# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mid10054.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0615.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0615, 919 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7918879 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9165+/-0.00019; mu= 11.0708+/- 0.011 mean_var=95.3867+/-18.422, 0's: 33 Z-trim: 39 B-trim: 21 in 1/64 Lambda= 0.131320 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|158564327|sp|Q6A037.2|N4BP1_MOUSE RecName: Full ( 893) 5913 1131.0 0 gi|74184736|dbj|BAE27970.1| unnamed protein produc ( 893) 5868 1122.5 0 gi|109507840|ref|XP_214648.4| PREDICTED: similar t ( 938) 5651 1081.4 0 gi|109128446|ref|XP_001109863.1| PREDICTED: Nedd4 ( 962) 4954 949.3 0 gi|114662446|ref|XP_520627.2| PREDICTED: Nedd4 bin ( 961) 4930 944.8 0 gi|182888093|gb|AAI60019.1| NEDD4 binding protein ( 896) 4839 927.5 0 gi|158515401|sp|O75113.3|N4BP1_HUMAN RecName: Full ( 896) 4831 926.0 0 gi|59808608|gb|AAH89324.1| N4bp1 protein [Mus musc ( 694) 4635 888.8 0 gi|73950420|ref|XP_535311.2| PREDICTED: similar to ( 884) 4533 869.6 0 gi|194208571|ref|XP_001491059.2| PREDICTED: simila ( 933) 4488 861.1 0 gi|82568915|gb|AAI08289.1| N4BP1 protein [Homo sap ( 828) 4443 852.5 0 gi|119603135|gb|EAW82729.1| Nedd4 binding protein ( 810) 4332 831.5 0 gi|67968003|dbj|BAE00483.1| unnamed protein produc ( 701) 3723 716.0 1.5e-203 gi|74148028|dbj|BAE22344.1| unnamed protein produc ( 383) 2472 478.8 2e-132 gi|193785550|dbj|BAG50916.1| unnamed protein produ ( 359) 2078 404.2 5.7e-110 gi|148679085|gb|EDL11032.1| mCG11550 [Mus musculus ( 474) 1924 375.1 4.3e-101 gi|74217968|dbj|BAE41972.1| unnamed protein produc ( 297) 1914 373.0 1.1e-100 gi|149636979|ref|XP_001506644.1| PREDICTED: simila (1238) 1635 320.6 2.7e-84 gi|82082531|sp|Q5ZLE9.1|N4BP1_CHICK RecName: Full= ( 931) 1364 269.2 6.2e-69 gi|13278429|gb|AAH04022.1| N4bp1 protein [Mus musc ( 381) 1317 260.0 1.5e-66 gi|109499503|ref|XP_577315.2| PREDICTED: similar t ( 506) 1305 257.8 9e-66 gi|109471643|ref|XP_001068669.1| PREDICTED: simila ( 361) 1303 257.3 9e-66 gi|109471645|ref|XP_001068717.1| PREDICTED: simila ( 329) 1302 257.1 9.6e-66 gi|109471638|ref|XP_001068419.1| PREDICTED: simila ( 329) 1259 249.0 2.7e-63 gi|109471640|ref|XP_001068465.1| PREDICTED: simila ( 361) 1259 249.0 2.9e-63 gi|109462432|ref|XP_001063174.1| PREDICTED: simila ( 300) 1231 243.6 1e-61 gi|109471634|ref|XP_001068318.1| PREDICTED: simila ( 339) 1229 243.3 1.4e-61 gi|109459064|ref|XP_344922.3| PREDICTED: similar t ( 312) 1214 240.4 9.6e-61 gi|109471632|ref|XP_578218.2| PREDICTED: similar t ( 336) 1205 238.7 3.3e-60 gi|149032638|gb|EDL87508.1| similar to Nedd4 bindi ( 473) 1172 232.6 3.3e-58 gi|62646746|ref|XP_578220.1| PREDICTED: similar to ( 257) 1123 223.1 1.3e-55 gi|82176585|sp|Q7ZXG4.1|N4BP1_XENLA RecName: Full= ( 848) 1085 216.3 4.7e-53 gi|26336803|dbj|BAC32084.1| unnamed protein produc ( 274) 1078 214.6 4.9e-53 gi|82183664|sp|Q6DJS0.1|N4BP1_XENTR RecName: Full= ( 819) 1083 215.9 6e-53 gi|47205721|emb|CAF88970.1| unnamed protein produc ( 513) 971 194.5 1e-46 gi|37589190|gb|AAH59205.1| Zgc:66437 [Danio rerio] ( 849) 959 192.4 7.3e-46 gi|158564242|sp|Q1LVK9.2|N4BP1_DANRE RecName: Full ( 849) 950 190.7 2.4e-45 gi|94733126|emb|CAK04516.1| novel protein (zgc:664 ( 858) 950 190.7 2.4e-45 gi|109499505|ref|XP_001064644.1| PREDICTED: simila ( 195) 917 184.0 5.8e-44 gi|109465738|ref|XP_001054886.1| PREDICTED: simila ( 207) 902 181.2 4.3e-43 gi|109519149|ref|XP_001081697.1| PREDICTED: simila ( 190) 879 176.8 8.3e-42 gi|163916370|gb|AAI57721.1| LOC100137686 protein [ ( 827) 871 175.8 7.4e-41 gi|126278224|ref|XP_001380295.1| PREDICTED: hypoth ( 772) 855 172.7 5.8e-40 gi|28071086|emb|CAD61924.1| unnamed protein produc ( 678) 807 163.6 2.9e-37 gi|26327849|dbj|BAC27665.1| unnamed protein produc ( 552) 800 162.2 6.1e-37 gi|154425921|gb|AAI51401.1| LOC100124517 protein [ ( 676) 800 162.2 7.1e-37 gi|194038837|ref|XP_001927174.1| PREDICTED: simila ( 663) 798 161.9 9.1e-37 gi|158256792|dbj|BAF84369.1| unnamed protein produ ( 678) 796 161.5 1.2e-36 gi|148704283|gb|EDL36230.1| RIKEN cDNA 9130227C08R (2203) 800 162.6 1.8e-36 gi|126278220|ref|XP_001380281.1| PREDICTED: simila (1896) 798 162.2 2.1e-36 >>gi|158564327|sp|Q6A037.2|N4BP1_MOUSE RecName: Full=NED (893 aa) initn: 5913 init1: 5913 opt: 5913 Z-score: 6051.8 bits: 1131.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 5913; 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