# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mnh10008.fasta.nr -Q ../query/mKIAA2035.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA2035, 623 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7919186 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1209+/-0.000193; mu= 8.5361+/- 0.011 mean_var=95.4847+/-18.285, 0's: 34 Z-trim: 39 B-trim: 262 in 1/65 Lambda= 0.131252 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|123230101|emb|CAM18662.1| zinc finger CCCH type (1177) 4200 805.8 0 gi|47117559|sp|Q8BYK8.2|ZC3H6_MOUSE RecName: Full= (1177) 4173 800.7 0 gi|27696591|gb|AAH43311.1| Zinc finger CCCH type c ( 936) 4162 798.5 0 gi|149023250|gb|EDL80144.1| zinc finger CCCH type (1180) 3776 725.5 2.3e-206 gi|109104224|ref|XP_001087547.1| PREDICTED: zinc f (1188) 3111 599.6 1.9e-168 gi|114579571|ref|XP_525863.2| PREDICTED: zinc fing (1189) 3105 598.5 4.1e-168 gi|47117369|sp|P61129.1|ZC3H6_HUMAN RecName: Full= (1189) 3078 593.3 1.4e-166 gi|118766347|ref|NP_940983.2| zinc finger CCCH-typ (1189) 3078 593.3 1.4e-166 gi|73980832|ref|XP_532959.2| PREDICTED: similar to (1166) 2943 567.8 6.9e-159 gi|149727373|ref|XP_001495641.1| PREDICTED: zinc f (1184) 2890 557.7 7.4e-156 gi|194671278|ref|XP_582657.4| PREDICTED: similar t (1213) 2775 536.0 2.7e-149 gi|34534836|dbj|BAC87128.1| unnamed protein produc ( 938) 2694 520.6 9.1e-145 gi|119572490|gb|EAW52105.1| hCG2040584 [Homo sapie ( 576) 2486 481.0 4.4e-133 gi|126304259|ref|XP_001382082.1| PREDICTED: simila (1189) 2112 410.4 1.6e-111 gi|224047526|ref|XP_002197235.1| PREDICTED: zinc f (1204) 2040 396.8 2.1e-107 gi|47077349|dbj|BAD18563.1| unnamed protein produc ( 892) 1844 359.6 2.5e-96 gi|26333093|dbj|BAC30264.1| unnamed protein produc ( 810) 1746 341.0 8.8e-91 gi|34528944|dbj|BAC85608.1| unnamed protein produc ( 342) 1660 324.5 3.5e-86 gi|134024349|gb|AAI35563.1| Zc3h6 protein [Xenopus (1005) 1042 207.8 1.4e-50 gi|189520055|ref|XP_687737.3| PREDICTED: similar t (1111) 960 192.3 7.2e-46 gi|161169020|ref|NP_941033.2| zinc finger CCCH-typ (1255) 758 154.1 2.6e-34 gi|94707996|sp|Q9UPT8.3|ZC3H4_HUMAN RecName: Full= (1303) 758 154.1 2.7e-34 gi|94708083|sp|Q6ZPZ3.2|ZC3H4_MOUSE RecName: Full= (1304) 758 154.1 2.7e-34 gi|47228963|emb|CAG09478.1| unnamed protein produc ( 855) 747 151.9 8.1e-34 gi|109458249|ref|XP_001053214.1| PREDICTED: simila (1304) 745 151.6 1.5e-33 gi|194215674|ref|XP_001917161.1| PREDICTED: simila (1176) 741 150.8 2.3e-33 gi|109125346|ref|XP_001109916.1| PREDICTED: simila (1303) 729 148.6 1.2e-32 gi|126329414|ref|XP_001373157.1| PREDICTED: simila (1273) 726 148.0 1.8e-32 gi|194675310|ref|XP_599954.4| PREDICTED: similar t (1303) 715 145.9 7.6e-32 gi|148710148|gb|EDL42094.1| mCG2069 [Mus musculus] (1038) 683 139.8 4.2e-30 gi|211828160|gb|AAH60274.2| Zc3h4 protein [Mus mus ( 584) 676 138.3 6.7e-30 gi|170284827|gb|AAI61391.1| LOC100145628 protein [ (1053) 673 137.9 1.6e-29 gi|149056891|gb|EDM08322.1| rCG53646 [Rattus norve ( 686) 670 137.2 1.7e-29 gi|195540171|gb|AAI68044.1| LOC100145628 protein [ (1365) 673 138.0 2e-29 gi|119577860|gb|EAW57456.1| hCG2040158 [Homo sapie (1009) 658 135.1 1.1e-28 gi|55731493|emb|CAH92458.1| hypothetical protein [ ( 250) 639 131.1 4.3e-28 gi|189528905|ref|XP_686060.3| PREDICTED: similar t (1352) 604 124.9 1.7e-25 gi|47207919|emb|CAG05196.1| unnamed protein produc (1216) 565 117.5 2.6e-23 >>gi|123230101|emb|CAM18662.1| zinc finger CCCH type con (1177 aa) initn: 4200 init1: 4200 opt: 4200 Z-score: 4295.1 bits: 805.