# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mid01021.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0177.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0177, 1269 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7920247 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3842+/-0.000183; mu= 13.7208+/- 0.010 mean_var=75.6755+/-14.689, 0's: 37 Z-trim: 45 B-trim: 0 in 0/67 Lambda= 0.147434 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|148704247|gb|EDL36194.1| mCG130836, isoform CRA (1279) 8293 1774.3 0 gi|148704246|gb|EDL36193.1| mCG130836, isoform CRA (1587) 8090 1731.2 0 gi|149064059|gb|EDM14329.1| ADP-ribosyltransferase (1219) 7350 1573.7 0 gi|109501732|ref|XP_341327.3| PREDICTED: similar t (1655) 7315 1566.3 0 gi|114649007|ref|XP_001153213.1| PREDICTED: poly ( (1299) 6283 1346.8 0 gi|17380231|sp|Q9UKK3.2|PARP4_HUMAN RecName: Full= (1724) 6284 1347.1 0 gi|114649005|ref|XP_509582.2| PREDICTED: poly (ADP (1616) 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(2291) 3891 838.1 0 gi|109121405|ref|XP_001110102.1| PREDICTED: simila ( 741) 3739 805.5 0 gi|189523418|ref|XP_001921910.1| PREDICTED: simila (2892) 3312 715.1 1.6e-202 gi|28386244|gb|AAH46397.1| Parp4 protein [Mus musc ( 498) 3258 703.1 1.1e-199 gi|210121365|gb|EEA69078.1| hypothetical protein B (2524) 2429 527.2 5e-146 gi|109120343|ref|XP_001117681.1| PREDICTED: poly ( ( 996) 2306 500.8 1.8e-138 gi|190579847|gb|EDV19935.1| hypothetical protein T ( 760) 1941 423.1 3.4e-115 gi|190579850|gb|EDV19938.1| hypothetical protein T (1262) 1776 388.1 1.9e-104 gi|198423074|ref|XP_002122302.1| PREDICTED: simila (2278) 1436 316.0 1.8e-82 gi|60465995|gb|EAL64062.1| type A von Willebrand f (2563) 1418 312.2 2.7e-81 gi|118142848|gb|AAH17815.1| PARP4 protein [Homo sa ( 327) 1391 305.8 2.9e-80 gi|156225845|gb|EDO46659.1| predicted protein [Nem ( 930) 1237 273.4 4.8e-70 gi|115928324|ref|XP_781157.2| PREDICTED: similar t (1119) 1206 266.8 5.3e-68 gi|47221959|emb|CAG08214.1| unnamed protein produc (1406) 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