# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mic20043.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0758.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0758, 1143 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7918469 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0246+/-0.000186; mu= 15.0220+/- 0.010 mean_var=73.6647+/-14.641, 0's: 31 Z-trim: 52 B-trim: 1516 in 1/66 Lambda= 0.149432 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|148691454|gb|EDL23401.1| mCG115189 [Mus musculu (1348) 5833 1267.9 0 gi|50400223|sp|Q9WVT0.1|GP116_RAT RecName: Full=Pr (1349) 5561 1209.2 0 gi|73973147|ref|XP_532160.2| PREDICTED: similar to (1363) 4516 983.9 0 gi|194223572|ref|XP_001498309.2| PREDICTED: G prot (1347) 4479 975.9 0 gi|6468391|emb|CAB61578.1| novel transcript [Homo (1346) 4477 975.5 0 gi|117645848|emb|CAL38391.1| hypothetical protein (1204) 4476 975.3 0 gi|50400545|sp|Q8IZF2.2|GP116_HUMAN RecName: Full= (1346) 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in 1144 aa overlap (1-1143:262-1360) 10 20 30 mKIAA0 NEQVIQNLNHTYKMDYNSFQGTPSNETKFT ::::.:.::.::::::::::.. ::..: gi|119 VTVTGFKSGSVVVTYEVKTTPPSLELIHKANEQVVQSLNQTYKMDYNSFQAVTINESNFF 240 250 260 270 280 290 40 50 60 70 80 90 mKIAA0 VIPEFIFEGDNVTLECETEFVTSNTSWYYGEKRSDIQNSDKYSIHTTVINNISLITRLTI : ::.:::::.:.: :: : ..::.:: : :.. .::::...::.:...::.. ...::: gi|119 VTPEIIFEGDTVSLVCEKEVLSSNVSWRYEEQQLEIQNSSRFSIYTALFNNMTSVSKLTI 300 310 320 330 340 350 100 110 120 130 140 150 mKIAA0 YNFTQHDAGMYGCNVTLDIFEYGTVRKLDVTPIRILAKEERKVVCDNHPISLNCCSENIA .:.: ::: : :.. :::::: .:.:: ::.:::.:: ::.:::.:.::::::.. . gi|119 HNITPGDAGEYVCKLILDIFEYECKKKIDVMPIQILANEEMKVMCDNNPVSLNCCSQGNV 360 370 380 390 400 410 160 170 180 190 200 210 mKIAA0 NWSSIEWKQEGKISILGNPESDLESSCSTYTLKADGTQCPSGSSGTTVIYTCEFVSAYGA :::..::::::::.: :.::.:..:::: :::::::::::::::::::::::::.::::: gi|119 NWSKVEWKQEGKINIPGTPETDIDSSCSRYTLKADGTQCPSGSSGTTVIYTCEFISAYGA 420 430 440 450 460 470 220 230 240 250 260 270 mKIAA0 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