3181

          3201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3250
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   3182 TTGCTGCCATCCAGTAAGCCTGGTTTAAAGTAGCTTCAAATTCACTACAG 3231

          3251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3300
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   3232 TTGAAGAAATACGTGCTTGCTTTCTAAGGCTTTTGAAAAAGCACTTTGGG 3281

          3301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3350
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   3282 GAAAGTATACTTTTTAAACATTGCTAAAATTACATGCATGCTAAATTTCA 3331

          3351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3400
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   3332 TCCTGCATTTCAAGCCAGCAAAATTAAGCAATTTTAATTACACGATGCCA 3381

          3401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3450
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   3382 CCAGTACGTTGGTTTATTTTCAAAGTAGGATCTTTGATACCAGAAATCAA 3431

          3451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3500
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   3432 GATTTTCCAAGACAAATAATACAGAGCTGTACCAATGCTGAGTGACCAGA 3481

          3501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3550
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   3482 GCTTGCTTCCGTGGGATTTAACACACGCCCACTACGTGTCCCCGAGGGGA 3531

          3551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3600
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   3532 GTGGGGAGTCGGGCTCCCGTGCCCCTGTGGAGATGGAGGTGTGTGCTGAT 3581

          3601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3650
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   3582 CCCCCGTCCGCCTGTGGAGATGAAGGTGTGTGTTGATTCCTCCTGCTGCT 3631

          3651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3700
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   3632 GTGGAGATGGAGGTGTGTGCTGATCGCCCGTCACCCTGTCTAGATGAAGG 3681

          3701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3750
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   3682 TATGTGCTGATTGCCTGTGCCCCTGTGGAGAAGGAGGTGTGTGCTGATCC 3731

          3751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3800
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   3732 CCTGTGCCCTGTGGAGATGGAGGTGTGTGCTGCTCCCTCGTGCCCCTGTG 3781

          3801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3850
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   3782 GAGATGGAGGTGTGTGCTGATCCCCCATCCCATCCCCCTGTCTAGATGAA 3831

          3851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3900
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   3832 GGTGTGTGCTGATTCCTCATGCCCCTGTCTGGATGAAGGTGTGTGCTGAT 3881

          3901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3950
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   3882 CCCCCGTCCCCCTGTGGAGATGAAGGTGTGTGCTGATCCCCCGTGCCCCT 3931

          3951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4000
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   3932 GTGGAGATGAAGGTGCGTGCTGATCCCCCATCTCCCTGTGGAGATGAAGG 3981

          4001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4050
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   3982 TGTGTGCTGATCCCCATCCCCCTGTGGAGATGAAGGGATATGCTGATCCC 4031

          4051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4100
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   4032 CTGTCCCACTGTGGAGATGAAGGGGTGTGCTGATCCCCCGTCCCCCTGTG 4081

          4101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4150
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   4082 GAGATGAAGGTGTGTGCTGATCCCCCATCTCCCTGTGGAGATGAAGGGGT 4131

          4151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4200
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   4132 GTGCCAATCCCCCGCGCCCCTGTGGAGATGGAGGCGTGTGCTGATCCCCA 4181

          4201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4250
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   4182 TCCCCCTGTGGAGATGAAGGTGTGTGCTGATCCCCCATCCCCATGTGGAG 4231

          4251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4300
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   4232 ATGAAGGGGTGTGTTGATCCCCTGTCCCCCTGTGGAGATGGTGTGTGCTG 4281

          4301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4350
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   4282 ATCCCCGTCCCCCTGTGGAGATGAAGGTGTGTGCTGATCCCCCATCTCCC 4331

          4351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4400
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   4332 TGTGAAGATGAAGGGGTGTGCTGATCCCCCGTGCCCCTGTGGACATGGAG 4381

          4401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4450
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   4382 GCGTGTGCTGATCCCCCGTCCCCCTGTGGAGATGAAGGTGTGTGCTGATC 4431

          4451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4500
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   4432 CCCCATCCCCATGTGGAGATGAAGGGGTGTGTTGATCCCCCGTCCCCCTG 4481

          4501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4550
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   4482 TGGAGATGAAGGTGTGTGCTGATCCCCGTCCCCCTGTGGAGATGAAGGGG 4531

          4551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4600
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   4532 TGTGCTGATCCCCCATGCCCTGTGGAGATGGAGGTGTGTGCTGATCCCTC 4581

          4601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4650
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   4582 GTGCCCCTGTGGAGATAGAGGTGTGTACTGATCCCCTGTTCCCCTATCTA 4631

          4651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4700
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   4632 GATGAAGGTGTGTACTGCTGATCCCCCGTCCCCCTGTGGAGATGAAGGTG 4681

          4701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4750
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   4682 TGTGCTGATCCCCCATCCCCCTGTGGAGATGAAGGGGTGTGCTGATCCCC 4731

