# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/mib05001.fasta.nr -Q ../query/mKIAA0624.ptfa /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 mKIAA0624, 1623 aa vs /cdna4/rodent/rouge_util/new.rouge/nfasta/nr library 2727779818 residues in 7921681 sequences statistics sampled from 60000 to 7916787 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9117+/-0.000193; mu= 12.2863+/- 0.011 mean_var=99.0215+/-18.873, 0's: 33 Z-trim: 41 B-trim: 185 in 1/67 Lambda= 0.128887 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7921681) gi|123792667|sp|Q0VAV2.1|EXPH5_MOUSE RecName: Full (1960) 10929 2044.0 0 gi|28415635|dbj|BAC57424.1| synaptotagmin-like hom (1960) 10920 2042.3 0 gi|74180886|dbj|BAE25642.1| unnamed protein produc ( 805) 5361 1008.4 0 gi|109483491|ref|XP_236272.4| PREDICTED: similar t (1934) 4360 822.5 0 gi|114640233|ref|XP_508743.2| PREDICTED: exophilin (1899) 3500 662.6 8.3e-187 gi|114640231|ref|XP_001141449.1| PREDICTED: exophi (1988) 3500 662.6 8.6e-187 gi|50949772|emb|CAH10364.1| hypothetical 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:..::.: ::: ::: ... gi|114 FDFQRSTLDSMVVSHGKETQLTPHFGTPNVCSMTGSSYHVKSSELVSQQDSSPVEVHINK 560 570 580 590 600 610 270 280 290 300 310 320 mKIAA0 DPYLCGKAQTPASSFRTPFPLSPDDGRESQSSSFPDSTATLQKIIPNKPDFLPIRNCTEV . : ::: ::::.: : :: :. :: .. . :.:::::.:::: :.:. ::: gi|114 EACSFGIAQTLASSFKTSFSQISDDRRNPQSPNLQNPTVTLQKIFPNKPASHPVRSHTEV 620 630 640 650 660 670 330 340 350 360 370 380 mKIAA0 PVACSHSTDSLSLTDTQPNIPVTETNSEKDMDVSVSKDEQLNKTGQKSRPTGLPQYVLHT :. :.:.::: :. .:::: :::.:.:::.. :.:::.::.: : .. .:: : .: gi|114 TVTNSNSVDSLPLAKSQPNILVTEVNNEKDLNESISKDKQLSKMDQTNKAGEIPQPVSQT 680 690 700 710 720 730 390 400 410 420 430 440 mKIAA0 VISNDLPDFQNAHSRDSAQNDRYGFNAPATERSRRSPRVFSRKGTSQIHTTQRDQSNKLS :::.:::::: :.:::... .:::: . :..:::::::: ::... . :.:: .. gi|114 GISNSLPDFQNPLSQDSAKSNGFGFNASTIISSKKSPRVFSRKDTSKMYIPHTDKSNDIK 740 750 760 770 780 790 450 460 470 480 490 500 mKIAA0 KNKCFGGDRTLDSAASPPFIQESGTATSLPSPNQGCHQK-TGSNEESSNTIKNSHWCFES ..: : .: : :.:: ::::: : :.: .:::::. : .::. : : :.:: gi|114 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