Comparison of KIAA cDNA sequences between mouse and human (KIAA1665)

<< Original sequence data >>

mouse  mKIAA1665 (mie39080)     length:    877 bp
human   KIAA1665  (hk01809)     length:   4311 bp


<< Aligned sequence information (excl. stop, if exists.) >>

----------------------------------------------------------
            length    #match  #mismatch   %diff
----------------------------------------------------------
DNA

  CDS1 :      345       306       39      11.30
  Total:      345       306       39      11.30

  3'UTR:      536       298      238      44.40

amino acid

  CDS1 :      115       112        3       2.61
  Total:      115       112        3       2.61
----------------------------------------------------------


<< Alignment region (incl. stop, if exists.) >>

----------------------------------------------------------
                    cDNA      cDNA original    amino acid
----------------------------------------------------------
  CDS1 : mouse     2 -   349      2 -   349      1 -   115
         human   511 -   858    205 -   858    103 -   217
  3'UTR: mouse   350 -   877
         human   859 -  4311
----------------------------------------------------------


<< Alignment >>

*--[ CDS1 ]--*
             1 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 50
             1 K  G  C  S  P  E  G  V  H  V  S  L  G  F  F  D  D  17
mie39080     2 AAAGGCTGCAGCCCAGAGGGTGTGCACGTCTCTTTAGGGTTCTTTGATGA 51
               ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||
hk01809    511 AAAGGCTGCAGCCCAGAAGGAGTGCACGTCTCTCTAGGCTTCTTCGATGA 560
           103 K  G  C  S  P  E  G  V  H  V  S  L  G  F  F  D  D  119

            51 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 100
            18  I  L  I  P  P  E  S  L  Q  Q  P  A  K  F  D  E  A 34
mie39080    52 CATTCTCATCCCCCCTGAGTCACTGCAGCAGCCTGCCAAGTTTGATGAAG 101
               ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||
hk01809    561 CATTCTCATCCCCCCAGAGTCACTGCAGCAGCCAGCCAAGTTCGACGAAG 610
           120  I  L  I  P  P  E  S  L  Q  Q  P  A  K  F  D  E  A 136

           101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 150
            35   E  Q  V  W  V  W  E  Y  E  T  E  E  G  A  H  D   50
mie39080   102 CGGAGCAAGTGTGGGTGTGGGAGTACGAGACGGAGGAAGGAGCGCATGAC 151
               ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
hk01809    611 CGGAGCAGGTGTGGGTGTGGGAGTACGAGACGGAGGAAGGAGCACACGAC 660
           137   E  Q  V  W  V  W  E  Y  E  T  E  E  G  A  H  D   152

           151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 200
            51 L  Y  M  D  T  G  E  E  I  R  F  R  V  V  D  E  S  67
mie39080   152 CTGTACATGGACACTGGGGAGGAGATCCGCTTCAGGGTGGTGGATGAGAG 201
               || ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||
hk01809    661 CTCTACATGGACACCGGCGAGGAGATCCGCTTCCGGGTGGTGGACGAGAG 710
           153 L  Y  M  D  T  G  E  E  I  R  F  R  V  V  D  E  S  169

           201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 250
            68  F  V  D  T  S  P  T  G  P  S  S  A  E  A  A  S  S 84
mie39080   202 CTTTGTGGACACATCCCCCACAGGACCCAGTTCCGCCGAGGCTGCCTCTT 251
               |||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||  || |||
hk01809    711 CTTTGTTGACACGTCCCCCACAGGGCCCAGCTCAGCAGATGCCACCACTT 760
           170  F  V  D  T  S  P  T  G  P  S  S  A  D  A  T  T  S 186

