FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1497.ptfa, 721 aa vs ./tmplib.26680 library 1768296 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9603+/-0.00476; mu= 13.4975+/- 0.318 mean_var=102.1478+/-23.340, 0's: 0 Z-trim: 35 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1269 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0405 ( 637 res) mbg12039 ( 637) 356 76 9.4e-15 mKIAA0416 ( 528 res) mbg05717 ( 528) 321 70 7.1e-13 mKIAA1580 ( 640 res) mbf00310 ( 640) 307 68 4.7e-12 mKIAA4208 ( 721 res) mbe00555 ( 721) 280 63 1.6e-10 mKIAA0644 ( 837 res) mbg06261 ( 837) 275 62 3.3e-10 mKIAA0918 ( 839 res) mfj08110 ( 839) 269 61 7e-10 mKIAA4111 ( 619 res) mid39041 ( 619) 264 60 1.1e-09 mKIAA1225 ( 1401 res) mbg04842 (1401) 245 57 2e-08 mKIAA1163 ( 638 res) mfj27154 ( 638) 240 55 2.3e-08 mKIAA4141 ( 1593 res) mbg03129 (1593) 244 56 2.5e-08 mKIAA1465 ( 785 res) mfj00439 ( 785) 230 54 9.5e-08 mKIAA1246 ( 833 res) mbj01002 ( 833) 223 52 2.4e-07 mKIAA0230 ( 1431 res) mbg10262 (1431) 225 53 2.6e-07 mKIAA4018 ( 606 res) mej02761 ( 606) 211 50 9e-07 mKIAA0813 ( 1557 res) mbg05377 (1557) 212 51 1.4e-06 mKIAA1365 ( 1497 res) mbg05137 (1497) 208 50 2.3e-06 mKIAA1469 ( 663 res) mbj00677 ( 663) 200 48 3.8e-06 mKIAA0862 ( 584 res) mpj01572 ( 584) 199 48 4e-06 mKIAA0231 ( 815 res) mbp00073 ( 815) 192 47 1.2e-05 mKIAA3024 ( 898 res) mfj07190 ( 898) 192 47 1.3e-05 mKIAA1132 ( 1723 res) mbg00857 (1723) 189 46 2.8e-05 mKIAA0606 ( 1318 res) mbg00108 (1318) 181 45 6.6e-05 mKIAA0012 ( 727 res) msj04008 ( 727) 178 44 6.6e-05 mKIAA1910 ( 760 res) mbg21737 ( 760) 178 44 6.8e-05 mKIAA0806 ( 702 res) mfj52037 ( 702) 168 42 0.00023 mKIAA1437 ( 811 res) mfj00342 ( 811) 162 41 0.00054 mKIAA1061 ( 696 res) mbp15027 ( 696) 159 40 0.00072 mKIAA3016 ( 714 res) mph00541 ( 714) 159 40 0.00073 mKIAA0626 ( 350 res) mbg10563 ( 350) 150 38 0.0015 mKIAA1851 ( 705 res) mpg00887 ( 705) 145 38 0.0043 mKIAA0147 ( 1694 res) mbg04389 (1694) 149 39 0.0045 mKIAA4170 ( 1376 res) mbg21326 (1376) 147 39 0.0051 mKIAA1916 ( 588 res) mbg08812 ( 588) 142 37 0.0056 mKIAA0343 ( 1202 res) mbg04270 (1202) 145 38 0.006 >>mKIAA0405 ( 637 res) mbg12039 (637 aa) initn: 172 init1: 136 opt: 356 Z-score: 357.2 bits: 76.5 E(): 9.4e-15 Smith-Waterman score: 384; 24.258% identity (28.719% ungapped) in 573 aa overlap (106-655:22-528) 80 90 100 110 120 130 mKIAA1 SSDTQVLLLQSNNIAKTVDELQQLFNLTELDFSQNNFTNIKEVGLANLTQLTTLHLEENQ .: : .. : :. .:.:.:..:: mKIAA0 LGLYLQVSKLLACPSVCRCDRNFVYCNERSLTSVPLGIPEGVTVLYLHNNQ 10 20 30 40 50 140 150 160 170 180 190 mKIAA1 ISEMT-DYCLQDLSNLQELYINHNQISTISANAFSGLKNLLRLHLNSNKLKVIDSRWFDS :.. :....... .:. ::.. . : ::. :::. :....:. . . mKIAA0 INNAGFPAELHNVQSVHTVYLYGNQLDEFPMNLP---KNVRVLHLQENNIQTISRAALAQ 60 70 80 90 100 200 210 220 230 240 250 mKIAA1 