FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0822.ptfa, 1574 aa vs ./tmplib.26680 library 1767443 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.5815+/-0.00423; mu= 25.3590+/- 0.285 mean_var=83.0535+/-18.663, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1407 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1888 ( 609 res) mbg15934 ( 609) 1403 296 1.9e-80 mKIAA1062 ( 1416 res) mbg17754 (1416) 649 143 3.6e-34 mFLJ00002 ( 1486 res) mbg13511 (1486) 233 59 9.8e-09 mKIAA1520 ( 782 res) mbh00594 ( 782) 146 41 0.0015 >>mKIAA1888 ( 609 res) mbg15934 (609 aa) initn: 1695 init1: 710 opt: 1403 Z-score: 1536.5 bits: 295.7 E(): 1.9e-80 Smith-Waterman score: 1697; 44.684% identity (46.379% ungapped) in 602 aa overlap (986-1567:1-600) 960 970 980 990 1000 1010 mKIAA0 QTDRSTYLMDETIHPLEDLWKTAFWLILTSACPPYIAMSSVTDYKNRAWFQLRVSGLFPS : :::.:: .. ..: .:. ::..:::.:: mKIAA1 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mKIAA0 QVEPLNTEILRLFPQASRQERYSSLMAYKLPVEAVQPLSQAFFKLEKVKQTFDLEEYSLS ... :. :: .::.::::: .::..:.:.: : :: :::.: :::..:.:: .::::.: mKIAA1 EIDRLQREIQYIFPNASRQESFSSILAFKIPKEDVQSLSQSFAKLEEAKRTFAIEEYSFS 510 520 530 540 550 560 1540 1550 1560 1570 mKIAA0 QSTLEQVFLELSKEQELDGLELEELDSSIKWKLLPQEEA :.::::::.::.:::: . : :.. :. mKIAA1 QATLEQVFVELTKEQEEEDNSCGTLASTLWWERTQEDRVVF 570 580 590 600 >>mKIAA1062 ( 1416 res) mbg17754 (1416 aa) initn: 1280 init1: 513 opt: 649 Z-score: 705.8 bits: 143.3 E(): 3.6e-34 Smith-Waterman score: 1291; 27.404% identity (35.223% ungapped) in 1383 aa overlap (464-1563:1-1359) 440 450 460 470 480 490 mKIAA0 RIRNISKEYKGKPNKIEALKDLTLDIYEGQITAVLGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSV ... :::.::::.: ..::.:: ::.::. mKIAA1 VVSFLGHNGAGKTTTMSILTGLFPPTSGSA 10 20 30 500 510 520 530 540 550 mKIAA0 TIYNNNLSEMADLENILRIAGVCPQANVQFDFLTVRENLRLFAKIRGIPPQDVEKEVQRV :::.... .....: . :.::: :: :: :::.:.: ........ ....::.... mKIAA1 TIYGHDIR--TEMDEIRKNLGMCPQHNVLFDRLTVEEHLWFYSRLKSMAQEEIRKETDKM 40 50 60 70 80 560 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: ..:. : :. :. .:: : : : mKIAA1 EGLTAVGGQAGNLARCSELAQSQASLQSASSVGSARGEEGTGYSDGYGDYRPLFDNLQDP 330 340 350 360 370 380 790 800 810 820 mKIAA0 DGMALWRQQTCAIAKV-----RL----LKLKH--------------ERKTLLSVLLILVV :...: . . :.:.: .: ::... . :.: : .:. . mKIAA1 DNVSLQEAEMEALAQVGQGSRKLEGWWLKMRQFHGLLVKRFHCARRNSKALCSQILLPAF 390 400 410 420 430 440 830 840 850 860 mKIAA0 GICPFLFENISTK---------IRQSSYTWELSPHDYF--------------LAPGQQPQ .: . .:. . :.: .:. : :.: .:: mKIAA1 FVCVAMTVALSVPEIGDLPPLVLSPSQYHNYTQPRGNFIPYANEERQEYRLRLSPDASPQ 450 460 470 480 490 500 870 880 mKIAA0 -----------------------GMLTQLLIINKTEASI-----------DDFIHSVERQ : : .: ... :. . ..: ... . mKIAA1 QLVSTFRLPSGVGATCVLKSPANGSLGPMLNLSSGESRLLAARFFDSMCLESFTQGLPLS 510 520 530 540 550 560 890 900 910 920 930 940 mKIAA0 NIALEVDASGTRDGTDDPSYNG----ALIVSGNEKNHSFSFACNTKRLNCFPVLMDILSN :.. . . :. .:. .. . . . .... : . :: :: .. mKIAA1 NFVPPPPSPAPSDSPVSPDEDSLQAWNMSLPPTAGPETWTSAPSLPRLVHEPVRCTCSAQ 570 580 590 600 610 620 950 960 970 980 mKIAA0 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