FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1928.ptfa, 1064 aa vs ./tmplib.26680 library 1767953 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2995+/-0.00708; mu= -2.1706+/- 0.469 mean_var=304.0124+/-73.408, 0's: 0 Z-trim: 1 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0736 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0310 ( 906 res) mbh03152 ( 906) 1657 190 1.3e-48 >>mKIAA0310 ( 906 res) mbh03152 (906 aa) initn: 1595 init1: 1061 opt: 1657 Z-score: 965.3 bits: 190.1 E(): 1.3e-48 Smith-Waterman score: 1717; 37.678% identity (44.502% ungapped) in 913 aa overlap (274-1059:3-902) 250 260 270 280 290 300 mKIAA1 QYMTAAPEEYEPMVSAAWRPIQADDTSATVPKAPMRFYVPHVSVSFGPGGQLVCVPPNSP : .: .: :::: . :::::::. : :: : mKIAA0 SRPTSPEKFTVPHVCARFGPGGQLLKVIPNLP 10 20 30 310 320 330 340 350 360 mKIAA1 ADGQTALVEVHSMEVLLNDFEDQEEMRAFPGPLIREDIHKVDIMTFCQQKATQCLKSETP ..:: ::::.::.:.::. .:::::.::::: ..: ::::...: :.:::.::..:. mKIAA0 SEGQPALVEIHSLETLLQHTPEQEEMRSFPGPLGKDDTHKVDVINFAQNKATKCLQNESL 40 50 60 70 80 90 370 380 390 400 410 420 mKIAA1 GSRDSA-LLWQLLVLLCRQNGSMVGSDIAELLMQDCKKLEKYKRQPPVANLINLTDEDWP ...:: :::....:::::::..::.::::::..: . . ..: ::::..:.: mKIAA0 IDKESASLLWKFIILLCRQNGTVVGTDIAELLLRDHRTVWLPGKSPNEANLIDFTNEAVE 100 110 120 130 140 150 430 440 450 460 470 mKIAA1 VLS---SGTRDL--LTGEIPPNVDTPAQIVEKFTKLLYYGRKKEALEWAMKNHLWGHALF . :: .: :: .... . .:.: .:: :::::.::: :::: ::::::. mKIAA0 QVEEEESGEAQLSFLTDSQTVTTSVLEKETERFRELLLYGRKKDALESAMKNGLWGHALL 160 170 180 190 200 210 480 490 500 510 520 530 mKIAA1 LASKMDPRTYNWVMSGFTSTLALNDPLQTLFQLMSGRIPQAATVCGDKQWGDWRPHLAVI :::::: ::. ::. :...: .::::::..::::::.: :.: :::..:::::::::.. mKIAA0 LASKMDSRTHARVMTRFANSLPINDPLQTVYQLMSGRMPAASTCCGDEKWGDWRPHLAMV 220 230 240 250 260 270 540 550 560 570 580 590 mKIAA1 LSNQAGDTELYQRAIVSMGDTLAGKGLVEASHFCYLMAHVPFGHYTVKTDHLALVGSSHS ::: .. .. .:....::::::.:::..:.:::::::.: :: :: :: .:.:.::.:: mKIAA0 LSNLNNNMDVESRTMATMGDTLASKGLLDAAHFCYLMAQVGFGVYTKKTTKLVLIGSNHS 280 290 300 310 320 330 600 610 620 630 640 650 mKIAA1 QEFMKFATIEAIQRTEIFEYCQMLGRPKSFIPSFQVYKLLYASRLADYGLASQALHYCEA :.:::: ::::::: .:: : :: .:.:::.:..: :::..:::.::.::::. mKIAA0 LPFLKFATNEAIQRTEAYEYAQSLGAHTCSLPNFQVFKFIYLCRLAEMGLATQAFHYCEV 340 350 360 