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 4200; 100.000% identity (100.000% similar) in 623 aa overlap (1-623:555-1177) 10 20 30 mKIAA2 SVKVPRESHSSPASLYQQMPSEMQRSADSE :::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 GPHSQAGGLVQLDTLPSMGGAYHSPGFPGHSVKVPRESHSSPASLYQQMPSEMQRSADSE 530 540 550 560 570 580 40 50 60 70 80 90 mKIAA2 SMQGSAEFYDDYYPQHAAHNFQPPDNSADEMWHEEFAQQQPPIARDTAHLGSGPNSSSRM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 SMQGSAEFYDDYYPQHAAHNFQPPDNSADEMWHEEFAQQQPPIARDTAHLGSGPNSSSRM 590 600 610 620 630 640 100 110 120 130 140 150 mKIAA2 TSHCPLSASGLPPAVQRALFIPLTQRYQEDEEPAGTQPHRASSKEEDDTANWYSSSEEEE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 TSHCPLSASGLPPAVQRALFIPLTQRYQEDEEPAGTQPHRASSKEEDDTANWYSSSEEEE 650 660 670 680 690 700 160 170 180 190 200 210 mKIAA2 GSGVKSILRTLQKQTGTLRNQQLPPTELSVPTDPRLAKEKRKRNQVVDPRLRTVPRQDIK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 GSGVKSILRTLQKQTGTLRNQQLPPTELSVPTDPRLAKEKRKRNQVVDPRLRTVPRQDIK 710 720 730 740 750 760 220 230 240 250 260 270 mKIAA2 KPHESVPVDLRLVWDPKKLRGNGGAPGGSSARGAEFDLRHTNAGANHKSKRREDDDEDSE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 KPHESVPVDLRLVWDPKKLRGNGGAPGGSSARGAEFDLRHTNAGANHKSKRREDDDEDSE 770 780 790 800 810 820 280 290 300 310 320 330 mKIAA2 RELREKAFLIPLDSSPGIVLQDPRSQLRQFSHIKMDIILNKPNFAKHIVWAPEDLLPVPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 RELREKAFLIPLDSSPGIVLQDPRSQLRQFSHIKMDIILNKPNFAKHIVWAPEDLLPVPL 830 840 850 860 870 880 340 350 360 370 380 390 mKIAA2 PKPDPVSSINLPLPPLIADQRLNRLWNTKSDHQGALSLDPTSAAKAKLSLTHREGCLEQS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 PKPDPVSSINLPLPPLIADQRLNRLWNTKSDHQGALSLDPTSAAKAKLSLTHREGCLEQS 890 900 910 920 930 940 400 410 420 430 440 450 mKIAA2 GDLHSSGGKLGDPRLQKNFDPRLHRLPNTESHQVTAKDSHSSRSALPLARWNPALSQSST :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 GDLHSSGGKLGDPRLQKNFDPRLHRLPNTESHQVTAKDSHSSRSALPLARWNPALSQSST 950 960 970 980 990 1000 460 470 480 490 500 510 mKIAA2 AAPINVASVTPPLYAPKLSSEGLPPGTSSSVLSGISLYDPRDKGSLSAMELSTISSGENT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 AAPINVASVTPPLYAPKLSSEGLPPGTSSSVLSGISLYDPRDKGSLSAMELSTISSGENT 1010 1020 1030 1040 1050 1060 520 530 540 550 560 570 mKIAA2 ESQKKSGLKNSDKNQPSPGEVIVPQNTTANLEVPVDGPVDMQTDILRSADKVQVPAVHSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 ESQKKSGLKNSDKNQPSPGEVIVPQNTTANLEVPVDGPVDMQTDILRSADKVQVPAVHSL 1070 1080 1090 1100 1110 1120 580 590 600 610 620 mKIAA2 PIQALTGLLRPPYSDPRQAREPGQASPTPDEETDDKPLKEVFKTFDPTASPFC ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|123 PIQALTGLLRPPYSDPRQAREPGQASPTPDEETDDKPLKEVFKTFDPTASPFC 1130 1140 1150 1160 1170 >>gi|47117559|sp|Q8BYK8.2|ZC3H6_MOUSE RecName: Full=Zinc (1177 aa) initn: 4173 init1: 4173 opt: 4173 Z-score: 4267.5 bits: 800.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 4173; 99.197% identity (99.518% similar) in 623 aa overlap (1-623:555-1177) 10 20 30 mKIAA2 SVKVPRESHSSPASLYQQMPSEMQRSADSE :::::::::::::::::::::::::::::: gi|471 GPHSQAGGLVQLDTLPSMGGAYHSPGFPGHSVKVPRESHSSPASLYQQMPSEMQRSADSE 530 540 550 560 570 580 40 50 60 70 80 90 mKIAA2 SMQGSAEFYDDYYPQHAAHNFQPPDNSADEMWHEEFAQQQPPIARDTAHLGSGPNSSSRM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|471 SMQGSAEFYDDYYPQHAAHNFQPPDNSADEMWHEEFAQQQPPIARDTAHLGSGPNSSSRM 590 600 610 620 630 640 100 110 120 130 140 150 mKIAA2 TSHCPLSASGLPPAVQRALFIPLTQRYQEDEEPAGTQPHRASSKEEDDTANWYSSSEEEE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|471 TSHCPLSASGLPPAVQRALFIPLTQRYQEDEEPAGTQPHRASSKEEDDTANWYSSSEEEE 650 660 670 680 690 700 160 170 180 190 200 210 mKIAA2 GSGVKSILRTLQKQTGTLRNQQLPPTELSVPTDPRLAKEKRKRNQVVDPRLRTVPRQDIK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|471 GSGVKSILRTLQKQTGTLRNQQLPPTELSVPTDPRLAKEKRKRNQVVDPRLRTVPRQDIK 710 720 730 740 750 760 220 230 240 250 260 270 mKIAA2 KPHESVPVDLRLVWDPKKLRGNGGAPGGSSARGAEFDLRHTNAGANHKSKRREDDDEDSE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|471 KPHESVPVDLRLVWDPKKLRGNGGAPGGSSARGAEFDLRHTNAGANHKSKRREDDDEDSE 770 780 790 800 810 820 280 290 300 310 320 330 mKIAA2 RELREKAFLIPLDSSPGIVLQDPRSQLRQFSHIKMDIILNKPNFAKHIVWAPEDLLPVPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|471 RELREKAFLIPLDSSPGIVLQDPRSQLRQFSHIKMDIILNKPNFAKHIVWAPEDLLPVPL 830 840 850 860 870 880 340 350 360 370 380 390 mKIAA2 PKPDPVSSINLPLPPLIADQRLNRLWNTKSDHQGALSLDPTSAAKAKLSLTHREGCLEQS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|471 PKPDPVSSINLPLPPLIADQRLNRLWNTKSDHQGALSLDPTSAAKAKLSLTHREGCLEQS 890 900 910 920 930 940 400 410 420 430 440 450 mKIAA2 