Comparison of KIAA cDNA sequences between mouse and human (KIAA1665)

<<Original sequence data>>

mouse  mKIAA1665 (mie39080)     length:    877 bp, CDS:     2 -   349
human   KIAA1665  (hk01809)     length:   4311 bp, CDS:   205 -   858

In this page, the longest coding region predicted by GeneMark
was assigned as CDS for each of mouse and human KIAA cDNAs.
They were colored in green.  When the CDS positions were not identical
on the aligned sequences between mouse and human cDNAs, mouse cDNA
sequence was translated based on the human CDS information.
The amino acid sequence produced here may not be identical to the
protein sequence deduced (see Description).


<<Aligned sequence information>>

----------------------------------------------------------
            region      #match  #mismatch  %diff
----------------------------------------------------------
DNA

5'UTR:    510 -   510       1        0      0.0
  CDS:    511 -   858     309       39      11.2
3'UTR:    859 -  4317     298      237      44.3

amino acid

  CDS:    511 -   858     113        3      2.6
----------------------------------------------------------


<<Alignment>>

             1 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 50
mie39080     1 .................................................. 1
                                                                 
hk01809      1 CGCGGCGCGGGCGCGCACCCGGAGCTGTGGACGGAGAGTGCCTCCCTCTG 50

            51 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 100
mie39080     1 .................................................. 1
                                                                 
hk01809     51 GCCTCAGTTTCCTCATGTTGTAGTAGCGGAGCATGGCCCGGACCGGGCCC 100

           101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 150
mie39080     1 .................................................. 1
                                                                 
hk01809    101 CCGAGACCGCCCCGTGCAACCTCACCGCCAGCCTGGGGGCCTCAGCGACT 150

           151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 200
mie39080     1 .................................................. 1
                                                                 
hk01809    151 GGGACGGGACCAAGGGGCTCGGGGATTCTCCCTGCCCCCGGCCCTGGTGC 200

           201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 250
mie39080     1 .................................................. 1
                                                                 
hk01809    201 GTGACTGACCCTCCTGTTCCCAGAGCCCCCAGCGCAGGCCGGGATGTTCG 250
                   L  T  L  L  F  P  E  P  P  A  Q  A  G  M  F  V

           251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 300
mie39080     1 .................................................. 1
                                                                 
hk01809    251 TCCTGGTGGAAATGGTGGACACCGTCCGGATCCCCCCTTGGCAGTTTGAG 300
                 L  V  E  M  V  D  T  V  R  I  P  P  W  Q  F  E  

           301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 350
mie39080     1 .................................................. 1
                                                                 
hk01809    301 AGGAAGCTCAACGACTCTATTGCCGAGGAGCTGAACAAGAAGTTGGCCAA 350
               R  K  L  N  D  S  I  A  E  E  L  N  K  K  L  A  N 

           351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 400
mie39080     1 .................................................. 1
                                                                 
hk01809    351 CAAGGTCGTGTACAACGTGGGACTCTGCATTTGTCTGTTTGATATCACCA 400
                K  V  V  Y  N  V  G  L  C  I  C  L  F  D  I  T  K

           401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 450
mie39080     1 .................................................. 1
                                                                 
hk01809    401 AACTGGAGGATGCCTATGTATTCCCTGGGGATGGCGCATCACACACCAAA 450
                 L  E  D  A  Y  V  F  P  G  D  G  A  S  H  T  K  

           451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 500
mie39080     1 .................................................. 1
                                                                 
hk01809    451 GTCCATTTTCGCTGCGTGGTGTTTCATCCATTCCTAGATGAGATTCTCAT 500
               V  H  F  R  C  V  V  F  H  P  F  L  D  E  I  L  I 

           501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 550
                         K  G  C  S  P  E  G  V  H  V  S  L  G  F
mie39080     1 .........CAAAGGCTGCAGCCCAGAGGGTGTGCACGTCTCTTTAGGGT 41
                        |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |
hk01809    501 TGGGAAGATCAAAGGCTGCAGCCCAGAAGGAGTGCACGTCTCTCTAGGCT 550
                G  K  I  K  G  C  S  P  E  G  V  H  V  S  L  G  F

           551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 600
                 F  D  D  I  L  I  P  P  E  S  L  Q  Q  P  A  K  
mie39080    42 TCTTTGATGACATTCTCATCCCCCCTGAGTCACTGCAGCAGCCTGCCAAG 91
               |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
hk01809    551 TCTTCGATGACATTCTCATCCCCCCAGAGTCACTGCAGCAGCCAGCCAAG 600
                 F  D  D  I  L  I  P  P  E  S  L  Q  Q  P  A  K  