TPNLEILMIGENPV--IGILDMNFRPLSNLRSLVLAGMYLTDVPGNALVGLD-SLESLSF .:: : . .: . .:. : :: .:. : :. .:..:: ::: .:. : mKIAA0 LLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVP----VGLPVDLQELRV 110 120 130 140 150 160 260 270 280 290 300 mKIAA1 YDNKLIKVPQLALQKVPNLKFLDLNKNPIHK--IQEGDFKNMLRLKELGI--NNMGELVS .:.. . ..:.:.. .:. : .. : . . : :: :... .:::..: :... mKIAA0 DENRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLKEFSIVRNSLS---- 170 180 190 200 210 220 310 320 330 340 350 360 mKIAA1 VDRYALDNLP--ELTKLEATNNPKLSYIHRLAFRSVPALESLMLNNNALNAVYQKTVESL . .:: .: .: .: ....: :: .. :: : ..:: : . : . . : mKIAA0 ---HPPPDLPGTHLIRLYLQDN-QINHIPLTAFANLRKLERLDISNNQLRMLTQGVFDHL 230 240 250 260 270 370 380 390 400 410 mKIAA1 PNLREISIHSNPLRCDCVIHWIN------SNKTNIR-FMEPLSMFCAMPPEYRGQQVKEV ::.... ..:: ::: :.:.. .. :.: :: : : . ::. :.: mKIAA0 SNLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSLNVRGFM------CQGPEQVRGMAVRE- 280 290 300 310 320 420 430 440 450 460 470 mKIAA1 LIQDSSEQCLPMISHDTFPNHLNMDIGTTLFLDCRAMAEPEPEIYWVTPIGNKITVETLS :::.. :.: . . : .. :: . .. : : mKIAA0 ---------------------LNMNL-----LSCPTTTPGLP-VF--TPAPSTVSPTTQS 330 340 350 360 480 490 500 510 520 530 mKIAA1 DKYKLSSEGTLEIANIQIEDSGRYTCVAQNVQGADTRVATIKVNGTLLDGAQVLKIYVKQ .. : . . .. .. : : .:. . . :. .:.. mKIAA0 PTLSVPSPSRGSVPPAPTPSK------LPTIPDWDGRE---RVTPPISERIQLSIHFVND 370 380 390 400 410 540 550 560 570 580 590 mKIAA1 TESHSILVSWKVNSNVMTSNLKWSSATMKIDNPHITYTARVPVDVHEYNLTHLQPSTDYE : :: ::: .::. .: : . .. . :. : . .. .:..:.: . :. mKIAA0 T---SIQVSWLSLFTVMAYKLTWVKMGHSLVGG-IVQERIVSGEKQHLSLVNLEPRSTYR 420 430 440 450 460 600 610 620 630 640 650 mKIAA1 VCLT---VSNIHQQTQKSCVNVTTKTAAF---ALDISDHETSTALAAVMGSMFAVISLAS .::. . : . . : ..::... . . :.:: .:. . ::: : . .: . mKIAA0 ICLVPLDAFNYRTVEDTICSEATTHASYLNNGSNTASSHEQTTSHS--MGSPFLLAGLIG 470 480 490 500 510 520 660 670 680 690 700 710 mKIAA1 IAIYIAKRFKRKNYHHSLKKYMQKTSSIPLNELYPPLINLWEADSDKDKDGSADTKPTQV :. mKIAA0 GAVIFVLVVLLSVFCWHMHKKGRYTSQKWKYNRGRRKDDYCEAGTKKDNSILEMTETSFQ 530 540 550 560 570 580 >>mKIAA0416 ( 528 res) mbg05717 (528 aa) initn: 630 init1: 264 opt: 321 Z-score: 323.5 bits: 70.0 E(): 7.1e-13 Smith-Waterman score: 326; 29.110% identity (30.686% ungapped) in 292 aa overlap (37-327:47-324) 10 20 30 40 50 60 mKIAA1 ARLSTGKAACQVVLGLLITSLTESSILTSECPQLCVCEIRPWFTPQSTYREATTVDCNDL :: : :: .. :.. mKIAA0 HFKWPLGAPMLAAIYAMSVVLKMLPALGMACPPKCRCEKLLFY-------------CDSQ 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 mKIAA1 RLTRIPGNLSSDTQVLLLQSNNI-AKTVDELQQLFNLTELDFSQNNFTNIKEVGLANLTQ . .:. .. . : :. :.: : :.. .. .:: : ...:.....:: .. .: . mKIAA0 GFHSVPNATDKGSLGLSLRHNHITALERDQFASFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAFQGLYK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 mKIAA1 LTTLHLEENQISEMTDYCLQDLSNLQELYINHNQISTISANAFSGLKNLLRLHLNSNKLK : : : :.: . . . .: :::.: .. ::.:.. . : ::..: ::: ::.:. mKIAA0 LKELILSSNKIFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 mKIAA1 VIDSRWFDSTPNLEILMIGENPVIGILDMNFRPLSNLRSLVLAGMYLTDVPGNALVGLDS .: : : . .::.: .. : . .. .: : .:: : : :: . .. :.: mKIAA0 TIPVRLFWDCRSLEFLDLSTNRLRSLARNGFAGLIKLRELHLEHNQLTKINFAHFLRLSS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 mKIAA1 LESLSFYDNKLIKVPQLALQKVPNLKFLDLNKNPIHKIQEGDFKNMLRLKELGINNMGEL :..: . ::. .. .:. :::. : :. :. :..: :: : ..: ..: mKIAA0 LHTLFLQWNKISNLTCGMDWTWSTLEKLDLTGNEIKAIDLTVFETMPNLKILLMDN-NKL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 mKIAA1 VSVDRYALDNLPELTKLEATNNPKLSYIHRLAFRSVPALESLMLNNNALNAVYQKTVESL :.: :..: :: . ..: mKIAA0 NSLDSKILNSLKSLTTVGLSGNLWECSPRVCALASWLGSFQGRWEHSILCHSPDHTQGED 310 320 330 340 350 360 >>mKIAA1580 ( 640 res) mbf00310 (640 aa) initn: 381 init1: 162 opt: 307 Z-score: 308.7 bits: 67.5 E(): 4.7e-12 Smith-Waterman score: 495; 26.892% identity (29.670% ungapped) in 502 aa overlap (114-606:66-529) 90 100 110 120 130 140 mKIAA1 LQSNNIAKTVDELQQLFNLTELDFSQNNFTNIKEV--GLANLTQLTTLHLEENQISEMTD :..:: :... :.: .:: ::::. . mKIAA1 LVVAGLVRAQTCPSVCSCSNQFSKVICVRKNLREVPDGISTNTRLLNLH--ENQIQIIKV 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 YCLQDLSNLQELYINHNQISTISANAFSGLKNLLRLHLNSNKLKVIDSRWFDSTPNLEIL .. : .:. : ...:.: :: .::.:: :: :.: .:.: .: . : .:. : mKIAA1 NSFKHLRHLEILQLSRNHIRTIEIGAFNGLANLNTLELFDNRLTTIPNGAFVYLSKLKEL 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 mKIAA1 MIGENPVIGILDMNFRPLSNLRSLVLAGM-YLTDVPGNALVGLDSLESLSFYDNKLIKVP . .::. .: .. : . .:: : :. . :. . .:. ::..:. :.. .: ..: mKIAA1 WLRNNPIESIPSYAFNRIPSLRRLDLGELKRLSYISEGAFEGLSNLRYLNLAMCNLREIP 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 mKIAA1 QLALQKVPNLKFLDLNKNPIHKIQEGDFKNMLRLKELGINNMGELVSVDRYALDNLPELT .:. . .: :::. : . :. :.:.....:..: . . ... ..: :.::: :. mKIAA1 NLT--PLIKLDELDLSGNHLSAIRPGSFQGLMHLQKLWMIQ-SQIQVIERNAFDNLQSLV 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 mKIAA1 KLEATNNPKLSYIHRLAFRSVPALESLMLNNNALNAVYQKTVESLPNLREISIHSNPLRC ... : .: :. . . : .:..: .: :: : mKIAA1 EIN-------------------------LAHNNLTLLPHDLFTPLHHLERIHLHHNPWNC 280 290 300 390 400 410 420 430 mKIAA1 DCVIHWINSNKTNIRFMEPLSMFCAM----PPEYRGQQVKEVLIQDSSEQCLPMISHDTF .: : :.. :: : : . : ::. .:. . : : :. :.: . mKIAA1 NCDILWLS---WWIRDMAPSNTACCARCNTPPNLKGRYIGE-LDQNYFTCYAPVIVEP-- 310 320 330 340 350 440 450 460 470 480 490 mKIAA1 PNHLNMDIGTTLFLDCRAMAEPEPEIYWVTPIGNKITVETLSDKYKLSSEGTLEIANIQI : ::. : . : ::: . . :.:: :. .: . . . . :.:::...:. . mKIAA1 PADLNVTEGMAAELKCRA-STSLTSVSWITPNGTVMTHGAYKVRIAVLSDGTLNFTNVTV 360 370 380 390 400 410 500 510 520 530 540 550 mKIAA1 EDSGRYTCVAQNVQGADTRVATIKVNGTLLDGAQVLKIYVKQTESHSILVSWKVNSNVM- .:.: :::...: : : ::..:... . .. . .: : . ...:: mKIAA1 QDTGMYTCMVSNSVGNTTASATLNVTAATTTPFSYFSTVTVETMEPSQDEARTTDNNVGP 