           251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 300
            85   S  E  E  L  P  K  K  E  A  P  Y  T  L  V  G  S   100
mie39080   252 CAAGCGAGGAGCTGCCCAAGAAGGAAGCACCATATACACTTGTGGGATCT 301
               | || ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| 
hk01809    761 CCAGTGAGGAGCTGCCAAAGAAGGAGGCTCCGTACACGCTTGTGGGATCC 810
           187   S  E  E  L  P  K  K  E  A  P  Y  T  L  V  G  S   202

           301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+--- 348
           101 I  S  E  P  G  L  G  L  L  S  W  W  T  S  N  *   116
mie39080   302 ATCAGTGAGCCAGGACTAGGCCTTCTCTCCTGGTGGACGAGCAACTAG 349
               |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||
hk01809    811 ATCAGTGAGCCAGGCCTGGGCCTTCTCTCCTGGTGGACCAGCAACTAG 858
           203 I  S  E  P  G  L  G  L  L  S  W  W  T  S  N      217


*--[ 3'UTR ]--*
             1 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 50
mie39080   350 CCCTGGAGCT...CACAGTGACTGCCCAGCCT.................. 378
               |||||| |||   ||  |   |   |||||||                  
hk01809    859 CCCTGGGGCTGGACAGTGGACCCTACCAGCCTGCGGGAAGGTGGTATGGC 908

            51 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 100
mie39080   379 .....................................GAAGACCCTGTCC 391
                                                    | |||   |||| 
hk01809    909 CGGCTGTGAAGACAACAGCAGCTGAGGCCGATGCTAAGGAGATAGTGTCT 958

           101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 150
mie39080   392 AGACTTGGGAAAGTAGAGAGCAGTTTGAGTGTTCTCCAG........... 430
                ||  |||  |   ||  |       |||||  | ||||           
hk01809    959 CGAGCTGGACAGTGAGGCAAGGCCAGGAGTGCCCACCAGCTTGCCCCGCT 1008

           151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 200
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1009 CCTCCACCATCTAGGCCCTGCTCCTCCTTCACTGCAGTGATGGATCCATC 1058

           201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 250
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1059 TGTGGCTGTGGCTGTTGGGCCTCCACTGACCTTGACTGAAAAGACCCTTC 1108

           251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 300
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1109 CTGGACCCTGGACTTGACAACAAACGGCACAGACACCAATCACTCACAGA 1158

           301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 350
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1159 ACAGTCACTGGTTTTGGATTCTTGTTTTCCTTGCAAGAACAAAAGGTTCT 1208

           351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 400
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1209 CTAGAATCCTTCAGCCACCAATGAAATGATCAGGCAGGAGAAAAACTTTA 1258

           401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 450
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1259 GATGGGAGTCTTGTCATCAAAAATAAATACAGTTGCATGGAGCTGCTTAA 1308

           451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 500
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1309 GATCTGAACCAAACTCAAAATAGGAAGACGGGGGCTAAAAAGTTATTTTA 1358

           501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 550
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1359 AGAACCCCCCCACCACAACCACAGTCACTCCGTGGGCTAAGCGGGGAGCA 1408

           551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 600
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1409 GGAAGCATGTCTGGTCACACCATCTTGGAATAGGAAGCCATGGCTGGACG 1458

           601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 650
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1459 GATCGGATCCACTGATGGCACACGTGGAGCTGAACTTGACGCCAGCGGCG 1508

           651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 700
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1509 GGGCGGGGAGGCACTGCCCTCACTGTTGCAGTTCCTTCATTCTGTTGAGG 1558

           701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 750
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1559 GCACTGCCAGCGCGGAACCACTCAATCTGCGTCTCGTTGAAGGTGTGGTT 1608

           751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 800
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1609 CAGGAGGATGGTCTCCTGGGTCCCGTTGGGGTGCTTGATGATGCACTTCA 1658

           801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 850
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1659 GGGGCTGCAAGGAGAAGGTGGGTGTGGGTGGAAGTGGTGGGTACTGTGTG 1708