370 380 390 660 670 680 690 700 710 mKIAA1 IGAAVLSQEGSSHPVLLAELIKLAEKLKLSDPLVLERRRGDRDLEPDWLVQLRRKHKDLE :. .::.: :. :::...: ..: .:.: :: . :. . . .:: :::::.. ..... mKIAA0 IAKSVLTQPGAYSPVLISQLTQMASQLRLFDPQLKEKPEEESFVEPAWLVQLQHVERQIQ 400 410 420 430 440 450 720 730 740 750 760 770 mKIAA1 QNRTGAPRDPDSTPSDIYGAGGTTDTPYPDLSG-HQNYSEDSEYSSTLWSTAEQTSLTN- .. . .: . :.. ..:. .. : : .:. . ... . :: .. mKIAA0 EGTVLWSQD-GTEPQQCRITSGS-EVEQSDGPGLNQQAGPQADNPLLMPSTEPLMHGVQL 460 470 480 490 500 510 780 790 800 810 820 830 mKIAA1 -PLAQQSFPLQRDTYSGHMGTPVPLYSVPATHLAVT-SGASGSSVAVTGTP-GGRVGEDM : : :..: : .:.. ::.. :: .. . : : : .. : : ..: . mKIAA0 LPTAPQTLP---DGQPAHLSR-VPMFPVPMSRGPLELSPAYGPPGSALGFPESSRSDPAV 520 530 540 550 560 840 850 860 870 mKIAA1 LRTHPAFGENTMT-QE----PLE----DPDGLEVISSLQ-TPAAPRVP------SFSEDS :. :. .:.. :: : : ::. . : .. .: :.. ::.. . mKIAA0 LHPGQALPPTTLSLQESGLPPQEAKSPDPEMVPRGSPVRHSP--PELSQEEFGESFADPG 570 580 590 600 610 620 880 890 900 910 920 mKIAA1 AASAKEDEE-------GSSDGADKPS--------HPDASQKGKLGDGKNTKSSGFGWFS- .. . .: : :::. . :: .: . : . . :.:.: ::: mKIAA0 SSRTAQDLETSPVWDLGSSSLTRAPSLTSDSEGKKPAQAVKKEPKEPKKTES----WFSR 630 640 650 660 670 680 930 940 950 960 mKIAA1 WFRSKPASSVSTSGDEDSS-----------DSSDSEESPRASSPHHAS----PGLSPTPP :. .: . . :...: . .. :: .: : .: : ..:: : mKIAA0 WLPGKKRTEAYLPDDKNKSIVWDEKKNQWVNLNEPEEEKKAPPPPPTSFPRVPQVAPTGP 690 700 710 720 730 740 970 980 990 mKIAA1 LTSPSLPGASTFSRGTGGS------ILQ--GSSNS-------------------SGI--- ..: ....::: .::: .:. :.. : :.. mKIAA0 -AGPPTASVNVFSRKAGGSRARYVDVLNPSGTQRSEPALAPADFFAPLAPLPIPSNLFVP 750 760 770 780 790 1000 1010 1020 mKIAA1 ---------AEGMGIGGFS--GTQG---------VSSEFYSQPGA--LPPPPTLQ----- :.: : : . :::. :.: : :: :: : . mKIAA0 NPDAEEPQPADGTGCRGQAPAGTQSKAESTLEPKVGSSTVSAPGPELLPSKPDGSQGGEA 800 810 820 830 840 850 1030 1040 1050 1060 mKIAA1 ------------GAVPLYNPSQVPQLPTASSLNRPNRLAQRRYPTQPC :.::.:::.:. : ..:. .::.:..::.: mKIAA0 PGDHCPTGAPHGGSVPFYNPAQLVQASVTSGNSRPGRIGQRKYAALN 860 870 880 890 900 1064 residues in 1 query sequences 1767953 residues in 2168 library sequences Scomplib [34t11] start: Mon Mar 27 10:56:03 2006 done: Mon Mar 27 10:56:04 2006 Scan time: 1.010 Display time: 0.080 Function used was FASTA [version 3.4t11 Apr 17, 2002]