FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4106.ptfa, 748 aa vs ./tmplib.26680 library 1768269 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4676+/-0.00449; mu= 17.1097+/- 0.301 mean_var=97.0679+/-23.035, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 18 in 1/35 Lambda= 0.1302 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4122 ( 790 res) mbg19439a ( 790) 1582 308 2e-84 mKIAA0617 ( 792 res) mpm06204 ( 792) 665 136 1.4e-32 mKIAA0695 ( 738 res) mbg01635 ( 738) 441 94 6.1e-20 mKIAA1406 ( 838 res) mph00927 ( 838) 189 47 1.2e-05 >>mKIAA4122 ( 790 res) mbg19439a (790 aa) initn: 1519 init1: 676 opt: 1582 Z-score: 1608.1 bits: 308.3 E(): 2e-84 Smith-Waterman score: 1698; 36.200% identity (39.112% ungapped) in 779 aa overlap (11-748:29-790) 10 20 30 40 mKIAA4 TCTMSLKPRVVDFDETWNKLLTTIKAVVMLEYVERATWNDRF . .:. :. : . :. : . . .. . . . mKIAA4 TRITVLDNFRTLLTMSSNRSQNPHGLKQIGLDQIWDDLRAGIQQVYTRQSMAKSRYMELY 10 20 30 40 50 60 50 60 70 mKIAA4 SDIYALCVAYPE---------P---------------LGERLYAETKIFLESHVRHLYKR . .: :.. . : .: .:: . : ::.... .: : mKIAA4 THVYNYCTSVHQSNQARGAGVPPSKSKKGQTPGGAQFVGLELYKRLKEFLKNYLTNLLKD 70 80 90 100 110 120 80 90 100 110 120 130 mKIAA4 VLE-SEEQVLVMYHRYWEEYSKGADYMDCLYRYLNTQYIKKNKLTEADIQYGYGGVDMNE . .:.:: .: . ::.: .. .. . ::: ..... : : : :. mKIAA4 GEDLMDESVLKFYTQQWEDYRFSSKVLNGICAYLNRHWVRR----ECD--EGRKGI---- 130 140 150 160 170 140 150 160 170 180 190 mKIAA4 PLMEIGELALDMWRKLMVEPLQNILIRMLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHV--- .:: ::: :: . .::.. . .:. :...:.:: : ..: ::..:.:.. mKIAA4 --YEIYSLALVTWRDCLFRPLNKQVTNAVLKLIEKERNGETINTRLISGVVQSYVELGLN 180 190 200 210 220 200 210 220 230 240 250 mKIAA4 --EQYKKKFPLKFYQGIFVSPFLTETGEYYKQEASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIR . . : : :. : : ::..: ..: .:....::.. ..::.:. .:: .:. : mKIAA4 EDDAFAKGPTLTVYKESFESQFLADTERFYTRESTEFLQQNPVTEYMKKAEARLLEEQRR 230 240 250 260 270 280 260 270 280 290 300 310 mKIAA4 CRKYLHPSSYTKVIHECQQRMVADHLQFLHSECHSIIQQERKNDMANMYVLLRAVSSGLP . ::: :. .. ..:.: .. ::...:.: ..... ....:.. :: :. ...:: mKIAA4 VQVYLHESTQDELARKCEQVLIEKHLEIFHTEFQNLLDADKNEDLGRMYNLVSRIQDGLG 290 300 310 320 330 340 320 330 340 350 360 370 mKIAA4 HMIEELQKHIHDEGLRATSNLTQEHM--PTLFVESVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMSA .. . :. :::..:: : . . . : ..:..::.:: :. :. ...:.: :..: mKIAA4 ELKKLLETHIHNQGLAAIEKCGEAALNDPKMYVQTVLDVHKKYNALVMSAFNNDAGFVAA 350 360 370 380 390 400 380 390 400 410 420 mKIAA4 LDKALTSVVNY----REPKSVCKAPELLAKYCDNLLKKSAKGMTENEVEDKLTSFITVFK :::: .: . .: :.:::::.:::.:::::.:. : :.:: :.. ..::: mKIAA4 LDKACGRFINNNAVTKMAQSSSKSPELLARYCDSLLKKSSKNPEEAELEDTLNQVMVVFK 410 420 430 440 450 460 430 440 450 460 470 480 mKIAA4 YIDDKDVFQKFYARMLAKRLIHGLSMSMDSEEAMINKLKQACGYEFTSKLHRMYTDMSVS ::.::::::::::.::::::.: : : :.: .::.:::::::.:.::::.::. :..:: mKIAA4 YIEDKDVFQKFYAKMLAKRLVHQNSASDDAEASMISKLKQACGFEYTSKLQRMFQDIGVS 470 480 490 500 510 520 490 500 510 520 530 540 mKIAA4 ADLNNKFNNFIRNQDTVIDLGISFQIYVLQAGAWPLTQAPSSTFAIPQELEKSVQMFELF :::..:.. . :.. : ..:.: ::..:.::. : : :::.:.:::.: : : : mKIAA4 KDLNEQFKKHLTNSEP---LDLDFSIQVLSSGSWPFQQ--SCTFALPSELERSYQRFTAF 530 540 550 560 570 580 550 560 570 580 590 600 mKIAA4 YSQHFSGRKLTWLHYLCTGEVKMNYLGKPYVAMVTTYQMAVLLAFNNSETVSYKELQDST :... ::::::::. : ::. : . . :. ...:.:::.:: .:. .. . ..: ::: mKIAA4 YASRHSGRKLTWLYQLSKGELVTNCFKNRYTLQASTFQMAILLQYNTEDAYTVQQLTDST 590 600 610 620 630 640 610 620 630 640 650 660 mKIAA4 QMNEKELTKTIKSLLDVKMINHDSEKEDID-----AESSFSLNMSFSSKRTKFKITTSMQ :.. :..... :: :.. ..:. ..: ... ..: .....:. . .:.. :. mKIAA4 QIKMDILAQVLQILLKSKLLVLEDENANVDEVELKSDTLIKLYLGYKNKKLRVNINVPMK 650 660 670 680 690 700 670 680 690 700 710 720 mKIAA4 KDTPQELEQTRSAVDEDRKMYLQAAIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISMI . :: : :.. ..::::. .::::::::: ::::.:. :. ::..: .::.: . .: mKIAA4 TEQKQEQETTHKNIEEDRKLLIQAAIVRIMKMRKVLKHQQLLGEVLTQLSSRFKPRVPVI 710 720 730 740 750 760 730 740 mKIAA4 KKCIEVLIDKQYIERSQASADEYSYVA ::::..::.:.:.:: .. : :::.: mKIAA4 KKCIDILIEKEYLERVDGEKDTYSYLA 770 780 790 >>mKIAA0617 ( 792 res) mpm06204 (792 aa) initn: 845 init1: 323 opt: 665 Z-score: 677.3 bits: 136.1 E(): 1.4e-32 Smith-Waterman score: 1059; 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