FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0615.ptfa, 919 aa vs ./tmplib.26680 library 1768098 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7680+/-0.00598; mu= 3.9082+/- 0.398 mean_var=180.9394+/-42.730, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0953 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0323 ( 718 res) mbg03489 ( 718) 800 123 1.7e-28 mKIAA1305 ( 1161 res) mbp09087 (1161) 679 106 2.5e-23 mKIAA1726 ( 613 res) mbp12272 ( 613) 459 76 2e-14 >>mKIAA0323 ( 718 res) mbg03489 (718 aa) initn: 1118 init1: 797 opt: 800 Z-score: 603.9 bits: 122.6 E(): 1.7e-28 Smith-Waterman score: 986; 31.538% identity (43.231% ungapped) in 891 aa overlap (34-918:59-714) 10 20 30 40 50 60 mKIAA0 CSGGTLRGRRRRWPPAPREAAPAMAARVVLDEFTAPAEKAALLERSRGRIEALFGVGLAV :.:.. :: ..... :.: .:.::..: mKIAA0 RAPRGAGGTRGFGGLQVEAMSTWGFASPTPDRFAVSAEAEDKVREQQTRLERIFNVGMSV 30 40 50 60 70 80 70 80 90 100 110 120 mKIAA0 LGALGAEEPLPARIWLQLRGAQEAVHSAKEYIKGICEPELEEKECYPKAMHCIFVGAQSL :. :.: .:::::.: .: : ::::.::.: :::. . :: .::::.::... mKIAA0 LSKDCPENP---HIWLQLEGPKENVCRAKEYLKGLCSPELQSEIHYPPRLHCIFLGAHGF 90 100 110 120 130 140 130 140 150 160 170 180 mKIAA0 FLKSLIQDTCADLCVLDTGLLGIRGSAEAVVMARSHIQQFVKLFESNENL---PSNQRES :: : .: : : : : : : : .:: :::.:.....:. . . .: :. .. mKIAA0 FLDCLAWSTSAHLVPLLPGSLMISGLTEAFVMAQSRVEELVQRLSWDLQLQSCPGAPDNG 150 160 170 180 190 200 190 200 210 220 230 240 mKIAA0 EIKREFRQFVEAHADSYTMDLLILPTSLKKELLSLTQGEESLFETDDDVITVGDVRPPEY . :.: ..... :.:: :: :: ....::::: mKIAA0 GVLRDFSALLQTREDAYTEALLRLPLAVQEELLSL------------------------- 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 mKIAA0 TQSAATGPSSARDEVVVQEDSRNKARTPVSELTKHMDTVFSSSPDVLFVPVNGLSPDEDA ::: ::... : : : ::. ::: mKIAA0 ----------------VQEASRGQG--PSRE-------VGSSGL---------LSP---- 250 260 310 320 330 340 350 360 mKIAA0 LSKDRVCHKRRSSDTEERHTKKQFSLENVPEGELLPDGKGSAGNEVIDLSDPASNSTNLS ::. .: : .:. .:..: ... : mKIAA0 ----------------------QFQGVRAP----LNEGREFVGTRVA--------GSGKS 270 280 370 380 390 400 410 420 mKIAA0 PDGKDTTEEMEYNILVNFFKTMGYSQEIVEKVIREYGPSTEPLLLLEEIEKENKRLQEDR : ..: : : . .:::... . : mKIAA0 P------------------------------AVR--GQS-------HTVEKEERKQDAVR 290 300 430 440 450 460 470 480 mKIAA0 DFPPCTVYPDASQSRNAGVGSTTNELTADSTPKKAQSHTEQSMVERFSQLPFKDSKHCTS : .:: .::... . : ... : ::: .. mKIAA0 D-----------------MGSGRKELSGEEV-------WEPGVAYR-SQLAGGGAE---- 310 320 330 340 490 500 510 520 530 mKIAA0 NCKVNSFRTVPVGQKQEIWGSKQNSSCTVDLETDGHSASAASASP-KDISFVSR--GASG .: .. : :::. .: .. .:. : .: . :.: . :...: ..:. mKIAA0 --EVAPLKGKASG-KQEV--PQQRGGFSVQGEPSGAHVPCQRAAPIRGASLLQRLHNGSA 350 360 370 380 390 540 550 560 570 580 590 mKIAA0 HQQRNPAFPENGFQQQTEPLLPNNTKPACEKRSGSCSSPQPKPNYPPLSPPLPLPQLLPS : :. : :: : . . . : :. .. : :: mKIAA0 SPPRVPSPPPA-----PEPPWPCGDRDRDRDR-GDRGDKQQAGARGRGSP---------- 400 410 420 430 600 610 620 630 640 650 mKIAA0 VTEARLGGSSDHIDSSVTGVQRFRDTLKIPYKLELKNEPGRADLKHIVIDGSNVAITHGL .. ::. :::.:::...:. :. : : : ::. ::.::::::::::..::: mKIAA0 WKRGTRGGNL------VTGTQRFQEALQDPFTLCLANVPGQPDLRHIVIDGSNVAMVHGL 440 450 460 470 480 490 660 670 680 690 700 710 mKIAA0 KKFFSCRGIAIAVEYFWKLGNRNITVFVPQWRTRRDPNITEQHFLTQLQELGILSLTPAR ...:: ::::.::.::: :.:.::::::::: .: .. :.::: .: :..:::::.: mKIAA0 QHYFSSRGIALAVQYFWDRGHRDITVFVPQWRFSKDSKVRESHFLQKLYSLSLLSLTPSR 500 510 520 530 540 550 720 730 740 750 760 770 mKIAA0 MVFGERIASHDDRFLLHLADKTGGIIVTNDNFREFVTESVSWREIITKRLLQYTFVGDIF .. :.::.:.::::...::..: ::::.::.::... :: .: :: .::: .::::..: mKIAA0 VMDGKRISSYDDRFMVKLAEETDGIIVSNDQFRDLAEESDKWMAIIRERLLPFTFVGNLF 560 570 580 590 600 610 780 790 800 810 820 830 mKIAA0 MVPDDPLGRNGPRLEEFLRKEAFLRHMQPLLNALPSVGTFDPGFRSPSTQVANNSHQPPP :::::::::::: :.:::.: .:.. . :: : ::. ::. mKIAA0 MVPDDPLGRNGPTLDEFLKKP--VRKQGSSKTQQPSKG---------STEQANQ------ 620 630 640 650 840 850 860 870 880 890 mKIAA0 RIQTSSSPWLPQQSHFTALATLPSMQQNPPLPAQRSSAETSELREALLKIFPDSEQKLKI ::.. . ..: . :.. :: .::. ::..: ...: . mKIAA0 -----------QQGK-------DADRSNGGI---RKTRETERLRRQLLEVFWGQDHK--V 660 670 680 690 900 910 mKIAA0 DQILAAHPYMKDLNALSALVLD : :: .:: .:.: :: .:. mKIAA0 DFILQREPYCRDINQLSEALLSLNF 700 710 >>mKIAA1305 ( 1161 res) mbp09087 (1161 aa) initn: 669 init1: 506 opt: 679 Z-score: 511.1 bits: 106.2 E(): 2.5e-23 Smith-Waterman score: 679; 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