FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mFLJ00155.ptfa, 785 aa vs ./tmplib.26680 library 1768232 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9947+/-0.00797; mu= -13.0323+/- 0.525 mean_var=397.2920+/-96.282, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.0643 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0989 ( 807 res) mpm12317 ( 807) 1230 129 2.5e-30 mKIAA1071 ( 539 res) mpm04376 ( 539) 943 102 2e-22 >>mKIAA0989 ( 807 res) mpm12317 (807 aa) initn: 1489 init1: 408 opt: 1230 Z-score: 636.7 bits: 128.7 E(): 2.5e-30 Smith-Waterman score: 1550; 42.517% identity (50.000% ungapped) in 755 aa overlap (4-743:137-793) 10 20 30 mFLJ00 QNNEELPTYEEAKAQSQFFRGQQQQQQQQQQQQ :::::::::::.::.. .:: mKIAA0 QEPQGQEHQGGETHLAENRLYRLCPQPSKGEELPTYEEAKAHSQYYAAQQA--------- 110 120 130 140 150 40 50 60 70 80 90 mFLJ00 QQQQQGQGPLSHTYYMAGGTSQKSRTEGRPTVNRANSGQAHKDEALKELKQGHVRSLSER :. : ::.: .: ..::::.::..::::::::: mKIAA0 -----GSRPHVGDRDPRGGVS---------------GGGRRQDEALRELRHGHVRSLSER 160 170 180 190 100 110 120 130 140 150 mFLJ00 IMQLSLERNGAK--QHLPSSGNGKSFKAGGE-PSPAQPVCKALDPRGPPPEYPFKTKPMK ..:::::::::. .:. :: . .. . . :.: : .. .::::::.:: mKIAA0 LLQLSLERNGARVPSHMSSSHSFPQLARSQQGPQPRGPPAEGPEPRGPPPQYP------- 200 210 220 230 240 250 160 170 180 190 200 210 mFLJ00 SPVSKNQDHGLYYNDQHPGVLHEMVKPYPAPQPARTEVAVLRYQPPPEYGVTSRPCQLPF :... .. .: .: .:. ..:: .:. : :: . .. :: mKIAA0 --------HAVMAQET-AAVTDPRYRPRSSPHFQHAEVRILQAQVPPVFLQQQQYQYLPQ 260 270 280 290 300 220 230 240 250 260 mFLJ00 PSTVQQHSPMSSQTSSIGGTLHSVSLPLPLPISLAA-SQPLPASPNQQLGPDAFAIVERA : :.::: :: ..: : :.. . : : . :: .: .: . mKIAA0 P---QEHSP----------PLHPAALGHGPPSSFGPPAVEGPPSAQATLGSAHLAQMETV 310 320 330 340 270 280 290 300 310 320 mFLJ00 QQMVEILTEENRVLHQELQGCYDNADKLHKFEKELQSISEAYESLVKSTTKRESLDKAMR . : ..:. :..::.. ..: ...:.:.:.: .:::.:::.....:::.:.:.:: mKIAA0 LRENARLQRDNERLQRELESTSEKAGRIEKLENEIQRLSEAHESLMRTSSKREALEKTMR 350 360 370 380 390 400 330 340 350 360 370 380 mFLJ00 TKLEGEIRRLHDFNRDLRDRLETANRQLSSREYD---GHEDKAAESHYVSQNKEFLKEKE .:..::.:::.:::::::.:::.:::.:.:. . : .: .:. ..:. : .:.: mKIAA0 NKMDGEMRRLQDFNRDLRERLESANRHLASKTQEAQAGSQDMVAK--LLAQSYEQQQEQE 410 420 430 440 450 460 390 400 410 420 430 440 mFLJ00 KLEMELAAVRTASEDHRRHIEILDQALSNAQARVIKLEEELREKQAYVEKVEKLQQALTQ ::: :.: .: : ::.::: :.:.:::.:::.:. . :::::.:::::::::.::::: : mKIAA0 KLEREMALLRGAIEDQRRHAELLEQALGNAQSRAARAEEELRKKQAYVEKVERLQQALGQ 470 480 490 500 510 520 450 460 470 480 490 500 mFLJ00 LQSACEKRGQMERRLRTWLERELDALRTQQKH------GTGPPVSLPECNAPALMELVRE ::.::::: :.: :::: ::.:: :::.::.. : : . : .: : : .:: mKIAA0 LQAACEKREQLELRLRTRLEQELKALRAQQRQTGTLAGGGGSHGGSAELSALRLSEQLRE 530 540 550 560 570 580 510 520 530 540 550 560 mFLJ00 KEERILALEADMTKWEQKYLEESTIRHFAMSAAAAATAERDTTISNHSRNGSYGESSLEA :::.:::::::::::::::::: ..:.:::.:::.:.:.::::. :: . : . ::.. mKIAA0 KEEQILALEADMTKWEQKYLEERAMRQFAMDAAATAAAQRDTTLIRHSPQPSPS-SSFNE 590 600 610 620 630 640 570 580 590 600 610 620 mFLJ00 HIWPEEEEVVQANRRCQDMEYTIKNLHAKIIEKDAMIKVLQQRSRKDAGKTDSASLRPAR . : .:.: :.:: .: :::.:.::::.::::::::::: ::. ...::::. mKIAA0 GLLP-------GNHRHQEMESRLKVLHAQILEKDAVIKVLQQRSRKDPGKATQGTLRPAK 650 660 670 680 690 630 640 650 660 670 mFLJ00 SVPSI-AAATGTHSRQTSLTSSQLTEEKKEEKTTWKGSIGFLLGKEHQGQASAPLLPTTP ::::: :::.::.. :.: :...:.: .: : .: mKIAA0 SVPSIFAAAVGTQG--------------------WQG----LVSSERQTDAR-PAGDRVP 700 710 720 730 680 690 700 710 720 730 mFLJ00 ASALSLPASTTSASSTHAKTGSKDSSTQTDKSTELFWPSMASLPSRGRLSTAPSN-SPIL : : .:. . :.: ::.:.::::: .. .:: :. : :. :. .: : mKIAA0 AEE---PPATAPLPA-HTKHGSRDGSTQTDGPADNTSACLASEPD-GLLGCNSSQRTPSL 740 750 760 770 780 740 750 760 770 780 mFLJ00 KHPAAKGAVEKQENSPGHGKASEHRGRVSNLLHKPEFPDGEMMEVLI :: mKIAA0 DSIAATRVQDLSDMVEILI 790 800 >>mKIAA1071 ( 539 res) mpm04376 (539 aa) initn: 664 init1: 579 opt: 943 Z-score: 494.9 bits: 101.9 E(): 2e-22 Smith-Waterman score: 945; 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