FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0126.ptfa, 1030 aa vs ./tmplib.26680 library 1767987 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9674+/-0.00407; mu= 15.3295+/- 0.272 mean_var=83.2786+/-18.748, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/36 Lambda= 0.1405 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA0684 ( 1186 res) mbg02790 (1186) 593 131 9.4e-31 mKIAA0860 ( 539 res) mbp00020 ( 539) 149 41 0.00068 >>mKIAA0684 ( 1186 res) mbg02790 (1186 aa) initn: 525 init1: 297 opt: 593 Z-score: 644.5 bits: 131.1 E(): 9.4e-31 Smith-Waterman score: 947; 26.253% identity (29.753% ungapped) in 918 aa overlap (172-1023:307-1182) 150 160 170 180 190 200 mKIAA0 ARLLLQDPGNHLISMTSSTTLNLSADRDAGERHIFCYLYSCFQRAKEEITKVPENLLPFA : .. :: ::.:. : :.:. : mKIAA0 STSSLSSLGASGGASNWDSYSDHFTIETCKETDMLNYLIECFDRVGIEEKKAPKMCSQPA 280 290 300 310 320 330 210 220 230 240 250 mKIAA0 VQCRNLTVSNTRTVLLTPEIYVDQNIHEQLVDLMLEAIQGAHF--EDVTE-FLEEVIEAL : . .:: :. .. : :. : .:. .. .. ... :..:.... mKIAA0 V---SQLLSNIRSQCISHTALVLQGSLTQPRSLQQPSFLVPYMLCRNLPYGFIQELVRTT 340 350 360 370 380 390 260 270 280 290 300 310 mKIAA0 LLDEEVRTFPEVMIPVFDILLSRIKDLEL----CQILLYAYLDIL-LYFTRQKDMAKVF- :::: : ...::... : :. : . :.: .. : . . : .. mKIAA0 HQDEEV--FKQIFIPILQGLALAAKECSLESDYFKYPLMALGELCETKFGKTHPMCNLVA 400 410 420 430 440 450 320 330 340 350 360 mKIAA0 -LEYIQPK--DPSNGQMYQK-TLLGVILNISCLLKTPG-VVENHGFFLNPSRSSPQEIKV : :: .:..:. :. . ::.....: . . . :::. .: .:. . .. .: mKIAA0 SLPLWLPKSLSPGSGRELQRLSYLGAFFSFSVFAEDDAKVVEK--YFSGPAITL-ENTRV 460 470 480 490 500 370 380 390 400 410 420 mKIAA0 QEANIHQFMAQFHEKIYQMLKNLLQLSPETKHCILFWLGNCLHANAGRTKIWANQMPEIF ...... .......:...: :. ::.. : ... ..:: .... :.. mKIAA0 VSQSLQHYLELGRQELFKILHSIL-LNGETREAALSYMAALVNANMKKAQMQADD----- 510 520 530 540 550 560 430 440 450 460 470 mKIAA0 FQMYASDAFFLNLGAALLKLCQPFCKPRSSRLLTFNPTY-----CVLKDLNDEER---KI .. ..:.:.::: .: .: . .: : .::: : . ::: : . mKIAA0 -RLVSTDGFMLNLLWVLQQLSTKI------KLETVDPTYIFHPRCRITLPNDETRINATM 570 580 590 600 610 480 490 500 510 520 530 mKIAA0 KSVHMRGLDKETCLIPAVQEPTFPQS---YNLVTENLA-LTEYTLYLGFHRLHDQMVKIN ..:. : : . : .:: :: .: ...:. : :. : .. . mKIAA0 EDVNER-LTELYGDQPPFSEPKFPTECFFLTLHAHHLSILPSCRRYIRRLRAIRELNRTV 620 630 640 650 660 670 540 550 560 570 580 