          4751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4800
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   4732 CGTCTTCCTGTGGAGATGAAGGTGTGTGCTGATTCCTCATGCCCCTGTGG 4781

          4801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4850
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   4782 AGATGGAGGTGTGTGCTGATCCCCCATCCCCCTGTGGGGATGAAGGTGTG 4831

          4851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4900
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   4832 TGCTGATCCCCCATCCCCCTGTGGAGATGAAGGGGTATGCTGATCCCCCG 4881

          4901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4950
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   4882 TCCCCCTGTGGAGATGAAGGTGTGTGCTGATCCCCCATCCCCCTGTGGAG 4931

          4951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5000
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   4932 ATGAAGGGGTATGCTGATCCCCTGTCCCCCTGTGGGGATGAAGGTGTGTG 4981

          5001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5050
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   4982 CTGATCTCTTGTCCCCCTGTGGAGATGGAGGTGTGTGCTGATCCCCCATC 5031

          5051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5100
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   5032 CCCCTGTGGAGATGAAGATGTGTGCTGATCCCCCGTCCTCCTGTGGAGAT 5081

          5101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5150
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   5082 GAAGGTGTGTGCTGCTTCCTCGTGCCCCTGTGGAGATGGAGGTGTGTGCT 5131

          5151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5200
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   5132 GGTCCCCCGTCCCCCTGTGGAGATGGAGGTGTGTGCTGATCCCCCGTCCC 5181

          5201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5250
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   5182 CCTGTGGAGATGGAGGCGTGTGCTGATCCCCCATCCCCCTGTGGAGATGA 5231

          5251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5300
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   5232 AGGCGTGTGCTGATCCGCCATCCCACTGTGGAGATGAAGGCGTGTGCTGA 5281

          5301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5350
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   5282 TCCCCCATCCCCCTGTGGAGATAAAGGTGTGTGCTGATCCCCCATCCCCC 5331

          5351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5400
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   5332 TGTGGAGATGAAGGCGTGTGCTGATCCGCCATCCCACTGTGGAGATGAAG 5381

          5401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5450
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   5382 GCGTGTGCTGATCCCCCATCCCCCTGTGGAGATGAAGGCGTGTGCTCATC 5431

          5451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5500
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   5432 CCCCATCCCCCTGTGGAGATGAAGGCGTGTGCTGATCCGCCATCCCACTG 5481

          5501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5550
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   5482 TGGAGATGAAGGTGTGTGCTGATCCCCCATCCCCCTGTGGAGATGAAGGT 5531

          5551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5600
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   5532 GTGTGCTGATCCCCGGTCCCCCTGTGGAGATGAAGGTGTGTGCTGATCCC 5581

          5601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5650
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   5582 CCGTCCTCCTGTGGAGATGAAGGCGTGTGCTGATCCCCCGTCCCCCTGTG 5631

          5651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5700
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   5632 GAGATGAAGGCGTGTGCTGATCCGCCGTCCCCCTGTGGAGATGAAGGCGT 5681

          5701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5750
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   5682 GTGCTGATCCGCCATCCCCCTGTGGAGATGAAGGCGTGTGCTCATCCCCC 5731

          5751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5800
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   5732 ATCCCCCTGTGGAGATGAAGGCGTGTGCTGATCCGCCATCCCACTGTGGA 5781

          5801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5850
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   5782 GATGAAGGTGTGTGCTGATCCCCCATCCCCCTGTGGAGATGAAGGCGTGT 5831

          5851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5900
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   5832 GCTGATCCCCGGTCCCCCTGTGGAGATGAAGGTGTGTGTTGATCCCCCAT 5881

          5901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 5950
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   5882 CCCCCTGTGGAGGTGAAGGTGTGTGCTGATTACTAATCCACATGGGCAAG 5931

          5951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 6000
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   5932 AACAGGATGTCCGTCATTACCCTGAATCAATGCTAACACAGTGCCACTTG 5981

          6001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 6050
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   5982 AGTTCACATTAAGTTAGAAATTGAGAATCTAAAGGTACCTTTATTTTAAC 6031

          6051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 6100
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   6032 TAAAAAATAATTTATATACTGTATATTGATTGTGACACAATTTACAAAGT 6081

          6101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 6150
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   6082 CTGAGGTGTGGAACAGTTATTTAAGCATTAGTCAACCCTGGTCCTTAAGA 6131

          6151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 6200
mnh10009  2079 .................................................. 2079
                                                                 
hg04104   6132 CAGTTCTAGTAAAATGGGATTGTATATATTTGTTCAACTATTTTGACCAA 6181

          6201 ----+----*----+----*----+ 6225
mnh10009  2079 ......................... 2079
                                        
hg04104   6182 AAAGTTCAATAAATTTTAAATGTTT 6206