# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mic38093.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0822.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0822, 1574 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7850642 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3782+/-0.000186; mu= 14.6343+/- 0.010 mean_var=98.1168+/-20.353, 0's: 41 Z-trim: 459 B-trim: 3041 in 2/66 Lambda= 0.129480 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|122890140|emb|CAM13339.1| ATP-binding cassette, (1558) 10198 1916.9 0 gi|115503761|sp|Q8K440.2|ABC8B_MOUSE RecName: Full (1620) 8172 1538.5 0 gi|22087275|gb|AAM90908.1|AF498362_1 ATP-binding c (1620) 8163 1536.8 0 gi|148702428|gb|EDL34375.1| mCG118047, isoform CRA (1634) 8081 1521.5 0 gi|109492136|ref|XP_001081601.1| PREDICTED: simila (1655) 7059 1330.6 0 gi|109489288|ref|XP_221074.4| PREDICTED: similar t (1655) 7049 1328.7 0 gi|149054665|gb|EDM06482.1| rCG35376 [Rattus norve 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