# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mng13118.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1911.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1911, 724 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7916963 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5323+/-0.00019; mu= 10.3906+/- 0.011 mean_var=92.0475+/-17.468, 0's: 29 Z-trim: 55 B-trim: 74 in 1/64 Lambda= 0.133681 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|74208355|dbj|BAE26373.1| unnamed protein produc ( 843) 4460 871.0 0 gi|67460471|sp|Q69Z69.2|ESCO1_MOUSE RecName: Full= ( 843) 4460 871.0 0 gi|183985967|gb|AAI66441.1| Esco1 protein [Rattus ( 840) 3929 768.6 0 gi|73961897|ref|XP_547645.2| PREDICTED: similar to ( 900) 3151 618.6 3.2e-174 gi|116241355|sp|Q5FWF5.3|ESCO1_HUMAN RecName: Full ( 840) 3096 608.0 4.7e-171 gi|58477533|gb|AAH89426.1| Establishment of cohesi ( 840) 3094 607.6 6.1e-171 gi|168270770|dbj|BAG10178.1| N-acetyltransferase E ( 840) 3088 606.4 1.4e-170 gi|114672524|ref|XP_523883.2| PREDICTED: establish ( 839) 3079 604.7 4.5e-170 gi|109121752|ref|XP_001091733.1| PREDICTED: simila ( 840) 3031 595.4 2.8e-167 gi|194678214|ref|XP_615012.4| PREDICTED: similar t ( 841) 2958 581.3 4.8e-163 gi|149721000|ref|XP_001491308.1| PREDICTED: establ ( 847) 2926 575.2 3.5e-161 gi|119621532|gb|EAX01127.1| establishment of cohes ( 701) 2856 561.6 3.5e-157 gi|50949433|emb|CAH10584.1| hypothetical protein [ ( 700) 2840 558.5 3e-156 gi|50949568|emb|CAH10682.1| hypothetical protein [ ( 581) 2461 485.3 2.6e-134 gi|26337523|dbj|BAC32447.1| unnamed protein produc ( 234) 1491 297.9 2.8e-78 gi|148691047|gb|EDL22994.1| mCG14668, isoform CRA_ ( 259) 1482 296.2 9.9e-78 gi|149031717|gb|EDL86667.1| rCG41261, isoform CRA_ ( 246) 1367 274.0 4.5e-71 gi|14198315|gb|AAH08220.1| Esco1 protein [Mus musc ( 234) 1305 262.1 1.7e-67 gi|74219146|dbj|BAE26712.1| unnamed protein produc ( 344) 1168 235.8 2.1e-59 gi|21748769|dbj|BAC03483.1| unnamed protein produc ( 386) 1126 227.7 6.2e-57 gi|224046144|ref|XP_002194852.1| PREDICTED: establ ( 852) 1123 227.4 1.7e-56 gi|26340334|dbj|BAC33830.1| unnamed protein produc ( 229) 933 190.3 6.8e-46 gi|148691048|gb|EDL22995.1| mCG14668, isoform CRA_ ( 319) 933 190.4 8.6e-46 gi|148691049|gb|EDL22996.1| mCG14668, isoform CRA_ ( 191) 928 189.3 1.2e-45 gi|149031720|gb|EDL86670.1| rCG41261, isoform CRA_ ( 319) 893 182.7 1.8e-43 gi|149491811|ref|XP_001505261.1| PREDICTED: simila ( 476) 878 180.0 1.8e-42 gi|149031718|gb|EDL86668.1| rCG41261, isoform CRA_ ( 178) 865 177.1 5e-42 gi|158828582|dbj|BAF91195.1| XEco1 [Xenopus laevis ( 262) 571 120.5 7.8e-25 gi|149411306|ref|XP_001507407.1| PREDICTED: simila ( 288) 515 109.8 1.5e-21 gi|47217459|emb|CAG10228.1| unnamed protein produc ( 251) 479 102.8 1.6e-19 gi|148704066|gb|EDL36013.1| establishment of cohes ( 516) 448 97.1 1.8e-17 gi|54311141|gb|AAH33303.2| Establishment of cohesi ( 592) 448 97.1 2e-17 gi|67460555|sp|Q8CIB9.3|ESCO2_MOUSE RecName: Full= ( 592) 448 97.1 2e-17 gi|68533796|gb|AAH99061.1| MGC115718 protein [Xeno ( 640) 441 95.8 5.3e-17 gi|158828580|dbj|BAF91194.1| XEco2 [Xenopus laevis ( 702) 441 95.8 5.7e-17 gi|12845802|dbj|BAB26905.1| unnamed protein produc ( 148) 430 93.1 7.8e-17 gi|67460434|sp|Q56NI9.1|ESCO2_HUMAN RecName: Full= ( 601) 435 94.6 1.1e-16 gi|119583942|gb|EAW63538.1| establishment of cohes ( 822) 435 94.7 1.4e-16 gi|109085986|ref|XP_001109626.1| PREDICTED: simila ( 600) 431 93.9 1.9e-16 gi|73993910|ref|XP_543224.2| PREDICTED: similar to ( 598) 430 93.7 2.2e-16 gi|114619463|ref|XP_001164762.1| PREDICTED: establ ( 601) 430 93.7 2.2e-16 gi|149030310|gb|EDL85366.1| rCG52137, isoform CRA_ ( 519) 428 93.2 2.6e-16 gi|148691050|gb|EDL22997.1| mCG14668, isoform CRA_ ( 217) 423 91.9 2.6e-16 gi|109501823|ref|XP_001080534.1| PREDICTED: simila ( 593) 428 93.3 2.8e-16 gi|149030309|gb|EDL85365.1| rCG52137, isoform CRA_ ( 595) 428 93.3 2.9e-16 gi|151556125|gb|AAI48945.1| ESCO2 protein [Bos tau ( 610) 428 93.3 2.9e-16 gi|183986176|gb|AAI66227.1| LOC100158558 protein [ ( 770) 429 93.6 3e-16 gi|71297041|gb|AAH34641.1| ESCO2 protein [Homo sap ( 239) 422 91.8 3.2e-16 gi|149746456|ref|XP_001492976.1| PREDICTED: simila ( 735) 427 93.2 3.8e-16 gi|109480686|ref|XP_001061977.1| PREDICTED: simila ( 595) 423 92.3 5.6e-16 >>gi|74208355|dbj|BAE26373.1| unnamed protein product [M (843 aa) initn: 4493 init1: 4460 opt: 4460 Z-score: 4649.0 bits: 871.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 4460; 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