FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0387.ptfa, 832 aa vs ./tmplib.26680 library 1768185 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1391+/-0.0059; mu= 7.8400+/- 0.393 mean_var=170.9286+/-40.832, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0981 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4064 ( 994 res) mbh02927 ( 994) 1062 163 1.9e-40 >>mKIAA4064 ( 994 res) mbh02927 (994 aa) initn: 1182 init1: 576 opt: 1062 Z-score: 818.6 bits: 162.7 E(): 1.9e-40 Smith-Waterman score: 1237; 35.000% identity (38.786% ungapped) in 840 aa overlap (12-825:11-794) 10 20 30 40 50 mKIAA0 RRLAKSLSVLAPARPWTERQP--AAGMGPP--LPLLLLLLLPPPLPRALPAPASARGRQL :.: :.: ..: : : ::. ::: : . : ::.: mKIAA4 RDSGRRESSEPGRMRRPRRPGGSGGSGGSGGLRLLVCLLLLSGRPGGCSA-ISAHG--- 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 mKIAA0 PGRLGCLFEDGLCGSLETCVNDGVFGRCQKVPVMDTYRYEVPPGALLHLKVTLQKLSRTG :::. ::. ::.:..::.::.:: . .: .: .:. .:..: : mKIAA4 -----CLFDRRLCSHLEVCIQDGLFGQCQAGVGQARPLLQVTSPVLQRLQGVLRQLMSQG 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 mKIAA0 FTWQDDYTQRVIAQELANLPKAYLWHGEASGPARSLQQNADNEKWFSLEREVALAKTLRR ..:.:: ::.::.::. .:. : : :: .:. :. mKIAA4 LSWHDDLTQHVISQEMERIPR--LRPPEPHPRDRS-----------------GLVP--RK 120 130 140 180 190 200 210 220 230 mKIAA0 YLPYLELLSQ-TPTANAHSRIDHETRPAKGEDSSPENILTYVAHTSALTYPPATRAKYPD : :::.: .::... . . ::: : :.. . . .. .: :: . mKIAA4 PGPAGELLTQGNPTGSSPA-AQGFPRPAGGGDGAGAG--SPLSSLQAELLPPLL-----E 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 mKIAA0 NLLRPFSRLQPDELSPKVDGDIDKQKLIAALGAYTAQRLPGENDPEPRYLVHGS-ARAPR .:: : :: . . . . . :. .:. ..: .:.. . : : :..: mKIAA4 HLLMPP---QPPHPALTYEPALLQPYLFHQFGSRDGSR-GSESSSGVVGVGHLSKAEGPA 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 mKIAA0 PFSATALSQRWPPPPGDA-KDSPSMDDDTLLQ-SLLKDLQQNSEVDRLGPLKEEKADSVA :: .: . : . : . . :.: : : . :. : : . . . mKIAA4 LFSRSASKAILGTHSGHSFGDLTGPSPAQLFQDSGLLYMAQELPVP--GRARAPRLPENG 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 mKIAA0 GAIQSDPAEGSQES--HGRGAEGQPREQTDAPETMLQDHRLSEVDDPVYKEVNRLS-FQL : : .:: .: ::: .. : :. :: :: ::. : :. .:. :. mKIAA4 GNRAEDSSEGHEEEVLGGRGEKSPP--QAAQPELSLQ--RLTAVLAGYGVELRQLTPEQF 320 330 340 350 360 370 410 420 430 440 450 mKIAA0 GDLLKDYGSPLLPEGPL--LEKS---SREEIKKSEQ------PEEVLSSEEETAGVEHVR . :: :::.: :: . . ..::. : : :.: : .. mKIAA4 STLLTLL--QLLPKGTGRNLEGAVNVGGADVKKTIQQMQRGDPAEALPPTPSLPG--YLT 380 390 400 410 420 460 470 480 490 500 510 mKIAA0 SRTYSKDLFERKPNSEPQPRRLEDQFQNRAPELWEDEESLKLAAQGPPSGGLQLEVQPSE . :... . . :.: . . . . . : :.. :. . : : . ..:: mKIAA4 ASPASSEVQQVLSPGFPEPPHTPSPLGSSSVLL---EKKSPLGQSQPTVVG-RPSARPSA 430 440 450 460 470 480 520 530 540 550 560 570 mKIAA0 EQQGYILTGNNPLSPEKGKQLMDQVAHILRVPSSFFADIKVLGPAVTFKVSANIQNMTTA :. :::.: ..::: : .:.. .:. ... :. : .:.:.::::::.. : ::.. : mKIAA4 EEYGYIVTDQKPLSLVAGVRLLEILAEHVHMSSGSFINISVVGPAVTFRIRHNEQNLSLA 490 500 510 520 530 540 580 590 600 610 620 630 mKIAA0 DVIKAAADNKDQLEKATGLTILQSGIRPKGKL-KLLPHQEEQEDSTKFILLTFLSIACIL :: . :. :..:: ::: :::.:. . . ..::.: . . . .:::....: . mKIAA4 DVTQQAGLVKSELEAQTGLQILQTGVGQREEAAEVLPRQAHGISPMRSVLLTLVALAGVA 550 560 570 580 590 600 640 650 660 670 680 690 mKIAA0 GVLLASSLAYCLRHNSHYKLKDKLSGLGADPS-ADATEAYQELCRQRMAIRPQ-DRSEG- :.:.: ..: :.::.:. . :..:..:: . . .:.: ::.::::.:: . .:.:: mKIAA4 GLLVALAVALCMRHHSRQRDKERLAALGPEGAHGDTTFEYQDLCRQHMATKSLFNRAEGQ 610 620 630 640 650 660 700 710 720 730 740 750 mKIAA0 PHTSRINSVSSQFSDGPMPSPSARSSTSSWSEEPVQSNMDISTGHMILAYMEDHLKNKNR :. ::..::::::::. . :::..::: :: :::.:.::::::::::::::::::.:..: mKIAA4 PEPSRVSSVSSQFSDAAQASPSSHSSTPSWCEEPAQANMDISTGHMILAYMEDHLRNRDR 670 680 690 700 710 720 760 770 780 790 800 810 mKIAA0 LEKEWEALCAYQAEPNSSLVAQREENAPKNRSLAVLTYDHSRILLKSQNSHGSSDYINAS : :::.::::::::::. .:: : : ::: : :::.:: :: ..: . ::::::: mKIAA4 LAKEWQALCAYQAEPNTCAAAQDESNIKKNRHPDFLPYDHARIKLKVESSPSRSDYINAS 730 740 750 760 770 780 820 830 mKIAA0 PIMDHDPPHPSAMNKTFE ::..::: :. mKIAA4 PIIEHDPRMPAYIATQGPLSHTIADFWQMVWESGCTVIVMLTPLVEDGVKQCDRYWPDEG 790 800 810 820 830 840 832 residues in 1 query sequences 1768185 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:19:33 2006 done: Mon Mar 27 10:19:35 2006 Scan time: 0.970 Display time: 0.070 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]