GDLHSSGGKLGDPRLQKNFDPRLHRLPNTESHQVTAKDSHSSRSALPLARWNPALSQSST ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :: gi|471 GDLHSSGGKLGDPRLQKNFDPRLHRLPNTESHQVTAKDSHSSRSALPLARWNPALSQPST 950 960 970 980 990 1000 460 470 480 490 500 510 mKIAA2 AAPINVASVTPPLYAPKLSSEGLPPGTSSSVLSGISLYDPRDKGSLSAMELSTISSGENT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::: gi|471 AAPINVASVTPPLYAPKLSSEGLPPGTSSSVLSGISLYDPRDKGSLSATELSTISSGENT 1010 1020 1030 1040 1050 1060 520 530 540 550 560 570 mKIAA2 ESQKKSGLKNSDKNQPSPGEVIVPQNTTANLEVPVDGPVDMQTDILRSADKVQVPAVHSL ::::::::::::::::::::: :::::::..::::::::::::::::::::::::::::: gi|471 ESQKKSGLKNSDKNQPSPGEVTVPQNTTADMEVPVDGPVDMQTDILRSADKVQVPAVHSL 1070 1080 1090 1100 1110 1120 580 590 600 610 620 mKIAA2 PIQALTGLLRPPYSDPRQAREPGQASPTPDEETDDKPLKEVFKTFDPTASPFC ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|471 PIQALTGLLRPPYSDPRQAREPGQASPTPDEETDDKPLKEVFKTFDPTASPFC 1130 1140 1150 1160 1170 >>gi|27696591|gb|AAH43311.1| Zinc finger CCCH type conta (936 aa) initn: 4162 init1: 4162 opt: 4162 Z-score: 4257.7 bits: 798.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 4162; 98.876% identity (99.518% similar) in 623 aa overlap (1-623:314-936) 10 20 30 mKIAA2 SVKVPRESHSSPASLYQQMPSEMQRSADSE :.:::::::::::::::::::::::::::: gi|276 GPHSQAGGLVQLDTLPSMGGAYHSPGFPGHSMKVPRESHSSPASLYQQMPSEMQRSADSE 290 300 310 320 330 340 40 50 60 70 80 90 mKIAA2 SMQGSAEFYDDYYPQHAAHNFQPPDNSADEMWHEEFAQQQPPIARDTAHLGSGPNSSSRM ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::: gi|276 SMQGSAEFYDDYYPQHAAHNFQPPDNSADEMWHEEFAQQQPPIAHDTAHLGSGPNSSSRM 350 360 370 380 390 400 100 110 120 130 140 150 mKIAA2 TSHCPLSASGLPPAVQRALFIPLTQRYQEDEEPAGTQPHRASSKEEDDTANWYSSSEEEE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|276 TSHCPLSASGLPPAVQRALFIPLTQRYQEDEEPAGTQPHRASSKEEDDTANWYSSSEEEE 410 420 430 440 450 460 160 170 180 190 200 210 mKIAA2 GSGVKSILRTLQKQTGTLRNQQLPPTELSVPTDPRLAKEKRKRNQVVDPRLRTVPRQDIK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|276 GSGVKSILRTLQKQTGTLRNQQLPPTELSVPTDPRLAKEKRKRNQVVDPRLRTVPRQDIK 470 480 490 500 510 520 220 230 240 250 260 270 mKIAA2 KPHESVPVDLRLVWDPKKLRGNGGAPGGSSARGAEFDLRHTNAGANHKSKRREDDDEDSE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|276 KPHESVPVDLRLVWDPKKLRGNGGAPGGSSARGAEFDLRHTNAGANHKSKRREDDDEDSE 530 540 550 560 570 580 280 290 300 310 320 330 mKIAA2 RELREKAFLIPLDSSPGIVLQDPRSQLRQFSHIKMDIILNKPNFAKHIVWAPEDLLPVPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|276 RELREKAFLIPLDSSPGIVLQDPRSQLRQFSHIKMDIILNKPNFAKHIVWAPEDLLPVPL 590 600 610 620 630 640 340 350 360 370 380 390 mKIAA2 PKPDPVSSINLPLPPLIADQRLNRLWNTKSDHQGALSLDPTSAAKAKLSLTHREGCLEQS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|276 PKPDPVSSINLPLPPLIADQRLNRLWNTKSDHQGALSLDPTSAAKAKLSLTHREGCLEQS 650 660 670 680 690 700 400 410 420 430 440 450 mKIAA2 GDLHSSGGKLGDPRLQKNFDPRLHRLPNTESHQVTAKDSHSSRSALPLARWNPALSQSST ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :: gi|276 GDLHSSGGKLGDPRLQKNFDPRLHRLPNTESHQVTAKDSHSSRSALPLARWNPALSQPST 710 720 730 740 750 760 460 470 480 490 500 510 mKIAA2 AAPINVASVTPPLYAPKLSSEGLPPGTSSSVLSGISLYDPRDKGSLSAMELSTISSGENT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::: gi|276 AAPINVASVTPPLYAPKLSSEGLPPGTSSSVLSGISLYDPRDKGSLSATELSTISSGENT 770 780 790 800 810 820 520 530 540 550 560 570 mKIAA2 ESQKKSGLKNSDKNQPSPGEVIVPQNTTANLEVPVDGPVDMQTDILRSADKVQVPAVHSL ::::::::::::::::::::: :::::::..::::::::::::::::::::::::::::: gi|276 ESQKKSGLKNSDKNQPSPGEVTVPQNTTADMEVPVDGPVDMQTDILRSADKVQVPAVHSL 830 840 850 860 870 880 580 590 600 610 620 mKIAA2 PIQALTGLLRPPYSDPRQAREPGQASPTPDEETDDKPLKEVFKTFDPTASPFC ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|276 PIQALTGLLRPPYSDPRQAREPGQASPTPDEETDDKPLKEVFKTFDPTASPFC 890 900 910 920 930 >>gi|149023250|gb|EDL80144.1| zinc finger CCCH type cont (1180 aa) initn: 3708 init1: 3650 opt: 3776 Z-score: 3861.2 bits: 725.5 E(): 2.3e-206 Smith-Waterman score: 3776; 88.498% identity (95.208% similar) in 626 aa overlap (2-623:555-1180) 10 20 30 mKIAA2 SVKVPRESHSSPASLYQQMPSEMQRSADSES .::::::::: ::::::::::.: ::::: gi|149 