# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mic28011.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1928.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1928, 1064 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7914494 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3446+/-0.000196; mu= 9.6240+/- 0.011 mean_var=112.6074+/-21.703, 0's: 34 Z-trim: 50 B-trim: 231 in 2/65 Lambda= 0.120862 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|193806483|sp|Q91XT4.2|SC16B_MOUSE RecName: Full (1051) 7161 1260.2 0 gi|37589164|gb|AAH59194.1| SEC16 homolog B (S. cer (1051) 7155 1259.1 0 gi|14517635|dbj|BAB61034.1| RGPR-p117 [Mus musculu (1051) 7112 1251.7 0 gi|81864905|sp|Q75N33.1|SC16B_RAT RecName: Full=Pr (1057) 6426 1132.0 0 gi|13785516|dbj|BAB43905.1| RGPR-p117 [Rattus norv (1058) 6292 1108.7 0 gi|109019628|ref|XP_001105806.1| PREDICTED: simila (1061) 5132 906.4 0 gi|193806482|sp|Q96JE7.2|SC16B_HUMAN RecName: Full (1060) 5121 904.5 0 gi|57997540|emb|CAI46016.1| hypothetical protein [ (1061) 5121 904.5 0 gi|119611421|gb|EAW91015.1| leucine zipper transcr (1061) 5115 903.4 0 gi|125434033|gb|ABN42197.1| SEC16S [Homo sapiens] (1060) 5114 903.3 0 gi|55958774|emb|CAI16321.1| SEC16 homolog B (S. ce (1061) 5113 903.1 0 gi|119611416|gb|EAW91010.1| leucine zipper transcr (1060) 5111 902.7 0 gi|14517637|dbj|BAB61035.1| RGPR-p117 [Homo sapien (1060) 5110 902.6 0 gi|114568106|ref|XP_514022.2| PREDICTED: hypotheti (1060) 5085 898.2 0 gi|149058306|gb|EDM09463.1| leucine zipper transcr ( 825) 5028 888.2 0 gi|109019630|ref|XP_001105752.1| PREDICTED: simila (1058) 4985 880.8 0 gi|149707914|ref|XP_001498372.1| PREDICTED: simila (1058) 4920 869.4 0 gi|73961316|ref|XP_547449.2| PREDICTED: similar to (1046) 4673 826.4 0 gi|75045147|sp|Q75NY9.1|SC16B_BOVIN RecName: Full= (1052) 4636 819.9 0 gi|119611420|gb|EAW91014.1| leucine zipper transcr ( 734) 3757 666.5 1.4e-188 gi|119611419|gb|EAW91013.1| leucine zipper transcr ( 737) 3731 662.0 3.3e-187 gi|75043311|sp|Q6BCB4.1|SC16B_RABIT RecName: Full= (1045) 3645 647.1 1.4e-182 gi|21748510|dbj|BAC03392.1| FLJ00305 protein [Homo ( 789) 3588 637.1 1.1e-179 gi|148707411|gb|EDL39358.1| leucine zipper transcr ( 954) 3529 626.9 1.6e-176 gi|126306451|ref|XP_001373782.1| PREDICTED: simila ( 972) 3321 590.6 1.3e-165 gi|194383064|dbj|BAG59088.1| unnamed protein produ ( 745) 3134 557.9 7.1e-156 gi|109019632|ref|XP_001105681.1| PREDICTED: simila ( 624) 3125 556.3 1.8e-155 gi|14318616|gb|AAH09106.1| SEC16B protein [Homo sa ( 625) 3084 549.1 2.6e-153 gi|119611417|gb|EAW91011.1| leucine zipper transcr ( 625) 3072 547.0 1.1e-152 gi|149636299|ref|XP_001515582.1| PREDICTED: simila ( 977) 2871 512.1 5.6e-142 gi|82085159|sp|Q6AW68.1|SC16B_CHICK RecName: Full= ( 929) 2194 394.1 1.8e-106 gi|55958773|emb|CAI16320.1| SEC16 homolog B (S. ce ( 541) 2010 361.8 5.6e-97 gi|21758691|dbj|BAC05357.1| unnamed protein produc ( 541) 2009 361.6 6.3e-97 gi|149058307|gb|EDM09464.1| leucine zipper transcr ( 284) 1801 325.1 3.2e-86 gi|126302711|ref|XP_001372799.1| PREDICTED: hypoth (2409) 1739 315.1 2.9e-82 gi|73967545|ref|XP_849192.1| PREDICTED: similar to (2238) 1729 313.3 9.3e-82 gi|149738142|ref|XP_001498615.1| PREDICTED: SEC16 (2345) 1726 312.8 1.4e-81 gi|149039274|gb|EDL93494.1| rCG45759 [Rattus norve (1417) 1721 311.7 1.7e-81 gi|189534472|ref|XP_695457.3| PREDICTED: hypotheti (2163) 1716 311.0 4.3e-81 gi|148676370|gb|EDL08317.1| expressed sequence AU0 (1418) 1702 308.4 1.7e-80 gi|194671785|ref|XP_597914.4| PREDICTED: similar t (2328) 1702 308.6 2.5e-80 gi|124378050|ref|NP_694765.2| SEC16 homolog A [Mus (2357) 1702 308.6 2.5e-80 gi|123228045|emb|CAM20305.1| SEC16 homolog A (S. c (2377) 1702 308.6 2.5e-80 gi|149420384|ref|XP_001521275.1| PREDICTED: hypoth (2601) 1691 306.7 1e-79 gi|27769253|gb|AAH42603.1| Sec16a protein [Mus mus ( 952) 1668 302.4 7.7e-79 gi|109109814|ref|XP_001117942.1| PREDICTED: inosit (1383) 1660 301.1 2.7e-78 gi|92096492|gb|AAI15275.1| LOC567075 protein [Dani (1097) 1652 299.6 5.9e-78 gi|114627573|ref|XP_001171478.1| PREDICTED: inosit (1325) 1644 298.3 1.8e-77 gi|114627579|ref|XP_001171462.1| PREDICTED: inosit (1327) 1644 298.3 1.8e-77 gi|114627571|ref|XP_001171511.1| PREDICTED: inosit (1330) 1644 298.3 1.8e-77 >>gi|193806483|sp|Q91XT4.2|SC16B_MOUSE RecName: Full=Pro (1051 aa) initn: 7161 init1: 7161 opt: 7161 Z-score: 6747.6 bits: 1260.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 7161; 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