FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA1884.ptfa, 1806 aa vs ./tmplib.26680 library 1767211 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.0323+/-0.00478; mu= 25.5074+/- 0.320 mean_var=98.7654+/-21.867, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 8 in 1/35 Lambda= 0.1291 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1894 ( 2796 res) mbf00006 (2796) 4996 943 0 mKIAA0927 ( 713 res) mbg08305 ( 713) 973 193 2.9e-49 mKIAA4158 ( 761 res) mfj68139 ( 761) 859 171 7.4e-43 mKIAA1890 ( 875 res) mbg14487 ( 875) 716 145 8.2e-35 mKIAA0534 ( 1444 res) mpf00179 (1444) 213 52 1.7e-06 mKIAA4159 ( 511 res) mid27006 ( 511) 198 48 6.7e-06 >>mKIAA1894 ( 2796 res) mbf00006 (2796 aa) initn: 8495 init1: 4996 opt: 4996 Z-score: 5019.3 bits: 942.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 7486; 57.753% identity (60.220% ungapped) in 1709 aa overlap (30-1738:396-2034) 10 20 30 40 50 mKIAA1 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mKIAA1 QWNDSLPTCIVPCGGILTKRKGTILSPGYPEPYDNNLNCVWKITVPEGAGIQVQVVSFAT 1020 1030 1040 1050 1060 1070 780 790 800 810 820 830 mKIAA1 EQNWDSLEVFDGADNTVTMLGSFSGTTVPALLNSTSNQLYLHFYSDISVSAAGFHLEYKT :.:::::. .::.::.. :::.::::.: :::::::.:::.: :::::::::::::: . mKIAA1 EHNWDSLDFYDGGDNNAPRLGSYSGTTIPHLLNSTSNNLYLNFQSDISVSAAGFHLEYTA 1080 1090 1100 1110 1120 1130 840 850 860 870 880 890 mKIAA1 VGLSSCPEPAVPSNGVKTGERYLVNDVVSFQCEPGYALQGHAHISCMPGTVRRWNYPPPL .::.::::: .::.:.:.:.::.:.:::::::. ::.::::.::.:::: ::::::: :. mKIAA1 IGLDSCPEPQTPSSGIKVGDRYMVGDVVSFQCDQGYSLQGHSHITCMPGPVRRWNYPIPI 1140 1150 1160 1170 1180 1190 900 910 920 930 940 950 mKIAA1 CIAQCGGAVEEMEGVILSPGFPGNYPSNMDCSWKISLPVGFGAHIQFLNFSTEPNHDFLE :.::::::. .. ::::::::::::::..::.: :.::.:::.:.::.::::: ::.:: mKIAA1 CLAQCGGAMSDFSGVILSPGFPGNYPSSLDCTWTIKLPIGFGVHLQFVNFSTETIHDYLE 1200 1210 1220 1230 1240 1250 960 970 980 990 1000 1010 mKIAA1 IRSGPSETSRMMGRFSGSELPGSLLSTSHDSIVYFHSDHSQNRPGFKLEYQAYELQECPD .::: :: : ..::.:: ..:.::.::.:.. .:::::.:::. ::.. ::::.:: ::: mKIAA1 VRSGSSEISTVIGRLSGPQIPSSLFSTTHETSLYFHSDYSQNKQGFHIVYQAYQLQSCPD 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1020 1030 1040 1050 1060 1070 mKIAA1 PEPFANGIVRGAGYNVGQSVTFECLPGYQLTGQPVLTCQHGTNRNWDHPLPRCEVPCGGN :.:: ::.: : ..:::...:::.::: : :. .::: ::..:::.:::::::. :::: mKIAA1 PRPFRNGFVIGNDFTVGQTISFECFPGYTLIGNSALTCLHGVSRNWNHPLPRCEALCGGN 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1080 1090 1100 1110 1120 1130 mKIAA1 