FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0758.ptfa, 1143 aa vs ./tmplib.26680 library 1767874 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2645+/-0.00419; mu= 13.8999+/- 0.280 mean_var=89.8835+/-20.124, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1353 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0768 ( 1057 res) mbh03527 (1057) 366 83 3.6e-16 mKIAA0786 ( 891 res) mpm11105 ( 891) 334 76 2.4e-14 mKIAA4089 ( 1251 res) mbg12616 (1251) 333 76 3.5e-14 mKIAA0821 ( 1406 res) mbg08158 (1406) 244 59 6.4e-09 mKIAA0279 ( 1484 res) meh01738 (1484) 231 56 3.9e-08 mKIAA4041 ( 1671 res) mpf01333 (1671) 225 55 9.5e-08 mKIAA0812 ( 1147 res) mbg15128 (1147) 194 49 4.8e-06 mKIAA1531 ( 1214 res) mpg00841 (1214) 166 44 0.00022 >>mKIAA0768 ( 1057 res) mbh03527 (1057 aa) initn: 436 init1: 102 opt: 366 Z-score: 382.7 bits: 82.6 E(): 3.6e-16 Smith-Waterman score: 630; 25.410% identity (30.097% ungapped) in 732 aa overlap (474-1134:102-790) 450 460 470 480 490 500 mKIAA0 SSVRSPSMKLKLIPRENVTCQDPIIGIGDPGKVIQKLCQFSGVYGSPGQAIGGTVTYKCV :.: .. : :. .:: . :: :. mKIAA0 LPSAASQIPAMEESCEAVEAREIMWFKTRQGQVAKQPC--------PAGTIGVS-TYLCL 80 90 100 110 120 510 520 530 540 550 mKIAA0 GTQ--WKEES---RACISAPINGLLQVAKALIKSPTQDQKLPTYLRDLSVSAGKEEQDIR . . : .. : : .: . : :. . . ..: :. ..:: :: mKIAA0 APDGIWDPQGPDLSNCSSPWVNHITQKLKSGETAANIARELAEQTRN-HLNAG----DIT 130 140 150 160 170 560 570 580 590 600 mKIAA0 SSPGSLGAIISILD--LLSTVP-------TQVNSEMMRD---------ILATINVILDKS : .. ....:: : . .: ..:. . :. .. :.: .:. . mKIAA0 YSVRAMDQLVGLLDVQLRNLTPGGKDSAARSLNKLQKRERSCRAYVQAMVETVNNLLQPQ 180 190 200 210 220 230 610 620 630 640 650 mKIAA0 ALNSWEKLL-QQQSNQSSQFLHSVER--FSQALQLGDSTPPFLAHPNVQMKSMVIKR--- :::.:. : ..: ....: .::. : : .: . :.:.. .. mKIAA0 ALNAWRDLTTSDQLRAATMLLDTVEESAFVLADNLLKTDIVRENTDNIQLEVARLSTEGN 240 250 260 270 280 290 660 670 680 690 700 mKIAA0 ----------GHPQIYQ-QQFIFKDSDLWGDVAIDECQLGNLQPDSSIVTVAFPTLKAIL :: . : . .:.. :.. . .:: : : : .: . mKIAA0 LEDLKFPENMGHGSTIQLSANTLKQNGRNGEIRVAFVLYNNLGPYLS-------TENASM 300 310 320 330 340 350 710 720 730 740 750 mKIAA0 AQDVQRKTSSHSLVMTTTV-SHNIVKPFR--------ISMTFKNNHRS--GGKPQCVFWN .. ...::..... : . : : : . .: :. ..: . .:.: ::. mKIAA0 KLGTEAMSTNHSVIVNSPVITAAINKEFSNKVYLADPVVFTVKHIKQSEENFNPNCSFWS 360 370 380 390 400 410 760 770 780 790 800 810 mKIAA0 FSLANNTGGWDSSGCSVEDDGRDNRDRVFCKCNHLTSFSILMSP-DSPDPGSLLKILLDI .: . :: :...:: . :. .. :.:::::.:..::. . .. .:::. mKIAA0 YSKRTMTGYWSTQGCRLLTT---NKTHTTCSCNHLTNFAVLMAHVEVKHSDAVHDLLLDV 420 430 440 450 460 820 830 840 850 860 870 mKIAA0 ISYIGLGFSIVSLAACLVVEAMVWKSVTKNRTSYMRHICIVNIAFCLLIADIWFIVAGAI :...:. .:.: : :. . . .... ..:.. ...:: :..:.. :... : mKIAA0 ITWVGILLSLVCLLICIFTFCF-FRGLQSDRNTIHKNLCI-----SLFVAELLFLIG--I 470 480 490 500 510 880 890 900 910 920 930 mKIAA0 HDGRYPLNETACVAATFFIHFFYLSVFFWMLTLGLMLFYRLIFILHDASKSTQKAIAFSL . :. ::.. . ..:::.:..: ::. :..:. :. ... :. ... . . mKIAA0 NRTDQPI---ACAVFAALLHFFFLAAFTWMFLEGVQLYIMLVEVFE--SEHSRRKYFYLV 520 530 540 550 560 570 940 950 960 970 980 990 mKIAA0 GYGCPLIISSITVGVTQPQEVYMRKNACWLNWEDTRALLAFAIPALIIVVVNVSITVVVI ::: : .: .....: . : ..::: :: . .: :: .:...:: . ... mKIAA0 GYGMPALIVAVSAAVDY--RSYGTDKVCWLRL-DTYFIWSFIGPATLIIMLNVIFLGIAL 580 590 600 610 620 630 1000 1010 1020 1030 1040 mKIAA0 ------TKILRPSIG--DKPGKQEKSSLFQISKSIGV--LTPLLGLTWGFGLATVIQGSN : ::.: : :. . ... ... : ::. : ::::::.::: . . :. mKIAA0 YKMFHHTAILKPESGCLDNINYEDNRPFIK-SWVIGAIALLCLLGLTWAFGLMYINE-ST 640 650 660 670 680 1050 1060 1070 1080 1090 mKIAA0 AVFHIIFTLLNAFQGLFILLFGCLWDQKVQEAL-----LHKFS-LSRWSSQHSKSTSIGS ... .::..:..::.::..: :. ..::.. : : : :: : .:: :: mKIAA0 VIMAYLFTIFNSLQGMFIFIFHCVLQKKVRKEYGKCLRTHCCSGKSTESSIGSGKTS-GS 690 700 710 720 730 740 1100 1110 1120 1130 1140 mKIAA0 STP-VFSMSSP--ISRRFNNLFGKTGTYNVSTPETTSSSLENSSSAYSLLN :: .: .: : : .:. : . . : . .::. : mKIAA0 RTPGRYSTGSQSRIRRMWNDTVRKQSESSFITGDINSSASLNREGLLNNARDTSVMDTLP 750 760 770 780 790 800 mKIAA0 LNGNHGNSYSIAGGEYLSNCVQIIDRGYNHNETALEKKILKELTSNYIPSYLNNHERSSE 810 820 830 840 850 860 >>mKIAA0786 ( 891 res) mpm11105 (891 aa) initn: 313 init1: 102 opt: 334 Z-score: 349.9 bits: 76.3 E(): 2.4e-14 Smith-Waterman score: 608; 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