PHSQAGGLVQLDTLPSMGGAYHSPGFPGHVMKVPRESHSSTASLYQQMPSEVQLSADSEC 530 540 550 560 570 580 40 50 60 70 80 90 mKIAA2 MQGSAEFYDDYYPQHAAHNFQPPDNSADEMWHEEFAQQQPPIARDTAHLGSGPNSSSRMT .::::: :::::::.:::.:::::::::::::::::::::: :.:. ::::::..:: .: gi|149 LQGSAEVYDDYYPQNAAHSFQPPDNSADEMWHEEFAQQQPPGAHDSPHLGSGPDTSSTLT 590 600 610 620 630 640 100 110 120 130 140 150 mKIAA2 SHCPLSASGLPPAVQRALFIPLTQRYQEDEEPAGTQPHRASSKEEDDTANWYSSSEEEEG ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::: gi|149 SHCPLPASGLPPAVQRALFIPLTQRYQEDEEPAGTQPHRASSKEEDDTVNWYSSSEEEEG 650 660 670 680 690 700 160 170 180 190 200 210 mKIAA2 SGVKSILRTLQKQTGTLRNQQLPPTELSVPTDPRLAKEKRKRNQVVDPRLRTVPRQDIKK ::::::::::::::::::::: ::::::.:::::::::::: ::::::::::::::::.: gi|149 SGVKSILRTLQKQTGTLRNQQHPPTELSIPTDPRLAKEKRKGNQVVDPRLRTVPRQDIRK 710 720 730 740 750 760 220 230 240 250 260 270 mKIAA2 PHESVPVDLRLVWDPKKLRGNGGAPGGSSARGAEFDLRHTNAGANHKSKRREDDDEDSER :::::::::::::::.:.:::::::::::: ::.::::::.:::::: :::.:::::.:: gi|149 PHESVPVDLRLVWDPRKFRGNGGAPGGSSATGAKFDLRHTSAGANHKPKRRDDDDEDTER 770 780 790 800 810 820 280 290 300 310 320 330 mKIAA2 ELREKAFLIPLDSSPGIVLQDPRSQLRQFSHIKMDIILNKPNFAKHIVWAPEDLLPVPLP ::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|149 ELREKAFLIPLDSSPGVVLQDPRSQLRQFSHIKMDIILNKPNFAKHIVWAPEDLLPVPLP 830 840 850 860 870 880 340 350 360 370 380 390 mKIAA2 KPDPVSSINLPLPPLIADQRLNRLWNTKSDHQGALSLDPTSAAKAKLSLTHREGCLEQSG :::::::::::::::::::::.:::::::::::.:::::::::::..::: ::::::::: gi|149 KPDPVSSINLPLPPLIADQRLSRLWNTKSDHQGTLSLDPTSAAKARMSLTPREGCLEQSG 890 900 910 920 930 940 400 410 420 430 440 450 mKIAA2 DLHSSGGKLGDPRLQKNFDPRLHRLPNTESHQVTAKDSHSSRSALPLARWNPALSQSSTA :::::::::::::::::::::::::::::: ::. ::::: :.::::::::::::: ::: gi|149 DLHSSGGKLGDPRLQKNFDPRLHRLPNTESPQVAIKDSHSLRNALPLARWNPALSQPSTA 950 960 970 980 990 1000 460 470 480 490 500 510 mKIAA2 APINVASVTPPLYAPKLSSEGLPPGTSSSVLSGISLYDPRDKGSLSAMELSTISSGENTE ::..:: :: :::: ::::.:::::: :::::::::::::::::::: :::::::::::: gi|149 APVTVAPVTLPLYASKLSSDGLPPGTPSSVLSGISLYDPRDKGSLSATELSTISSGENTE 1010 1020 1030 1040 1050 1060 520 530 540 550 560 570 mKIAA2 SQKKSGLKNSDKNQPSPGEVIVPQNTTANLEVPVDGPVDMQTDILRSADKVQVPAVHSLP .:::::.::::::::::::::.::.:::...::::::.:.:::.: ::: ::.::::::: gi|149 NQKKSGVKNSDKNQPSPGEVILPQKTTADMKVPVDGPADVQTDVLSSADGVQAPAVHSLP 1070 1080 1090 1100 1110 1120 580 590 600 610 620 mKIAA2 IQALTGLLRPPYSDPRQAREPGQASPTPDE----ETDDKPLKEVFKTFDPTASPFC :::::::. ::::::::::::::::::::. ::::: :::::::::::::::: gi|149 IQALTGLIGPPYSDPRQAREPGQASPTPDDDPSRETDDKSLKEVFKTFDPTASPFC 1130 1140 1150 1160 1170 1180 >>gi|109104224|ref|XP_001087547.1| PREDICTED: zinc finge (1188 aa) initn: 2784 init1: 1909 opt: 3111 Z-score: 3180.6 bits: 599.6 E(): 1.9e-168 Smith-Waterman score: 3111; 74.404% identity (88.235% similar) in 629 aa overlap (2-623:560-1188) 10 20 30 mKIAA2 SVKVPRESHSSPASLYQQMPSEMQRSADSES .:::::.: ::.: ::: :.::: .:. :: gi|109 QAGVLVQPDTSLTPPSMGGAYHSPGFPGHVMKVPRENHCSPGSSYQQSPGEMQLNANYES 530 540 550 560 570 580 40 50 60 70 80 90 mKIAA2 MQGSAEFYDDYYPQHAAHNFQPPDNSADEMWHEEFAQQQPPIARDTAHLGSGPNSSSRMT .:. :::::.:: :: .::::::.::.: ::: ::::::::...:. . ::: ..:: : gi|109 LQNPAEFYDNYYAQHPVHNFQPPSNSGDGMWHGEFAQQQPPVVQDSPNHGSGSDGSSTRT 590 600 610 620 630 640 100 110 120 130 140 150 mKIAA2 SHCPLSASGLPPAVQRALFIPLTQRYQEDEEPAGTQPHRASSKEEDDTANWYSSSEEEEG .: :: . :: ::::::::. :::::::::: ..:::::: :::::::.::::::::::: gi|109 GHGPLPVPGLLPAVQRALFVRLTQRYQEDEEQTSTQPHRAPSKEEDDTVNWYSSSEEEEG 650 660 670 680 690 700 160 170 180 190 200 210 mKIAA2 SGVKSILRTLQKQTGTLRNQQLPPTELSVPTDPRLAKEKRKRNQVVDPRLRTVPRQDIKK :.:::::.:::::: :::::: : ::::.:::::::::: : ::::::::::.:::::.: gi|109 SSVKSILKTLQKQTETLRNQQQPSTELSTPTDPRLAKEKSKGNQVVDPRLRTIPRQDIRK 710 720 730 740 750 760 220 230 240 250 260 270 mKIAA2 PHESVPVDLRLVWDPKKLRGNGGAPGGSSARGAEFDLRHTNAGANHKSKRREDDDEDSER : ::.:.:::..:::.::::::.. :::. ::.:::.:.:::.: : :: .:::::.:: gi|109 PSESAPLDLRFAWDPRKLRGNGSGHVGSSVSGAKFDLHHANAGTNVKHKRGDDDDEDTER 770 780 790 800 810 820 280 290 300 310 320 330 mKIAA2 ELREKAFLIPLDSSPGIVLQDPRSQLRQFSHIKMDIILNKPNFAKHIVWAPEDLLPVPLP ::::::::::::.::::.:::::::::::::::::: :.::::::::::::::::::::: gi|109 ELREKAFLIPLDASPGIMLQDPRSQLRQFSHIKMDITLTKPNFAKHIVWAPEDLLPVPLP 830 840 850 860 870 880 340 350 360 370 380 390 mKIAA2 KPDPVSSINLPLPPLIADQRLNRLWNTKSD-HQGALSLDPTSAAKAKLSLTHREGCLEQS :::::::::::::::::::::::::::::: ::...:.:: :::::.. : ::: ::: gi|109 KPDPVSSINLPLPPLIADQRLNRLWNTKSDLHQNTVSIDPKLAAKAKINTTSREGYLEQF 890 900 910 920 930 940 400 410 420 430 440 450 mKIAA2 GDLHSSGGKLGDPRLQKNFDPRLHRLPNTESHQVTAKDSHSSRSALPLARWNPALSQSST :: ::::.::::::::::::::::::::::::::. ::::.:..: ::: ::. :: : gi|109 GDSHSSGSKLGDPRLQKNFDPRLHRLPNTESHQVVMKDSHTSKGAPHLARPNPGSSQPSG 950 960 970 980 990 1000 460 470 480 490 500 mKIAA2 AAPINVASVTPPLYAPKLSSE-GLPPGTSSSVLSGISLYDPRDKGSLSAMELSTISSGEN :. : .: . : :.::::: ::: :::.:::::::::::::.:: :. ::.: ::::: gi|109 AGASNSGSGALPPYVPKLSSSAGLPLGTSTSVLSGISLYDPRDHGSSSTSELATASSGEN 1010 1020 1030 1040 1050 1060 510 520 530 540 550 560 mKIAA2 TESQKKSG-LKNSDKNQPSPGEVIVPQNTTANLEVPVDGPVDMQTDILRSADKVQVPAVH ...::::: ::.::::.:::::.:.::.:. :.:: .:::.: :.:. ::. :::::::: gi|109 SKNQKKSGGLKSSDKNEPSPGEAILPQKTSPNVEVTLDGPADPQADVPRSSGKVQVPAVH 1070 1080 1090 1100 1110 1120 570 580 590 600 610 620 mKIAA2 SLPIQALTGLLRPPYSDPRQAREPGQASPTPDE----ETDDKPLKEVFKTFDPTASPFC :::.::::::.:: ::::::::.:::.:::::. ::::: :::::::::::::::: gi|109 SLPVQALTGLIRPQYSDPRQARQPGQGSPTPDNDPGRETDDKSLKEVFKTFDPTASPFC 1130 1140 1150 1160 1170 1180 >>gi|114579571|ref|XP_525863.2| PREDICTED: zinc finger C (1189 aa) initn: 2778 init1: 1909 opt: 3105 Z-score: 3174.5 bits: 598.5 E(): 4.1e-168 Smith-Waterman score: 3105; 74.245% identity (88.394% similar) in 629 aa overlap (2-623:561-1189) 10 20 30 mKIAA2 SVKVPRESHSSPASLYQQMPSEMQRSADSES .:::::.: ::.: ::: :.::: ... :: gi|114 QAGVLVQPDTSLTPPSMGGAYHSPGFPGHVMKVPRENHCSPGSSYQQSPGEMQLNTNYES 540 550 560 570 580 590 40 50 60 70 80 90 mKIAA2 MQGSAEFYDDYYPQHAAHNFQPPDNSADEMWHEEFAQQQPPIARDTAHLGSGPNSSSRMT .:. :::::.:: ::. ::::::.::.: ::: ::::::::...:. . ::: ..:: : gi|114 LQNPAEFYDNYYAQHSIHNFQPPNNSGDGMWHGEFAQQQPPVVQDSPNHGSGSDGSSTRT 600 610 620 630 640 650 100 110 120 130 140 150 mKIAA2 SHCPLSASGLPPAVQRALFIPLTQRYQEDEEPAGTQPHRASSKEEDDTANWYSSSEEEEG .: :: . :: ::::::::. :::::::::: ..:::::: :::::::.::::::::::: gi|114 GHGPLPVPGLLPAVQRALFVRLTQRYQEDEEQTSTQPHRAPSKEEDDTVNWYSSSEEEEG 660 670 680 690 700 710 160 170 180 190 200 210 mKIAA2 SGVKSILRTLQKQTGTLRNQQLPPTELSVPTDPRLAKEKRKRNQVVDPRLRTVPRQDIKK :.:::::.:::::: :::::: : ::::.:::::::::: : ::::::::::.:::::.: gi|114 SSVKSILKTLQKQTETLRNQQQPSTELSAPTDPRLAKEKSKGNQVVDPRLRTIPRQDIRK 720 730 740 750 760 770 220 230 240 250 260 270 mKIAA2 PHESVPVDLRLVWDPKKLRGNGGAPGGSSARGAEFDLRHTNAGANHKSKRREDDDEDSER : ::.:.::::.:::.::::::.. :::. ::.:::.:.:::.: : :: .:::::.:: gi|114 PSESAPLDLRLAWDPRKLRGNGSGHIGSSVGGAKFDLHHANAGTNVKHKRGDDDDEDTER 780 790 800 810 820 830 280 290 300 310 320 330 mKIAA2 ELREKAFLIPLDSSPGIVLQDPRSQLRQFSHIKMDIILNKPNFAKHIVWAPEDLLPVPLP ::::::::::::.::::.:::::::::::::::::: :.::::::::::::::::::::: gi|114 ELREKAFLIPLDASPGIMLQDPRSQLRQFSHIKMDITLTKPNFAKHIVWAPEDLLPVPLP 840 850 860 870 880 890 340 350 360 370 380 390 mKIAA2 KPDPVSSINLPLPPLIADQRLNRLWNTKSD-HQGALSLDPTSAAKAKLSLTHREGCLEQS :::::::::::::::::::::::::::::: ::...:.:: :::::.. :.::: ::: gi|114 KPDPVSSINLPLPPLIADQRLNRLWNTKSDLHQNTVSIDPKLAAKAKINTTNREGYLEQF 900 910 920 930 940 950 400 410 420 430 440 450 mKIAA2 GDLHSSGGKLGDPRLQKNFDPRLHRLPNTESHQVTAKDSHSSRSALPLARWNPALSQSST :: :.::.::::::::::::::::::::::::::. ::::.:..: :.: ::. :: : gi|114 GDSHGSGAKLGDPRLQKNFDPRLHRLPNTESHQVVMKDSHTSKGAPHLSRSNPGSSQPSG 960 970 980 990 1000 1010 460 470 480 490 500 mKIAA2 AAPINVASVTPPLYAPKLSSE-GLPPGTSSSVLSGISLYDPRDKGSLSAMELSTISSGEN :. : .: . : ::::::: ::: :::.:::::::::::::.:: :. ::.: ::::: gi|114 AGTSNSGSGALPPYAPKLSSSAGLPLGTSTSVLSGISLYDPRDHGSSSTSELATASSGEN 1020 1030 1040 1050 1060 1070 510 520 530 540 550 560 mKIAA2 TESQKKSG-LKNSDKNQPSPGEVIVPQNTTANLEVPVDGPVDMQTDILRSADKVQVPAVH ...::::: ::.::.:.:::::.:.::.:. :.:: .:::.: :.:: ::. :::::::: gi|114 SKNQKKSGGLKSSDRNEPSPGEAILPQKTNPNVEVTLDGPADPQADIPRSSGKVQVPAVH 1080 