           601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 650
               F  D  E  A  E  Q  V  W  V  W  E  Y  E  T  E  E  G 
mie39080    92 TTTGATGAAGCGGAGCAAGTGTGGGTGTGGGAGTACGAGACGGAGGAAGG 141
               || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
hk01809    601 TTCGACGAAGCGGAGCAGGTGTGGGTGTGGGAGTACGAGACGGAGGAAGG 650
               F  D  E  A  E  Q  V  W  V  W  E  Y  E  T  E  E  G 

           651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 700
                A  H  D  L  Y  M  D  T  G  E  E  I  R  F  R  V  V
mie39080   142 AGCGCATGACCTGTACATGGACACTGGGGAGGAGATCCGCTTCAGGGTGG 191
               ||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||
hk01809    651 AGCACACGACCTCTACATGGACACCGGCGAGGAGATCCGCTTCCGGGTGG 700
                A  H  D  L  Y  M  D  T  G  E  E  I  R  F  R  V  V

           701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 750
                 D  E  S  F  V  D  T  S  P  T  G  P  S  S  A  E  
mie39080   192 TGGATGAGAGCTTTGTGGACACATCCCCCACAGGACCCAGTTCCGCCGAG 241
               |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || 
hk01809    701 TGGACGAGAGCTTTGTTGACACGTCCCCCACAGGGCCCAGCTCAGCAGAT 750
                 D  E  S  F  V  D  T  S  P  T  G  P  S  S  A  D  

           751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 800
               A  A  S  S  S  E  E  L  P  K  K  E  A  P  Y  T  L 
mie39080   242 GCTGCCTCTTCAAGCGAGGAGCTGCCCAAGAAGGAAGCACCATATACACT 291
               ||  || |||| || ||||||||||| |||||||| || || || || ||
hk01809    751 GCCACCACTTCCAGTGAGGAGCTGCCAAAGAAGGAGGCTCCGTACACGCT 800
               A  T  T  S  S  E  E  L  P  K  K  E  A  P  Y  T  L 

           801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 850
                V  G  S  I  S  E  P  G  L  G  L  L  S  W  W  T  S
mie39080   292 TGTGGGATCTATCAGTGAGCCAGGACTAGGCCTTCTCTCCTGGTGGACGA 341
               ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
hk01809    801 TGTGGGATCCATCAGTGAGCCAGGCCTGGGCCTTCTCTCCTGGTGGACCA 850
                V  G  S  I  S  E  P  G  L  G  L  L  S  W  W  T  S

           851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 900
                 N  *                                            
mie39080   342 GCAACTAGCCCTGGAGCT...CACAGTGACTGCCCAGCCT.......... 378
               |||||||||||||| |||   ||  |   |   |||||||          
hk01809    851 GCAACTAGCCCTGGGGCTGGACAGTGGACCCTACCAGCCTGCGGGAAGGT 900
                 N  *                                            

           901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 950
mie39080   379 .............................................GAAGA 383
                                                            | |||
hk01809    901 GGTATGGCCGGCTGTGAAGACAACAGCAGCTGAGGCCGATGCTAAGGAGA 950

           951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1000
mie39080   384 CCCTGTCCAGACTTGGGAAAGTAGAGAGCAGTTTGAGTGTTCTCCAG... 430
                  ||||  ||  |||  |   ||  |       |||||  | ||||   
hk01809    951 TAGTGTCTCGAGCTGGACAGTGAGGCAAGGCCAGGAGTGCCCACCAGCTT 1000

          1001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1050
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1001 GCCCCGCTCCTCCACCATCTAGGCCCTGCTCCTCCTTCACTGCAGTGATG 1050

          1051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1100
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1051 GATCCATCTGTGGCTGTGGCTGTTGGGCCTCCACTGACCTTGACTGAAAA 1100

          1101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1150
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1101 GACCCTTCCTGGACCCTGGACTTGACAACAAACGGCACAGACACCAATCA 1150

          1151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1200
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1151 CTCACAGAACAGTCACTGGTTTTGGATTCTTGTTTTCCTTGCAAGAACAA 1200

          1201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1250
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1201 AAGGTTCTCTAGAATCCTTCAGCCACCAATGAAATGATCAGGCAGGAGAA 1250

