FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0977.ptfa, 1209 aa vs ./tmplib.26680 library 1767808 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.9646+/- 0.008; mu= -16.1199+/- 0.524 mean_var=474.5453+/-118.032, 0's: 0 Z-trim: 7 B-trim: 135 in 1/35 Lambda= 0.0589 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0633 ( 1334 res) mbg06737 (1334) 671 73 5.2e-13 >>mKIAA0633 ( 1334 res) mbg06737 (1334 aa) initn: 823 init1: 367 opt: 671 Z-score: 325.9 bits: 72.5 E(): 5.2e-13 Smith-Waterman score: 875; 26.050% identity (30.594% ungapped) in 1286 aa overlap (34-1183:13-1243) 10 20 30 40 50 60 mKIAA0 ASSAMDRSVPDPLPRSAPRTPAMQPAGSAGKTKGKAPLPPAETKGTDVSSAEDPVESTAV : :..:: ::.. . .: : :. . :. mKIAA0 LPLVMDCDDKERKMKARAPPPPGKPAAQNVHS-EQKLPHDAT 10 20 30 40 70 80 90 100 110 mKIAA0 VTEQQ------DNMIDKDIELSVVLPGDILKSTTVHGSKPMMDLLVFLCAQYHLNPSSHT . :: . . .. ....::::. . :...: ::. 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