           851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 900
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1709 CCCTTGGCCCCGCAGGGGGGTCAGGGAGACAGGGCACTGCCTGGGGACCT 1758

           901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 950
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1759 AAGAGGTCAGCAGGCAAACCAAATCCTAGGCCAGTCTGTGCCTGATGGCC 1808

           951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1000
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1809 CAGGTCAGACCCAGGTGGCACCTACAGGGGATTCCTGGGGCCCAGAGGGT 1858

          1001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1050
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1859 CCTGCAGTGGGTGGGCTGTCCCCTGAGTGCCAGGTCCTGGTGAGTAAAGG 1908

          1051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1100
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1909 GAGGTTGGGGAGGTGTGAGGGCCCCGGGTTGACTCCAACCCCCAACTCTG 1958

          1101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1150
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1959 AGAAGCCACTTTGCTTTCTCTGTGGGGCCACCTGGAGAACTGGGGGCCTT 2008

          1151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1200
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   2009 TCCAGCTGGAATGAAGCCTCCTGGGAGAAGCTACCCTGGGGCCAGTGCAG 2058

          1201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1250
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   2059 GAGGGGAAACAAGGTGGCTGCCCCTCACCCCACCACCTCAGGGGGACCCG 2108

          1251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1300
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   2109 GGCCCCTAACCTTGCCAGGGGTGAAGTCCTTCAGGCCCTGAATGGTCAGC 2158

          1301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1350
mie39080   431 ......................................AGCCAAGCTTGG 442
                                                     ||| ||| |  |
hk01809   2159 TTGTCCACAGGGTGAATCTTGTTGTAGTCAGCCGGGTCAGCGAAGGTCAG 2208

          1351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1400
mie39080   443 TGGGACCAGGAGCAGTGACAAGTGCTTGTCCTCT................ 476
                || | ||||  | ||  |    | |||  ||||                
hk01809   2209 AGGCAGCAGGCCCTGTTTCTTCAGGTTGGTCTCTGGAAAGCAGGCGGCAT 2258

          1401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1450
mie39080   477 .................................................. 477
                                                                 
hk01809   2259 TCGGTCATCGGGGGCCTGACTAGCCTGGAGAGCTTCATTTTCTGAACCCA 2308

          1451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1500
mie39080   477 .................................................. 477
                                                                 
hk01809   2309 TCTGGGGCTCTGGGAGATGCCCCTAATCCTGCTGCCTGGGACAATGCCCG 2358

          1501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1550
mie39080   477 .................................................. 477
                                                                 
hk01809   2359 GGCAGTGACTATGGGGCCCTGGTCTGCTCCCTTTCACTAGGGGTGCCCCT 2408

          1551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1600
mie39080   477 .................................................. 477
                                                                 
hk01809   2409 AGCAAGTGTGCGCTGGTGCTGAGGTCTGCGAGGCCTTCCTGCTGCACATT 2458

          1601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1650
mie39080   477 .................................................. 477
                                                                 
hk01809   2459 CATGATCAGAAAGAACCCCCTGGCACATGTCCTAGATCTCAGTGGCTCAG 2508

          1651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1700
mie39080   477 .................................................. 477
                                                                 
hk01809   2509 ATCTACAAGCCTGGAAGCAGGGCCTGCGGGAAGCCGGGAAGCTGAGCGTC 2558

          1701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1750
mie39080   477 .................................................. 477
                                                                 
hk01809   2559 GGATGTGCACTGTGTGAGCCTAAGAAGGGGCAAGAGGCTGACGGGCCTGT 2608

          1751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1800
mie39080   477 .........................CCCTCCCCAGCACTGCTTCTCTCGT 501
                                        ||   |||| | | ||  |   |  
hk01809   2609 GGGCTGCAGTGGACACAGCCTAGAACCAGGCCCAACTCAGCCACGGGCAG 2658

