# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mic23055.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1758.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1758, 1565 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7893684 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8205+/-0.000209; mu= 9.0827+/- 0.012 mean_var=167.1807+/-32.078, 0's: 33 Z-trim: 143 B-trim: 226 in 2/63 Lambda= 0.099193 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|38322746|gb|AAR16298.1| cortactin-binding prote (1648) 10407 1502.9 0 gi|223461282|gb|AAI41408.1| Cttnbp2 protein [Mus m (1650) 10407 1502.9 0 gi|38322766|gb|AAR16316.1| cortactin-binding prote (1649) 9922 1433.5 0 gi|158512458|sp|A0M8T5.1|CTTB2_FELCA Cortactin-bin (1658) 8745 1265.1 0 gi|118572271|sp|Q07E28|CTTB2_NEONE Cortactin-bindi (1658) 8738 1264.1 0 gi|118572265|sp|Q2IBF8|CTTB2_EULMM Cortactin-bindi (1653) 8678 1255.5 0 gi|118572276|sp|Q09YI1|CTTB2_SHEEP Cortactin-bindi 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