1090 1100 1110 1120 1130 570 580 590 600 610 620 mKIAA2 SLPIQALTGLLRPPYSDPRQAREPGQASPTPDE----ETDDKPLKEVFKTFDPTASPFC :::.::::::.:: ::::::::.:::.:::::. ::::: :::::::::::::::: gi|114 SLPVQALTGLIRPQYSDPRQARQPGQGSPTPDNDPGRETDDKSLKEVFKTFDPTASPFC 1140 1150 1160 1170 1180 >>gi|47117369|sp|P61129.1|ZC3H6_HUMAN RecName: Full=Zinc (1189 aa) initn: 2751 init1: 1909 opt: 3078 Z-score: 3146.8 bits: 593.3 E(): 1.4e-166 Smith-Waterman score: 3078; 73.609% identity (87.917% similar) in 629 aa overlap (2-623:561-1189) 10 20 30 mKIAA2 SVKVPRESHSSPASLYQQMPSEMQRSADSES .:::::.: ::.: ::: :.::: ... :: gi|471 QAGVLVQPDTSLTPPSMGGAYHSPGFPGHVMKVPRENHCSPGSSYQQSPGEMQLNTNYES 540 550 560 570 580 590 40 50 60 70 80 90 mKIAA2 MQGSAEFYDDYYPQHAAHNFQPPDNSADEMWHEEFAQQQPPIARDTAHLGSGPNSSSRMT .:. :::::.:: ::. ::::::.::.: ::: ::::::::...:. . ::: ..:: : gi|471 LQNPAEFYDNYYAQHSIHNFQPPNNSGDGMWHGEFAQQQPPVVQDSPNHGSGSDGSSTRT 600 610 620 630 640 650 100 110 120 130 140 150 mKIAA2 SHCPLSASGLPPAVQRALFIPLTQRYQEDEEPAGTQPHRASSKEEDDTANWYSSSEEEEG .: :: . :: ::::::::. :::::::::: ..:::::: :::::::.::::::::::: gi|471 GHGPLPVPGLLPAVQRALFVRLTQRYQEDEEQTSTQPHRAPSKEEDDTVNWYSSSEEEEG 660 670 680 690 700 710 160 170 180 190 200 210 mKIAA2 SGVKSILRTLQKQTGTLRNQQLPPTELSVPTDPRLAKEKRKRNQVVDPRLRTVPRQDIKK :.:::::.:::::: :::::: : ::::.:::::::::: : ::::::::::.:::::.: gi|471 SSVKSILKTLQKQTETLRNQQQPSTELSTPTDPRLAKEKSKGNQVVDPRLRTIPRQDIRK 720 730 740 750 760 770 220 230 240 250 260 270 mKIAA2 PHESVPVDLRLVWDPKKLRGNGGAPGGSSARGAEFDLRHTNAGANHKSKRREDDDEDSER : ::.:.::::.:::.::::::.. :::. ::.:::.:.:::.: : :: .:::::.:: gi|471 PSESAPLDLRLAWDPRKLRGNGSGHIGSSVGGAKFDLHHANAGTNVKHKRGDDDDEDTER 780 790 800 810 820 830 280 290 300 310 320 330 mKIAA2 ELREKAFLIPLDSSPGIVLQDPRSQLRQFSHIKMDIILNKPNFAKHIVWAPEDLLPVPLP ::::::::::::.::::.:::::::::::::::::: :.::::::::::::::::::::: gi|471 ELREKAFLIPLDASPGIMLQDPRSQLRQFSHIKMDITLTKPNFAKHIVWAPEDLLPVPLP 840 850 860 870 880 890 340 350 360 370 380 390 mKIAA2 KPDPVSSINLPLPPLIADQRLNRLWNTKSD-HQGALSLDPTSAAKAKLSLTHREGCLEQS :::::::::::::::::::::::::::::: ::...:.:: :::::.. :.::: ::: gi|471 KPDPVSSINLPLPPLIADQRLNRLWNTKSDLHQNTVSIDPKLAAKAKINTTNREGYLEQF 900 910 920 930 940 950 400 410 420 430 440 450 mKIAA2 GDLHSSGGKLGDPRLQKNFDPRLHRLPNTESHQVTAKDSHSSRSALPLARWNPALSQSST :: :.::.::::::::::::::::::::::::::. ::::.:..: : : ::. :: : gi|471 GDSHGSGAKLGDPRLQKNFDPRLHRLPNTESHQVVMKDSHASKGAPHLPRSNPGSSQPSG 960 970 980 990 1000 1010 460 470 480 490 500 mKIAA2 AAPINVASVTPPLYAPKLSSE-GLPPGTSSSVLSGISLYDPRDKGSLSAMELSTISSGEN :. : .: . : ::::::: ::: :::.:::::::::::::.:: :. ::.: ::::: gi|471 AGTSNSGSGALPPYAPKLSSSAGLPLGTSTSVLSGISLYDPRDHGSSSTSELATASSGEN 1020 1030 1040 1050 1060 1070 510 520 530 540 550 560 mKIAA2 TESQKKSG-LKNSDKNQPSPGEVIVPQNTTANLEVPVDGPVDMQTDILRSADKVQVPAVH ...::::: ::.:::..:::::.:.::. . :. : ..::.: :.:. ::. :::::::: gi|471 SKNQKKSGGLKSSDKTEPSPGEAILPQKPSPNVGVTLEGPADPQADVPRSSGKVQVPAVH 1080 1090 1100 1110 1120 1130 570 580 590 600 610 620 mKIAA2 SLPIQALTGLLRPPYSDPRQAREPGQASPTPDE----ETDDKPLKEVFKTFDPTASPFC :::.::::::.:: ::::::::.:::.:::::. ::::: :::::::::::::::: gi|471 SLPVQALTGLIRPQYSDPRQARQPGQGSPTPDNDPGRETDDKSLKEVFKTFDPTASPFC 1140 1150 1160 1170 1180 >>gi|118766347|ref|NP_940983.2| zinc finger CCCH-type do (1189 aa) initn: 2751 init1: 1909 opt: 3078 Z-score: 3146.8 bits: 593.3 E(): 1.4e-166 Smith-Waterman score: 3078; 73.609% identity (87.917% similar) in 629 aa overlap (2-623:561-1189) 10 20 30 mKIAA2 SVKVPRESHSSPASLYQQMPSEMQRSADSES .:::::.: ::.: ::: :.::: ... :: gi|118 QAGVLVQPDTSLTPPSMGGAYHSPGFPGHVMKVPRENHCSPGSSYQQSPGEMQLNTNYES 540 550 560 570 580 590 40 50 60 70 80 90 mKIAA2 MQGSAEFYDDYYPQHAAHNFQPPDNSADEMWHEEFAQQQPPIARDTAHLGSGPNSSSRMT .:. :::::.:: ::. ::::::.::.: ::: ::::::::...:. . ::: ..:: : gi|118 LQNPAEFYDNYYAQHSIHNFQPPNNSGDGMWHGEFAQQQPPVVQDSPNHGSGSDGSSTRT 600 610 620 630 640 650 100 110 120 130 140 150 mKIAA2 SHCPLSASGLPPAVQRALFIPLTQRYQEDEEPAGTQPHRASSKEEDDTANWYSSSEEEEG .: :: . :: ::::::::. :::::::::: ..:::::: :::::::.::::::::::: gi|118 GHGPLPVPGLLPAVQRALFVRLTQRYQEDEEQTSTQPHRAPSKEEDDTVNWYSSSEEEEG 