FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0686.ptfa, 1483 aa vs ./tmplib.26680 library 1767534 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3502+/-0.00443; mu= 14.7715+/- 0.296 mean_var=96.9525+/-22.517, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1303 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0821 ( 1406 res) mbg08158 (1406) 348 77 2.7e-14 mKIAA0768 ( 1057 res) mbh03527 (1057) 339 75 7.1e-14 mKIAA0786 ( 891 res) mpm11105 ( 891) 332 74 1.6e-13 mKIAA4089 ( 1251 res) mbg12616 (1251) 250 59 8.7e-09 mKIAA0279 ( 1484 res) meh01738 (1484) 249 59 1.1e-08 >>mKIAA0821 ( 1406 res) mbg08158 (1406 aa) initn: 338 init1: 130 opt: 348 Z-score: 349.0 bits: 77.2 E(): 2.7e-14 Smith-Waterman score: 356; 23.750% identity (27.014% ungapped) in 480 aa overlap (965-1409:652-1108) 940 950 960 970 980 990 mKIAA0 QINGHKFEGKEGDYIQIPERLLDVPEAEMLDGKNACTLVQFVEYSSQQWFIAGDNLPALK ...:. . : :. :.. :.. .: : mKIAA0 NTEGQVQELVFPQEYPSENSIQLSANTIKQNSRNGVVKVVFILYNNLGLFLSTEN--ATV 630 640 650 660 670 1000 1010 1020 1030 mKIAA0 DKVLSLNVKGQSAQPLPNNNEVLY--------RIHAAEPRV--VPH-------TSRCLLW . .. : .. : :..:. :. .: . : : .. : .: mKIAA0 KLAGEAGTGGPGGASLVVNSQVIAASINKESSRVFLMDPVIFTVAHLEAKNHFNANCSFW 680 690 700 710 720 730 1040 1050 1060 1070 1080 1090 mKIAA0 NQAAASWLS--DSQFCKVVEDASDYVECACSHMSVYAV-YAQTD-NSSSYNEAFFSA--- : . : :. ..: :..::. . .. :::::.. .:: .:. . .. :: ..:. mKIAA0 NYSERSMLGYWSTQGCRLVESNKTHTTCACSHLTNFAVLMAHREIYQGRINELLLSVITW 740 750 760 770 780 790 1100 1110 1120 1130 1140 mKIAA0 -GLICISGLCLAVVSHMFCARHSMFAAKLLTH--MMVASLGTQILFLASAYASPHLSEES :.. :: .:::. :: ... . . : . . . ...:::.. . . : . mKIAA0 VGIV-ISLVCLAICISTFCFLRGLQTDRNTIHKNLCINLFLAELLFLVGIDKTQY--EVA 800 810 820 830 840 850 1150 1160 1170 1180 1190 1200 mKIAA0 CSAVAAVAHYLYLCQFSWMLIQSVNFWYVLVVSDEHTERRCLLFCLLSWGLPSFVVILLI : :.. ::..: :::. ...:... .:: : : . : .. .:..:: mKIAA0 CPIFAGLLHYFFLAAFSWLCLEGVHLYLLLVEVFESEYSRTKYYYLGGYCFPALVVG--- 860 870 880 890 900 910 1210 1220 1230 1240 1250 1260 mKIAA0 LILRGIYHRSM-PQIYGLIHGDLCFIPNIYAALFTAALVPLMCLVVVFVVFIHAYQ-LKP : .: .::. . .. : :: .. . . . .: :. :.:.. .:.. . ::: mKIAA0 -IAAAIDYRSYGTEKACWLRVDNYFIWSFIGPVSFVIVVNLVFLMVTLHKMIRSSSVLKP 920 930 940 950 960 970 1270 1280 1290 1300 1310 1320 mKIAA0 QWKGYDDVFRGRTNAAEIPLILYLFALISMTWLWGGLHMAYRHFWMLVLFVIFNSLQGLY . . :.. .. . : :: :...:: .: : . . : ::. ::..::.. mKIAA0 DSSRLDNI-----KSWALGAIALLF-LLGLTWAFGLLFINKESVVMAYLFTTFNAFQGVF 980 990 1000 1010 1020 1330 1340 1350 1360 1370 1380 mKIAA0 VFVVYFIL----HNQTCCPMKASYTVEMNGHPGPSTAFFTPGSGIPPAGEINKSTQNLIN .:: . : :.. .. :: . . :: . . . :.. . .::. : mKIAA0 IFVFHCALQKKVHKEYSKCLRHSYCC-IRSPPGGTHGSLKT-SAMRSNTRYYTGTQSRIR 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1390 1400 1410 1420 1430 mKIAA0 AMEEVPSDWERSSFQQTSQA--SPDLKTSPQNGASFPSSGGYGPGSLIADEESQEFDDLI : :. . .:: .. . :....: mKIAA0 RM------WNDTVRKQTESSFMAGDINSTPTLNRGTMGNHLLTNPVLQPRGGTSPYNTLI 1090 1100 1110 1120 1130 >>mKIAA0768 ( 1057 res) mbh03527 (1057 aa) initn: 270 init1: 116 opt: 339 Z-score: 341.4 bits: 75.3 E(): 7.1e-14 Smith-Waterman score: 380; 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