FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4078.ptfa, 609 aa vs ./tmplib.26680 library 1768408 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.0168+/-0.00414; mu= 19.2967+/- 0.278 mean_var=81.7550+/-18.760, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1418 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4053 ( 1400 res) mbg07434 (1400) 3298 686 7.9e-198 mKIAA0463 ( 1529 res) mbg07539 (1529) 3092 643 4.1e-185 mKIAA1550 ( 199 res) mfj03098 ( 199) 1090 232 2.7e-62 mKIAA0620 ( 1746 res) mpf00920 (1746) 934 202 3.8e-52 mKIAA0407 ( 1207 res) mpm02292 (1207) 906 196 1.7e-50 mKIAA0315 ( 1299 res) mbg03309 (1299) 886 192 2.9e-49 mKIAA1206 ( 1374 res) mbg00219 (1374) 812 177 1.1e-44 >>mKIAA4053 ( 1400 res) mbg07434 (1400 aa) initn: 3298 init1: 3298 opt: 3298 Z-score: 3644.0 bits: 685.5 E(): 7.9e-198 Smith-Waterman score: 3298; 81.940% identity (81.940% ungapped) in 598 aa overlap (12-609:803-1400) 10 20 30 40 mKIAA4 FPKPDRPAACYAFAELQTDINELTNHMDGVQIPFLDYRTYA :::::::::.:::. .::. :::::::::: mKIAA4 RKSRDADRTLKRLQLQMDNLESRVALECKEAFAELQTDIHELTSDLDGAGIPFLDYRTYA 780 790 800 810 820 830 50 60 70 80 90 100 mKIAA4 VRVLFPGIEAHPVLKELDTPPNVEKALRLFGQLLHSRAFLLTFIHTLEAQSSFSMRDRGT .:::::::: ::::::... ::::.: :::::: .. ::::::.::::: ::::::::. mKIAA4 MRVLFPGIEDHPVLKEMEVQANVEKSLTLFGQLLTKKHFLLTFIRTLEAQRSFSMRDRGN 840 850 860 870 880 890 110 120 130 140 150 160 mKIAA4 VASLTMVALQSRLDYATGLLKQLLADLIEKNLESKNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFL :::: :.:::....::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: mKIAA4 VASLIMTALQGEMEYATGVLKQLLSDLIEKNLESKNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFL 900 910 920 930 940 950 170 180 190 200 210 220 mKIAA4 LHKFLKECAGEPLFLLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQIDYKTLTLHCV :.::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: mKIAA4 LYKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQIDYKTLTLNCV 960 970 980 990 1000 1010 230 240 250 260 270 280 mKIAA4 CPESEGSAQVPVKVLNCDSITQAKDKLLDTVYKGIPYSQRPKAEDMDLEWRQGRMARIIL :: :.. .:::: ::::..::.:.::::.::::.:::::::: :::::::::::::::: mKIAA4 NPEHENAPEVPVKGLNCDTVTQVKEKLLDAVYKGVPYSQRPKAGDMDLEWRQGRMARIIL 1020 1030 1040 1050 1060 1070 290 300 310 320 330 340 mKIAA4 QDEDITTKIECDWKRVNSLAHYQVTDGSLVALVPKQVSAYNMANSFTFTRSLSRYESLLR ::::.::::. ::::.:.:::::::::: :::::::.::::..:: :::.:::::::.:: mKIAA4 QDEDVTTKIDNDWKRLNTLAHYQVTDGSSVALVPKQTSAYNISNSSTFTKSLSRYESMLR 1080 1090 1100 1110 1120 1130 350 360 370 380 390 400 mKIAA4 AASSPDSLRSRAPMLTPDQEAGTKLWHLVRNHDHTDHREGDRGSKMVSEIYLTRLLATKG .::::::::::.::.::: :.::::::::.:::: :.::::::::::::::::::::::: mKIAA4 TASSPDSLRSRTPMITPDLESGTKLWHLVKNHDHLDQREGDRGSKMVSEIYLTRLLATKG 1140 1150 1160 1170 1180 1190 410 420 430 440 450 460 mKIAA4 TLQKFVDDLFETVFSTAHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADQRQISDPDVRHTWKSNCLPLR ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::..:: : :::::::::::::: mKIAA4 TLQKFVDDLFETIFSTAHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADKHQIHDSDVRHTWKSNCLPLR 1200 1210 1220 1230 1240 1250 470 480 490 500 510 520 mKIAA4 FWVNVIKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::: mKIAA4 FWVNVIKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFMDSCSTSEHKLGKDSPSNKLLYAKDIPN 1260 1270 1280 1290 1300 1310 530 540 550 560 570 580 mKIAA4 YKSWVERYYRDIAKMASISDQDMDAYLVEQSRLHANDFNVLSALSELYFYVTKYRQEILT ::::::::: ::::: .::::::.:::.:::::: ..:: .::: :.: :..::..:::. mKIAA4 YKSWVERYYADIAKMPAISDQDMSAYLAEQSRLHLSQFNSMSALHEIYSYIAKYKDEILV 1320 1330 1340 1350 1360 1370 590 600 mKIAA4 SLDRDASCRKHKLRQKLEQIITLVSSSS .:..: . :...::.::::.. .. :: mKIAA4 ALEKDEQARRQRLRSKLEQVVDTMALSS 1380 1390 1400 >>mKIAA0463 ( 1529 res) mbg07539 (1529 aa) initn: 3089 init1: 1462 opt: 3092 Z-score: 3415.7 bits: 643.4 E(): 4.1e-185 Smith-Waterman score: 3092; 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80.402% identity (80.402% ungapped) in 199 aa overlap (411-609:1-199) 390 400 410 420 430 440 mKIAA4 GDRGSKMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETVFSTAHRGSALPLAIKYMFDFLDEQAD :::.:::::::::::::::::::::::::: mKIAA1 FETIFSTAHRGSALPLAIKYMFDFLDEQAD 10 20 30 450 460 470 480 490 500 mKIAA4 QRQISDPDVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFMDSCSTS .. : :: :::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: mKIAA1 KHGIHDPHVRHTWKSNCLPLRFWVNMIKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFMDSCSTS 40 50 60 70 80 90 510 520 530 540 550 560 mKIAA4 EHRLGKDSPSNKLLYAKDIPNYKSWVERYYRDIAKMASISDQDMDAYLVEQSRLHANDFN ::::::::::::::::::::.::.:::::: ::.:: .::::::.:::.::::.: :.:: mKIAA1 EHRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKNWVERYYSDIGKMPAISDQDMNAYLAEQSRMHMNEFN 100 110 120 130 140 150 570 580 590 600 mKIAA4 VLSALSELYFYVTKYRQEILTSLDRDASCRKHKLRQKLEQIITLVSSSS ..:::::.. :: :: .::: ::.: .: :.:: ::::.:::.: .: mKIAA1 TMSALSEIFSYVGKYSEEILGPLDHDDQCGKQKLAYKLEQVITLMSLDS 160 170 180 190 >>mKIAA0620 ( 1746 res) mpf00920 (1746 aa) initn: 1687 init1: 741 opt: 934 Z-score: 1028.5 bits: 201.9 E(): 3.8e-52 Smith-Waterman score: 1689; 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