mKIAA0 QNLHRLQVAWRDAQQSSSPAADNLRE-------QFERLMTIYLSTKTAMTEPQMLQNCLN ..:. . :.: :: : :: :...:. . ... . ..:. ::: mKIAA0 EDLKNNESQWKD-----SPLATRHREMLKRCKTQLKKLVRCKACADAGLLDESFLRRCLN 680 690 700 710 720 590 600 610 620 630 640 mKIAA0 LQVSMAVLLVQLAIGNEGSQPIELSFPLPDGYSSL-AYVPEFFADNLGDFLIFLRRFAED . ::.:: . ....:: . .. : .:::.......::.:. ... . mKIAA0 FYG----LLIQLMLRILDPAYPDVTLPLNSEVPKVFAALPEFYVEDVAEFLFFIVQYSPQ 730 740 750 760 770 780 650 660 670 680 690 700 mKIAA0 ILETSADSLEHVLHFITIFTGSIERMKNPHLRAKLAEVLEAVMPHLDQTPSPLVSSVFHR .: . .. :.... . . ..::.: :::.::. . : .. : ... :. mKIAA0 VLYEPCT--QDIVMFLVVMLCNQNYIRNPYLVAKLVEVMFMTNPSVQ----PRTQKFFE- 790 800 810 820 830 710 720 730 740 750 mKIAA0 KRVFCNFPYAPQL-AEALIKVFVDIEFTGDPHQFEQKFNYRRPMYPILRYMW-------- .. : : . .: . .:.: ..:.: :: .: .::. : . :.. .: mKIAA0 --MIENHPLSTKLLVPSLMKFYTDVEHTGATSEFYDKFTIRYHISTIFKSLWQNIAHHGT 840 850 860 870 880 890 760 770 780 790 mKIAA0 -------GTDCYR--------------ESIKYLSKI-KIQQIEKDRGEWESLTPEARREK : . : ::.. :..: ..:. :.. .:..: . .. . mKIAA0 FMEEFNSGKQFVRYINMLINDTTFLLDESLESLKRIHEVQEEMKNKEQWDQLPRDQQQAR 900 910 920 930 940 950 800 810 820 830 840 850 mKIAA0 EAGLQMFGQLARFHNIMSNETIGTLSFLTSEIKSLFVHPFLAERIISMLNYFLQHLVGPK .. : . ...: . ...::. . .::..... :..: :. :. .:::. ::.: ::: mKIAA0 QSQLAQDERVSRSYLALATETVDMFHLLTKQVQKPFLRPELGPRLAAMLNFNLQQLCGPK 960 970 980 990 1000 1010 860 870 880 890 900 910 mKIAA0 MGALKVKDFSEFDFKPQQLVSDICTIYLNLGDEENFCATVPKDGRSYSPTLFAQTVRVLK :::.. .. :.:..:.... :::.: : : .. : :::: :: ... .. mKIAA0 CRDLKVENPEKYGFEPKKLLDQLTDIYLQL-DCARFAKAIADDQRSYSKELFEEVISKMR 1020 1030 1040 1050 1060 1070 920 930 940 950 960 970 mKIAA0 KINKPGNMIVA-FSNLAERIKSLADLQQQEEETYADACDEFLDPIMSTLMSDPVVLPSSR : . ... . :. :::... .. . . : :.:: ::: ::.:.:::.::: :::. mKIAA0 KAGIKSTIAIEKFKLLAEKVEEIVAKNARAEIDYSDAPDEFRDPLMDTLMTDPVRLPSGT 1080 1090 1100 1110 1120 1130 980 990 1000 1010 1020 1030 mKIAA0 VTVDRSTIARHLLSDQTDPFNRSPLTMDQIRPNTELKEKIQRWLAERKQQKEQPE : .::: : ::::.. ::::::. :: ....: ::::.:: :. :... mKIAA0 V-MDRSIILRHLLNSPTDPFNRQMLTESMLEPVPELKEQIQAWMREKQSSDH 1140 1150 1160 1170 1180 >>mKIAA0860 ( 539 res) mbp00020 (539 aa) initn: 109 init1: 81 opt: 149 Z-score: 162.2 bits: 40.7 E(): 0.00068 Smith-Waterman score: 149; 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