420 430 440 450 460 470 560 570 580 590 600 610 mKIAA1 TSNLKWSSATMKID-NPHITYTARVPVDVHEYNLTHLQPSTDYEVCLTVSNIHQQTQKSC : . : .... . .:. : ... . ... :. : :: :.. : mKIAA1 TPVIDWETTNVTTSLTPQSTRSTEKTFTIPVTDINSGIPGID-EVMKTTKIIIGCFVAIT 480 490 500 510 520 530 620 630 640 650 660 670 mKIAA1 VNVTTKTAAFALDISDHETSTALAAVMGSMFAVISLASIAIYIAKRFKRKNYHHSLKKYM mKIAA1 LMAAVMLVIFYKMRKQHHRQNHHAPTRTVEIINVDDEITGDTPMESHLPMPAIEHEHLNH 540 550 560 570 580 590 >>mKIAA4208 ( 721 res) mbe00555 (721 aa) initn: 450 init1: 280 opt: 280 Z-score: 281.4 bits: 62.6 E(): 1.6e-10 Smith-Waterman score: 388; 25.524% identity (34.447% ungapped) in 525 aa overlap (37-558:22-413) 10 20 30 40 50 60 mKIAA1 ARLSTGKAACQVVLGLLITSLTESSILTSECPQLCVCEIRPWFTPQSTYREATTVDCNDL ::. :::.: ..:. :: : mKIAA4 STMEKFLFYLFLIGIAVRAQICPKRCVCQI---LSPNL----ATL--CAKK 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 mKIAA1 RLTRIPGNLSSDTQVLLLQSNNIAKTVDELQQLFNLTELDFSQNNFTNIKEVGLANLTQL : .: :.. : .:: ...: ::::. .::.:.: mKIAA4 GLLFVPPNIDRRT-----------------------VELRLADNFVTNIKRKDFANMTSL 50 60 70 130 140 150 160 170 180 mKIAA1 TTLHLEENQISEMTDYCLQDLSNLQELYINHNQISTISANAFSGLKNLLRLHLNSNKLKV . : : .: :: .: . . :: ::. :..: :... :. . ::::.:: .: ::.:.: . mKIAA4 VDLTLSRNTISFITPHAFADLRNLRALHLNSNRLTKITNDMFSGLSNLHHLILNNNQLTL 80 90 100 110 120 130 190 200 210 220 230 240 mKIAA1 IDSRWFDSTPNLEILMIGENPVIGILDMNFRPLSNLRSLVLAGMYLTDVPGNALVGLDSL :.: ::.. :: : :... mKIAA4 ISSTAFDDVFALEEL-----------DLSY------------------------------ 140 150 250 260 270 280 290 300 mKIAA1 ESLSFYDNKLIKVPQLALQKVPNLKFLDLNKNPIHKIQEGDFKNMLRLKELGINNMGELV :.: .: :..:. .:. :.:..: : .: .: :... .. .: ... mKIAA4 -------NNLETIPWDAVEKMVSLHTLSLDHNMIDNIPKGTFSHLHKMTRLDVTSN---- 160 170 180 190 200 310 320 330 340 350 360 mKIAA1 SVDRYALDNLPELTKLEATNNPKLSYIHRLAFRSVPALESLMLNNNALNAVYQKTVESLP :..:: .: .. . :: .. . : mKIAA4 -----KLQKLPP--------DPLFQRAQVLATSGIIS----------------------P 210 220 230 370 380 390 400 410 420 mKIAA1 NLREISIHSNPLRCDCVIHWINSNKTNIRFMEPLSMFCAMPPEYRGQQVKEVLIQDSSEQ . .:. .:::.:.: . :. . . : :: : :. : . mKIAA4 STFALSFGGNPLHCNCELLWLRR----LSREDDLET-CASPALLTGRYFWS--IPEEEFL 240 250 260 270 280 430 440 450 460 470 480 mKIAA1 CLP-MISHDTFPNHLNMDIGTTLFLDCRAMAEPEPEIYWVTPIGNKITVETLSDKYKLSS : : .:.. : ... . : : :.: ..::: :.:..: :. :. : : : . mKIAA4 CEPPLITRHT--HEMRVLEGQRATLRCKARGDPEPAIHWISPEGKLISNATRSLVY---D 290 300 310 320 330 340 490 500 510 520 530 540 mKIAA1 EGTLEIANIQIEDSGRYTCVAQNVQGADTRVATIKVNGT--LLDGAQVLKIYVKQTESHS .:::.: ..:.: .::.:.: : :... ... ::.... .:. . : . mKIAA4 NGTLDILITTVKDTGAFTCIASNPAGEATQTVDLHIIKLPHLLNSTN--HIHEPDPGSSD 350 360 370 380 390 550 560 570 580 590 600 mKIAA1 ILVSWKVNSNVMTSNLKWSSATMKIDNPHITYTARVPVDVHEYNLTHLQPSTDYEVCLTV : .: : .::. .:: mKIAA4 ISTSTKSGSNASSSNGDTKMSQDKIVVAEATSSTALLKFNFQRNIPGIRMFQIQYNGTYD 