FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1342.ptfa, 499 aa vs ./tmplib.26680 library 1768518 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1051+/-0.00477; mu= 13.4250+/- 0.319 mean_var=103.8346+/-24.103, 0's: 0 Z-trim: 18 B-trim: 8 in 1/35 Lambda= 0.1259 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0080 ( 353 res) mbh01670 ( 353) 1245 236 2.5e-63 mKIAA4194 ( 320 res) mbg12940 ( 320) 740 145 9.5e-36 mKIAA1427 ( 443 res) mbg18863 ( 443) 397 83 6.6e-17 mKIAA0985 ( 684 res) mbp05185 ( 684) 298 65 2.2e-11 mKIAA0538 ( 826 res) msh37311 ( 826) 241 55 3.3e-08 mFLJ00227 ( 590 res) mtk02576 ( 590) 226 52 1.8e-07 mKIAA4186 ( 899 res) mfj00029 ( 899) 209 49 2e-06 mFLJ00067 ( 891 res) msh44296 ( 891) 195 46 1.1e-05 mKIAA0734 ( 1159 res) mbg10039 (1159) 188 45 3.2e-05 mKIAA0439 ( 442 res) mbg08890 ( 442) 182 44 3.7e-05 mKIAA0636 ( 560 res) mkg04101 ( 560) 163 40 0.00047 mKIAA1597 ( 407 res) mnh09216 ( 407) 159 39 0.00064 mKIAA0559 ( 1592 res) mbg01260 (1592) 155 39 0.0025 >>mKIAA0080 ( 353 res) mbh01670 (353 aa) initn: 921 init1: 811 opt: 1245 Z-score: 1229.2 bits: 236.5 E(): 2.5e-63 Smith-Waterman score: 1245; 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