# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mib23081.fasta.nr -Q ../query/mKIAA1915.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA1915, 745 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7917594 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1949+/-0.00019; mu= 13.0203+/- 0.011 mean_var=81.4998+/-15.786, 0's: 25 Z-trim: 41 B-trim: 1474 in 1/66 Lambda= 0.142068 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|94717659|sp|Q69Z66.2|MYSM1_MOUSE RecName: Full= ( 819) 5002 1035.5 0 gi|109475146|ref|XP_216460.4| PREDICTED: similar t ( 890) 4476 927.7 0 gi|114556825|ref|XP_513441.2| PREDICTED: hypotheti ( 828) 3981 826.2 0 gi|74756898|sp|Q5VVJ2.1|MYSM1_HUMAN RecName: Full= ( 828) 3974 824.8 0 gi|194665759|ref|XP_593335.3| PREDICTED: similar t ( 831) 3953 820.5 0 gi|109005110|ref|XP_001110190.1| PREDICTED: simila ( 729) 3821 793.4 0 gi|126306045|ref|XP_001381159.1| PREDICTED: simila ( 835) 3474 722.3 1.8e-205 gi|73956386|ref|XP_546688.2| PREDICTED: similar to ( 764) 3429 713.0 1e-202 gi|82231180|sp|Q5F3F2.1|MYSM1_CHICK RecName: Full= ( 832) 3368 700.6 6.4e-199 gi|224058320|ref|XP_002194646.1| PREDICTED: myb-li (1222) 3249 676.3 1.9e-191 gi|194207397|ref|XP_001914709.1| PREDICTED: myb-li ( 833) 3176 661.2 4.5e-187 gi|119627034|gb|EAX06629.1| hCG23220 [Homo sapiens ( 575) 3131 651.8 2e-184 gi|193785224|dbj|BAG54377.1| unnamed protein produ ( 575) 3130 651.6 2.3e-184 gi|116487819|gb|AAI25980.1| Mysm1 protein [Xenopus ( 818) 2419 506.0 2.2e-140 gi|26349303|dbj|BAC38291.1| unnamed protein produc ( 411) 2238 468.7 2e-129 gi|74211061|dbj|BAE37628.1| unnamed protein produc ( 405) 2223 465.6 1.7e-128 gi|189532876|ref|XP_689723.2| PREDICTED: si:ch211- ( 822) 2147 450.3 1.4e-123 gi|26335913|dbj|BAC31657.1| unnamed protein produc ( 354) 1846 388.3 2.7e-105 gi|149044504|gb|EDL97763.1| myb-like, SWIRM and MP ( 493) 1660 350.3 1e-93 gi|148698981|gb|EDL30928.1| mCG11654 [Mus musculus ( 389) 1636 345.3 2.6e-92 gi|31873936|emb|CAD97896.1| hypothetical protein [ ( 234) 1466 310.2 5.6e-82 gi|156224272|gb|EDO45099.1| predicted protein [Nem ( 632) 1192 254.5 9.4e-65 gi|47211086|emb|CAF95202.1| unnamed protein produc ( 342) 1069 229.0 2.3e-57 gi|148682645|gb|EDL14592.1| mCG11656, isoform CRA_ ( 152) 999 214.4 2.7e-53 gi|47211085|emb|CAF95201.1| unnamed protein produc ( 163) 868 187.5 3.4e-45 gi|126631938|gb|AAI34240.1| Si:ch211-59d15.8 prote ( 402) 855 185.2 4.2e-44 gi|210108020|gb|EEA55937.1| hypothetical protein B ( 809) 758 165.6 6.8e-38 gi|159164078|pdb|2DCE|A Chain A, Solution Structur ( 111) 694 151.7 1.4e-34 gi|51476610|emb|CAH18287.1| hypothetical protein [ ( 106) 614 135.3 1.2e-29 gi|215500653|gb|EEC10147.1| MPN domain-containing ( 427) 566 126.0 3e-26 gi|190583263|gb|EDV23334.1| hypothetical protein T ( 128) 501 112.2 1.2e-22 gi|157422816|gb|AAI53338.1| Mysm1 protein [Xenopus ( 405) 483 109.0 3.8e-21 gi|148682646|gb|EDL14593.1| mCG11656, isoform CRA_ ( 75) 456 102.8 5e-20 gi|74997242|sp|Q54Z40.1|MYBH_DICDI RecName: Full=M (1217) 470 106.7 5.4e-20 gi|210125232|gb|EEA72924.1| hypothetical protein B ( 105) 454 102.5 8.5e-20 gi|91090584|ref|XP_972498.1| PREDICTED: similar to ( 797) 454 103.3 3.8e-19 gi|163775154|gb|EDQ88779.1| predicted protein [Mon (1097) 433 99.1 9.5e-18 gi|144580959|gb|ABO99017.1| predicted protein [Ost ( 458) 415 95.1 6.5e-17 gi|210115237|gb|EEA62991.1| hypothetical protein B ( 432) 405 93.0 2.6e-16 gi|134024232|gb|AAI36149.1| LOC100125058 protein [ ( 466) 388 89.6 3e-15 gi|126323210|ref|XP_001374585.1| PREDICTED: hypoth ( 793) 366 85.2 1e-13 gi|123908300|sp|Q08CH3.1|MPND_DANRE RecName: Full= ( 458) 361 84.0 1.4e-13 gi|4581082|gb|AAD24592.1|AC007292_2 R31167_1, part ( 498) 359 83.6 2e-13 gi|119589637|gb|EAW69231.1| hypothetical protein F ( 501) 359 83.6 2e-13 gi|156223987|gb|EDO44817.1| predicted protein [Nem ( 423) 357 83.2 2.3e-13 gi|75517321|gb|AAI01894.1| LOC681944 protein [Ratt ( 436) 356 83.0 2.7e-13 gi|72088398|ref|XP_791918.1| PREDICTED: similar to ( 449) 356 83.0 2.8e-13 gi|149028235|gb|EDL83673.1| rCG45081, isoform CRA_ ( 487) 356 83.0 3e-13 gi|194668814|ref|XP_590284.4| PREDICTED: similar t ( 585) 356 83.1 3.4e-13 gi|159163956|pdb|2CU7|A Chain A, Solution Structur ( 72) 345 80.0 3.4e-13 >>gi|94717659|sp|Q69Z66.2|MYSM1_MOUSE RecName: Full=Prot (819 aa) initn: 5002 init1: 5002 opt: 5002 Z-score: 5537.7 bits: 1035.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 5002; 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