# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mng12175.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0136.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0136, 984 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7916260 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6897+/-0.000191; mu= 11.6095+/- 0.011 mean_var=93.3994+/-17.957, 0's: 42 Z-trim: 63 B-trim: 428 in 1/66 Lambda= 0.132710 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|67867470|gb|AAH98072.1| Microrchidia 3 [Mus mus ( 942) 6183 1194.8 0 gi|148877531|gb|AAI45706.1| Microrchidia 3 [Mus mu ( 942) 6181 1194.4 0 gi|74001433|ref|XP_852752.1| PREDICTED: similar to ( 939) 5196 1005.8 0 gi|124375864|gb|AAI32732.1| MORC3 protein [Homo sa ( 938) 5159 998.7 0 gi|114684068|ref|XP_514887.2| PREDICTED: MORC fami ( 939) 5154 997.8 0 gi|108935853|sp|Q14149.3|MORC3_HUMAN RecName: Full ( 939) 5149 996.8 0 gi|66267201|gb|AAH94779.1| MORC family CW-type zin ( 939) 5143 995.6 0 gi|119630147|gb|EAX09742.1| MORC family CW-type zi ( 941) 5119 991.1 0 gi|194226231|ref|XP_001493369.2| PREDICTED: MORC f ( 966) 5017 971.5 0 gi|194663810|ref|XP_870987.3| PREDICTED: MORC fami ( 940) 4973 963.1 0 gi|109065361|ref|XP_001084530.1| PREDICTED: simila ( 868) 4682 907.4 0 gi|194379210|dbj|BAG58156.1| unnamed protein produ ( 868) 4667 904.5 0 gi|55726240|emb|CAH89892.1| hypothetical protein [ ( 867) 4631 897.6 0 gi|149637400|ref|XP_001512549.1| PREDICTED: simila ( 956) 4093 794.6 0 gi|149017732|gb|EDL76733.1| microrchidia 3 (predic ( 679) 3980 772.9 0 gi|154757654|gb|AAI51786.1| MORC3 protein [Bos tau ( 713) 3772 733.1 1.2e-208 gi|224042483|ref|XP_002187821.1| PREDICTED: dopey ( 930) 3121 608.5 4.8e-171 gi|60098661|emb|CAH65161.1| hypothetical protein [ ( 924) 3078 600.3 1.4e-168 gi|118083882|ref|XP_001234224.1| PREDICTED: hypoth (1011) 3078 600.3 1.5e-168 gi|126325349|ref|XP_001373989.1| PREDICTED: hypoth ( 925) 2924 570.8 1.1e-159 gi|20071493|gb|AAH26506.1| Morc3 protein [Mus musc ( 456) 2899 565.8 1.7e-158 gi|115292048|gb|AAI21993.1| MORC family CW-type zi ( 902) 2536 496.5 2.4e-137 gi|50415445|gb|AAH77542.1| Zcwcc3-prov protein [Xe ( 903) 2533 495.9 3.6e-137 gi|47123115|gb|AAH70772.1| MGC83806 protein [Xenop ( 895) 2485 486.7 2.1e-134 gi|141795583|gb|AAI35001.1| Zgc:162471 protein [Da (1079) 2167 425.9 5.2e-116 gi|63101882|gb|AAH95325.1| Zgc:162471 protein [Dan ( 491) 2081 409.2 2.6e-111 gi|220678197|emb|CAX14360.1| novel protein (zgc:10 ( 763) 1950 384.2 1.3e-103 gi|210095753|gb|EEA43911.1| hypothetical protein B ( 465) 1816 358.4 4.6e-96 gi|119633228|gb|ABL84747.1| MORC family CW-type zi ( 900) 1789 353.5 2.7e-94 gi|145553971|ref|NP_001078823.1| zinc finger, CW t ( 900) 1789 353.5 2.7e-94 gi|73920232|sp|Q8TE76.2|MORC4_HUMAN RecName: Full= ( 937) 1789 353.5 2.8e-94 gi|109131795|ref|XP_001093744.1| PREDICTED: zinc f ( 937) 1788 353.3 3.2e-94 gi|74008549|ref|XP_538131.2| PREDICTED: similar to (1021) 1776 351.0 1.7e-93 gi|12856723|dbj|BAB30759.1| unnamed protein produc ( 797) 1774 350.6 1.8e-93 gi|124376452|gb|AAI32498.1| Microrchidia 4 [Mus mu ( 883) 1772 350.2 2.6e-93 gi|73921009|sp|Q8BMD7.2|MORC4_MOUSE RecName: Full= ( 928) 1772 350.2 2.7e-93 gi|148691972|gb|EDL23919.1| microrchidia 4, isofor ( 977) 1772 350.3 2.8e-93 gi|119623133|gb|EAX02728.1| MORC family CW-type zi ( 935) 1770 349.9 3.5e-93 gi|124297883|gb|AAI32154.1| Microrchidia 4 [Mus mu ( 883) 1769 349.6 3.8e-93 gi|126541049|emb|CAM46136.1| microrchidia 4 [Mus m ( 883) 1767 349.3 5e-93 gi|126541048|emb|CAM46135.1| microrchidia 4 [Mus m ( 928) 1767 349.3 5.2e-93 gi|210095749|gb|EEA43907.1| hypothetical protein B ( 439) 1754 346.5 1.7e-92 gi|26328587|dbj|BAC28032.1| unnamed protein produc ( 883) 1752 346.4 3.7e-92 gi|68534224|gb|AAH98483.1| Morc4 protein [Mus musc ( 480) 1737 343.3 1.7e-91 gi|109469965|ref|XP_001053814.1| PREDICTED: simila (1031) 1739 344.0 2.3e-91 gi|149640079|ref|XP_001514155.1| PREDICTED: simila ( 696) 1723 340.7 1.4e-90 gi|194228180|ref|XP_001915527.1| PREDICTED: MORC f ( 857) 1686 333.7 2.3e-88 gi|62202673|gb|AAH93193.1| Zgc:152774 protein [Dan ( 422) 1629 322.6 2.6e-85 gi|82414755|gb|AAI10101.1| Zgc:152774 protein [Dan ( 396) 1624 321.6 4.8e-85 gi|194390598|dbj|BAG62058.1| unnamed protein produ ( 808) 1516 301.2 1.4e-78 >>gi|67867470|gb|AAH98072.1| Microrchidia 3 [Mus musculu (942 aa) initn: 6183 init1: 6183 opt: 6183 Z-score: 6395.4 bits: 1194.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 6183; 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