660 670 680 690 700 710 160 170 180 190 200 210 mKIAA2 SGVKSILRTLQKQTGTLRNQQLPPTELSVPTDPRLAKEKRKRNQVVDPRLRTVPRQDIKK :.:::::.:::::: :::::: : ::::.:::::::::: : ::::::::::.:::::.: gi|118 SSVKSILKTLQKQTETLRNQQQPSTELSTPTDPRLAKEKSKGNQVVDPRLRTIPRQDIRK 720 730 740 750 760 770 220 230 240 250 260 270 mKIAA2 PHESVPVDLRLVWDPKKLRGNGGAPGGSSARGAEFDLRHTNAGANHKSKRREDDDEDSER : ::.:.::::.:::.::::::.. :::. ::.:::.:.:::.: : :: .:::::.:: gi|118 PSESAPLDLRLAWDPRKLRGNGSGHIGSSVGGAKFDLHHANAGTNVKHKRGDDDDEDTER 780 790 800 810 820 830 280 290 300 310 320 330 mKIAA2 ELREKAFLIPLDSSPGIVLQDPRSQLRQFSHIKMDIILNKPNFAKHIVWAPEDLLPVPLP ::::::::::::.::::.:::::::::::::::::: :.::::::::::::::::::::: gi|118 ELREKAFLIPLDASPGIMLQDPRSQLRQFSHIKMDITLTKPNFAKHIVWAPEDLLPVPLP 840 850 860 870 880 890 340 350 360 370 380 390 mKIAA2 KPDPVSSINLPLPPLIADQRLNRLWNTKSD-HQGALSLDPTSAAKAKLSLTHREGCLEQS :::::::::::::::::::::::::::::: ::...:.:: :::::.. :.::: ::: gi|118 KPDPVSSINLPLPPLIADQRLNRLWNTKSDLHQNTVSIDPKLAAKAKINTTNREGYLEQF 900 910 920 930 940 950 400 410 420 430 440 450 mKIAA2 GDLHSSGGKLGDPRLQKNFDPRLHRLPNTESHQVTAKDSHSSRSALPLARWNPALSQSST :: :.::.::::::::::::::::::::::::::. ::::.:..: : : ::. :: : gi|118 GDSHGSGAKLGDPRLQKNFDPRLHRLPNTESHQVVMKDSHASKGAPHLPRSNPGSSQPSG 960 970 980 990 1000 1010 460 470 480 490 500 mKIAA2 AAPINVASVTPPLYAPKLSSE-GLPPGTSSSVLSGISLYDPRDKGSLSAMELSTISSGEN :. : .: . : ::::::: ::: :::.:::::::::::::.:: :. ::.: ::::: gi|118 AGTSNSGSGALPPYAPKLSSSAGLPLGTSTSVLSGISLYDPRDHGSSSTSELATASSGEN 1020 1030 1040 1050 1060 1070 510 520 530 540 550 560 mKIAA2 TESQKKSG-LKNSDKNQPSPGEVIVPQNTTANLEVPVDGPVDMQTDILRSADKVQVPAVH ...::::: ::.:::..:::::.:.::. . :. : ..::.: :.:. ::. :::::::: gi|118 SKNQKKSGGLKSSDKTEPSPGEAILPQKPSPNVGVTLEGPADPQADVPRSSGKVQVPAVH 1080 1090 1100 1110 1120 1130 570 580 590 600 610 620 mKIAA2 SLPIQALTGLLRPPYSDPRQAREPGQASPTPDE----ETDDKPLKEVFKTFDPTASPFC :::.::::::.:: ::::::::.:::.:::::. ::::: :::::::::::::::: gi|118 SLPVQALTGLIRPQYSDPRQARQPGQGSPTPDNDPGRETDDKSLKEVFKTFDPTASPFC 1140 1150 1160 1170 1180 >>gi|73980832|ref|XP_532959.2| PREDICTED: similar to Zin (1166 aa) initn: 1937 init1: 1494 opt: 2943 Z-score: 3008.8 bits: 567.8 E(): 6.9e-159 Smith-Waterman score: 2943; 71.338% identity (86.465% similar) in 628 aa overlap (2-623:544-1166) 10 20 30 mKIAA2 SVKVPRESHSSPASLYQQMPSEMQRSADSES .:: ::.: ::.: : : .::: :.. :: gi|739 HGQTGALVQPDTPLTPPSMSGTYHCFPEHMMKVARENHCSPGSSYLQSTGEMQLSTNYES 520 530 540 550 560 570 40 50 60 70 80 90 mKIAA2 MQGSAEFYDDYYPQHAAHNFQPPDNSADEMWHEEFAQQQPPIARDTAHLGSGPNSSSRMT .:. :::::.:: :::.::::::.:: : ::: .:::.::::..:. . ::: :.:. :: gi|739 LQNPAEFYDNYYSQHAVHNFQPPNNSDDGMWHVDFAQHQPPIVQDSPNCGSGSNGSTNMT 580 590 600 610 620 630 100 110 120 130 140 150 mKIAA2 SHCPLSASGLPPAVQRALFIPLTQRYQEDEEPAGTQPHRASSKEEDDTANWYSSSEEEEG .: :: : ::::::.::::. :::.:::..::..:::::: :::::::.::::::::::: gi|739 GHGPLPAPGLPPAVHRALFVRLTQKYQEEDEPSSTQPHRAPSKEEDDTVNWYSSSEEEEG 640 650 660 670 680 690 160 170 180 190 200 210 mKIAA2 SGVKSILRTLQKQTGTLRNQQLPPTELSVPTDPRLAKEKRKRNQVVDPRLRTVPRQDIKK :.:::::.:::::: :::.:: : ::::.:::::::::: : ::::::::::.::::..: gi|739 SSVKSILKTLQKQTETLRSQQQPSTELSTPTDPRLAKEKSKGNQVVDPRLRTIPRQDMRK 700 710 720 730 740 750 220 230 240 250 260 270 mKIAA2 PHESVPVDLRLVWDPKKLRGNGGAPGGSSARGAEFDLRHTNAGANHKSKRREDDDEDSER ::.:.::::.:::..:::::.. :::. :..:: .:.::: : :: .:::::.:: gi|739 SSESTPLDLRLAWDPRRLRGNGSSHVGSSVGGTKFDSHHANAGPV-KHKRGDDDDEDTER 760 770 780 790 800 810 280 290 300 310 320 330 mKIAA2 ELREKAFLIPLDSSPGIVLQDPRSQLRQFSHIKMDIILNKPNFAKHIVWAPEDLLPVPLP :::::::::::::::::.::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::: gi|739 ELREKAFLIPLDSSPGIMLQDPRSQLRQFSHIKMDIILTKPNFAKHIVWAPEDLLPVPLP 820 830 840 850 860 870 340 350 360 370 380 390 mKIAA2 KPDPVSSINLPLPPLIADQRLNRLWNTKSD-HQGALSLDPTSAAKAKLSLTHREGCLEQS :::::::::::::::::::::::::::::: ::... .: ::::::.. :.::: ::: gi|739 KPDPVSSINLPLPPLIADQRLNRLWNTKSDLHQNTVPVDSKSAAKAKVNTTNREGYLEQF 880 890 900 910 920 930 400 410 420 430 440 450 mKIAA2 GDLHSSGGKLGDPRLQKNFDPRLHRLPNTESHQVTAKDSHSSRSALPLARWNPALSQSST :::::::.:::::::::::::::::: .:::: .. ::::. ... ::: ::: :: . gi|739 GDLHSSGSKLGDPRLQKNFDPRLHRLHSTESHPAVMKDSHTLKGTPHLARSNPASSQPTG 940 950 960 970 980 990 460 470 480 490 500 mKIAA2 AAPINVASVTPPLYAPKLSSE-GLPPGTSSSVLSGISLYDPRDKGSLSAMELSTISSGEN :. . . . : ::::::: ::: :: :::::::::::::..:: :. ::.: :: gi|739 AVTSSSGPGALPPYAPKLSSSAGLPLGTPSSVLSGISLYDPREHGSSSTSELAT----EN 1000 1010 1020 1030 1040 510 520 530 540 550 560 mKIAA2 TESQKKSGLKNSDKNQPSPGEVIVPQNTTANLEVPVDGPVDMQTDILRSADKVQVPAVHS .:.::::.::.::::.:::::...::.:.::.:. ::: .: :.:::::. :::::::: gi|739 AENQKKSSLKSSDKNDPSPGEAVLPQKTSANVEATVDGLADPQADILRSSGVVQVPAVHS 1050 1060 1070 1080 1090 1100 570 580 590 600 610 620 mKIAA2 LPIQALTGLLRPPYSDPRQAREPGQASPT----PDEETDDKPLKEVFKTFDPTASPFC :::::::::.:: ::::::.:.::: ::: :..: ::: :::::::::::::::: gi|739 LPIQALTGLIRPQYSDPRQSRQPGQMSPTLESDPNREPDDKSLKEVFKTFDPTASPFC 1110 1120 1130 1140 1150 1160 >>gi|149727373|ref|XP_001495641.1| PREDICTED: zinc finge (1184 aa) initn: 2555 init1: 1759 opt: 2890 Z-score: 2954.5 bits: 557.7 E(): 7.4e-156 Smith-Waterman score: 2890; 71.429% identity (85.556% similar) in 630 aa overlap (2-623:562-1184) 10 20 30 mKIAA2 SVKVPRESHSSPASLYQQMPSEMQRSADSES .:::::.: ::.: . : :.::: . : :: gi|149 QAGVLVQPDTPLTPPSMSGTYHCPGFPEHIMKVPRENHCSPGSSHLQNPGEMQLT-DYES 540 550 560 570 580 590 40 50 60 70 80 90 mKIAA2 MQGSAEFYDDYYPQHAAHNFQPPDNSADEMWHEEFAQQQPPIARDTAHLGSGPNSSSRMT .:. .::::.:: :::.::::::.::.: :: ::::.:::...:. . ::: .::: .: gi|149 LQNPTEFYDNYYSQHAVHNFQPPNNSGDGMWPSEFAQHQPPVVQDSPNRGSGSDSSSNLT 600 610 620 630 640 650 100 110 120 130 140 150 mKIAA2 SHCPLSASGLPPAVQRALFIPLTQRYQEDEEPAGTQPHRASSKEEDDTANWYSSSEEEEG .: :: : :: ::::::::. :::.::: :::.::::.:. :::::::.::::::::::: gi|149 GHGPLPAPGLLPAVQRALFVRLTQKYQEGEEPSGTQPQRVPSKEEDDTVNWYSSSEEEEG 660 670 680 690 700 710 160 170 180 190 200 210 mKIAA2 SGVKSILRTLQKQTGTLRNQQLPPTELSVPTDPRLAKEKRKRNQVVDPRLRTVPRQDIKK :.:::::.:::::: :::.:: : .::: :::::::::: : ::::::::::. ::::.: gi|149 SSVKSILKTLQKQTETLRTQQQPSSELSPPTDPRLAKEKSKGNQVVDPRLRTISRQDIRK 720 730 740 750 760 770 220 230 240 250 260 270 mKIAA2 PHESVPVDLRLVWDPKKLRGNGGAPGGSSARGAEFDLRHTNAGANHKSKRREDDDEDSER ::.:.::::.:::.::::::.. :::. ::.:::.:..::.: : :: .:::::.:: gi|149 SSESTPLDLRLAWDPRKLRGNGSGHVGSSVGGAKFDLHHASAGTNAKHKRGDDDDEDTER 780 790 800 810 820 830 280 290 300 310 320 330 mKIAA2 ELREKAFLIPLDSSPGIVLQDPRSQLRQFSHIKMDIILNKPNFAKHIVWAPEDLLPVPLP ::::::::::::::::..:::::::::::::::::: :.::::::::::::::::::::: gi|149 ELREKAFLIPLDSSPGMMLQDPRSQLRQFSHIKMDITLTKPNFAKHIVWAPEDLLPVPLP 840 850 860 870 880 890 340 350 360 370 380 390 mKIAA2 KPDPVSSINLPLPPLIADQRLNRLWNTKSD-HQGALSLDPTSAAKAKLSLTHREGCLEQS :::::::::::::::::::::::::::::: ::... : :::::.. :.::. ::: gi|149 KPDPVSSINLPLPPLIADQRLNRLWNTKSDLHQNTVPTDSKLAAKAKINTTNREAYLEQF 900 910 920 930 940 950 400 410 420 430 440 450 mKIAA2 GDLHSSGGKLGDPRLQKNFDPRLHRLPNTESHQVTAKDSHSSRSALPLARWNPALSQSST :::::::.:::::::::::::::::: :.::::.. ::::.:.:: ::: ::. :: : gi|149 GDLHSSGSKLGDPRLQKNFDPRLHRLHNAESHQAVMKDSHTSKSAPHLARANPGSSQPSR 960 970 980 990 1000 1010 460 470 480 490 500 mKIAA2 AAPINVA-SVTPPLYAPKLSSE-GLPPGTSSSVLSGISLYDPRDKGSLSAMELSTISSGE :. : . .: :: ::::::: :: :: :::::::::::::.. : :. ::.. : gi|149 AVTSNSGPGVLPP-YAPKLSSSAGLLLGTPSSVLSGISLYDPREHISSSTSELAS----E 1020 1030 1040 1050 1060 510 520 530 540 550 560 mKIAA2 NTESQKKSG-LKNSDKNQPSPGEVIVPQNTTANLEVPVDGPVDMQTDILRSADKVQVPAV :::.::::: ::.::::. : :: :.::.:: :..: .:::.: :.::: :. :::::: gi|149 NTENQKKSGSLKSSDKNEAS-GEGILPQKTTPNVDVTADGPADPQADILPSSGMVQVPAV 1070 1080 1090 1100 1110 1120 570 580 590 600 610 620 mKIAA2 HSLPIQALTGLLRPPYSDPRQAREPGQASPTPDE----ETDDKPLKEVFKTFDPTASPFC :::::::::::.:: ::::::.:. ::.:::::. ::::: :::::::::::::::: gi|149 HSLPIQALTGLIRPQYSDPRQSRQQGQVSPTPDDDPSRETDDKSLKEVFKTFDPTASPFC 1130 1140 1150 1160 1170 1180 623 residues in 1 query sequences 2727779818 residues in 7921681 library sequences Tcomplib [34.26] (2 proc) start: Mon Mar 16 21:18:14 2009 done: Mon Mar 16 21:25:56 2009 Total Scan time: 1024.520 Total Display time: 0.290 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]