400 410 420 430 440 450 >>mKIAA0644 ( 837 res) mbg06261 (837 aa) initn: 283 init1: 180 opt: 275 Z-score: 275.7 bits: 61.8 E(): 3.3e-10 Smith-Waterman score: 382; 26.733% identity (28.800% ungapped) in 404 aa overlap (35-424:84-472) 10 20 30 40 50 60 mKIAA1 TMARLSTGKAACQVVLGLLITSLTESSILTSECPQLCVCEIRPWFTPQSTYREATTVDCN : ::. : :. :: :. mKIAA0 RAGRAAMEGVGAVRFWLVVCGCLAFPPRAESVCPERCDCQ-----HPQHLL-------CT 60 70 80 90 100 70 80 90 100 110 mKIAA1 DLRLTRIP--GNLSSDTQVLL--LQSNNIAK-TVDELQQLFNLTELDFSQNNFTNIKEVG . : .: ..: : .:: : .: :.. :. ....: .: .::.. :.. ... mKIAA0 NRGLRAVPKTSSLPSPQDVLTYSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQIRSLHPKT 110 120 130 140 150 160 120 130 140 150 160 170 mKIAA1 LANLTQLTTLHLEENQISEMTDYCLQDLSNLQELYINHNQISTISANAFSGLKNLLRLHL . .:..: :.: .: .. .. : : .:. :: : :.:. .: ..: ::..:..:.: mKIAA0 FEKLSRLEELYLGNNLLQALVPGTLAPLRKLRILYANGNEIGRLSRGSFEGLESLVKLRL 170 180 190 200 210 220 180 190 200 210 220 230 mKIAA1 NSNKLKVIDSRWFDSTPNLEILMIGENPVIGILDMNFRPLSNLRSLVLAGMYLTDVPGNA ..: : .. . : :: : . : . . : :..:: : :.. : .: mKIAA0 DGNVLGALPDAVFAPLGNLLYLHLESNRIRFLGKNAFSQLGKLRFLNLSANELQPSLRHA 230 240 250 260 270 280 240 250 260 270 280 290 mKIAA1 --LVGLDSLESLSFYDNKLIKVPQLALQKVPNLKFLDLNKNPIHKIQEGDFKNMLRLKEL .: : :: .: . :.: .. ..:..: : .:.:. : . .. : .. :.:: mKIAA0 ATFVPLRSLSTLILSANSLQHLGPRVFQHLPRLGLLSLSGNQLTHLAPEAFWGLEALREL 290 300 310 320 330 340 300 310 320 330 340 350 mKIAA1 GINNMGELVSVDRYALDNLPELTKLEATNNPKLSYIHRLAFRSVPALESLMLNNNALNAV ... ..: .. :. : : :. ..: .:: .: .: :. : : .:::.:. mKIAA0 RLEG-NRLNQLPLTLLEPLHSLEALDLSGN-ELSALHPATFGHQGRLRELSLRDNALSAL 350 360 370 380 390 360 370 380 390 400 410 mKIAA1 YQKTVESLPNLREISIHSNPLRCDCVIH----WINSNKTNIRFMEPLSMFCAMPPEYRGQ . : : .... .: ::: .. :... ... :.. . . : :: ::. mKIAA0 SGDIFAASPALYRLDLDGNGWTCDCRLRGLKRWMGNWHSQGRLLTVFVQ-CRHPPALRGK 400 410 420 430 440 450 420 430 440 450 460 470 mKIAA1 Q---VKEVLIQDSSEQCLPMISHDTFPNHLNMDIGTTLFLDCRAMAEPEPEIYWVTPIGN . . :.:..: mKIAA0 YLDYLDDQLLQNGSCVDPSPSPTAGSRQWPLPTSSEEGMTPPAGLSQELPLQPQPQPQQR 460 470 480 490 500 510 >>mKIAA0918 ( 839 res) mfj08110 (839 aa) initn: 288 init1: 236 opt: 269 Z-score: 269.8 bits: 60.7 E(): 7e-10 Smith-Waterman score: 269; 33.133% identity (33.742% ungapped) in 166 aa overlap (91-254:281-445) 70 80 90 100 110 mKIAA1 VDCNDLRLTRIPGNLSSDTQVLLLQSNNIAKTVDELQ-QLFNLTELDFSQNNFTNIKEVG ... ::: . .: .. ...: .: .... mKIAA0 PVPLECPTACTCNLQISDLGLNVNCQERKIESIAELQPKPYNPKKMYLTENYITVVRRTD 260 270 280 290 300 310 120 130 140 150 160 170 mKIAA1 LANLTQLTTLHLEENQISEMTDYCLQDLSNLQELYINHNQISTISANAFSGLKNLLRLHL . . : : ::: .:.:: . : . ::.::..::.: :.: .: . : ::..: : : mKIAA0 FLEATGLDLLHLGNNRISMIQDRAFGDLGNLRRLYLNGNRIERLSPELFYGLQSLQYLFL 320 330 340 350 360 370 180 190 200 210 220 230 mKIAA1 NSNKLKVIDSRWFDSTPNLEILMIGENPVIGILDMNFRPLSNLRSLVLAGMYLTDVP-GN . : .. :.. :: .:::..:....: . .. . : :. :: : : : .:..: .. mKIAA0 QYNLIREIQAGTFDPVPNLQLLFLNNNQLQAMPSGVFSGLTLLR-LNLRGNSFTSLPVSG 380 390 400 410 420 240 250 260 270 280 290 mKIAA1 ALVGLDSLESLSFYDNKLIKVPQLALQKVPNLKFLDLNKNPIHKIQEGDFKNMLRLKELG .: : :: .....:: mKIAA0 VLDQLTSLIQIDLHDNPWDCTCDVVGMKLWIEQLKVGVLVDEVICKAPKKFAETYMRSIK 430 440 450 460 470 480 >>mKIAA4111 ( 619 res) mid39041 (619 aa) initn: 470 init1: 251 opt: 264 Z-score: 266.3 bits: 59.6 E(): 1.1e-09 Smith-Waterman score: 344; 25.258% identity (26.703% ungapped) in 388 aa overlap (3-379:14-391) 10 20 30 mKIAA1 GWQATMARLSTGKAACQVVLGLLIT----SLTESSILTS------ECPQ :.::: : ::. : :.:.. .. : .. .: .:: mKIAA4 TALAHCLPAASSVQGTMA-LRTGSPALVVLLAFWVALGPCYLQGTDPGASADAEGPQCPV 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 90 mKIAA1 LCVCEIRPWFTPQSTYREATTVDCNDLRLTRIPGNLSSDTQVLLLQSNNIAKTVDE-LQQ :.: . : . .: :.. ::..: .. .:..: :..::... . .:. mKIAA4 TCTCSY-------DDYTDELSVFCSSRNLTQLPDSIPVSTRALWLDGNNLSSIPSAAFQN 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 mKIAA1 LFNLTELDFSQNNFTNIKEVGLANLTQLTTLHLEENQISEMTDYCLQDLSNLQELYINHN : .: :... . . ... .: .: .: ::::.: . .. .. .: : ...: mKIAA4 LSSLDFLNLQGSWLRSLEPQALLGLQNLYHLHLERNLLRSLAAGLFRHTPSLASLSLGNN 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 mKIAA1 QISTISANAFSGLKNLLRLHLNSNKLKVIDSRWFDSTPNLEILMIGENPVIGILDMNFRP .. . . : ::..: :.:. :.: :. . :.. ::. :... : . . . mKIAA4 LLGRLEEGLFRGLSHLWDLNLGWNSLVVLPDTVFQGLGNLHELVLAGNKLTYLQPALLCG 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 LSNLRSLVLAGMYLTDVPGNALVGLDSLESLSFYDNKLIKVPQLALQKVPNLKFLDLNKN :..:: : :. : .: .:... : :..: . : . : :. . :..:::..: mKIAA4 LGELRELDLSRNALRSVKANVFIHLPRLQKLYLDRNLITAVAPRAFLGMKALRWLDLSHN 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 PIHKIQEGDFKNMLRLKELGINNMGELVSVDRYALDNLPELTKLEATNNPKLSYIHRLAF . . : : ..: :. : . . . ..:. .. .: : .:. .: .. . . .: mKIAA4 RVAGLLEDTFPGLLGLHVLRLAH-NAITSLRPRTFKDLHFLEELQLGHN-RIRQLGEKTF 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 mKIAA1 RSVPALESLMLNNNALNAVYQKTVESLPNLREISIHSNPLRCDCVIHWINSNKTNIRFME ... :: : ::.: .. : . .: :. ... .: :: mKIAA4 EGLGQLEVLTLNDNQIHEVKVGAFFGLFNVAVMNLSGNCLRSLPEHVFQGLGRLHSLHLE 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 mKIAA1 PLSMFCAMPPEYRGQQVKEVLIQDSSEQCLPMISHDTFPNHLNMDIGTTLFLDCRAMAEP mKIAA4 HSCLGRIRLHTFAGLSGLRRLFLRDNSISSIEEQSLAGLSELLELDLTANQLTHLPRQLF 420 430 440 450 460 470 >>mKIAA1225 ( 1401 res) mbg04842 (1401 aa) initn: 165 init1: 57 opt: 245 Z-score: 243.5 bits: 56.6 E(): 2e-08 Smith-Waterman score: 245; 25.455% identity (28.324% ungapped) in 385 aa overlap (59-429:50-409) 30 40 50 60 70 80 mKIAA1 ESSILTSECPQLCVCEIRPWFTPQSTYREATTVDCNDLRLTRIPGNLSS---DTQVLLLQ ::.: . : ..: .. . . : :. mKIAA1 NSVHLKMTTKRSLFVRLVPCRCLRGEEETVTTLDYSHCSLEQVPKEIFTFEKTLEELYLD 20 30 40 50 60 70 90 100 110 