FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 3.4t11 Apr 17, 2002 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 ../query/mKIAA0478.ptfa, 1234 aa vs ./tmplib.26680 library 1767783 residues in 2168 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0472+/-0.00531; mu= 14.1207+/- 0.354 mean_var=191.4312+/-45.826, 0's: 0 Z-trim: 55 B-trim: 18 in 1/35 Lambda= 0.0927 FASTA (3.45 Mar 2002) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2168) mKIAA1588 ( 617 res) mbp00262 ( 617) 637 98 3.7e-21 mKIAA1559 ( 504 res) mbp01052 ( 504) 626 97 9.3e-21 mKIAA4205 ( 653 res) mfj21207 ( 653) 615 96 3e-20 mKIAA4218 ( 601 res) mpm12334 ( 601) 607 94 6e-20 mKIAA1874 ( 435 res) mbg02924 ( 435) 596 93 1.4e-19 mKIAA1710 ( 461 res) mbg19468 ( 461) 594 93 1.7e-19 mKIAA1396 ( 481 res) mfj16154 ( 481) 581 91 5.9e-19 mKIAA1431 ( 833 res) mfj27243 ( 833) 582 91 7.3e-19 mKIAA1948 ( 463 res) mph00578 ( 463) 558 88 4.8e-18 mKIAA0326 ( 885 res) mib10041 ( 885) 551 87 1.3e-17 mKIAA4229 ( 450 res) mfj48069 ( 450) 533 84 4.8e-17 mKIAA1141 ( 886 res) mef00011 ( 886) 537 85 4.9e-17 mKIAA0961 ( 486 res) mph04182 ( 486) 532 84 5.5e-17 mKIAA0628 ( 508 res) msj08164 ( 508) 529 84 7.5e-17 mKIAA4236 ( 919 res) mfj05191 ( 919) 531 85 8.7e-17 mKIAA3006 ( 617 res) mbg05721 ( 617) 512 82 4e-16 mKIAA4237 ( 519 res) mfj17080 ( 519) 509 81 4.8e-16 mKIAA1852 ( 736 res) mej02019 ( 736) 457 75 7.3e-14 mKIAA0236 ( 1852 res) mbg02771 (1852) 422 70 3.1e-12 mKIAA0426 ( 508 res) mpm11025 ( 508) 414 69 3.2e-12 mFLJ00187 ( 488 res) mbg06919 ( 488) 405 67 7.2e-12 mFLJ00416 ( 522 res) msj08249 ( 522) 390 65 3e-11 mKIAA1015 ( 831 res) mbh00453 ( 831) 390 66 3.9e-11 mKIAA0924 ( 617 res) mbp20088 ( 617) 388 65 4e-11 mKIAA1703 ( 891 res) mfj09089 ( 891) 383 65 7.7e-11 mKIAA4196 ( 437 res) mfj00049 ( 437) 374 63 1.2e-10 mKIAA0441 ( 699 res) mbp07087 ( 699) 357 61 7.5e-10 mKIAA0760 ( 1400 res) mbg03730 (1400) 361 62 7.7e-10 mKIAA4227 ( 539 res) mng13251 ( 539) 308 54 6.1e-08 mKIAA1954 ( 643 res) mpj01436 ( 643) 308 55 6.7e-08 mFLJ00107 ( 1371 res) mfj24090 (1371) 280 51 1.4e-06 mKIAA4222 ( 543 res) mkg04188 ( 543) 274 50 1.4e-06 mKIAA0211 ( 1292 res) mpm11220 (1292) 261 49 7.8e-06 mKIAA1572 ( 463 res) mfj40003 ( 463) 250 47 1.2e-05 mKIAA1675 ( 707 res) mia50030 ( 707) 251 47 1.4e-05 mKIAA0296 ( 1541 res) mpf00724 (1541) 253 48 1.8e-05 mKIAA1020 ( 642 res) mpm09294 ( 642) 246 46 2.1e-05 mKIAA1951 ( 392 res) mid22012 ( 392) 240 45 2.8e-05 mKIAA4234 ( 105 res) mph00083 ( 105) 232 43 2.8e-05 mKIAA1611 ( 558 res) mph00982 ( 558) 234 45 5.9e-05 mKIAA0352 ( 686 res) meh01314 ( 686) 225 43 0.00015 mKIAA0198 ( 506 res) mpm05258 ( 506) 219 42 0.00023 mKIAA0390 ( 1303 res) mbh01388 (1303) 222 43 0.00029 mKIAA3011 ( 496 res) mph01327 ( 496) 206 41 0.00074 mFLJ00134 ( 174 res) mbg08825 ( 174) 192 38 0.0015 mKIAA1084 ( 1013 res) mpf00327 (1013) 202 41 0.0016 mKIAA1993 ( 527 res) meh02016 ( 527) 197 40 0.0018 mKIAA1555 ( 1068 res) mtj00168 (1068) 191 39 0.0046 mKIAA0569 ( 1248 res) mbg07960 (1248) 190 39 0.0055 mKIAA1803 ( 705 res) mfj24209 ( 705) 184 38 0.007 >>mKIAA1588 ( 617 res) mbp00262 (617 aa) initn: 491 init1: 232 opt: 637 Z-score: 472.1 bits: 98.5 E(): 3.7e-21 Smith-Waterman score: 830; 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