ITSFNGTVYSPGYPSPYSSSQDCVWQITVPIGHGVHLNLSLLQIEPFGDYITVWDGPQQT ::..:::.::::::. : . ::: : . :: :.:...:...:: ::. :.:::::::.:. mKIAA1 ITAMNGTIYSPGYPDEYPNFQDCFWLVRVPPGNGIYINFTVLQTEPIYDFITVWDGPDQN 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1140 1150 1160 1170 1180 1190 mKIAA1 SLQLGVFTRSLSKKIAHSSSNQVLLKFHRDTATGGIFAIAFSAYPLTKCPPPTILPNAEV : :.: :. . . . ..:.:::.:.::: : .:.:.:.... :: : : :: .::::. mKIAA1 SPQIGQFSGNTALESVYSTSNQILIKFHSDFTTSGFFVLSYHAYQLRVCQPPPPVPNAEI 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1200 1210 1220 1230 1240 1250 mKIAA1 VTENEEFNIGDIVRYRCLPGFTLVGSEILTCKLGTYLQFEGPPPICEVHCPTNELLTDST .::..::.::::.::.:::::::::. ::::.:: ::..: ::.:.: ::.::: ::: mKIAA1 LTEDDEFEIGDIIRYQCLPGFTLVGNAILTCRLGERLQMDGAPPVCQVLCPANELRLDST 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1260 1270 1280 1290 1300 1310 mKIAA1 GVILSQSYPGSYPQFQTCSWLVRVEPEYNISITVEYFLSEKQYDEFEIFDGPSGQSPLLK ::::: .:: :::..: :.: . :: ::::. ::.: .::..: ....:::. :::.: mKIAA1 GVILSPGYPDSYPNLQMCAWSISVEKGYNISMFVEFFQTEKEFDVLQVYDGPNIQSPVLI 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1320 1330 1340 1350 1360 1370 mKIAA1 ALSGNYSAPLIVTSSSNSVYLRWSSDHAYNRKGFKIRYSAPYCSLPKAPLHGFILGQTTT .:::.::: . :::... :.:.::.::. :.:::.::: : ::: :..: ::.:..:: mKIAA1 SLSGDYSAAFNVTSNGHEVFLQWSADHGNNKKGFRIRYIAFYCSTPESPPHGYIISQTGG 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1380 1390 1400 1410 1420 1430 mKIAA1 QPGGSIHFGCNTGYRLVGHSMAICTRHPQGYHLWSEAIPLCQALSCGLPDAPKNGIVFGK : .. ....:. :.::::.: :.: . ::: :. .: :::.:::.: :: :: .. mKIAA1 QLNSVVRWACDRGFRLVGKSSAVCRKSSYGYHSWDAPVPACQAISCGIPKAPTNGGILTT 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1440 1450 1460 1470 1480 1490 mKIAA1 EYTVGTKAVYSCNEGYHLQAGAEATAECLDTGLWSNSNVPPQCVPVTCPDISSISVEHGR .: :::...: ::.::.:.. .:: : . : ::: : :.:: ::::.:.:....::: mKIAA1 DYLVGTRVTYFCNDGYRLSSKELTTATCQSDGTWSNHNKTPRCVVVTCPSINSFTLDHGR 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1500 1510 1520 1530 1540 1550 mKIAA1 WRLIFETQYQFQAQLMLICDPGYYYTGQRVIRCQANGRWSLGESMPTCQIISCGELPTPP ::.. ..:........ :::::. : :.: :: :: : ::::::::::::: mKIAA1 WRIVNGSHYEYKTKVVFSCDPGYHGLGPASIECLPNGTWSWRTERPYCQIISCGELPTPP 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1560 1570 1580 1590 1600 1610 mKIAA1 SGHRIGTMSVYGATAIFSCNSGYTLVGSRVRECMANGLWSGSEVRCLAGHCGTPEPIVNG .:..:::.. ::.::::.:. :. :::: ::::...:::::::.:::::::: :: :::: mKIAA1 NGNKIGTQTSYGSTAIFTCDLGFMLVGSAVRECLSSGLWSGSETRCLAGHCGIPELIVNG 