120 130 140 mKIAA1 SNNIAKTVDEL-QQLFN---LTELDFSQNNFTNIKEVGLANLTQLTTLHLEENQISEMTD .:.: .:: .:::: : .:.. .:..:.. ...::: .: : . .: :.:. . mKIAA1 ANQI----EELPKQLFNCQSLHKLSLPDNDLTTLP-ASIANLINLRELDVSKNGIQEFPE 80 90 100 110 120 130 150 160 170 180 190 mKIAA1 YCLQDLSNLQELYINHNQISTIS--ANAFSGLKNLLRLHLNSNKLKVIDSRWFDSTPNLE ...: . : : . ... :: ..:: : :: .:.::. :. . . : .:. mKIAA1 ----NIKNCKVLTIVEASVNPISKLPDGFSQLLNLTQLYLNDAFLEFLPAN-FGRLTKLQ 140 150 160 170 180 200 210 220 230 240 250 mKIAA1 ILMIGENPVIGILDMNFRPLSNLRSLVLAGMYLTDVPGNALVGLDSLESLSFYDNKLIKV :: . :: . .: .. :..:. : :.. .:.:: ..: :..:. . . :.: . mKIAA1 ILELRENQ-LKMLPKTMNRLTQLERLDLGSNEFTEVP-EVLEQLSGLREFWMDGNRLTFI 190 200 210 220 230 240 260 270 280 290 300 310 mKIAA1 PQLALQKVPNLKFLDLNKNPIHKIQEG--DFKNMLRLKELGINNMGELVSVDRYALDNLP : . . .. .: .::..:: :. ..:: .: . :. :.. .: . . .: mKIAA1 PGF-IGSLRQLTYLDVSKNNIEMVEEGISTCENPQDFL-LSSNSLQQLPET----IGSLK 250 260 270 280 290 300 320 330 340 350 360 370 mKIAA1 ELTKLEATNNPKLSYIHRLAFRSVPALESLMLNNNALNAVYQKTVESLPNLREISIHSNP ..: :. .: .: :. .. .. ..: : . : ..:. ... .: :.: .. : mKIAA1 NVTTLKIDEN-QLMYLPD-SIGGLRSIEELDCSFNEIEAL-PSSIGQLTNMRTFAADHNY 310 320 330 340 350 380 390 400 410 420 430 mKIAA1 LRC--DCVIHWINSNKTNIRFMEPLSMFCAMPPEYRG-QQVKEVLIQDSSEQCLPMISHD :. . .: : .. :.. . . ..: :. :..: . ..:. . ::. mKIAA1 LQQLPPEIGNWKN---ITVLFLH-CNKLETLPEEMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFSFTK 360 370 380 390 400 410 440 450 460 470 480 490 mKIAA1 TFPNHLNMDIGTTLFLDCRAMAEPEPEIYWVTPIGNKITVETLSDKYKLSSEGTLEIANI mKIAA1 LQQLTAMWLSDNQSKPLIPLQKETDTETQKMVLTNYMFPQQPRTEDVMFISDNESFNPAL 420 430 440 450 460 470 >>mKIAA1163 ( 638 res) mfj27154 (638 aa) initn: 253 init1: 137 opt: 240 Z-score: 242.4 bits: 55.2 E(): 2.3e-08 Smith-Waterman score: 311; 26.351% identity (28.889% ungapped) in 296 aa overlap (243-528:231-510) 220 230 240 250 260 270 mKIAA1 DMNFRPLSNLRSLVLAGMYLTDVPGNALVGLDSLESLSFYDNKLIKVPQLALQKVPNLKF : .:.:: . :.: . . :. ::::.. mKIAA1 VPQSLPSYTALLDLSHNNLSRLRAEWTPTRLTNLHSLLLSHNHLNFISSEAFVPVPNLRY 210 220 230 240 250 260 280 290 300 310 320 330 mKIAA1 LDLNKNPIHKIQEGDFKNMLRLKELGINNMGELVSVDRYALDNLPELTKLEATNNPKLSY :::..: .: ..: :... :. : . : ...: ::: :.... .: :: ..: . mKIAA1 LDLSSNHLHTLDEFLFSDLQALEVLLLYN-NHIVVVDRNAFEDMAQLQKLYLSQNQISRF 270 280 290 300 310 340 350 360 370 380 mKIAA1 IHRLA--FRSVPALESLMLNNNALNAVYQKTVESLPNLRE--ISIHSNPLRCDCVI---- .: ..: : : :..: :. . ...:: . . .:.:::.::: . mKIAA1 PVELIKDGNKLPKLMLLDLSSNKLKKLPLTDLQKLPAWVKNGLYLHNNPLECDCKLYQLF 320 330 340 350 360 370 390 400 410 420 430 440 mKIAA1 -HWINSNKTNIR-FMEPLSMFCAMPPEYRGQQVKEVLIQDSSEQCLPMISHDTFPNHLNM :: . ... :.: : .: .......... : . : . ..... :: mKIAA1 SHWQYRQLSSVMDFQEDL--YC-----MHSKKLHNIFSLDFFN-CSEY-KESAWEAHL-- 380 390 400 410 420 450 460 470 480 490 500 mKIAA1 DIGTTLFLDCRAMAEPEPEIYWVTPIGNKITVETLSDKYKLSSEGTLEIANIQIEDSGRY : :: . : . . .. ::.: .... . . . .. . : : . ..:.::.: : mKIAA1 --GDTLTIRCDTKQQGMTKV-WVSPSNEQVLSQGSNGSVSVRN-GDLFFKKVQVEDGGVY 430 440 450 460 470 480 510 520 530 540 550 560 mKIAA1 TCVAQNVQGADTRVATIKVNGTLLDGAQVLKIYVKQTESHSILVSWKVNSNVMTSNLKWS :: :.. .: . .:: . : : mKIAA1 TCYAMGETFNETLSVELKVYNFTLHGHHDTLNTAYTTLVGCILSVVLVLIYLYLTPCRCW 490 500 510 520 530 540 >>mKIAA4141 ( 1593 res) mbg03129 (1593 aa) initn: 434 init1: 242 opt: 244 Z-score: 241.9 bits: 56.5 E(): 2.5e-08 Smith-Waterman score: 348; 24.145% identity (27.427% ungapped) in 468 aa overlap (1-430:526-975) 10 20 30 mKIAA1 GWQATMARLSTGKAACQVVLGLLITSLTES : . : : ..: :. . : ::. mKIAA4 TMHLAQNPFICDCHLKWLADYLHTNPIETSGARCTSPRRLANKRIGQIKSKKFRCSGTED 500 510 520 530 540 550 40 50 60 70 80 mKIAA1 --SILTSECPQLCVCEIRPWFTPQSTYREATTVDCNDLRLTRIPGNLSSDTQVLLLQSN- : :...: .: :.. :.:::::.. ::..:: .. . : : :..: mKIAA4 YRSKLSGDCFADLAC-------PEKCRCEGTTVDCSNQRLNKIPDHIPQYTAELRLNNNE 560 570 580 590 600 90 100 110 120 130 140 mKIAA1 -NIAKTVDELQQLFNLTELDFSQNNFTNIKEVGLANLTQLTTLHLEENQISEMTDYCLQD .. ... ...: .: ...::.:..:.:.: .. . . .. . : :.. .. .. mKIAA4 FTVLEATGIFKKLPQLRKINFSNNKITDIEEGAFEGASGVNEILLTSNRLENVQHKMFKG 610 620 630 640 650 660 150 160 170 180 190 200 mKIAA1 LSNLQELYINHNQISTISANAFSGLKNLLRLHLNSNKLKVIDSRWFDSTPNLEILMIGEN : .:. :.. :.:: .. ..: :: .. : : .:.. .. ::: .: : . : mKIAA4 LESLKTLMLRSNRISCVGNDSFIGLGSVRLLSLYDNQITTVAPGAFDSLHSLSTLNLLAN 670 680 690 700 710 720 210 220 230 240 mKIAA1 PVIGILDMNFRPLSNLRSLVLAG-------MYLTDVPGNALV--------GLDS------ : . . :. ...: ..: ..: . .. : :. mKIAA4 PFNCNCHLAWLGEWLRRKRIVTGNPRCQKPYFLKEIPIQDVAIQDFTCDDGNDDNSCSPL 730 740 750 760 770 780 250 260 270 280 290 mKIAA1 ---------LESLSFYDNKLIKV-PQLALQKVPNLKFLDLNKNPIHKIQEGDFKNMLRLK :... .:: .:: :. . : .: .:: :. . . ...:. : : mKIAA4 SRCPSECTCLDTVVRCSNKGLKVLPKGIPKDVTEL-YLDGNQFTLVPKELSNYKH-LTLI 790 800 810 820 830 840 300 310 320 330 340 350 mKIAA1 ELGINNMGELVSVDRYALDNLPELTKLEATNNPKLSYIHRLAFRSVPALESLMLNNNALN .:. : .. : . ...:. .: : . : .: : .: .. .:. : :..: .. mKIAA4 DLSNNRISTLSN---QSFSNMTQLLTLILSYN-RLRCIPPRTFDGLKSLRLLSLHGNDIS 850 860 870 880 890 900 360 370 380 390 400 410 mKIAA1 AVYQKTVESLPNLREISIHSNPLRCDCVIHWINSNKTNIRFMEPLSMFCAMPPEYRGQQV .: . . ..: : ...: .::: ::: ..:. :. .. .. :: :: : :... mKIAA4 VVPEGAFNDLSALSHLAIGANPLYCDCNMQWL-SDWVKSEYKEPGIARCAGP----GEMA 910 920 930 940 950 420 430 440 450 460 470 mKIAA1 KEVLIQDSSEQ--CL-PMISHDTFPNHLNMDIGTTLFLDCRAMAEPEPEIYWVTPIGNKI ..:. :.. : :: mKIAA4 DKLLLTTPSKKFTCQGPMDITIQAKCNPCLSNPCKNDGTCNNDPVDFYRCTCPYGFKGQD 960 970 980 990 1000 1010 721 residues in 1 query sequences 1768296 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:46:36 2006 done: Mon Mar 27 10:46:37 2006 Scan time: 0.880 Display time: 0.300 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]