FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4124.ptfa, 1066 aa vs ./tmplib.26680 library 1767951 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.9792+/-0.00387; mu= 21.0585+/- 0.259 mean_var=70.5484+/-16.030, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 103 in 1/35 Lambda= 0.1527 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0698 ( 1169 res) mpm09368 (1169) 1109 255 6.3e-68 >>mKIAA0698 ( 1169 res) mpm09368 (1169 aa) initn: 2064 init1: 742 opt: 1109 Z-score: 1311.8 bits: 254.6 E(): 6.3e-68 Smith-Waterman score: 3668; 49.860% identity (51.054% ungapped) in 1069 aa overlap (10-1061:18-1078) 10 20 30 40 mKIAA4 PRGRKMKFLLLSTFIFLYSSLALARD---KHYFIGITEAVWDYA-SGTE--E :: ......: .. : ..:..:: . :.:: .: . mKIAA0 IFHFLFLKVLWAMKAGHLLWALLLMHSLWSIPTDGAIRNYYLGIQDMQWNYAPKGRNVIT 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 mKIAA4 KKLISVDTEQSNFYLQNGPDRIGRKYKKALYFEYTDGTFSKTIDKPAWLGFLGPVIKAEV .. .. :: :.: 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