FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4131.ptfa, 789 aa vs ./tmplib.26680 library 1768228 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3315+/-0.00464; mu= 14.7370+/- 0.310 mean_var=112.1702+/-25.832, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1211 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0718 ( 769 res) mbg07395 ( 769) 2065 372 1.3e-103 mKIAA0145 ( 1039 res) mbg16251 (1039) 542 106 2e-23 >>mKIAA0718 ( 769 res) mbg07395 (769 aa) initn: 2758 init1: 1427 opt: 2065 Z-score: 1952.4 bits: 372.0 E(): 1.3e-103 Smith-Waterman score: 3222; 60.050% identity (66.620% ungapped) in 801 aa overlap (35-789:2-769) 10 20 30 40 50 mKIAA4 EQWVSLSSEEFDQLQKYSEYSSKKIKDVLAEFNEGGSLRQYDP-------HKPISYDVFK ::. .: : .:.: .. :... :: mKIAA0 EEFHGNGVLAKYNPEGKQDILNQTIDFEGFK 10 20 30 60 70 80 90 100 110 mKIAA4 LFMRAYLEVDLPQPLSTHLFLAFSQKPRQETPDHPKEGASSSEPNVSDYNSDNAAKADEA :::...::..::. ...:::..::.: :. : :::.. mKIAA0 LFMKTFLEAELPDDFTAHLFMSFSNK-------FPH-----SSPNVKS------------ 40 50 60 120 130 140 150 160 170 mKIAA4 CAPDTESKTTKTQAPSKELEAAAPWEDPGALASSSDAPVVYLKDVVCYLSLMETGRPQDK : : . . . . : .: :.. . :..:::.::::::.: :::.:: mKIAA0 -KPALLSGGLRMNKGA----ITPPRSSP---ANTCSPEVIHLKDIVCYLSLLERGRPEDK 70 80 90 100 110 180 190 200 210 220 230 mKIAA4 LEFMFRLYDSDENGLLDQAEMDQIVSQMLHVAQYLEWDPTELRPILKEMLQGMDYDKDGF :::::::::.: ::.::..:...:..::.:::.::::: ::: :::.::.. .:::.:: mKIAA0 LEFMFRLYDTDGNGFLDSSELENIIGQMMHVAEYLEWDVTELNPILHEMMEEIDYDRDGT 120 130 140 150 160 170 240 250 260 270 280 290 mKIAA4 VSLQEWINGGMTTIPLLVLLGMDDSGSKGDGRHAWTLKHFKKPTYCNFCRAMLMGVGKQG :::.:::.:::::::::::::.... : ::.:.: ::::.::.:::.: ::.:::::: mKIAA0 VSLEEWIQGGMTTIPLLVLLGLENN-VKDDGQHVWRLKHFNKPAYCNLCLNMLIGVGKQG 180 190 200 210 220 230 300 310 320 330 340 350 mKIAA4 LCCIYCKYTVHQRCVSKTIHGCVKTNSKAKRSGEVMQHAWVEGNSSVKCDRCHKSIKCYQ ::: .::::::.:::... .:.:: :.:.. .::.: ::::: .:::.:::..:::: mKIAA0 LCCSFCKYTVHERCVARAPPSCIKTYVKSKKNTDVMHHYWVEGNCPTKCDKCHKTVKCYQ 240 250 260 270 280 290 360 370 380 390 mKIAA4 SVTARHCVWCRMTFHRKC--ELSTVCDGGELKDHILLPTSICPV---------------- ..:. :::::. :.: :: .:. :: : :::::: ::.:::: mKIAA0 GLTGLHCVWCQTTLHNKCASHLKPECDCGPLKDHILPPTTICPVVLTMPSAGASVPEERQ 300 310 320 330 340 350 400 410 420 430 440 mKIAA4 -------SGDRQGGK-SDGSVAAKGELVTQ----YKIIPSPGTHPLLVLVNPKSGGRQGE :...: .: .: . ... ::. .: : ::::::::.:::::::.::: mKIAA0 STAKKEKSSSQQPNKATDKNKMQRANSVTMDGQGLQITPVPGTHPLLVFVNPKSGGKQGE 360 370 380 390 400 410 450 460 470 480 490 500 mKIAA4 RILRKFHYLLNPEQVFNLDNGGPTPGLNFFHDTPDFRVLACGGDGTVGWILDCIDKANFT :: :::.:::::.::..:...:: :::.::.:.:::::::::::::::::::::.::: . mKIAA0 RIYRKFQYLLNPRQVYSLSGNGPMPGLHFFRDVPDFRVLACGGDGTVGWILDCIEKANVV 420 430 440 450 460 470 510 520 530 540 550 560 mKIAA4 KHPPVAVLPLGTGNDLARCLRWGGGYEGGSLTKILKEIEQSPLVMLDRWYLEVMPREEVE ::::::.::::::::::::::::::::: .: ::::.::.: .::::: .:: : .. : mKIAA0 KHPPVAILPLGTGNDLARCLRWGGGYEGENLMKILKDIESSTEIMLDRWKFEVTPNDKDE 480 490 500 510 520 530 570 580 590 600 610 620 mKIAA4 NGDQVPYNIMNNYFSIGVDASIAHRFHMMREKHPEKFNSRMKNKLWYFEFGTSETFAATC .:: :::.:.:::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::::::::::.::: mKIAA0 KGDPVPYSIINNYFSIGVDASIAHRFHIMREKHPEKFNSRMKNKFWYFEFGTSETFSATC 540 550 560 570 580 590 630 640 650 660 670 680 mKIAA4 KKLHDHIELECDGVEVDLSNIFLEGIAILNIPSMYGGTNLWGETKKNRAVIR------ES ::::. .:.:::::..:: :: ::::::::::::.::.:::::.::.:. : .. mKIAA0 KKLHESVEIECDGVQIDLINISLEGIAILNIPSMHGGSNLWGESKKKRSHRRIEKKGSDK 600 610 620 630 640 650 690 700 710 720 730 740 mKIAA4 RKSVTDPKELKCCVQDLSDQLLEVVGLEGAMEMGQIYTGLKSAGRRLAQCSSVTIRTNKL : ..:: :::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.: mKIAA0 RPTLTDAKELKFASQDLSDQLLEVVGLEGAMEMGQIYTGLKSAGRRLAQCSSVVIRTSKS 660 670 680 690 700 710 750 760 770 780 mKIAA4 LPMQVDGEPWMQPQCTIKITHKNQAPMMMGPPQKSSFF-SL--RRKSRSKD ::::.::::::: :::::::::::::.:::: :...: :: : ..:::. mKIAA0 LPMQIDGEPWMQTPCTIKITHKNQAPMLMGPPPKTGLFCSLIKRTRNRSKE 720 730 740 750 760 >>mKIAA0145 ( 1039 res) mbg16251 (1039 aa) initn: 1036 init1: 420 opt: 542 Z-score: 512.9 bits: 106.1 E(): 2e-23 Smith-Waterman score: 667; 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