# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mib34059.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1884.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1884, 1806 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7915816 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2554+/-0.000189; mu= 15.6065+/- 0.011 mean_var=79.0871+/-15.565, 0's: 44 Z-trim: 81 B-trim: 1467 in 1/65 Lambda= 0.144219 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|194207716|ref|XP_001916796.1| PREDICTED: simila (3410) 11158 2332.8 0 gi|126330338|ref|XP_001380425.1| PREDICTED: simila (3575) 10891 2277.3 0 gi|62954774|dbj|BAD97692.1| CSMD2 protein [Homo sa (3631) 10617 2220.3 0 gi|194665931|ref|XP_001790373.1| PREDICTED: simila (3640) 10590 2214.7 0 gi|118101683|ref|XP_417788.2| PREDICTED: similar t (3562) 10431 2181.6 0 gi|118088968|ref|XP_419917.2| PREDICTED: similar t (3555) 8606 1801.9 0 gi|224048645|ref|XP_002194077.1| PREDICTED: CUB 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