FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mFLJ00319.ptfa, 537 aa vs ./tmplib.26680 library 1768480 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.7374+/-0.00415; mu= 21.9191+/- 0.280 mean_var=76.1609+/-17.382, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 18 in 1/35 Lambda= 0.1470 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA4172 ( 515 res) mbj00115 ( 515) 958 212 6.7e-56 mKIAA1001 ( 512 res) mbj00867 ( 512) 574 131 2.2e-31 mKIAA1077 ( 1163 res) mpm06017 (1163) 164 45 5e-05 >>mKIAA4172 ( 515 res) mbj00115 (515 aa) initn: 722 init1: 304 opt: 958 Z-score: 1095.9 bits: 212.4 E(): 6.7e-56 Smith-Waterman score: 958; 36.138% identity (39.873% ungapped) in 523 aa overlap (28-520:9-512) 10 20 30 40 50 mFLJ00 AAGLGLGLDSSAGAWFAMAACTAAQQLLLVLSALGL-LAAG--APQPPNIVLLLMDDMGW ...:..: : :::: . .::::.:.. ::.:. mKIAA4 GHRPICISVMALGTLFLALAAGLSTASPPNILLIFADDLGY 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 mFLJ00 GDLGVNGEPSRETPNLDRMAAEGMLFPSFYSANPLCSPSRAALLTGRLPIRNGFYTTNAH :::: :.:: :::::..: :. : .:: ::.::::::::::::.:.:.: mKIAA4 GDLGSYGHPSSTTPNLDQLAEGGLRFTDFYVPVSLCTPSRAALLTGRLPVRSGMYP---- 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 mFLJ00 ARNAYTPQEIMGGIPNSEHLLPELLKKAGYTNKIVGKWHLGHRPQ--FHPLKHGFDEWFG .. :. .::.: : : :.: :: . ..:::::: :. : : ..:: ...: mKIAA4 --GVLGPSS-QGGLPLEEVTLAEVLAARGYLTGMAGKWHLGVGPEGAFLPPHQGFHRFLG 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 mFLJ00 SPNCH-FGPYDNKA--KPNIPVYR--DWEMVG-RFYEEFPINRKTGE-ANLTQLYTQEAL : : :: .: . :.:: : .: . .. .. . .: :.. . mKIAA4 IPYSHDQGPCQNLTCFPPDIPCKGGCDQGLVPIPLLANLTVEAQPPWLPGLEARYVSFSR 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 mFLJ00 DFIQTQHARQSPFFLYWAIDATHAPVYASRQFLGTSLRGRYGDAVREIDDSVGKILSLLQ :.. . . :::::.: :: : .....: : :: .::.. :.: .:: ... . mKIAA4 DLMADAQRQGRPFFLYYASHHTHYPQFSGQSFTKRSGRGPFGDSLMELDGAVGALMTTVG 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 mFLJ00 NLGISKNTFVFFTSDNGAALISAPNEGGSNGPFLCGKQTTFEGGMREPAIAWWPGHIAAG .::. ..:.:.::.::: :. : :: .: . ::: ::::::.::::...:::::. : mKIAA4 DLGLLEETLVIFTADNGPELMRMSN-GGCSGLLRCGKGTTFEGGVREPALVYWPGHITPG 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 mFLJ00 QVSHQLGSIMDLFTTSLSLAGLKPPSDRVIDGLDLLPTML-KGQMMDRPIFYY-----RG :.:.:.: .::. : .:.: : . ..::.:. : .: :. . .:.: . mKIAA4 -VTHELASSLDLLPTLAALTG-APLPNVTLDGVDISPLLLGTGKSPRKSVFFYPPYPDEI 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 mFLJ00 NTLMAVTLGQYKAHLWTWTNSWEEFTQGTDFCPGQNVSGVTTHTQEEHTELPLIFHLGRD . ..:: :.::::..: .. . :. : . : .:.: : ::.. :..: mKIAA4 HGVFAVRNGKYKAHFFTQGSAHSDTTSDPA-CHAANR--LTAH------EPPLLYDLSQD 400 410 420 430 440 470 480 490 500 510 mFLJ00 PGERFPL--SFH--SDEYQDALSRTTQVVQEHQKSLV--PGQ------PQLNVCNQAVMN ::: . . :.. : : .::.. . ... ... :.: : :..: : . mKIAA4 PGENYNVLESIEGVSPEALQALKHIQLLKAQYDAAMTFGPSQIAKGEDPALQICCQPSCT 450 460 470 480 490 500 520 530 mFLJ00 WAPPGCEKLGKCLTPPESVPEKCFWAH : :. :. mKIAA4 PHPVCCHCPGSQS 510 >>mKIAA1001 ( 512 res) mbj00867 (512 aa) initn: 869 init1: 298 opt: 574 Z-score: 655.9 bits: 131.0 E(): 2.2e-31 Smith-Waterman score: 886; 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