FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA4126.ptfa, 1285 aa vs ./tmplib.26680 library 1767732 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.3434+/-0.00867; mu= -12.0454+/- 0.575 mean_var=474.3776+/-113.250, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0589 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0700 ( 1101 res) mbg16185 (1101) 2753 249 2.5e-66 >>mKIAA0700 ( 1101 res) mbg16185 (1101 aa) initn: 3892 init1: 1478 opt: 2753 Z-score: 1283.0 bits: 249.4 E(): 2.5e-66 Smith-Waterman score: 3793; 51.973% identity (56.583% ungapped) in 1166 aa overlap (122-1285:29-1101) 100 110 120 130 140 150 mKIAA4 SHHHPTAVQPHGGQVVQSHAHPAPPVAPVQGQQQFQRLKVEDALSYLDQVKLQFGSQPQV :.... ..:::::.::::::..:::.: . mKIAA0 TSNMAHAGSGGSAGRGFGGSRWGRSGSGGHEKLP-VHVEDALTYLDQVKIRFGSDPAT 10 20 30 40 50 160 170 180 190 200 210 mKIAA4 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