          1801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1850
mie39080   502 CTGGAGCCACCCTGA...............................ATCG 520
                  |||  ||| |||                               |  |
hk01809   2659 GGAGAGTGACCTTGATCACTAGGGATGGGATGAGGATGGCCTGGGTACAG 2708

          1851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1900
mie39080   521 TCTCCAGAGTGTCATGGATCCAGGC......................... 545
                ||||||     | ||||||| |||                         
hk01809   2709 ACTCCAGCTCACCGTGGATCCTGGCAAAGCTCTTGGTGATGATGGCCCGG 2758

          1901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1950
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   2759 CCCCCAAGGTGGCGAGGCTCCAGAGCTGCATGCTCCCGGCTCGAGCCCTC 2808

          1951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2000
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   2809 GCCGTAGTTCTCGTCTCCGATCACCACCCACCTGATGCCATGTTTCTGTC 2858

          2001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2050
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   2859 AGGCAAGCGGGGGTAAGGTTATAAGGCAGAGGAGGGCACCGTCCTCACCT 2908

          2051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2100
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   2909 GTCTGGCCCTACCTGCCTGGCCTCACCCACCTGGCGCCTGGGCATCCTGA 2958

          2101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2150
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   2959 GGCTCCCGGTAAAGGGGCTGGAGGGGCCCTTCCTCGCCTGCTGCCTAAGG 3008

          2151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2200
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   3009 GCAAGTGAAGCCTGCGTGAATGAGACCCAAACGAGGCCCCGAGGGGACAG 3058

          2201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2250
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   3059 AGGCACGTGGTTGTTTGCAGTGGCAAAGAAGACAGAAGCCACCCATTGGT 3108

          2251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2300
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   3109 GCTTGGCAGAGGCAGGTGTGTGTGGAGGGAGGTTGGGTGAGACAGGGACG 3158

          2301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2350
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   3159 GCCTCCGGGCCCCACACAAGATGCATCTGTGAAGCTCAAGGCGCCCCCTT 3208

          2351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2400
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   3209 CCTGGGAGCACCCTCTGCCCCACCCAGCCACCAGGGGGTGCCAGAGTCCT 3258

          2401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2450
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   3259 TTCACCCGGCTGGGCCAGGACTTGGGTTCAGCCCTGGTTCTGTTTGTTTC 3308

          2451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2500
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   3309 TCAAAGCAGAAAAAGTCCAATCACCTCAGACCCTCTCTGCCTGCTCACTG 3358

          2501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2550
mie39080   546 ................................TGGCTTCTCACTTGCTGT 563
                                               |||| ||| |||| ||| 
hk01809   3359 TGAGGCCCCGTGTAGCCCCCTCTCTGAGCTTTTGGCCTCTGACTTCCTGA 3408

          2551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2600
mie39080   564 AT................................................ 565
                |                                                
hk01809   3409 GTCGGCCCCCTTCCTTGTCTTTGTCTAGGGCCAGATATCCTAAGATATCT 3458

          2601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2650
mie39080   566 .................................................. 566
                                                                 
hk01809   3459 CTCACTAACTCCTCCTGGTGCAGGGACCCGGCTGTACCACCGGACCTGGG 3508

          2651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2700
mie39080   566 .................................................. 566
                                                                 
hk01809   3509 CCTCATGCCTTCTCAGCCACAGGGAGGGGCTGCAGGCCTCTCCTCCCTTC 3558

          2701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2750
mie39080   566 .................................................. 566
                                                                 
hk01809   3559 CACAGCAGTCCCCTTTGGGCTTGGTCGGCCTCCTTCCCAGTTTCCACTCC 3608

          2751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2800
mie39080   566 .................................................. 566
                                                                 
hk01809   3609 CCTAATGTCCTCCCTGCACCTGCCTTGCAGGCCCCTTCAGGAGTGACCAC 3658

          2801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2850
mie39080   566 ...........................AGCATAGAGTAGCCTGGAGTTTC 588
                                          | | |  ||||||  | ||| ||
hk01809   3659 TGGCATTGCCCCTATCAACTCTGACCCACCTTGTAGTAGCGGGCAGTGTC 3708