          1251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1300
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1251 AAACTTTAGATGGGAGTCTTGTCATCAAAAATAAATACAGTTGCATGGAG 1300

          1301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1350
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1301 CTGCTTAAGATCTGAACCAAACTCAAAATAGGAAGACGGGGGCTAAAAAG 1350

          1351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1400
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1351 TTATTTTAAGAACCCCCCCACCACAACCACAGTCACTCCGTGGGCTAAGC 1400

          1401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1450
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1401 GGGGAGCAGGAAGCATGTCTGGTCACACCATCTTGGAATAGGAAGCCATG 1450

          1451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1500
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1451 GCTGGACGGATCGGATCCACTGATGGCACACGTGGAGCTGAACTTGACGC 1500

          1501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1550
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1501 CAGCGGCGGGGCGGGGAGGCACTGCCCTCACTGTTGCAGTTCCTTCATTC 1550

          1551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1600
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1551 TGTTGAGGGCACTGCCAGCGCGGAACCACTCAATCTGCGTCTCGTTGAAG 1600

          1601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1650
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1601 GTGTGGTTCAGGAGGATGGTCTCCTGGGTCCCGTTGGGGTGCTTGATGAT 1650

          1651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1700
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1651 GCACTTCAGGGGCTGCAAGGAGAAGGTGGGTGTGGGTGGAAGTGGTGGGT 1700

          1701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1750
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1701 ACTGTGTGCCCTTGGCCCCGCAGGGGGGTCAGGGAGACAGGGCACTGCCT 1750

          1751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1800
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1751 GGGGACCTAAGAGGTCAGCAGGCAAACCAAATCCTAGGCCAGTCTGTGCC 1800

          1801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1850
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1801 TGATGGCCCAGGTCAGACCCAGGTGGCACCTACAGGGGATTCCTGGGGCC 1850

          1851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1900
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1851 CAGAGGGTCCTGCAGTGGGTGGGCTGTCCCCTGAGTGCCAGGTCCTGGTG 1900

          1901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 1950
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1901 AGTAAAGGGAGGTTGGGGAGGTGTGAGGGCCCCGGGTTGACTCCAACCCC 1950

          1951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2000
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   1951 CAACTCTGAGAAGCCACTTTGCTTTCTCTGTGGGGCCACCTGGAGAACTG 2000

          2001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2050
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   2001 GGGGCCTTTCCAGCTGGAATGAAGCCTCCTGGGAGAAGCTACCCTGGGGC 2050

          2051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2100
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   2051 CAGTGCAGGAGGGGAAACAAGGTGGCTGCCCCTCACCCCACCACCTCAGG 2100

          2101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2150
mie39080   431 .................................................. 431
                                                                 
hk01809   2101 GGGACCCGGGCCCCTAACCTTGCCAGGGGTGAAGTCCTTCAGGCCCTGAA 2150

          2151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2200
mie39080   431 ..............................................AGCC 434
                                                             ||| 
hk01809   2151 TGGTCAGCTTGTCCACAGGGTGAATCTTGTTGTAGTCAGCCGGGTCAGCG 2200

          2201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2250
mie39080   435 AAGCTTGGTGGGACCAGGAGCAGTGACAAGTGCTTGTCCTCT........ 476
               ||| |  | || | ||||  | ||  |    | |||  ||||        
hk01809   2201 AAGGTCAGAGGCAGCAGGCCCTGTTTCTTCAGGTTGGTCTCTGGAAAGCA 2250

          2251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2300
mie39080   477 .................................................. 477
                                                                 
hk01809   2251 GGCGGCATTCGGTCATCGGGGGCCTGACTAGCCTGGAGAGCTTCATTTTC 2300

          2301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2350
mie39080   477 .................................................. 477
                                                                 
hk01809   2301 TGAACCCATCTGGGGCTCTGGGAGATGCCCCTAATCCTGCTGCCTGGGAC 2350

          2351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2400
mie39080   477 .................................................. 477
                                                                 
hk01809   2351 AATGCCCGGGCAGTGACTATGGGGCCCTGGTCTGCTCCCTTTCACTAGGG 2400

          2401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2450
mie39080   477 .................................................. 477
                                                                 
hk01809   2401 GTGCCCCTAGCAAGTGTGCGCTGGTGCTGAGGTCTGCGAGGCCTTCCTGC 2450

          2451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2500
mie39080   477 .................................................. 477
                                                                 