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1620 1630 1640 1650 1660 1670 mKIAA1 HINGENFNYRGSVVYQCRAGFRLIGMSVRICQQDHHWSGKTPFCVPITCGHPGNPVNGLT .. :::..:: .::::: :::::: :::::::::.:::. : :::..:::::.:. : : mKIAA1 QVIGENYGYRDTVVYQCNPGFRLIGSSVRICQQDHNWSGQLPSCVPVSCGHPGSPIYGRT 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1680 1690 1700 1710 1720 1730 mKIAA1 QGSQFNLNDVVKFICNPGYIAEGAARSQCLASGQWSDTLPTCRIINCTDPGHQENSVRQV .:. ::.:::: : :: ::. .: ...:: :. ::: :.:...::.::: :: :. mKIAA1 SGNGFNFNDVVTFSCNIGYLMQGPTKAQCQANRQWSHPPPVCKVVNCSDPGIPANSKRES 1980 1990 2000 2010 2020 2030 1740 1750 1760 1770 1780 1790 mKIAA1 HTSGPHRLSPSPTIPVSTTSIPRGKKKSKTKTKKKSFVQRYIFIIQSLYSTKKRQEKKVY mKIAA1 KIEHGNFTYGTVVFYDCNPGYFLFGSSVLICQPNGQWDKPLPECIMIDCGHPGIPPNAVL 2040 2050 2060 2070 2080 2090 >>mKIAA0927 ( 713 res) mbg08305 (713 aa) initn: 621 init1: 244 opt: 973 Z-score: 976.7 bits: 192.6 E(): 2.9e-49 Smith-Waterman score: 973; 31.229% identity (33.516% ungapped) in 586 aa overlap (32-600:33-595) 10 20 30 40 50 60 mKIAA1 FPASPGTVWRARPASRAWGADGACGARLCQAECGNSVTGTQGTLLSPNFPVN-YNNNHEC : :: : . .: . : .:: . :.. :: mKIAA0 ELTGSASEESQETTTSTIVTTTIITTEQAPALCGVSFSDPEGYIDSSDFPPQPYSSFLEC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 mKIAA1 IYSIQTQPGKGIQLKAKAFELAEGDLLKVYDGTNNSARLLGVFSRSEML--GVTLNSTSS :.. . : :..:..:. .:.::.::.. :... . : :.. . .: : .. : .. mKIAA0 TYNVTVYTGYGVELQVKSVNLSEGELLSIR-GVDGPT--LTVLANQTLLVEGQVIRSPTN 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 mKIAA1 SLWLDFITDAENTSKGFELQFSSFELIRCEDPGTPQFG-YKVHDGGHFAGSSVTFSCDPG .. . : : .. :.:....: .. : : :. : : : : .:. . : : : mKIAA0 TISVYFRTFQDDGLGTFQLHYQAF-MLSCPFPRRPDAGEVTVMDL-H-SGGVAHFHCHLG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 mKIAA1 YSLRGSEELMCLSGERRTWDRPLPTCVAECGGTVRGEVSGQVLSPGYPAPYEHNLNCIWT : :.:.. : :... . :. :.: : :::.:.. . :.::::..:. . . :.:: mKIAA0 YELQGAKTLTCINASKPHWSSQEPVCSAPCGGAVHNATIGRVLSPSFPGTANGSQLCVWT 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 mKIAA1 IEADAGCTIGLHFLVFDTEEVHDVLRIWDGPVESGVLLKE-LSGPMLP-KDLHSTFNSVV ::: : . ::. . .: .: . ...: .....:: . : .: . : : .:. mKIAA0 IEAPEGQKLHLHLERLLLHE-KDRMIVYSGRTNTSALLYDSLRTESVPFEGLLSEGSSIR 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 mKIAA1 LQFSTDFFTSKQGFAIQFSVSTATSCNDPGVPQNG--SRSGDSWEAGDSTVFQCDPGYAL ..:..: . ..: :.: . : .: . ::: . : ... : . : ::::..: mKIAA0 IEFTSDQGQAASAFNIRFEAFEKGHCYEPYI-QNGNFTTSDPTYNIGTIVEFTCDPGHSL 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