          2851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2900
mie39080   589 .................................................. 589
                                                                 
hk01809   3709 AGGGACGGGGCCAAACTCCTGAGTGACGGCATTGCGCACGGAGTTGGCCT 3758

          2901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2950
mie39080   589 .................................................. 589
                                                                 
hk01809   3759 TGCCGTTTTCAATGTTGATGGCACCAATGAGCAGGTTGTTGGAGATGTTA 3808

          2951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3000
mie39080   589 ..........................TGATCCTCCAGCTGGGAT...TCC 609
                                          |  ||  |||||| |||     |
hk01809   3809 TCCAAGTGCCCACGGAACTTGAGCCAGGGGCCAGCAGCTGAGATGTGGTC 3858

          3001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3050
mie39080   610 AGGTGTGCAGTGCCACCTTGAGCCTATGTGGAAGGTAGGGA......... 650
               ||  || || | || | |||| | |  |||| | |||| ||         
hk01809   3859 AGTGGTACACTTCC.CTTTGACCTTGGGTGGTAAGTAGAGAGGACAGAGG 3907

          3051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3100
mie39080   651 .................................................. 651
                                                                 
hk01809   3908 TCAGGGCATGGCCCTGGAGGGGTGGATGACAAGCCCTCCAGAGGCAGCAG 3957

          3101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3150
mie39080   651 ....TGGGTCCCAGGACTCGTG............................ 668
                    ||| |||||||   |||                            
hk01809   3958 GCCCCGGGGCCCAGGAGGGGTGACAGAGGGGTGAGAGGCAGGCAAGTCTT 4007

          3151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3200
mie39080   669 ..............................CACACCAGGGAGGCATTCTC 688
                                             ||| | | ||   |||   |
hk01809   4008 CAGACACGTGTTCTGTGGTCCTGGTGCTTCCACCCTAAGGCCACATGGGC 4057

          3201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3250
mie39080   689 CCAGGGGAGCTGCTTCCCCATCACAAGGACTGTTTGGTGGTTTTTGTAAT 738
                ||||  ||   ||||  |  | ||| | |   | | || |   | |   
hk01809   4058 TCAGGCCAG.GCCTTCATCCCCTCAAAGGCCTCTGGCTGCTCAGTCTCCC 4106

          3251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3300
mie39080   739 TT................................................ 740
               ||                                                
hk01809   4107 TTATGGGGCAGAGGCCGCCCAAAGTTGGGACAGGTCAATGTTCGCTCACC 4156

          3301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3350
mie39080   741 .........................CTTCAGGGCTGAGGATGGAACCCAG 765
                                        |  |||  || | | ||||  |  |
hk01809   4157 CTTCAGGCCTCAGCTGCAAGATCAGCCACAGACCTCATGCTGGACACAGG 4206

          3351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3400
mie39080   766 GGCCTCTTTCATGTTAGGTGGGTGTTGTACTACTGAGCTAGGCCCAGTCT 815
                |||     ||||   ||    ||    |  |||||  |  | |   |||
hk01809   4207 AGCCCAGGACATGCCTGGGTCCTGGCTGATGACTGA..TTAGTCTCTTCT 4254

          3401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3450
mie39080   816 ATCCTATGAACTTCTGGCTTTCAGTGACGCAGAATACATTTAATAAATAC 865
                ||  | |     ||||    |  | |   ||   |   | |||||||| 
hk01809   4255 GTCACAGGGGTGCCTGGAGACCCCTTAATAAG..CAGCATAAATAAATAT 4302

          3451 ----+----*-- 3462
mie39080   866 TGGTGGCAGAGC 877
                 |   |||   
hk01809   4303 CTGACACAG... 4311