hk01809   2451 TGCACATTCATGATCAGAAAGAACCCCCTGGCACATGTCCTAGATCTCAG 2500

          2501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2550
mie39080   477 .................................................. 477
                                                                 
hk01809   2501 TGGCTCAGATCTACAAGCCTGGAAGCAGGGCCTGCGGGAAGCCGGGAAGC 2550

          2551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2600
mie39080   477 .................................................. 477
                                                                 
hk01809   2551 TGAGCGTCGGATGTGCACTGTGTGAGCCTAAGAAGGGGCAAGAGGCTGAC 2600

          2601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2650
mie39080   477 .................................CCCTCCCCAGCACTGCT 493
                                                ||   |||| | | || 
hk01809   2601 GGGCCTGTGGGCTGCAGTGGACACAGCCTAGAACCAGGCCCAACTCAGCC 2650

          2651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2700
mie39080   494 TCTCTCGTCTGGAGCCACCCTGA........................... 516
                |   |     |||  ||| |||                           
hk01809   2651 ACGGGCAGGGAGAGTGACCTTGATCACTAGGGATGGGATGAGGATGGCCT 2700

          2701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2750
mie39080   517 ....ATCGTCTCCAGAGTGTCATGGATCCAGGC................. 545
                   |  | ||||||     | ||||||| |||                 
hk01809   2701 GGGTACAGACTCCAGCTCACCGTGGATCCTGGCAAAGCTCTTGGTGATGA 2750

          2751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2800
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   2751 TGGCCCGGCCCCCAAGGTGGCGAGGCTCCAGAGCTGCATGCTCCCGGCTC 2800

          2801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2850
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   2801 GAGCCCTCGCCGTAGTTCTCGTCTCCGATCACCACCCACCTGATGCCATG 2850

          2851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2900
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   2851 TTTCTGTCAGGCAAGCGGGGGTAAGGTTATAAGGCAGAGGAGGGCACCGT 2900

          2901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 2950
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   2901 CCTCACCTGTCTGGCCCTACCTGCCTGGCCTCACCCACCTGGCGCCTGGG 2950

          2951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3000
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   2951 CATCCTGAGGCTCCCGGTAAAGGGGCTGGAGGGGCCCTTCCTCGCCTGCT 3000

          3001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3050
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   3001 GCCTAAGGGCAAGTGAAGCCTGCGTGAATGAGACCCAAACGAGGCCCCGA 3050

          3051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3100
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   3051 GGGGACAGAGGCACGTGGTTGTTTGCAGTGGCAAAGAAGACAGAAGCCAC 3100

          3101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3150
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   3101 CCATTGGTGCTTGGCAGAGGCAGGTGTGTGTGGAGGGAGGTTGGGTGAGA 3150

          3151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3200
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   3151 CAGGGACGGCCTCCGGGCCCCACACAAGATGCATCTGTGAAGCTCAAGGC 3200

          3201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3250
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   3201 GCCCCCTTCCTGGGAGCACCCTCTGCCCCACCCAGCCACCAGGGGGTGCC 3250

          3251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3300
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   3251 AGAGTCCTTTCACCCGGCTGGGCCAGGACTTGGGTTCAGCCCTGGTTCTG 3300

          3301 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3350
mie39080   546 .................................................. 546
                                                                 
hk01809   3301 TTTGTTTCTCAAAGCAGAAAAAGTCCAATCACCTCAGACCCTCTCTGCCT 3350

          3351 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3400
mie39080   546 ........................................TGGCTTCTCA 555
                                                       |||| ||| |
hk01809   3351 GCTCACTGTGAGGCCCCGTGTAGCCCCCTCTCTGAGCTTTTGGCCTCTGA 3400

          3401 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3450
mie39080   556 CTTGCTGTAT........................................ 565
               ||| |||  |                                        
hk01809   3401 CTTCCTGAGTCGGCCCCCTTCCTTGTCTTTGTCTAGGGCCAGATATCCTA 3450

