FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1939.ptfa, 798 aa vs ./tmplib.26680 library 1768219 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.5168+/-0.00416; mu= 22.7580+/- 0.279 mean_var=81.2306+/-18.614, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1423 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1137 ( 923 res) meh02020 ( 923) 1939 409 1.4e-114 mKIAA1021 ( 1196 res) mpm09008 (1196) 1312 280 8.9e-76 mKIAA4233 ( 1195 res) mbg18924 (1195) 1137 244 5.8e-65 mKIAA0566 ( 1521 res) mbg09880 (1521) 1054 227 8.8e-60 mKIAA0956 ( 1210 res) mpm12246 (1210) 563 127 1.7e-29 mKIAA0611 ( 1093 res) mbh02036 (1093) 443 102 4.3e-22 mKIAA0715 ( 889 res) mbp06183 ( 889) 357 84 8e-17 >>mKIAA1137 ( 923 res) meh02020 (923 aa) initn: 1951 init1: 1267 opt: 1939 Z-score: 2149.5 bits: 408.8 E(): 1.4e-114 Smith-Waterman score: 1939; 65.306% identity (65.455% ungapped) in 441 aa overlap (285-725:13-452) 260 270 280 290 300 310 mKIAA1 GPDTKLMQNSGKTKFKRTSIDRLMNTLVLWIFGFLVCLGIILAVGSSILESEVGDQFRTP :::::::.:.:::.:..: : ::: .:.. mKIAA1 ASASSALFLSPQIFGFLVCMGVILAIGNAIWEHEVGTRFQVY 10 20 30 40 320 330 340 350 360 370 mKIAA1 PFWREGEKSFLFSGFLTFWSYVIILNTLVPISLYVSVEVIRLGHSYFINWDRKMYYASKA : :. : .:::::.::::.:::::.:::::::::::::::::::::::.::. .: mKIAA1 LPWDEAVDSAFFSGFLSFWSYIIILNTVVPISLYVSVEVIRLGHSYFINWDKKMFCMKKR 50 60 70 80 90 100 380 390 400 410 420 430 mKIAA1 MPAEARTTTLNEELGQIEYIFSDKTGTLTQNIMTFKKCSINGRVYAGEVLDDPIQKKEIT :::::::::::::::.::::::::::::::::.:.::::::. : :.:.: .: :. mKIAA1 TPAEARTTTLNEELGQVEYIFSDKTGTLTQNIMVFNKCSINGHSY-GDVFDVLGHKAELG 110 120 130 140 150 160 440 450 460 470 480 490 mKIAA1 KEKEATDFSSKSKSEKTLHFFDQSLMESIELGDPKVHEFLRLLALCHTVMSEENSAGQLV .. : .::: . ..: . :.:.::.:....:::..:::.:::.:::::::::.. :.: mKIAA1 ERPEPVDFSFNPLADKKFLFWDSSLLEAVKMGDPHTHEFFRLLSLCHTVMSEEKNEGELY 170 180 190 200 210 220 500 510 520 530 540 550 mKIAA1 YQVQSPDEGALVTAARNFGFIFKSRTPETITIEELGTPVTYQLLAFLDFNNIRKRMSVIV :..:::::::::::::::::.:.::::.:::..:::: .::::::.:::::::::::::: mKIAA1 YKAQSPDEGALVTAARNFGFVFRSRTPKTITVHELGTAITYQLLAILDFNNIRKRMSVIV 230 240 250 260 270 280 560 570 580 590 600 610 mKIAA1 RNPEGRIKLYSKGADTILFEKLHPSNEDLQSLTSDHLSEFAGEGLRTLAIAYRELDDKYF :::::.:.:: :::::::...::: ...: : :.:::.:.::.:::::..::..::..:. mKIAA1 RNPEGKIRLYCKGADTILLDRLHPPTQELLSSTTDHLNEYAGDGLRTLVLAYKDLDEEYY 290 300 310 320 330 340 620 630 640 650 660 670 mKIAA1 KMWQKMLEDANSATLERDERISGLYEEIERDLMLLGATAVEDKLQEGVIETITSLSLANI . : . .:. : :..:....:::.: :.:::::::.:::::.:: :::. :.:::: mKIAA1 EEWARRRLQASLAQDSREDRLASIYEEVESDMMLLGATAIEDKLQQGVPETIALLTLANI 350 360 370 380 390 400 680 690 700 710 720 730 mKIAA1 KIWILTGDKQETAINIGYACNVLTDAMDALFVITGNTAGEVREELRCVLKERESGKGQGR :::.:::::::::.::::.:..::: : .::.::.:. ::::::: . :. mKIAA1 KIWVLTGDKQETAVNIGYSCKMLTDDMTEVFVVTGHTVLEVREELRKARKKMVDSSHAVG 410 420 430 440 450 460 740 750 760 770 780 790 mKIAA1 ETVLPFLFRSTSLGLNHVPHQGLILATRHCLRASNISQVFSGKNLKSCMLCFKMFLDKNL mKIAA1 NGFTYQGNLSSSKLTSVLEAVAGEYALVINGHSLAHALEADMELEFLETACACKAVICCR 470 480 490 500 510 520 >>mKIAA1021 ( 1196 res) mpm09008 (1196 aa) initn: 1348 init1: 330 opt: 1312 Z-score: 1452.8 bits: 280.3 E(): 8.9e-76 Smith-Waterman score: 1326; 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