          3451 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3500
mie39080   566 .................................................. 566
                                                                 
hk01809   3451 AGATATCTCTCACTAACTCCTCCTGGTGCAGGGACCCGGCTGTACCACCG 3500

          3501 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3550
mie39080   566 .................................................. 566
                                                                 
hk01809   3501 GACCTGGGCCTCATGCCTTCTCAGCCACAGGGAGGGGCTGCAGGCCTCTC 3550

          3551 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3600
mie39080   566 .................................................. 566
                                                                 
hk01809   3551 CTCCCTTCCACAGCAGTCCCCTTTGGGCTTGGTCGGCCTCCTTCCCAGTT 3600

          3601 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3650
mie39080   566 .................................................. 566
                                                                 
hk01809   3601 TCCACTCCCCTAATGTCCTCCCTGCACCTGCCTTGCAGGCCCCTTCAGGA 3650

          3651 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3700
mie39080   566 ...................................AGCATAGAGTAGCCT 580
                                                  | | |  ||||||  
hk01809   3651 GTGACCACTGGCATTGCCCCTATCAACTCTGACCCACCTTGTAGTAGCGG 3700

          3701 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3750
mie39080   581 GGAGTTTC.......................................... 588
               | ||| ||                                          
hk01809   3701 GCAGTGTCAGGGACGGGGCCAAACTCCTGAGTGACGGCATTGCGCACGGA 3750

          3751 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3800
mie39080   589 .................................................. 589
                                                                 
hk01809   3751 GTTGGCCTTGCCGTTTTCAATGTTGATGGCACCAATGAGCAGGTTGTTGG 3800

          3801 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3850
mie39080   589 ..................................TGATCCTCCAGCTGGG 604
                                                  |  ||  |||||| |
hk01809   3801 AGATGTTATCCAAGTGCCCACGGAACTTGAGCCAGGGGCCAGCAGCTGAG 3850

          3851 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3900
mie39080   605 AT...TCCAGGTGTGCAGTGCCACCTTGAGCCTATGTGGAAGGTAGGGA. 650
               ||     |||  || || | || | |||| | |  |||| | |||| || 
hk01809   3851 ATGTGGTCAGTGGTACACTTCC.CTTTGACCTTGGGTGGTAAGTAGAGAG 3899

          3901 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 3950
mie39080   651 .................................................. 651
                                                                 
hk01809   3900 GACAGAGGTCAGGGCATGGCCCTGGAGGGGTGGATGACAAGCCCTCCAGA 3949

          3951 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4000
mie39080   651 ............TGGGTCCCAGGACTCGTG.................... 668
                            ||| |||||||   |||                    
hk01809   3950 GGCAGCAGGCCCCGGGGCCCAGGAGGGGTGACAGAGGGGTGAGAGGCAGG 3999

          4001 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4050
mie39080   669 ......................................CACACCAGGGAG 680
                                                     ||| | | ||  
hk01809   4000 CAAGTCTTCAGACACGTGTTCTGTGGTCCTGGTGCTTCCACCCTAAGGCC 4049

          4051 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4100
mie39080   681 GCATTCTCCCAGGGGAGCTGCTTCCCCATCACAAGGACTGTTTGGTGGTT 730
                |||   | ||||  ||   ||||  |  | ||| | |   | | || | 
hk01809   4050 ACATGGGCTCAGGCCAG.GCCTTCATCCCCTCAAAGGCCTCTGGCTGCTC 4098

          4101 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4150
mie39080   731 TTTGTAATTT........................................ 740
                 | |   ||                                        
hk01809   4099 AGTCTCCCTTATGGGGCAGAGGCCGCCCAAAGTTGGGACAGGTCAATGTT 4148

          4151 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4200
mie39080   741 .................................CTTCAGGGCTGAGGATG 757
                                                |  |||  || | | ||
hk01809   4149 CGCTCACCCTTCAGGCCTCAGCTGCAAGATCAGCCACAGACCTCATGCTG 4198

          4201 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4250
mie39080   758 GAACCCAGGGCCTCTTTCATGTTAGGTGGGTGTTGTACTACTGAGCTAGG 807
               ||  |  | |||     ||||   ||    ||    |  |||||  |  |
hk01809   4199 GACACAGGAGCCCAGGACATGCCTGGGTCCTGGCTGATGACTGA..TTAG 4246

          4251 ----+----*----+----*----+----*----+----*----+----* 4300
mie39080   808 CCCAGTCTATCCTATGAACTTCTGGCTTTCAGTGACGCAGAATACATTTA 857
                |   ||| ||  | |     ||||    |  | |   ||   |   | |
hk01809   4247 TCTCTTCTGTCACAGGGGTGCCTGGAGACCCCTTAATAAG..CAGCATAA 4294

          4301 ----+----*----+----* 4320
mie39080   858 ATAAATACTGGTGGCAGAGC 877
               |||||||   |   |||   
hk01809   4295 ATAAATATCTGACACAG... 4311